More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_1232 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007948  Bpro_1232  hypothetical protein  100 
 
 		 332 aa  667    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0281455  normal  0.949647 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4361  hypothetical protein  67.58 
 
 		 335 aa  438  9.999999999999999e-123  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.459389 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2030  hypothetical protein  61.66 
 
 		 332 aa  426  1e-118  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.608213  normal  0.556518 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3439  hypothetical protein  52.8 
 
 		 327 aa  359  4e-98  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0617  hypothetical protein  52.48 
 
 		 341 aa  352  4e-96  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4122  hypothetical protein  44.58 
 
 		 327 aa  308  8e-83  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.657669  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0356  hypothetical protein  44.48 
 
 		 329 aa  294  1e-78  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3699  hypothetical protein  45.48 
 
 		 345 aa  283  2.0000000000000002e-75  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00286748  normal  0.239602 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3148  hypothetical protein  44.41 
 
 		 336 aa  279  4e-74  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5146  hypothetical protein  38.79 
 
 		 327 aa  227  2e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0987531  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6278  hypothetical protein  39.53 
 
 		 322 aa  218  1e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.000130922  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5105  hypothetical protein  38.69 
 
 		 329 aa  215  7e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5061  extra-cytoplasmic solute receptor  37.09 
 
 		 335 aa  212  7.999999999999999e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000369607  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1912  hypothetical protein  38.38 
 
 		 335 aa  211  1e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5574  extra-cytoplasmic solute receptor  35.87 
 
 		 330 aa  211  1e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2903  hypothetical protein  37.58 
 
 		 327 aa  209  4e-53  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.900443  normal  0.012055 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5896  hypothetical protein  37.7 
 
 		 332 aa  209  7e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.971815  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4289  hypothetical protein  39.4 
 
 		 322 aa  207  2e-52  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0170791  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2485  hypothetical protein  38.74 
 
 		 346 aa  206  4e-52  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0644524  normal  0.0188147 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4645  extra-cytoplasmic solute receptor  36.76 
 
 		 348 aa  205  8e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.176289  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1657  hypothetical protein  35.51 
 
 		 331 aa  204  1e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.129303  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2570  hypothetical protein  38.34 
 
 		 339 aa  204  1e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.052781 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5801  hypothetical protein  36.45 
 
 		 330 aa  204  2e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.744071  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5278  extra-cytoplasmic solute receptor  36.95 
 
 		 331 aa  204  2e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.777708  normal  0.21823 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0143  hypothetical protein  37.42 
 
 		 330 aa  204  2e-51  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.627963 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0161  hypothetical protein  37.42 
 
 		 330 aa  204  2e-51  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4551  hypothetical protein  36.28 
 
 		 323 aa  203  3e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4422  hypothetical protein  38.89 
 
 		 352 aa  203  4e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.386029  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1908  hypothetical protein  35.29 
 
 		 336 aa  202  6e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.781517  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4458  hypothetical protein  36.42 
 
 		 332 aa  202  6e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.60746  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5119  hypothetical protein  36 
 
 		 328 aa  201  9.999999999999999e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.111845 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3987  hypothetical protein  35.22 
 
 		 334 aa  201  1.9999999999999998e-50  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.700334  normal  0.0774583 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1812  hypothetical protein  37.75 
 
 		 326 aa  201  1.9999999999999998e-50  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4073  extra-cytoplasmic solute receptor  37.38 
 
 		 332 aa  199  3.9999999999999996e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000509768  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3420  hypothetical protein  38.1 
 
 		 320 aa  199  3.9999999999999996e-50  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.21089  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4316  hypothetical protein  38.96 
 
 		 341 aa  199  3.9999999999999996e-50  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.414867  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5112  hypothetical protein  35.76 
 
 		 325 aa  199  3.9999999999999996e-50  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.386337  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0112  hypothetical protein  34.45 
 
 		 338 aa  199  5e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.25815  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0116  hypothetical protein  35.38 
 
 		 331 aa  199  6e-50  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0256  hypothetical protein  35.71 
 
 		 327 aa  199  6e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0099  hypothetical protein  35.38 
 
 		 331 aa  198  7.999999999999999e-50  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.361253  normal  0.47407 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4280  hypothetical protein  35.83 
 
 		 333 aa  198  9e-50  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.711918  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3324  hypothetical protein  35.53 
 
 		 328 aa  198  1.0000000000000001e-49  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.0025587  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3974  hypothetical protein  35.53 
 
 		 328 aa  198  1.0000000000000001e-49  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.406148 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3124  hypothetical protein  33.03 
 
 		 340 aa  197  1.0000000000000001e-49  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.65371  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5584  hypothetical protein  36.69 
 
 		 337 aa  197  2.0000000000000003e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0384253  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5382  extra-cytoplasmic solute receptor  35.14 
 
 		 331 aa  197  3e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.203559  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4501  extra-cytoplasmic solute receptor  31.42 
 
 		 327 aa  196  3e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.034407  normal  0.0507087 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1635  hypothetical protein  33.73 
 
