77 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_0923 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_0923  triple helix repeat-containing collagen  100 
 
 		 236 aa  458  9.999999999999999e-129  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0470667  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0478  cell-surface large adhesin  60 
 
 		 2851 aa  73.6  0.000000000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1632  large adhesin  55.22 
 
 		 2914 aa  66.6  0.0000000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0025  triple helix repeat-containing collagen  50 
 
 		 366 aa  58.9  0.00000007  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.123658  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1704  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  57.38 
 
 		 689 aa  57.4  0.0000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3402  triple helix repeat-containing collagen  52.78 
 
 		 253 aa  55.5  0.0000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000301368 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2697  hypothetical protein  52.94 
 
 		 382 aa  55.1  0.000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13970  collagen triple helix repeat protein  41.38 
 
 		 523 aa  53.5  0.000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1608  collagen triple helix repeat protein  52.94 
 
 		 1101 aa  53.5  0.000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.712053 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2569  hypothetical protein  51.47 
 
 		 442 aa  52.8  0.000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3403  triple helix repeat-containing collagen  61.82 
 
 		 582 aa  53.1  0.000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000154784 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0804  Collagen triple helix repeat  52.31 
 
 		 288 aa  52.4  0.000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.479308  normal  0.0397602 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3685  triple helix repeat-containing collagen  56.36 
 
 		 493 aa  52.4  0.000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4914  Collagen triple helix repeat protein  54.1 
 
 		 283 aa  51.6  0.000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.209024  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1866  hypothetical protein  43.82 
 
 		 835 aa  51.6  0.00001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3841  hypothetical protein  36.09 
 
 		 478 aa  50.8  0.00002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000174288  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3557  hypothetical protein  36.09 
 
 		 481 aa  50.8  0.00002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.285889  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2393  hypothetical protein  34.95 
 
 		 307 aa  50.8  0.00002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.535773  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4113  Collagen triple helix repeat  56.45 
 
 		 212 aa  50.1  0.00003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.366844  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1937  triple helix repeat-containing collagen  46.84 
 
 		 219 aa  49.3  0.00005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.402337  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2353  triple helix repeat-containing collagen  54.55 
 
 		 580 aa  48.9  0.00006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5836  Collagen triple helix repeat protein  45 
 
 		 1426 aa  49.3  0.00006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.278516  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1120  hypothetical protein  40.16 
 
 		 198 aa  48.9  0.00007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0114992  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3360  hypothetical protein  46.75 
 
 		 835 aa  48.5  0.00008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.888871  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1203  tail fiber protein  52.73 
 
 		 451 aa  48.1  0.0001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3470  triple helix repeat-containing collagen  58.18 
 
 		 813 aa  47.8  0.0001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.943395  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3686  triple helix repeat-containing collagen  44.12 
 
 		 587 aa  48.1  0.0001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3721  collagen triple helix repeat protein  40.37 
 
 		 706 aa  48.1  0.0001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.98705e-33 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2165  tail fiber protein  52.73 
 
 		 437 aa  47.8  0.0002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.468721  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1618  group-specific protein  52.86 
 
 		 643 aa  47.4  0.0002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.747405  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2871  tail fiber protein  52.73 
 
 		 437 aa  47.8  0.0002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0235495 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5064  Collagen triple helix repeat protein  56.36 
 
 		 839 aa  47.8  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.18046  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1338  group-specific protein  49.25 
 
 		 436 aa  47.8  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00783091  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3339  triple helix repeat-containing collagen  59.18 
 
 		 158 aa  47.4  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.487784  normal  0.022781 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0878  triple helix repeat-containing collagen  54.9 
 
 		 303 aa  46.6  0.0003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0304216 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1339  collagen-like protein  58.18 
 
 		 712 aa  46.6  0.0003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1581  hypothetical protein  59.02 
 
 		 585 aa  47  0.0003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.322632  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1926  triple helix repeat-containing collagen  50 
 
 		 582 aa  46.6  0.0003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1925  triple helix repeat-containing collagen  52.73 
 
