121 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_3949 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013739  Cwoe_3949  Collagen triple helix repeat protein  100 
 
 		 270 aa  540  9.999999999999999e-153  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1120  hypothetical protein  51.72 
 
 		 198 aa  73.9  0.000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0114992  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0478  cell-surface large adhesin  41.58 
 
 		 2851 aa  61.6  0.00000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3470  triple helix repeat-containing collagen  52.94 
 
 		 813 aa  59.3  0.00000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.943395  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13970  collagen triple helix repeat protein  48.84 
 
 		 523 aa  59.3  0.00000007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1339  collagen-like protein  55.88 
 
 		 712 aa  57.8  0.0000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5836  Collagen triple helix repeat protein  48.78 
 
 		 1426 aa  57.4  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.278516  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1008  Collagen triple helix repeat protein  49.33 
 
 		 380 aa  58.2  0.0000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1380  triple helix repeat-containing collagen  51.39 
 
 		 474 aa  57.4  0.0000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0453849  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1202  triple helix repeat-containing collagen  47.76 
 
 		 400 aa  56.6  0.0000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.0000183423  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1581  hypothetical protein  52.94 
 
 		 585 aa  55.8  0.0000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.322632  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1632  large adhesin  44.44 
 
 		 2914 aa  55.5  0.0000008  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1618  group-specific protein  52.94 
 
 		 643 aa  55.8  0.0000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.747405  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1549  group-specific protein  55.88 
 
 		 512 aa  55.5  0.0000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000333718 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3152  BclA protein  52.94 
 
 		 347 aa  55.5  0.0000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0005  BclA protein  52.94 
 
 		 347 aa  55.5  0.0000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3557  hypothetical protein  50 
 
 		 481 aa  55.1  0.000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.285889  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3841  hypothetical protein  50 
 
 		 478 aa  55.1  0.000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000174288  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4655  collagen triple helix repeat domain protein  45.68 
 
 		 426 aa  54.7  0.000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4578  Collagen triple helix repeat protein  56.16 
 
 		 444 aa  55.1  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.567616 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2467  exosporium protein H  53.97 
 
 		 437 aa  55.1  0.000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1924  triple helix repeat-containing collagen  51.47 
 
 		 466 aa  54.7  0.000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3684  triple helix repeat-containing collagen  51.47 
 
 		 468 aa  54.3  0.000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0586  Collagen triple helix repeat protein  48.28 
 
 		 606 aa  53.9  0.000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1203  tail fiber protein  53.85 
 
 		 451 aa  53.9  0.000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1804  tail fiber protein  54.93 
 
 		 434 aa  53.9  0.000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.982324  hitchhiker  0.00650595 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2165  tail fiber protein  53.85 
 
 		 437 aa  53.5  0.000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.468721  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2871  tail fiber protein  53.85 
 
 		 437 aa  53.5  0.000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0235495 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4654  hypothetical protein  51.47 
 
 		 462 aa  53.5  0.000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0915  tail fiber protein  53.12 
 
 		 438 aa  53.1  0.000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2758  tail fiber protein  54.69 
 
 		 439 aa  53.5  0.000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.204827  normal  0.264951 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3118  tail fiber protein  54.69 
 
 		 437 aa  53.1  0.000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.145222 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3721  collagen triple helix repeat protein  52.94 
 
 		 706 aa  53.5  0.000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.98705e-33 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1338  group-specific protein  43.02 
 
 		 436 aa  53.1  0.000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00783091  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3403  triple helix repeat-containing collagen  50 
 
 		 582 aa  52.8  0.000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000154784 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3360  hypothetical protein  43.18 
 
 		 835 aa  52.8  0.000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.888871  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4914  Collagen triple helix repeat protein  54.1 
 
 		 283 aa  52.8  0.000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.209024  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1925  triple helix repeat-containing collagen  42.86 
 
 		 492 aa  52.8  0.000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0682  triple helix repeat-containing collagen  50.82 
 
 		 542 aa  52.4  0.000007  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0939  Collagen triple helix repeat protein  38.33 
 
 		 194 aa  52.4  0.000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0376709  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1027  triple helix repeat-containing collagen  46.38 
 
 		 403 aa  52.4  0.000008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.155494  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2925  collagen triple helix repeat protein  45.33 
 
 		 252 aa  52.4  0.000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00742867 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2244  exosporium protein H  55.17 
 
 		 435 aa  52.4  0.000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.800271  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4635  collagen triple helix repeat domain protein  51.47 
 
 		 459 aa  52  0.000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.179421  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2201  exosporium protein H  53.97 
 
 		 428 aa  51.6  0.00001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1426  triple helix repeat-containing collagen  49.32 
 
 		 473 aa  51.6  0.00001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.937607  normal  0.524919 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2280  triple helix repeat-containing collagen  42.65 
 
 		 299 aa  51.6  0.00001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0151545  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4355  triple helix repeat-containing collagen  49.23 
 
 		 369 aa  51.6  0.00001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.105642  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1262  BclA protein  46.97 
 
 		 295 aa  51.6  0.00001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2610  Collagen triple helix repeat protein  40.38 
 
