More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sdel_0408 on replicon NC_013512
Organism: Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013512  Sdel_0408  ABC transporter related protein  100 
 
 		 214 aa  443  1.0000000000000001e-124  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0838  lipoprotein-releasing system ATP-binding protein LolD  58.05 
 
 		 214 aa  248  4e-65  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.19069  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1440  ABC transporter, ATP-binding protein  58.88 
 
 		 214 aa  247  9e-65  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0548  modulator of drug activity  59.8 
 
 		 214 aa  245  4e-64  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00351407  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1259  lipoprotein-releasing system ATP-binding protein LolD  56.13 
 
 		 215 aa  241  6e-63  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0312879  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1092  ABC transporter, ATP-binding protein  53.33 
 
 		 211 aa  233  2.0000000000000002e-60  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1799  ABC transporter-related protein  52.97 
 
 		 214 aa  233  2.0000000000000002e-60  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1314  ABC transporter, ATP-binding protein  55.71 
 
 		 211 aa  224  6e-58  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.24854  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0549  ABC transporter, ATP-binding protein  55.71 
 
 		 211 aa  224  6e-58  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.977002  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1195  ABC transporter, ATP-binding protein  55.24 
 
 		 211 aa  222  4e-57  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.762072  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2067  ABC transporter related  39.9 
 
 		 236 aa  158  7e-38  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.488124  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1439  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  38.81 
 
 		 236 aa  153  2e-36  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.383265  normal  0.239297 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0685  ABC transporter, ATPase protein  40.09 
 
 		 235 aa  152  4e-36  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.360664 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3452  ABC transporter related  41.05 
 
 		 228 aa  152  5e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0356163  hitchhiker  0.0000197884 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1611  SalX-type ABC antimicrobial peptide transport system ATPase  40.53 
 
 		 357 aa  152  5e-36  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6499  ABC transporter related protein  40.28 
 
 		 230 aa  150  1e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2317  ABC transporter ATP-binding protein  40.53 
 
 		 228 aa  150  2e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0467206  hitchhiker  0.0000370874 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0111  ABC transporter related  38.64 
 
 		 237 aa  150  2e-35  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0550  ABC transporter related  44 
 
 		 224 aa  148  5e-35  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0929666  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0442  ABC transporter related  39.68 
 
 		 305 aa  148  6e-35  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0818201  normal  0.869538 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1919  ABC transporter related  39.69 
 
 		 227 aa  148  6e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.000203037  hitchhiker  0.000000000000141091 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3274  ABC transporter related  41.4 
 
 		 232 aa  148  7e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.991934  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1759  ABC transporter related  39.69 
 
 		 227 aa  148  8e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0432501  hitchhiker  0.0000000000939298 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2670  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  37.16 
 
 		 233 aa  147  8e-35  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1889  ABC transporter related  41.18 
 
 		 238 aa  147  1.0000000000000001e-34  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.236618  normal  0.569597 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0723  ABC transporter, ATP-binding protein  40.11 
 
 		 225 aa  147  1.0000000000000001e-34  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000098011  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02180  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  40.3 
 
 		 259 aa  147  1.0000000000000001e-34  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27150  ABC transporter ATP-binding protein  41.3 
 
 		 227 aa  147  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.358472  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3030  ABC transporter related  39.9 
 
 		 200 aa  146  2.0000000000000003e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0284091  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3778  ABC transporter related  39.36 
 
 		 233 aa  146  2.0000000000000003e-34  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.691965  normal  0.46776 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0038  ABC transporter ATP-binding protein  40.39 
 
 		 221 aa  146  3e-34  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2115  ABC transporter related  40.48 
 
 		 236 aa  146  3e-34  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.398737  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07200  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  39.78 
 
 		 242 aa  146  3e-34  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.408967  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2599  ABC transporter related  40.32 
 
 		 232 aa  145  4.0000000000000006e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.215852  normal  0.92859 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2619  ABC transporter related  38.94 
 
 		 239 aa  145  4.0000000000000006e-34  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.512871  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2195  ABC transporter related  39.89 
 
 		 232 aa  145  4.0000000000000006e-34  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0336091  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1045  ABC transporter related  40.47 
 
 		 239 aa  145  4.0000000000000006e-34  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3192  ABC transporter related protein  37.67 
 
 		 243 aa  145  5e-34  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.110755  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2408  ABC transporter related  37.56 
 
 		 219 aa  145  6e-34  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000980681 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1672  ABC transporter related  38.14 
 
 		 217 aa  144  7.0000000000000006e-34  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0501975  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0531  ABC transporter related  38.66 
 
 		 246 aa  144  8.000000000000001e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.328993  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2897  ABC transporter related  38.24 
 
 		 246 aa  144  8.000000000000001e-34  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0555647  hitchhiker  0.000651722 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2258  lipoprotein releasing system ATP-binding protein LolD  39.02 
 
 		 230 aa  144  1e-33  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0286  ABC transporter ATP-binding protein  35.9 
 
 		 224 aa  144  1e-33  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.441396  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0428  ABC transporter, ATPase subunit  40.11 
 
 		 239 aa  144  1e-33  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0642  ABC transporter related  38.5 
 
 		 231 aa  144  1e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0483  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein LolD  38.5 
 
