More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CFF8240_1440 on replicon NC_008599
Organism: Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008599  CFF8240_1440  ABC transporter, ATP-binding protein  100 
 
 
214 aa  436  1e-121  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0548  modulator of drug activity  66.82 
 
 
214 aa  290  2e-77  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00351407  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1259  lipoprotein-releasing system ATP-binding protein LolD  63.85 
 
 
215 aa  285  2.9999999999999996e-76  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0312879  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0838  lipoprotein-releasing system ATP-binding protein LolD  61.61 
 
 
214 aa  274  8e-73  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.19069  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1092  ABC transporter, ATP-binding protein  62.14 
 
 
211 aa  259  2e-68  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1799  ABC transporter-related protein  56.4 
 
 
214 aa  252  4.0000000000000004e-66  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0408  ABC transporter related protein  58.88 
 
 
214 aa  247  9e-65  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1195  ABC transporter, ATP-binding protein  58.96 
 
 
211 aa  235  5.0000000000000005e-61  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.762072  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1314  ABC transporter, ATP-binding protein  58.49 
 
 
211 aa  234  6e-61  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.24854  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0549  ABC transporter, ATP-binding protein  58.49 
 
 
211 aa  233  2.0000000000000002e-60  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.977002  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1611  SalX-type ABC antimicrobial peptide transport system ATPase  38.61 
 
 
357 aa  167  8e-41  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2067  ABC transporter related  39.91 
 
 
236 aa  163  1.0000000000000001e-39  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.488124  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07200  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  40.93 
 
 
242 aa  160  1e-38  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.408967  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1672  ABC transporter related  39.9 
 
 
217 aa  157  1e-37  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0501975  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2324  ABC transporter related  38.99 
 
 
256 aa  155  3e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.232947  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00596  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  37.32 
 
 
236 aa  155  3e-37  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.820221  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2724  ABC transporter, ATP-binding protein  42.71 
 
 
225 aa  156  3e-37  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.497191  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2670  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  36.99 
 
 
233 aa  153  1e-36  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0442  ABC transporter related  37.69 
 
 
305 aa  153  2e-36  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0818201  normal  0.869538 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02180  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  37.88 
 
 
259 aa  153  2e-36  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6782  ABC transporter related  37.61 
 
 
225 aa  152  2.9999999999999998e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1542  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  36.41 
 
 
237 aa  152  2.9999999999999998e-36  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.523279  normal  0.32706 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2286  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  36.89 
 
 
253 aa  152  2.9999999999999998e-36  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00104581  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2258  lipoprotein releasing system ATP-binding protein LolD  39.47 
 
 
230 aa  152  4e-36  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1813  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  36.89 
 
 
253 aa  152  4e-36  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0357978  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0759  ABC transporter related  36.71 
 
 
230 aa  152  5e-36  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0004925  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1733  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  36.89 
 
 
253 aa  152  5e-36  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000305672  normal  0.724903 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0086  ABC transporter related  36.45 
 
 
231 aa  151  5.9999999999999996e-36  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0522946  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1759  ABC transporter related  38.39 
 
 
227 aa  150  1e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0432501  hitchhiker  0.0000000000939298 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1633  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  35 
 
 
233 aa  150  1e-35  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00322127  normal  0.820935 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1546  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  36.95 
 
 
238 aa  150  1e-35  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0365689  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2269  ABC transporter, ATP-binding protein  37.5 
 
 
224 aa  150  2e-35  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0385  ABC transporter ATP-binding protein  38.66 
 
 
240 aa  149  2e-35  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1814  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  35.45 
 
 
236 aa  150  2e-35  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0451036  normal  0.0825777 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4410  ABC transporter related  37.06 
 
 
234 aa  150  2e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.567617  normal  0.378234 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3422  ABC transporter related  36 
 
 
224 aa  149  3e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1151  ABC transporter related  38.69 
 
 
230 aa  149  3e-35  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2155  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  37.56 
 
 
231 aa  149  3e-35  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.263413  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3744  ABC transporter related  37.62 
 
 
230 aa  149  3e-35  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.319618  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3238  ABC transporter related  37.31 
 
 
223 aa  149  4e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0758948  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0481  ABC transporter related  39.9 
 
 
241 aa  148  5e-35  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3274  ABC transporter related  39.09 
 
 
232 aa  148  5e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.991934  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1211  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  35.29 
 
 
225 aa  148  5e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0838  ABC transporter related protein  35.5 
 
 
224 aa  148  6e-35  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5553  ABC transporter related protein  36.32 
 
 
258 aa  148  6e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.48366  normal  0.985013 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0286  ABC transporter ATP-binding protein  38.27 
 
 
224 aa  148  7e-35  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.441396  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2508  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  35.15 
 
 
225 aa  148  7e-35  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.711904  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2267  ABC transporter, ATP-binding protein  39.17 
 
 
227 aa  147  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0167995  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2148  ABC transporter related  40.1 
 
 
225 aa  147  1.0000000000000001e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.357033  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2115  ABC transporter related  37.44 
 
 
236 aa  147  1.0000000000000001e-34  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.398737  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2094  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  35.91 
 
