More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_0617 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008781  Pnap_0617  hypothetical protein  100 
 
 		 341 aa  699    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3439  hypothetical protein  76.56 
 
 		 327 aa  513  1e-144  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1232  hypothetical protein  53.64 
 
 		 332 aa  358  6e-98  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0281455  normal  0.949647 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4361  hypothetical protein  51.96 
 
 		 335 aa  338  9e-92  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.459389 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4122  hypothetical protein  48.76 
 
 		 327 aa  332  6e-90  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.657669  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2030  hypothetical protein  47.89 
 
 		 332 aa  328  1.0000000000000001e-88  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.608213  normal  0.556518 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0356  hypothetical protein  52 
 
 		 329 aa  322  5e-87  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3699  hypothetical protein  46.82 
 
 		 345 aa  296  3e-79  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00286748  normal  0.239602 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3148  hypothetical protein  48.02 
 
 		 336 aa  294  2e-78  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1635  hypothetical protein  37.23 
 
 		 333 aa  207  2e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.345549  normal  0.902401 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2276  hypothetical protein  38.22 
 
 		 266 aa  199  7e-50  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2776  hypothetical protein  32.84 
 
 		 332 aa  199  7e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.918758  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2485  hypothetical protein  33.72 
 
 		 346 aa  198  9e-50  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0644524  normal  0.0188147 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4280  hypothetical protein  35.05 
 
 		 333 aa  198  1.0000000000000001e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.711918  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1722  hypothetical protein  32.81 
 
 		 338 aa  197  2.0000000000000003e-49  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.322135 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4624  hypothetical protein  35.65 
 
 		 327 aa  196  4.0000000000000005e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5751  hypothetical protein  36.67 
 
 		 327 aa  196  6e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0796477  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4609  extra-cytoplasmic solute receptor  35.02 
 
 		 328 aa  195  8.000000000000001e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.636278 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5161  extra-cytoplasmic solute receptor  34.25 
 
 		 341 aa  195  9e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0547548 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5061  extra-cytoplasmic solute receptor  34.74 
 
 		 335 aa  195  1e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000369607  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1106  hypothetical protein  38.59 
 
 		 326 aa  194  2e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.171121  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0309  twin-arginine translocation pathway signal  34.89 
 
 		 328 aa  193  4e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6021  hypothetical protein  35.1 
 
 		 338 aa  192  9e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5574  extra-cytoplasmic solute receptor  34.49 
 
 		 330 aa  191  1e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3124  hypothetical protein  33.65 
 
 		 340 aa  191  1e-47  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.65371  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0256  hypothetical protein  33.55 
 
 		 327 aa  192  1e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5801  hypothetical protein  35.18 
 
 		 330 aa  190  2e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.744071  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4354  hypothetical protein  33.99 
 
 		 327 aa  190  2e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.110423  normal  0.165755 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3987  hypothetical protein  33.22 
 
 		 334 aa  190  2e-47  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.700334  normal  0.0774583 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5273  extra-cytoplasmic solute receptor  38.02 
 
 		 322 aa  191  2e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.320147  normal  0.0608959 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0476  hypothetical protein  35.39 
 
 		 330 aa  189  5e-47  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.211749 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0467  hypothetical protein  35 
 
 		 345 aa  189  5e-47  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0719  hypothetical protein  34.2 
 
 		 326 aa  188  9e-47  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.32495 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0843  hypothetical protein  33.86 
 
 		 324 aa  188  9e-47  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.593129  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1191  hypothetical protein  32.3 
 
 		 335 aa  188  1e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0120541  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5278  extra-cytoplasmic solute receptor  36.3 
 
 		 331 aa  188  1e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.777708  normal  0.21823 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0112  hypothetical protein  34.78 
 
 		 338 aa  187  2e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.25815  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5146  hypothetical protein  33.14 
 
 		 327 aa  187  3e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0987531  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5105  hypothetical protein  31.45 
 
 		 329 aa  187  3e-46  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4501  extra-cytoplasmic solute receptor  33.93 
 
 		 327 aa  187  3e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.034407  normal  0.0507087 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2648  hypothetical protein  34.62 
 
 		 336 aa  186  4e-46  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.43635  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3986  hypothetical protein  32.56 
 
 		 339 aa  186  4e-46  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.323954  normal  0.0812118 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5112  hypothetical protein  33.99 
 
 		 325 aa  186  4e-46  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.386337  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1657  hypothetical protein  33.44 
 
 		 331 aa  186  6e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.129303  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3178  hypothetical protein  31.55 
 
 		 328 aa  186  7e-46  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000137109 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1906  hypothetical protein  31.87 
 
 		 325 aa  185  9e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.375062  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1908  hypothetical protein  32.09 
 
 		 336 aa  184  2.0000000000000003e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.781517  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3711  hypothetical protein  34.35 
 
 		 331 aa  184  2.0000000000000003e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.150567  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3985  hypothetical protein  32.56 
 
 		 349 aa  184  2.0000000000000003e-45  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.19648  normal  0.0884631 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2903  hypothetical protein  34.17 
 