 		 231 aa  144  1e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4529  lipoprotein-releasing system ATP-binding protein lolD  40.32 
 
 		 233 aa  144  1e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.830407  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2567  ABC transporter related  39.49 
 
 		 249 aa  144  1e-33  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1633  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  37.07 
 
 		 233 aa  144  1e-33  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00322127  normal  0.820935 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0529  ABC transport protein  39.52 
 
 		 220 aa  144  1e-33  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.476252  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1400  ABC transporter, ATP-binding protein  39.7 
 
 		 219 aa  143  2e-33  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1608  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  36.53 
 
 		 237 aa  143  2e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.109115  normal  0.0760989 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1546  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  36.99 
 
 		 238 aa  143  2e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0365689  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1863  ABC transporter, ATPase subunit  39.78 
 
 		 232 aa  143  2e-33  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0577867  normal  0.0321889 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5419  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  37.68 
 
 		 252 aa  143  2e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.912303  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1579  ABC transporter component  39.36 
 
 		 252 aa  143  2e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.132522  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2297  ABC transporter ATP-binding protein  40.76 
 
 		 227 aa  143  2e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.101815  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2863  ABC transporter related  39.78 
 
 		 232 aa  143  2e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.479401  normal  0.429967 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2269  ABC transporter, ATP-binding protein  38.73 
 
 		 224 aa  142  3e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1123  ABC transporter related  37.21 
 
 		 243 aa  142  3e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0137163  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1211  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  37.5 
 
 		 225 aa  142  3e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2713  ABC transporter related  40.11 
 
 		 224 aa  142  3e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.889678  hitchhiker  0.0038315 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1972  ABC transporter related  37.43 
 
 		 228 aa  142  3e-33  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0086  ABC transporter related  38.76 
 
 		 231 aa  142  3e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0522946  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1178  ABC transporter related  36.49 
 
 		 220 aa  142  3e-33  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00268171  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1814  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  37.56 
 
 		 236 aa  142  4e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0451036  normal  0.0825777 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1604  ABC transporter related  38.5 
 
 		 242 aa  142  5e-33  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2810  ABC transporter related  38.5 
 
 		 230 aa  142  5e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0257216  normal  0.633294 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1661  ABC transporter related  39.49 
 
 		 247 aa  142  5e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.044489  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1813  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  39.02 
 
 		 253 aa  142  5e-33  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0357978  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1157  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  38.34 
 
 		 252 aa  141  6e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.572225  normal  0.0166271 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2270  ABC transporter related  38.5 
 
 		 250 aa  141  6e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.42707  normal  0.355714 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0285  ABC transporter related  38.14 
 
 		 246 aa  141  6e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.664514  normal  0.0597012 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2361  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  38.3 
 
 		 227 aa  142  6e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0014315  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2241  ABC transporter related  37 
 
 		 234 aa  141  7e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0103221  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0415  ABC transporter, ATPase subunit  37.93 
 
 		 240 aa  141  7e-33  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.35006  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1251  ABC transporter related  37.38 
 
 		 228 aa  141  7e-33  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.799033  normal  0.890973 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0563  ABC transporter related protein  36.79 
 
 		 233 aa  141  7e-33  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2402  ABC transporter-related protein  37.5 
 
 		 246 aa  141  7e-33  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2309  ABC transporter ATP-binding protein  35.78 
 
 		 237 aa  141  8e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0709631  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1377  ABC transporter related  37.63 
 
 		 229 aa  141  8e-33  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0531793  normal  0.0760119 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3019  ABC transporter-related protein  37.97 
 
 		 237 aa  141  9e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.364354 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3022  ABC transporter related  38.25 
 
 		 229 aa  141  9e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  decreased coverage  0.000385784  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2131  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  37.25 
 
 		 253 aa  141  9e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.099841  normal  0.052889 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5964  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  37.25 
 
 		 253 aa  141  9e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.115719  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2113  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  37.25 
 
 		 253 aa  141  9e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0436359  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3732  ABC transporter related  39 
 
 		 235 aa  141  9e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.624286  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2210  hypothetical protein  37.24 
 
 		 227 aa  140  9.999999999999999e-33  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1708  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  38.42 
 
 		 234 aa  140  9.999999999999999e-33  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000319183  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1816  ABC transporter, ATP-binding protein  37.68 
 
 		 224 aa  140  9.999999999999999e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.932395  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2913  ABC transporter related  38.5 
 
 		 241 aa  140  9.999999999999999e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2559  ABC transporter related  37.79 
 
 		 227 aa  140  9.999999999999999e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00000178082  hitchhiker  0.000000000000206732 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1733  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  38.54 
 
 		 253 aa  140  9.999999999999999e-33  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000305672  normal  0.724903 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2286  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  38.05 
 
 		 253 aa  140  9.999999999999999e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00104581  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2206  ABC transporter related  39.57 
 
 		 240 aa  140  1.9999999999999998e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3420  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  36.14 
 
 		 226 aa  140  1.9999999999999998e-32  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0399135  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2425  ABC transporter related  39.57 
 
 		 228 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05802  ABC transporter ATP-binding protein  36.32 
 
 		 233 aa  140  1.9999999999999998e-32  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3524  ABC transporter related  41.85 
 
 		 671 aa  140  1.9999999999999998e-32  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>