 		 492 aa  47  0.0003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1924  triple helix repeat-containing collagen  59.18 
 
 		 466 aa  47  0.0003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2758  tail fiber protein  52.73 
 
 		 439 aa  46.6  0.0004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.204827  normal  0.264951 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3118  tail fiber protein  52.73 
 
 		 437 aa  46.6  0.0004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.145222 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1202  triple helix repeat-containing collagen  55.77 
 
 		 400 aa  46.2  0.0004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.0000183423  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0915  tail fiber protein  50 
 
 		 438 aa  45.8  0.0005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2610  Collagen triple helix repeat protein  52.63 
 
 		 767 aa  45.8  0.0005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.965964  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1027  triple helix repeat-containing collagen  44.44 
 
 		 403 aa  45.8  0.0006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.155494  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3508  tail fiber protein  52.73 
 
 		 645 aa  45.8  0.0006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.283696 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1426  triple helix repeat-containing collagen  48.08 
 
 		 473 aa  45.8  0.0006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.937607  normal  0.524919 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3684  triple helix repeat-containing collagen  57.14 
 
 		 468 aa  45.4  0.0007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2641  collagen triple helix repeat protein  59.09 
 
 		 497 aa  45.4  0.0008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4370  triple helix repeat-containing collagen  44.59 
 
 		 344 aa  45.1  0.0009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.324657  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3469  triple helix repeat-containing collagen  56.25 
 
 		 748 aa  44.7  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1380  triple helix repeat-containing collagen  49.09 
 
 		 474 aa  44.7  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0453849  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6234  putative collagen-like protein  58.14 
 
 		 180 aa  44.7  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3386  hypothetical protein  50.7 
 
 		 867 aa  45.1  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.12938  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8979  hypothetical protein  32.84 
 
 		 307 aa  45.1  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0713  Collagen triple helix repeat protein  42.22 
 
 		 322 aa  44.3  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2389  triple helix repeat-containing collagen  56.6 
 
 		 842 aa  44.3  0.002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00549275  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1681  hypothetical protein  53.7 
 
 		 953 aa  44.3  0.002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3477  triple helix repeat-containing collagen  52.73 
 
 		 936 aa  43.9  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00171179  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1549  group-specific protein  58.18 
 
 		 512 aa  43.9  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000333718 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1804  tail fiber protein  50 
 
 		 434 aa  43.9  0.002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.982324  hitchhiker  0.00650595 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1848  Collagen triple helix repeat protein  57.78 
 
 		 250 aa  43.5  0.003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.152171  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0478  Collagen triple helix repeat protein  41.72 
 
 		 281 aa  43.5  0.003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.151972 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0939  Collagen triple helix repeat protein  38.46 
 
 		 194 aa  43.5  0.003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0376709  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0398  collagen triple helix repeat domain protein  57.63 
 
 		 951 aa  43.5  0.003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.178342  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4557  triple helix repeat-containing collagen  60.38 
 
 		 934 aa  43.5  0.003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4862  collagen triple helix repeat domain protein  50.68 
 
 		 1170 aa  43.5  0.003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2011  triple helix repeat-containing collagen  50 
 
 		 308 aa  43.5  0.003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.160641 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1865  collagen triple helix repeat domain protein  53.45 
 
 		 838 aa  42.7  0.004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.224261  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0623  triple helix repeat-containing collagen  58.7 
 
 		 221 aa  43.1  0.004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1304  Collagen triple helix repeat protein  56.36 
 
 		 319 aa  42.7  0.005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.174683  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0838  Collagen triple helix repeat protein  52.94 
 
 		 297 aa  42.4  0.006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.932228  normal  0.0295691 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3387  hypothetical protein  51.61 
 
 		 835 aa  42.4  0.007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.265829  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4476  collagen-like protein  33.82 
 
 		 815 aa  42.4  0.007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.957246  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0682  triple helix repeat-containing collagen  51.72 
 
 		 542 aa  42  0.009  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4655  collagen triple helix repeat domain protein  45.45 
 
 		 426 aa  41.6  0.01  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>