 		 333 aa  197  3e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.345549  normal  0.902401 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3792  extra-cytoplasmic solute receptor  35.95 
 
 		 326 aa  196  4.0000000000000005e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5153  extra-cytoplasmic solute receptor  38.91 
 
 		 329 aa  196  4.0000000000000005e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.415379 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4853  extra-cytoplasmic solute receptor  33.98 
 
 		 314 aa  196  4.0000000000000005e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0565268  normal  0.206495 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3985  hypothetical protein  34.55 
 
 		 349 aa  196  5.000000000000001e-49  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.19648  normal  0.0884631 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0719  hypothetical protein  35.37 
 
 		 326 aa  196  5.000000000000001e-49  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.32495 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3894  hypothetical protein  36.45 
 
 		 321 aa  196  6e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0107663  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6021  hypothetical protein  35.97 
 
 		 338 aa  196  6e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2776  hypothetical protein  33.83 
 
 		 332 aa  196  6e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.918758  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3983  extra-cytoplasmic solute receptor  33.23 
 
 		 328 aa  195  8.000000000000001e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0104878 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4624  hypothetical protein  35.65 
 
 		 327 aa  195  9e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3550  hypothetical protein  31.8 
 
 		 326 aa  195  1e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.615423  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4631  hypothetical protein  36 
 
 		 325 aa  195  1e-48  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4947  extra-cytoplasmic solute receptor  36.69 
 
 		 327 aa  194  1e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.395577  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2293  hypothetical protein  35.76 
 
 		 320 aa  195  1e-48  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000010806  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1041  hypothetical protein  36.54 
 
 		 327 aa  194  2e-48  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0191  hypothetical protein  33.12 
 
 		 335 aa  194  2e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4779  hypothetical protein  34.88 
 
 		 324 aa  194  2e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4673  hypothetical protein  36.63 
 
 		 344 aa  194  2e-48  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1121  hypothetical protein  36.54 
 
 		 325 aa  194  2e-48  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.237862  normal  0.618143 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4314  hypothetical protein  36.79 
 
 		 322 aa  194  2e-48  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.210006  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4610  hypothetical protein  33.97 
 
 		 322 aa  193  3e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0432088  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3178  hypothetical protein  34.26 
 
 		 328 aa  193  3e-48  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000137109 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3331  hypothetical protein  38.15 
 
 		 336 aa  193  4e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0744  hypothetical protein  35.8 
 
 		 325 aa  192  5e-48  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.61051  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3884  hypothetical protein  34.26 
 
 		 328 aa  192  6e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2357  hypothetical protein  35.91 
 
 		 333 aa  192  6e-48  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.827571  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1672  hypothetical protein  35.51 
 
 		 326 aa  192  7e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0669762  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6186  hypothetical protein  32.31 
 
 		 327 aa  192  7e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0596  hypothetical protein  35.5 
 
 		 336 aa  192  7e-48  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.642014  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4513  hypothetical protein  36.58 
 
 		 338 aa  192  7e-48  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0122346  normal  0.691436 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1868  hypothetical protein  37.98 
 
 		 330 aa  192  8e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3664  hypothetical protein  35.02 
 
 		 324 aa  192  8e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1733  hypothetical protein  37.08 
 
 		 330 aa  192  9e-48  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3329  hypothetical protein  36.33 
 
 		 323 aa  191  1e-47  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.422296  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4957  hypothetical protein  36.28 
 
 		 331 aa  191  1e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0102082  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5251  hypothetical protein  33.23 
 
 		 338 aa  191  1e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1930  hypothetical protein  37.08 
 
 		 330 aa  191  1e-47  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.886467  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5887  hypothetical protein  36.88 
 
 		 318 aa  192  1e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.947907  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3580  hypothetical protein  35.31 
 
 		 336 aa  191  1e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.082795  normal  0.0103715 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4004  hypothetical protein  35.79 
 
 		 339 aa  191  1e-47  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.506172  normal  0.0371737 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0590  hypothetical protein  36.72 
 
 		 324 aa  192  1e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2870  hypothetical protein  35.91 
 
 		 333 aa  191  1e-47  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4876  extra-cytoplasmic solute receptor  36.88 
 
 		 328 aa  191  2e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.748926  normal  0.754985 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6115  hypothetical protein  36.49 
 
 		 328 aa  191  2e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3152  hypothetical protein  35.03 
 
 		 333 aa  190  2e-47  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.35228  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4304  hypothetical protein  35.71 
 
 		 331 aa  191  2e-47  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.618665  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5199  hypothetical protein  35.14 
 
 		 342 aa  191  2e-47  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3910  hypothetical protein  34.78 
 
 		 332 aa  191  2e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.032337  normal  0.0571508 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1726  hypothetical protein  36.14 
 
 		 337 aa  191  2e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.183123  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0646  hypothetical protein  34.44 
 
 		 334 aa  190  2.9999999999999997e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0969  putative lipoprotein  38.49 
 
 		 322 aa  190  2.9999999999999997e-47  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.288033  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>