More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_4122 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007948  Bpro_4122  hypothetical protein  100 
 
 		 327 aa  666    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.657669  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0617  hypothetical protein  48.76 
 
 		 341 aa  317  2e-85  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3439  hypothetical protein  46.42 
 
 		 327 aa  313  3.9999999999999997e-84  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1232  hypothetical protein  44.7 
 
 		 332 aa  300  3e-80  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0281455  normal  0.949647 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0356  hypothetical protein  46.82 
 
 		 329 aa  295  7e-79  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2030  hypothetical protein  43.97 
 
 		 332 aa  288  7e-77  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.608213  normal  0.556518 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4361  hypothetical protein  44.7 
 
 		 335 aa  281  1e-74  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.459389 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3699  hypothetical protein  44.52 
 
 		 345 aa  280  3e-74  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00286748  normal  0.239602 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3148  hypothetical protein  41.99 
 
 		 336 aa  268  8e-71  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1635  hypothetical protein  35.83 
 
 		 333 aa  217  2e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.345549  normal  0.902401 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1657  hypothetical protein  36.31 
 
 		 331 aa  210  3e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.129303  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4501  extra-cytoplasmic solute receptor  36.2 
 
 		 327 aa  209  5e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.034407  normal  0.0507087 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3178  hypothetical protein  36.11 
 
 		 328 aa  207  1e-52  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000137109 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4853  extra-cytoplasmic solute receptor  38.44 
 
 		 314 aa  207  3e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0565268  normal  0.206495 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1033  hypothetical protein  40.26 
 
 		 325 aa  207  3e-52  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.829997  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1908  hypothetical protein  35.8 
 
 		 336 aa  205  8e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.781517  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0256  hypothetical protein  37.04 
 
 		 327 aa  205  8e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5278  extra-cytoplasmic solute receptor  36.91 
 
 		 331 aa  205  9e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.777708  normal  0.21823 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5061  extra-cytoplasmic solute receptor  36.3 
 
 		 335 aa  204  1e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000369607  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5146  hypothetical protein  36.02 
 
 		 327 aa  205  1e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0987531  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1912  hypothetical protein  38.8 
 
 		 335 aa  203  4e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0779  hypothetical protein  38.59 
 
 		 335 aa  203  4e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0125  hypothetical protein  38.85 
 
 		 331 aa  202  6e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.654987  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2776  hypothetical protein  35.9 
 
 		 332 aa  202  7e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.918758  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1121  hypothetical protein  36.21 
 
 		 325 aa  201  9.999999999999999e-51  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.237862  normal  0.618143 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1041  hypothetical protein  36.21 
 
 		 327 aa  201  1.9999999999999998e-50  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3792  extra-cytoplasmic solute receptor  38.41 
 
 		 326 aa  201  1.9999999999999998e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3550  hypothetical protein  35.69 
 
 		 326 aa  200  3e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.615423  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3721  extra-cytoplasmic solute receptor  35.64 
 
 		 345 aa  200  3e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.31096 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2828  hypothetical protein  35.58 
 
 		 328 aa  199  3.9999999999999996e-50  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.384643  normal  0.180289 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2276  hypothetical protein  39.46 
 
 		 266 aa  199  3.9999999999999996e-50  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3546  hypothetical protein  37.05 
 
 		 330 aa  198  7.999999999999999e-50  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0909589  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0112  hypothetical protein  37.46 
 
 		 338 aa  199  7.999999999999999e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.25815  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4323  hypothetical protein  36.59 
 
 		 344 aa  198  7.999999999999999e-50  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.957408  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1607  hypothetical protein  36.63 
 
 		 333 aa  197  1.0000000000000001e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1906  hypothetical protein  34.69 
 
 		 325 aa  198  1.0000000000000001e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.375062  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0309  twin-arginine translocation pathway signal  35.33 
 
 		 328 aa  197  2.0000000000000003e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2357  hypothetical protein  37.74 
 
 		 333 aa  197  2.0000000000000003e-49  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.827571  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5751  hypothetical protein  34.88 
 
 		 327 aa  197  2.0000000000000003e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0796477  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0476  hypothetical protein  37.13 
 
 		 330 aa  197  2.0000000000000003e-49  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.211749 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0467  hypothetical protein  37.13 
 
 		 345 aa  197  2.0000000000000003e-49  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6283  hypothetical protein  34.97 
 
 		 321 aa  197  3e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.120039  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5801  hypothetical protein  36.6 
 
 		 330 aa  197  3e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.744071  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2869  hypothetical protein  36.75 
 
 		 330 aa  197  3e-49  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2870  hypothetical protein  37.74 
 
 		 333 aa  195  7e-49  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5896  hypothetical protein  37.38 
 
 		 332 aa  195  8.000000000000001e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.971815  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5709  hypothetical protein  37.67 
 
 		 327 aa  195  8.000000000000001e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.21123  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1191  hypothetical protein  31.25 
 
