More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cla_1092 on replicon NC_012039
Organism: Campylobacter lari RM2100



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012039  Cla_1092  ABC transporter, ATP-binding protein  100 
 
 		 211 aa  427  1e-119  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1314  ABC transporter, ATP-binding protein  70.14 
 
 		 211 aa  285  4e-76  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.24854  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1195  ABC transporter, ATP-binding protein  69.67 
 
 		 211 aa  283  1.0000000000000001e-75  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.762072  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0549  ABC transporter, ATP-binding protein  69.67 
 
 		 211 aa  282  2.0000000000000002e-75  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.977002  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1259  lipoprotein-releasing system ATP-binding protein LolD  62.32 
 
 		 215 aa  269  2e-71  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0312879  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0548  modulator of drug activity  63.29 
 
 		 214 aa  265  5e-70  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00351407  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1440  ABC transporter, ATP-binding protein  62.14 
 
 		 214 aa  259  2e-68  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0838  lipoprotein-releasing system ATP-binding protein LolD  60 
 
 		 214 aa  258  3e-68  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.19069  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1799  ABC transporter-related protein  54.11 
 
 		 214 aa  236  2e-61  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0408  ABC transporter related protein  53.33 
 
 		 214 aa  233  2.0000000000000002e-60  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1576  ABC transporter related  38.79 
 
 		 223 aa  159  2e-38  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1151  ABC transporter related  41.71 
 
 		 228 aa  160  2e-38  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.023193  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1471  ABC transporter related  37.5 
 
 		 232 aa  155  3e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.827608 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25580  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  39.22 
 
 		 280 aa  155  3e-37  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.470855  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1633  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  37.62 
 
 		 233 aa  155  5.0000000000000005e-37  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00322127  normal  0.820935 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3744  ABC transporter related  38.38 
 
 		 230 aa  155  5.0000000000000005e-37  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.319618  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0563  ABC transporter related protein  40.28 
 
 		 233 aa  154  7e-37  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2670  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  39.2 
 
 		 233 aa  154  7e-37  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1530  ABC transporter related  38.71 
 
 		 224 aa  154  1e-36  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.0701501 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3881  ABC transporter related  36.06 
 
 		 229 aa  154  1e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.770849  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2067  ABC transporter related  38.28 
 
 		 236 aa  154  1e-36  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.488124  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3778  ABC transporter related  36.92 
 
 		 233 aa  153  2e-36  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.691965  normal  0.46776 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0539  ABC transporter related protein  37.5 
 
 		 227 aa  153  2e-36  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0632704  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1611  SalX-type ABC antimicrobial peptide transport system ATPase  37.31 
 
 		 357 aa  152  2.9999999999999998e-36  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1841  ABC transporter related  35.05 
 
 		 226 aa  152  2.9999999999999998e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.656554  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0967  ABC transporter related  35.92 
 
 		 261 aa  152  2.9999999999999998e-36  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.205736  normal  0.507807 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2018  ABC transporter related  37.33 
 
 		 238 aa  151  5.9999999999999996e-36  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003991  lipoprotein releasing system ATP-binding protein LolD  38.12 
 
 		 235 aa  151  5.9999999999999996e-36  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2361  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  35.48 
 
 		 227 aa  151  5.9999999999999996e-36  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0014315  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00596  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  33.64 
 
 		 236 aa  151  7e-36  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.820221  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0481  ABC transporter related  38.73 
 
 		 241 aa  151  8e-36  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1672  ABC transporter related  36.92 
 
 		 217 aa  151  8.999999999999999e-36  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0501975  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1542  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  33.49 
 
 		 237 aa  150  8.999999999999999e-36  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.523279  normal  0.32706 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0111  ABC transporter related  37.04 
 
 		 237 aa  149  2e-35  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0838  ABC transporter related protein  34.76 
 
 		 224 aa  149  2e-35  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6782  ABC transporter related  38.35 
 
 		 225 aa  150  2e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01531  hypothetical protein  37.62 
 
 		 235 aa  149  2e-35  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0403  ABC transporter related  38.94 
 
 		 217 aa  150  2e-35  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.784809  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0669  ABC transporter related  40 
 
 		 242 aa  149  3e-35  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6890  ABC transporter related  37.33 
 
 		 226 aa  149  3e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.430612 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0086  ABC transporter related  37.02 
 
 		 231 aa  149  3e-35  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0522946  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4388  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  35.92 
 
 		 238 aa  149  4e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0119739  normal  0.0787869 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1377  ABC transporter related  35.38 
 
 		 229 aa  149  4e-35  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0531793  normal  0.0760119 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0759  ABC transporter related  34.5 
 
 		 230 aa  148  5e-35  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0004925  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2202  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  35.45 
 
 		 227 aa  148  6e-35  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.15426 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02180  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  36.73 
 
 		 259 aa  148  6e-35  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0292  ABC transporter related  38.79 
 
 		 225 aa  148  7e-35  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0299  ABC transporter related  38.79 
 
 		 225 aa  148  7e-35  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.151141  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1534  ABC transporter related  39.34 
 
 		 217 aa  148  7e-35  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.598778  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1250  putative ATP-binding component of a transport system  33.64 
 