 		 327 aa  184  2.0000000000000003e-45  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.900443  normal  0.012055 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3329  hypothetical protein  34.78 
 
 		 323 aa  184  2.0000000000000003e-45  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.422296  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3917  extra-cytoplasmic solute receptor  34.27 
 
 		 328 aa  182  5.0000000000000004e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.897664 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1383  hypothetical protein  33.33 
 
 		 325 aa  183  5.0000000000000004e-45  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.5589  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4422  hypothetical protein  33.02 
 
 		 352 aa  182  5.0000000000000004e-45  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.386029  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2828  hypothetical protein  36.4 
 
 		 328 aa  182  6e-45  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.384643  normal  0.180289 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3884  hypothetical protein  36.79 
 
 		 328 aa  182  6e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0619  hypothetical protein  33.33 
 
 		 325 aa  182  6e-45  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2294  hypothetical protein  35.79 
 
 		 326 aa  182  6e-45  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.0000131413  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1912  hypothetical protein  34.98 
 
 		 335 aa  182  7e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5932  hypothetical protein  33.92 
 
 		 328 aa  182  9.000000000000001e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5251  hypothetical protein  32.93 
 
 		 338 aa  181  1e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1098  hypothetical protein  37.13 
 
 		 339 aa  181  2e-44  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3792  extra-cytoplasmic solute receptor  33.44 
 
 		 326 aa  181  2e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4614  hypothetical protein  36.15 
 
 		 322 aa  181  2e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.25356  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5443  hypothetical protein  33.78 
 
 		 337 aa  180  2e-44  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5199  hypothetical protein  34.34 
 
 		 342 aa  181  2e-44  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3548  hypothetical protein  35.35 
 
 		 334 aa  180  2.9999999999999997e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0576712  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4957  hypothetical protein  35.87 
 
 		 331 aa  180  2.9999999999999997e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0102082  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1233  hypothetical protein  34.71 
 
 		 326 aa  180  2.9999999999999997e-44  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.305229  normal  0.989225 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6186  hypothetical protein  36.22 
 
 		 327 aa  180  2.9999999999999997e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5896  hypothetical protein  33.22 
 
 		 332 aa  180  4e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.971815  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0116  hypothetical protein  33.12 
 
 		 331 aa  180  4e-44  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4641  hypothetical protein  35.2 
 
 		 327 aa  179  4e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.647286  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3870  hypothetical protein  32.59 
 
 		 315 aa  179  4e-44  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0646118  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6278  hypothetical protein  34.65 
 
 		 322 aa  180  4e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.000130922  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0099  hypothetical protein  33.12 
 
 		 331 aa  179  5.999999999999999e-44  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.361253  normal  0.47407 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4511  hypothetical protein  34.33 
 
 		 337 aa  179  7e-44  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3799  hypothetical protein  32.24 
 
 		 329 aa  178  9e-44  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.681724 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6257  hypothetical protein  35.23 
 
 		 330 aa  178  1e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3550  hypothetical protein  32.53 
 
 		 326 aa  178  1e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.615423  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4610  hypothetical protein  30.89 
 
 		 322 aa  178  1e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0432088  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0436  hypothetical protein  34.86 
 
 		 337 aa  178  1e-43  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5699  hypothetical protein  32.89 
 
 		 327 aa  178  1e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.537325  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3152  hypothetical protein  33.45 
 
 		 333 aa  177  2e-43  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.35228  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1121  hypothetical protein  33 
 
 		 325 aa  177  2e-43  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.237862  normal  0.618143 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4503  extra-cytoplasmic solute receptor  35.78 
 
 		 366 aa  177  2e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.4554  normal  0.0615049 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1041  hypothetical protein  33 
 
 		 327 aa  177  2e-43  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3216  hypothetical protein  35.08 
 
 		 332 aa  177  2e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2904  hypothetical protein  34.65 
 
 		 332 aa  177  2e-43  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.339964  normal  0.0116375 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3832  extra-cytoplasmic solute receptor  33.75 
 
 		 322 aa  177  3e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5153  extra-cytoplasmic solute receptor  35.44 
 
 		 329 aa  177  3e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.415379 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3703  hypothetical protein  37.04 
 
 		 333 aa  177  3e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2113  hypothetical protein  33.55 
 
 		 318 aa  177  3e-43  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.723108  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5819  hypothetical protein  35.43 
 
 		 329 aa  177  3e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.659696  normal  0.528927 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6069  hypothetical protein  32.49 
 
 		 318 aa  176  4e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1128  hypothetical protein  34.8 
 
 		 324 aa  176  5e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.794936  normal  1 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4625  hypothetical protein  33.22 
 
 		 327 aa  176  5e-43  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2570  hypothetical protein  34.57 
 
 		 339 aa  176  6e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.052781 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4779  hypothetical protein  34.38 
 
 		 324 aa  176  6e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3966  hypothetical protein  34.2 
 
 		 356 aa  176  7e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0682449  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>