 		 335 aa  194  2e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0120541  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3664  hypothetical protein  36.58 
 
 		 324 aa  194  2e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5161  extra-cytoplasmic solute receptor  33.75 
 
 		 341 aa  194  2e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0547548 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6069  hypothetical protein  36.08 
 
 		 318 aa  193  3e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4610  hypothetical protein  33.64 
 
 		 322 aa  193  3e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0432088  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3884  hypothetical protein  35.76 
 
 		 328 aa  193  4e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4631  hypothetical protein  34.98 
 
 		 325 aa  193  4e-48  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6021  hypothetical protein  35.1 
 
 		 338 aa  192  5e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0823  hypothetical protein  33.44 
 
 		 325 aa  192  5e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0213458 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6278  hypothetical protein  35.55 
 
 		 322 aa  192  6e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.000130922  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5382  extra-cytoplasmic solute receptor  36.04 
 
 		 331 aa  192  6e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.203559  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4073  extra-cytoplasmic solute receptor  35.42 
 
 		 332 aa  192  6e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000509768  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0842  hypothetical protein  34.1 
 
 		 325 aa  192  7e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0179  hypothetical protein  35.96 
 
 		 328 aa  192  1e-47  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.303741 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0843  hypothetical protein  33.54 
 
 		 324 aa  191  1e-47  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.593129  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5849  hypothetical protein  36.15 
 
 		 330 aa  191  1e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1466  hypothetical protein  36.84 
 
 		 335 aa  191  1e-47  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.652931 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2293  hypothetical protein  35.42 
 
 		 320 aa  191  1e-47  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000010806  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5584  hypothetical protein  34.11 
 
 		 337 aa  191  1e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0384253  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0187  hypothetical protein  35.4 
 
 		 332 aa  190  2e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3974  hypothetical protein  37.54 
 
 		 328 aa  191  2e-47  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.406148 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1098  hypothetical protein  36.07 
 
 		 339 aa  191  2e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4047  extra-cytoplasmic solute receptor  33.33 
 
 		 329 aa  191  2e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0364236  normal  0.64466 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1017  hypothetical protein  35.31 
 
 		 304 aa  191  2e-47  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.221773 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2903  hypothetical protein  35 
 
 		 327 aa  190  2.9999999999999997e-47  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.900443  normal  0.012055 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3324  hypothetical protein  37.54 
 
 		 328 aa  189  4e-47  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.0025587  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4957  hypothetical protein  36.17 
 
 		 331 aa  189  4e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0102082  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3832  extra-cytoplasmic solute receptor  33.75 
 
 		 322 aa  189  4e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3711  hypothetical protein  34.92 
 
 		 331 aa  189  5e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.150567  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4597  hypothetical protein  35.53 
 
 		 329 aa  189  5.999999999999999e-47  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.658248 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0257  hypothetical protein  37.12 
 
 		 334 aa  189  5.999999999999999e-47  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2570  hypothetical protein  35.49 
 
 		 339 aa  189  7e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.052781 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4625  hypothetical protein  38.15 
 
 		 327 aa  189  7e-47  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2507  hypothetical protein  35.2 
 
 		 336 aa  188  9e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3420  hypothetical protein  35.62 
 
 		 333 aa  188  1e-46  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.467518  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0099  hypothetical protein  35.74 
 
 		 331 aa  187  1e-46  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.361253  normal  0.47407 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3868  hypothetical protein  34.91 
 
 		 324 aa  188  1e-46  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.231863  normal  0.156504 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1818  hypothetical protein  38.16 
 
 		 326 aa  188  1e-46  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00429449 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0116  hypothetical protein  35.74 
 
 		 331 aa  188  1e-46  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5699  hypothetical protein  35 
 
 		 327 aa  188  1e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.537325  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3894  hypothetical protein  35.44 
 
 		 327 aa  187  2e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0367386  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0143  hypothetical protein  34.71 
 
 		 324 aa  187  2e-46  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.169608  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4354  hypothetical protein  35.29 
 
 		 327 aa  187  2e-46  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.110423  normal  0.165755 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5741  hypothetical protein  34.88 
 
 		 339 aa  187  2e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.286317  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3216  hypothetical protein  34.75 
 
 		 332 aa  187  2e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4611  hypothetical protein  34.21 
 
 		 332 aa  187  3e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.214044  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0125  hypothetical protein  34.71 
 
 		 324 aa  186  3e-46  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4513  hypothetical protein  34.9 
 
 		 338 aa  187  3e-46  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0122346  normal  0.691436 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1863  hypothetical protein  33.74 
 
 		 327 aa  187  3e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.405454  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2869  hypothetical protein  37.5 
 
 		 329 aa  186  4e-46  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3966  hypothetical protein  35.71 
 
 		 356 aa  186  4e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0682449  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2356  hypothetical protein  37.84 
 
 		 329 aa  186  4e-46  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.632454  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5119  hypothetical protein  33.44 
 
 		 328 aa  186  4e-46  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.111845 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>