 		 767 aa  51.6  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.965964  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3739  hypothetical protein  52.94 
 
 		 1147 aa  51.2  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0102662  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2697  hypothetical protein  46.91 
 
 		 382 aa  51.2  0.00002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3685  triple helix repeat-containing collagen  42.86 
 
 		 493 aa  50.8  0.00002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4370  triple helix repeat-containing collagen  52.24 
 
 		 344 aa  50.8  0.00002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.324657  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3508  tail fiber protein  54.69 
 
 		 645 aa  51.2  0.00002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.283696 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0713  Collagen triple helix repeat protein  48.53 
 
 		 322 aa  50.8  0.00002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3469  triple helix repeat-containing collagen  50.72 
 
 		 748 aa  50.4  0.00003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4476  collagen-like protein  44.44 
 
 		 815 aa  50.8  0.00003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.957246  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2569  hypothetical protein  37.3 
 
 		 442 aa  50.4  0.00003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3227  triple helix repeat-containing collagen  44.16 
 
 		 274 aa  50.4  0.00003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3402  triple helix repeat-containing collagen  47.06 
 
 		 253 aa  50.4  0.00003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000301368 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0148  collagen triple helix repeat protein  46.25 
 
 		 639 aa  50.8  0.00003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1304  Collagen triple helix repeat protein  48.53 
 
 		 319 aa  50.1  0.00004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.174683  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4263  triple helix repeat-containing collagen  42.47 
 
 		 390 aa  50.1  0.00004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1104  bclA protein  45.07 
 
 		 283 aa  50.1  0.00004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0923  triple helix repeat-containing collagen  37.23 
 
 		 236 aa  50.1  0.00004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0470667  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2406  collagen triple helix repeat protein  42.5 
 
 		 300 aa  50.1  0.00004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1704  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  40.3 
 
 		 689 aa  49.7  0.00005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0600  collagen triple helix repeat domain protein  52.73 
 
 		 300 aa  49.3  0.00006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.952581  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1866  hypothetical protein  41.86 
 
 		 835 aa  49.7  0.00006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2465  BclA protein  51.47 
 
 		 348 aa  49.3  0.00006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2241  BclA protein  45.95 
 
 		 285 aa  49.3  0.00007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4978  triple helix repeat-containing collagen  46.38 
 
 		 469 aa  49.3  0.00007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0804  Collagen triple helix repeat  54.69 
 
 		 288 aa  49.3  0.00007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.479308  normal  0.0397602 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3386  hypothetical protein  45.45 
 
 		 867 aa  48.9  0.00008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.12938  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1007  Collagen triple helix repeat protein  56.86 
 
 		 445 aa  48.9  0.00009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3456  triple helix repeat-containing collagen  52.94 
 
 		 1168 aa  48.5  0.0001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00439724  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0879  Collagen triple helix repeat protein  38.89 
 
 		 328 aa  48.1  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2389  triple helix repeat-containing collagen  47.76 
 
 		 842 aa  48.5  0.0001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00549275  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2011  triple helix repeat-containing collagen  45.59 
 
 		 308 aa  48.5  0.0001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.160641 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4623  triple helix repeat-containing collagen  46.38 
 
 		 647 aa  48.1  0.0002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4458  collagen-like protein  43.75 
 
 		 1055 aa  48.1  0.0002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2198  hypothetical protein  42.65 
 
 		 240 aa  47.8  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1926  triple helix repeat-containing collagen  45.95 
 
 		 582 aa  47.8  0.0002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3686  triple helix repeat-containing collagen  46.88 
 
 		 587 aa  47.4  0.0002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0025  triple helix repeat-containing collagen  46.27 
 
 		 366 aa  48.1  0.0002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.123658  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1608  collagen triple helix repeat protein  45.95 
 
 		 1101 aa  47.4  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.712053 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0397  phage tail Collar  49.28 
 
 		 1873 aa  47.4  0.0003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1748  hypothetical protein  34.78 
 
 		 1408 aa  47.4  0.0003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2599  triple helix repeat-containing collagen  50.75 
 
 		 222 aa  46.6  0.0004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0118729  normal  0.173421 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3124  Collagen triple helix repeat protein  50 
 
 		 1580 aa  47  0.0004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2240  hypothetical protein  42.65 
 
 		 258 aa  46.6  0.0005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5064  Collagen triple helix repeat protein  37.72 
 
 		 839 aa  46.2  0.0005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.18046  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2256  triple helix repeat-containing collagen  43.42 
 
 		 326 aa  46.2  0.0005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0346745  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3477  triple helix repeat-containing collagen  49.25 
 
 		 936 aa  46.2  0.0006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00171179  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4844  collagen triple helix repeat domain protein  42.5 
 
 		 1219 aa  46.2  0.0006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2353  triple helix repeat-containing collagen  42.03 
 
 		 580 aa  45.8  0.0007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4113  Collagen triple helix repeat  43.06 
 
 		 212 aa  45.8  0.0007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.366844  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1848  Collagen triple helix repeat protein  67.5 
 
 		 250 aa  45.8  0.0007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.152171  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4557  triple helix repeat-containing collagen  43.42 
 
 		 934 aa  45.4  0.0009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>