More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCV52592_1259 on replicon NC_009715
Organism: Campylobacter curvus 525.92



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009715  CCV52592_1259  lipoprotein-releasing system ATP-binding protein LolD  100 
 
 		 215 aa  436  1e-121  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0312879  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0548  modulator of drug activity  79.44 
 
 		 214 aa  349  2e-95  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00351407  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0838  lipoprotein-releasing system ATP-binding protein LolD  64.79 
 
 		 214 aa  286  2e-76  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.19069  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1440  ABC transporter, ATP-binding protein  63.85 
 
 		 214 aa  285  2.9999999999999996e-76  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1092  ABC transporter, ATP-binding protein  62.32 
 
 		 211 aa  269  2e-71  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1799  ABC transporter-related protein  58.6 
 
 		 214 aa  252  2.0000000000000002e-66  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0408  ABC transporter related protein  56.13 
 
 		 214 aa  241  6e-63  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1314  ABC transporter, ATP-binding protein  60 
 
 		 211 aa  239  2e-62  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.24854  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0549  ABC transporter, ATP-binding protein  60.49 
 
 		 211 aa  239  2e-62  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.977002  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1195  ABC transporter, ATP-binding protein  60.49 
 
 		 211 aa  239  2e-62  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.762072  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1611  SalX-type ABC antimicrobial peptide transport system ATPase  41.51 
 
 		 357 aa  160  1e-38  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2754  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  37.75 
 
 		 226 aa  156  2e-37  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.662272  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3420  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  37.75 
 
 		 226 aa  156  2e-37  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0399135  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0442  ABC transporter related  39.62 
 
 		 305 aa  155  4e-37  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0818201  normal  0.869538 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1633  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  37.67 
 
 		 233 aa  155  6e-37  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00322127  normal  0.820935 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2324  ABC transporter related  40.91 
 
 		 256 aa  155  6e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.232947  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3778  ABC transporter related  39.63 
 
 		 233 aa  155  6e-37  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.691965  normal  0.46776 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02180  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  37.79 
 
 		 259 aa  154  7e-37  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1151  ABC transporter related  40.18 
 
 		 228 aa  154  1e-36  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.023193  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2067  ABC transporter related  38.99 
 
 		 236 aa  152  5e-36  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.488124  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1542  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  36.61 
 
 		 237 aa  151  5.9999999999999996e-36  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.523279  normal  0.32706 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0287  ABC transporter related  39.6 
 
 		 240 aa  151  8e-36  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5553  ABC transporter related protein  37.74 
 
 		 258 aa  151  8e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.48366  normal  0.985013 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07200  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  41.03 
 
 		 242 aa  150  2e-35  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.408967  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1250  putative ATP-binding component of a transport system  38.31 
 
 		 227 aa  149  2e-35  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  3.40949e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2397  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  36.45 
 
 		 232 aa  149  2e-35  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2361  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  35.75 
 
 		 227 aa  150  2e-35  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0014315  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32340  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  39.09 
 
 		 264 aa  149  2e-35  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.442827 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3699  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  36.76 
 
 		 230 aa  149  3e-35  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.752092 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0838  ABC transporter related protein  36 
 
 		 224 aa  149  4e-35  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0286  ABC transporter ATP-binding protein  39.02 
 
 		 224 aa  149  4e-35  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.441396  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05802  ABC transporter ATP-binding protein  40.3 
 
 		 233 aa  149  5e-35  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0385  ABC transporter ATP-binding protein  37.05 
 
 		 240 aa  148  7e-35  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2306  ABC transporter related  36.94 
 
 		 256 aa  148  7e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000206589  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7376  ABC-type antimicrobial peptide transport system ATPase component-like protein  39.2 
 
 		 280 aa  147  9e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.628473  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02358  ABC transporter ATP-binding subunit  40.3 
 
 		 242 aa  147  1.0000000000000001e-34  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.00000106167  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1672  ABC transporter related  38.69 
 
 		 217 aa  147  1.0000000000000001e-34  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0501975  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3274  ABC transporter related  39.39 
 
 		 232 aa  147  1.0000000000000001e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.991934  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1439  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  38.89 
 
 		 236 aa  147  1.0000000000000001e-34  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.383265  normal  0.239297 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3744  ABC transporter related  37.13 
 
 		 230 aa  147  1.0000000000000001e-34  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.319618  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5400  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  36.82 
 
 		 238 aa  147  1.0000000000000001e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.122098  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2599  ABC transporter related  38.38 
 
 		 232 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.215852  normal  0.92859 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3422  ABC transporter related  35.9 
 
 		 224 aa  146  2.0000000000000003e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1574  ABC transporter related  38.42 
 
 		 225 aa  146  2.0000000000000003e-34  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0590821  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2148  ABC transporter related  40.4 
 
 		 225 aa  147  2.0000000000000003e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.357033  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1015  ABC transporter related  37.5 
 
 		 228 aa  145  3e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.5301  normal  0.120325 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2628  ABC transporter related  40.8 
 
 		 241 aa  145  4.0000000000000006e-34  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1863  ABC transporter, ATPase subunit  39.9 
 
