More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_0852 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013530  Xcel_0852  ABC transporter related protein  100 
 
 		 240 aa  475  1e-133  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1582  ABC transporter related protein  89.17 
 
 		 240 aa  426  1e-118  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.217269  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1589  ABC transporter related protein  75.8 
 
 		 230 aa  316  2e-85  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.11191  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3176  ABC transporter related protein  76.89 
 
 		 218 aa  305  4.0000000000000004e-82  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21600  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  55.71 
 
 		 214 aa  221  9.999999999999999e-57  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09480  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  51.9 
 
 		 221 aa  208  7e-53  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.31196  normal  0.583973 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0083  ABC transporter related  44.65 
 
 		 212 aa  175  5e-43  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.599688 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1943  ABC transporter related protein  42.13 
 
 		 288 aa  164  2.0000000000000002e-39  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.728996  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3446  ABC transporter, ATP-binding protein  39.91 
 
 		 227 aa  162  3e-39  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00000000207745  normal  0.0995359 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4410  ABC transporter related  46.49 
 
 		 234 aa  159  3e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.567617  normal  0.378234 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0838  ABC transporter related protein  41.4 
 
 		 224 aa  159  4e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6888  ABC transporter related  41.54 
 
 		 238 aa  159  5e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.228229 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2358  ABC transporter-related protein  44.1 
 
 		 225 aa  158  6e-38  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.816057 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2599  ABC transporter related  41.51 
 
 		 232 aa  157  1e-37  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.215852  normal  0.92859 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6782  ABC transporter related  47.72 
 
 		 225 aa  157  2e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2863  ABC transporter related  40.38 
 
 		 232 aa  157  2e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.479401  normal  0.429967 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2530  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  41.18 
 
 		 233 aa  155  5.0000000000000005e-37  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000457106  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1239  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  41.18 
 
 		 233 aa  155  5.0000000000000005e-37  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000867827  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2484  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  41.18 
 
 		 233 aa  155  5.0000000000000005e-37  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000399068  normal  0.0488273 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1239  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  41.18 
 
 		 233 aa  155  5.0000000000000005e-37  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000767258  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05802  ABC transporter ATP-binding protein  41.84 
 
 		 233 aa  155  5.0000000000000005e-37  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2195  ABC transporter related  43.59 
 
 		 232 aa  155  6e-37  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0336091  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3422  ABC transporter related  43.23 
 
 		 224 aa  155  6e-37  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2039  ABC transporter related  47.25 
 
 		 237 aa  155  7e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3274  ABC transporter related  42.35 
 
 		 232 aa  155  7e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.991934  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27880  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  41.45 
 
 		 235 aa  155  7e-37  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0310468  normal  0.542219 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2958  ABC transporter ATP-binding protein  43.01 
 
 		 224 aa  155  8e-37  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0717892 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1966  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  41.67 
 
 		 233 aa  154  9e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00198197  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1295  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  41.67 
 
 		 233 aa  154  9e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0289168  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1318  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  41.67 
 
 		 233 aa  154  9e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.113611  hitchhiker  0.00161216 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1333  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  41.67 
 
 		 233 aa  154  9e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00479967 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2150  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  41.67 
 
 		 233 aa  154  9e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.166466  hitchhiker  0.000506788 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01113  outer membrane-specific lipoprotein transporter subunit  40.69 
 
 		 233 aa  154  1e-36  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2206  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  40.69 
 
 		 233 aa  154  1e-36  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.165489  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0175  ABC transporter related  37.93 
 
 		 226 aa  154  1e-36  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0570775  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01121  hypothetical protein  40.69 
 
 		 233 aa  154  1e-36  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0085  ABC transporter related  43.78 
 
 		 235 aa  154  1e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4461  ABC transporter related  45.11 
 
 		 247 aa  154  1e-36  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.856819  normal  0.326534 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1456  ABC transporter related  37.99 
 
 		 256 aa  154  1e-36  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  hitchhiker  0.00934987  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4529  lipoprotein-releasing system ATP-binding protein lolD  43.08 
 
 		 233 aa  154  2e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.830407  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1026  ABC transporter related  40 
 
 		 251 aa  153  2e-36  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1366  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  45.26 
 
 		 230 aa  153  2e-36  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0286  ABC transporter ATP-binding protein  40.31 
 
 		 224 aa  154  2e-36  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.441396  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1863  ABC transporter, ATPase subunit  40.89 
 
 		 232 aa  153  2.9999999999999998e-36  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0577867  normal  0.0321889 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0723  ABC transporter, ATP-binding protein  44.21 
 
 		 225 aa  152  2.9999999999999998e-36  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000098011  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2496  ABC transporter related protein  44.95 
 
 		 244 aa  153  2.9999999999999998e-36  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2009  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  40.69 
 
 		 233 aa  152  4e-36  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.56693  normal  0.0495903 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0759  ABC transporter related  42.13 
 
 		 230 aa  152  4e-36  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0004925  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2457  ABC-type transport systems, involved in lipoprotein release, ATPase components  40.93 
 
 		 244 aa  152  4e-36  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1546  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  40.4 
 
 		 238 aa  152  5e-36  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0365689  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000167  predicted ABC-type transport system ATPase component  43.88 
 