 
225 aa  147  1.0000000000000001e-34  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0980636  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2408  ABC transporter related  35.65 
 
 
219 aa  147  1.0000000000000001e-34  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000980681 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0349  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  38.14 
 
 
240 aa  147  1.0000000000000001e-34  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2508  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  37.06 
 
 
231 aa  146  2.0000000000000003e-34  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.214498  normal  0.0731118 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2403  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  37.06 
 
 
231 aa  146  2.0000000000000003e-34  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.017802  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2392  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  37.06 
 
 
231 aa  146  2.0000000000000003e-34  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000179176  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2067  ABC transporter  39.34 
 
 
227 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.168595  normal  0.288661 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1173  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  37.04 
 
 
230 aa  147  2.0000000000000003e-34  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.659944  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1955  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  37.06 
 
 
231 aa  146  2.0000000000000003e-34  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00212141  normal  0.0513198 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1567  ABC lipoprotein efflux pump, ATPase subunit  36.7 
 
 
247 aa  146  2.0000000000000003e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.37654 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1439  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  35.96 
 
 
236 aa  146  2.0000000000000003e-34  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.383265  normal  0.239297 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27150  ABC transporter ATP-binding protein  37.37 
 
 
227 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.358472  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0287  ABC transporter related  37.13 
 
 
240 aa  146  2.0000000000000003e-34  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1333  lipoprotein releasing system ATP-binding protein LolD  35.45 
 
 
229 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0369942  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2397  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  33.64 
 
 
232 aa  146  3e-34  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2023  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  37.93 
 
 
231 aa  145  3e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.488055  normal  0.290833 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2195  ABC transporter related  38.42 
 
 
232 aa  146  3e-34  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0336091  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2396  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  35.61 
 
 
239 aa  146  3e-34  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.261186  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2150  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  37.93 
 
 
252 aa  146  3e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0659015  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1179  ABC transporter related  40.51 
 
 
253 aa  146  3e-34  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.515909  normal  0.937486 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2897  ABC transporter related  35.92 
 
 
246 aa  145  4.0000000000000006e-34  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0555647  hitchhiker  0.000651722 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2297  ABC transporter ATP-binding protein  37.37 
 
 
227 aa  145  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.101815  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3778  ABC transporter related  35.68 
 
 
233 aa  145  4.0000000000000006e-34  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.691965  normal  0.46776 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2830  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  37 
 
 
231 aa  145  4.0000000000000006e-34  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0931795  normal  0.0149457 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0967  ABC transporter related  34.6 
 
 
261 aa  145  4.0000000000000006e-34  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.205736  normal  0.507807 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1377  ABC transporter related  35.78 
 
 
229 aa  145  4.0000000000000006e-34  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0531793  normal  0.0760119 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3004  ABC transporter related  37.5 
 
 
228 aa  145  5e-34  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.669488  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1393  ABC transporter related  36.41 
 
 
230 aa  145  5e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02358  ABC transporter ATP-binding subunit  36.32 
 
 
242 aa  145  5e-34  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.00000106167  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2566  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  36.7 
 
 
247 aa  145  5e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0799342  normal  0.05105 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1574  ABC transporter related  40 
 
 
225 aa  145  5e-34  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0590821  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1100  ABC transporter related  38.31 
 
 
235 aa  145  5e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1919  ABC transporter related  38.5 
 
 
227 aa  145  6e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.000203037  hitchhiker  0.000000000000141091 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2754  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  33.64 
 
 
226 aa  145  6e-34  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.662272  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0302  ABC transporter related protein  34.58 
 
 
228 aa  145  6e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3420  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  33.64 
 
 
226 aa  145  6e-34  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0399135  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1015  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  34.55 
 
 
224 aa  145  6e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.0629404 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2402  ABC transporter-related protein  35.71 
 
 
246 aa  145  6e-34  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0693  lipoprotein-releasing system ATP-binding protein  36.95 
 
 
238 aa  144  7.0000000000000006e-34  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.359  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1199  ABC transporter, ATP-binding protein  41.62 
 
 
221 aa  144  7.0000000000000006e-34  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0191254  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0723  ABC transporter, ATP-binding protein  37.19 
 
 
225 aa  144  8.000000000000001e-34  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000098011  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2238  hypothetical protein  37.5 
 
 
227 aa  144  8.000000000000001e-34  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0852  ABC transporter related protein  36.65 
 
 
240 aa  144  8.000000000000001e-34  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3231  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  36.92 
 
 
258 aa  144  8.000000000000001e-34  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.15277  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2317  ABC transporter ATP-binding protein  38 
 
 
228 aa  144  9e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0467206  hitchhiker  0.0000370874 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2210  hypothetical protein  37.5 
 
 
227 aa  144  9e-34  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3452  ABC transporter related  38 
 
 
228 aa  144  9e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0356163  hitchhiker  0.0000197884 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1400  ABC transporter, ATP-binding protein  36.36 
 
 
219 aa  144  1e-33  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4049  ABC transporter related  40.32 
 
 
250 aa  144  1e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0191001  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2429  ABC transporter related  37.06 
 
 
232 aa  144  1e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.506044  normal  0.0627468 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>