 		 232 aa  145  4.0000000000000006e-34  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0577867  normal  0.0321889 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2402  ABC transporter-related protein  39.81 
 
 		 246 aa  145  4.0000000000000006e-34  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2195  ABC transporter related  40.4 
 
 		 232 aa  145  5e-34  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0336091  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2897  ABC transporter related  40.49 
 
 		 246 aa  145  5e-34  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0555647  hitchhiker  0.000651722 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0539  ABC transporter related protein  37.9 
 
 		 227 aa  145  5e-34  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0632704  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0349  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  36.16 
 
 		 240 aa  145  6e-34  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0550  ABC transporter related  38.19 
 
 		 224 aa  145  6e-34  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0929666  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0835  ABC transporter related  36 
 
 		 235 aa  145  6e-34  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2309  ABC transporter ATP-binding protein  38.92 
 
 		 237 aa  145  7.0000000000000006e-34  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0709631  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15650  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  39.9 
 
 		 244 aa  144  8.000000000000001e-34  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0693  lipoprotein-releasing system ATP-binding protein  39.59 
 
 		 238 aa  144  9e-34  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.359  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2094  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  40 
 
 		 225 aa  144  1e-33  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0980636  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2863  ABC transporter related  37.88 
 
 		 232 aa  144  1e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.479401  normal  0.429967 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4952  ABC transporter, ATP-binding protein  36.07 
 
 		 250 aa  143  2e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4731  ABC transporter ATP-binding protein  36.07 
 
 		 250 aa  143  2e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1616  ABC transporter related protein  40.7 
 
 		 230 aa  143  2e-33  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4571  ABC transporter, ATP-binding protein  36.07 
 
 		 250 aa  143  2e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00946862  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4591  ABC transporter, ATP-binding protein  36.07 
 
 		 250 aa  143  2e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0723  ABC transporter, ATP-binding protein  38.31 
 
 		 225 aa  143  2e-33  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000098011  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0428  ABC transporter, ATPase subunit  38.24 
 
 		 239 aa  143  2e-33  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5091  ABC transporter ATP-binding protein  36.07 
 
 		 250 aa  143  2e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0198  ABC transporter related  36.87 
 
 		 251 aa  143  2e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.884369 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0086  ABC transporter related  37.11 
 
 		 233 aa  143  2e-33  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2118  ABC transporter related  39.7 
 
 		 259 aa  143  2e-33  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.36781  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0824  lipoprotein releasing system ATP-binding protein LolD  37.04 
 
 		 227 aa  142  3e-33  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.617096  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1760  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  36.99 
 
 		 226 aa  142  3e-33  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.585377  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1015  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  35.75 
 
 		 224 aa  142  3e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0629404 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0531  ABC transporter related  35.86 
 
 		 246 aa  142  3e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.328993  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3230  ABC transporter related protein  40.51 
 
 		 312 aa  142  3e-33  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.1961  normal  0.0782588 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02550  ABC transporter related  38.01 
 
 		 266 aa  142  4e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00397831  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1393  ABC transporter related  34.13 
 
 		 230 aa  142  4e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0191  ABC transporter related  35.14 
 
 		 247 aa  142  4e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00111007  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0086  ABC transporter related  37.04 
 
 		 231 aa  142  4e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0522946  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00596  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  35.43 
 
 		 236 aa  142  5e-33  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.820221  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2476  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  35.87 
 
 		 235 aa  142  5e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.637177  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1739  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  38.67 
 
 		 228 aa  142  5e-33  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.221594 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1333  lipoprotein releasing system ATP-binding protein LolD  39.8 
 
 		 229 aa  141  6e-33  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0369942  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0278  ABC transporter related protein  35.48 
 
 		 252 aa  141  7e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0818  lipoprotein releasing system ATP-binding protein LolD  36.57 
 
 		 227 aa  141  7e-33  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0458  ABC transporter related  39.34 
 
 		 288 aa  141  8e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.186138  normal  0.029508 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3255  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  35.29 
 
 		 318 aa  141  8e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0560  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbA  36.89 
 
 		 228 aa  141  9e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0759  ABC transporter related  35.41 
 
 		 230 aa  141  9e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0004925  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0570  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbA  36.89 
 
 		 228 aa  141  9e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.661781 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25580  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  36.82 
 
 		 280 aa  141  9e-33  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.470855  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3587  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  36.94 
 
 		 232 aa  141  9e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.45407 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0614  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbA  36.89 
 
 		 228 aa  141  9e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2078  ABC transporter related  35.75 
 
 		 227 aa  141  9e-33  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.106777  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0553  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbA  36.89 
 
 		 228 aa  141  9e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2155  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  36.94 
 
 		 232 aa  140  9.999999999999999e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.390667  normal  0.080358 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0009  ABC transporter related  37.24 
 
 		 241 aa  140  9.999999999999999e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.788883  hitchhiker  0.00117724 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0534  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbA  36.41 
 
 		 228 aa  140  9.999999999999999e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0775  ABC transporter related  40.1 
 
 		 236 aa  140  9.999999999999999e-33  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.159069  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>