 		 230 aa  152  5.9999999999999996e-36  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.780039  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3238  ABC transporter related  40.85 
 
 		 223 aa  151  8e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0758948  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0442  ABC transporter related  46.7 
 
 		 305 aa  151  8e-36  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0818201  normal  0.869538 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2297  ABC transporter related  39.09 
 
 		 225 aa  151  8.999999999999999e-36  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5001  ABC transporter related  39.69 
 
 		 230 aa  151  1e-35  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02358  ABC transporter ATP-binding subunit  39.05 
 
 		 242 aa  150  2e-35  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.00000106167  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2269  ABC transporter, ATP-binding protein  42.56 
 
 		 224 aa  150  2e-35  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2429  ABC transporter related  43.09 
 
 		 232 aa  150  2e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.506044  normal  0.0627468 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1497  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  40.2 
 
 		 233 aa  150  2e-35  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000137035  normal  0.884927 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2963  ABC transporter related  40.91 
 
 		 251 aa  150  2e-35  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00665747 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4146  ABC transporter related  45.6 
 
 		 234 aa  150  2e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2577  ABC transporter related  38.34 
 
 		 260 aa  149  3e-35  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.993808  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3157  ABC transporter related protein  44 
 
 		 240 aa  149  3e-35  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0896  ABC transporter, ATPase subunit  38.1 
 
 		 229 aa  149  3e-35  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00595939  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2822  ABC transporter related protein  42.52 
 
 		 234 aa  149  4e-35  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.794487  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1250  putative ATP-binding component of a transport system  41.03 
 
 		 227 aa  149  4e-35  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  3.40949e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2966  ABC transporter-like protein  44.04 
 
 		 234 aa  149  4e-35  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3761  ABC transporter related protein  42.06 
 
 		 265 aa  149  4e-35  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0776  ABC lipoprotein efflux transporter, ATPase subunit, LolD  42.86 
 
 		 224 aa  149  5e-35  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1598  ABC transporter related  38.36 
 
 		 228 aa  149  5e-35  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0073  ABC transporter related  41.55 
 
 		 237 aa  148  7e-35  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0776828 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1393  ABC transporter related  42.58 
 
 		 230 aa  148  7e-35  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0908  ABC transporter related  40 
 
 		 235 aa  148  7e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1795  ABC transporter related  44.62 
 
 		 229 aa  148  8e-35  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.219829  normal  0.943815 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2216  ABC transporter related  41.58 
 
 		 228 aa  148  8e-35  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.126053  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3478  lipoprotein releasing system ATP-binding protein LolD  38.46 
 
 		 258 aa  147  1.0000000000000001e-34  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.741929  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04770  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  42.27 
 
 		 253 aa  147  1.0000000000000001e-34  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1632  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  40 
 
 		 233 aa  147  1.0000000000000001e-34  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.961804  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1579  ABC transporter component  41.85 
 
 		 252 aa  147  1.0000000000000001e-34  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.132522  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0307  hypothetical protein  41.45 
 
 		 230 aa  147  1.0000000000000001e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1377  ABC transporter related  45.08 
 
 		 232 aa  146  2.0000000000000003e-34  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.757456  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2002  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  40.2 
 
 		 234 aa  146  2.0000000000000003e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.286552  normal  0.0212812 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1542  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  43.88 
 
 		 237 aa  147  2.0000000000000003e-34  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.523279  normal  0.32706 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1439  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  42.05 
 
 		 236 aa  146  2.0000000000000003e-34  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.383265  normal  0.239297 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0920  ABC transporter related  38.54 
 
 		 228 aa  147  2.0000000000000003e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2784  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  40.2 
 
 		 235 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0359571  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0217  ABC transporter related protein  41.26 
 
 		 234 aa  146  3e-34  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.941766  normal  0.16938 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2367  ABC transporter related  39.09 
 
 		 249 aa  146  3e-34  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0699  ABC transporter related  43.32 
 
 		 229 aa  146  3e-34  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1486  ABC transporter, ATP-binding protein  40.51 
 
 		 249 aa  146  3e-34  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1333  lipoprotein releasing system ATP-binding protein LolD  38.32 
 
 		 229 aa  146  4.0000000000000006e-34  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0369942  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1633  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  37.24 
 
 		 233 aa  145  4.0000000000000006e-34  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00322127  normal  0.820935 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2094  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  39.63 
 
 		 225 aa  145  5e-34  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0980636  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2361  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  37.44 
 
 		 227 aa  145  5e-34  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0014315  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2350  ABC transporter related protein  38.07 
 
 		 220 aa  145  5e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.575927  normal  0.731614 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1616  ABC transporter related protein  42.25 
 
 		 230 aa  145  6e-34  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1760  ABC transporter related  39.49 
 
 		 250 aa  145  6e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1073  ABC transporter related  37.06 
 
 		 231 aa  145  6e-34  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0796  ABC transporter, ATP-binding protein  38.92 
 
 		 226 aa  145  6e-34  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.109288  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0681  ABC transporter, ATP-binding protein  39.79 
 
 		 222 aa  145  7.0000000000000006e-34  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.614663 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>