 		 227 aa  148  8e-35  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  3.40949e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2078  ABC transporter related  36.36 
 
 		 227 aa  147  8e-35  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.106777  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3422  ABC transporter related  34.76 
 
 		 224 aa  147  8e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1546  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  36.14 
 
 		 238 aa  147  9e-35  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0365689  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01113  outer membrane-specific lipoprotein transporter subunit  37.76 
 
 		 233 aa  147  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2073  ABC transporter related protein  35.29 
 
 		 236 aa  147  1.0000000000000001e-34  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.997021 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2206  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  37.76 
 
 		 233 aa  147  1.0000000000000001e-34  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.165489  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01121  hypothetical protein  37.76 
 
 		 233 aa  147  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2358  ABC transporter-related protein  38.07 
 
 		 225 aa  147  1.0000000000000001e-34  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.816057 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3410  ABC transporter, ATPase subunit  35.03 
 
 		 239 aa  147  1.0000000000000001e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.072759  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3826  ABC transporter related  37.02 
 
 		 225 aa  147  1.0000000000000001e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2009  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  37.76 
 
 		 233 aa  147  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.56693  normal  0.0495903 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2530  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  37.76 
 
 		 233 aa  147  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000457106  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2484  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  37.76 
 
 		 233 aa  147  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000399068  normal  0.0488273 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1239  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  37.76 
 
 		 233 aa  147  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000767258  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1701  ATPase  35.02 
 
 		 240 aa  146  2.0000000000000003e-34  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.620814 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1173  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  38.6 
 
 		 230 aa  146  2.0000000000000003e-34  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.659944  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3973  ABC transporter related protein  34.16 
 
 		 275 aa  146  2.0000000000000003e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.155103  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1239  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  37.76 
 
 		 233 aa  147  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000867827  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0286  ABC transporter ATP-binding protein  37.56 
 
 		 224 aa  146  2.0000000000000003e-34  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.441396  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2396  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  38.74 
 
 		 239 aa  146  2.0000000000000003e-34  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.261186  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0723  ABC transporter, ATP-binding protein  38.22 
 
 		 225 aa  147  2.0000000000000003e-34  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000098011  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1473  ABC transporter, ATP-binding protein  37.06 
 
 		 228 aa  147  2.0000000000000003e-34  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0349  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  33.79 
 
 		 240 aa  146  2.0000000000000003e-34  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0385  ABC transporter ATP-binding protein  34.25 
 
 		 240 aa  146  2.0000000000000003e-34  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2958  ABC transporter ATP-binding protein  39.09 
 
 		 224 aa  146  2.0000000000000003e-34  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0717892 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1497  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  37.76 
 
 		 233 aa  145  3e-34  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000137035  normal  0.884927 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6488  ABC transporter related protein  36.63 
 
 		 246 aa  146  3e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2309  ABC transporter ATP-binding protein  38.97 
 
 		 237 aa  145  4.0000000000000006e-34  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0709631  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0302  ABC transporter related protein  34.95 
 
 		 228 aa  145  4.0000000000000006e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2397  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  32.7 
 
 		 232 aa  145  4.0000000000000006e-34  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1251  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  36 
 
 		 238 aa  145  4.0000000000000006e-34  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3961  ABC transporter related  39.06 
 
 		 255 aa  145  4.0000000000000006e-34  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.538851  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2258  lipoprotein releasing system ATP-binding protein LolD  36.11 
 
 		 230 aa  145  5e-34  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2114  ABC efflux transporter, ATPase subunit  38.89 
 
 		 229 aa  145  5e-34  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2435  ABC transporter related  38.89 
 
 		 229 aa  145  5e-34  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2913  ABC transporter related  38.54 
 
 		 241 aa  145  5e-34  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1199  ABC transporter, ATP-binding protein  38.92 
 
 		 221 aa  145  5e-34  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0191254  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6499  ABC transporter related protein  37.38 
 
 		 230 aa  145  5e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3559  ABC transporter related  33.01 
 
 		 239 aa  145  6e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1739  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  37.27 
 
 		 228 aa  145  6e-34  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.221594 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1516  ABC transporter related  38.79 
 
 		 230 aa  145  6e-34  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0782  ABC lipoprotein exporter, ATPase subunit, LolD  37.33 
 
 		 226 aa  144  7.0000000000000006e-34  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.000690329  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0428  ABC transporter, ATPase subunit  35.51 
 
 		 239 aa  144  7.0000000000000006e-34  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1366  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  34.72 
 
 		 230 aa  144  7.0000000000000006e-34  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0833  ABC transporter related  39.91 
 
 		 224 aa  144  7.0000000000000006e-34  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1814  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  36.19 
 
 		 236 aa  144  7.0000000000000006e-34  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0451036  normal  0.0825777 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2210  hypothetical protein  37.63 
 
 		 227 aa  144  8.000000000000001e-34  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0612  ABC transporter related  34.85 
 
 		 228 aa  144  8.000000000000001e-34  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.0037706  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1708  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  37.17 
 
 		 234 aa  144  9e-34  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000319183  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3238  ABC transporter related  35.53 
 
 		 223 aa  144  1e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0758948  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>