More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHAB381_0838 on replicon NC_009714
Organism: Campylobacter hominis ATCC BAA-381



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009714  CHAB381_0838  lipoprotein-releasing system ATP-binding protein LolD  100 
 
 		 214 aa  433  1e-120  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.19069  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0548  modulator of drug activity  66.67 
 
 		 214 aa  293  1e-78  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00351407  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1259  lipoprotein-releasing system ATP-binding protein LolD  64.79 
 
 		 215 aa  286  2e-76  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0312879  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1440  ABC transporter, ATP-binding protein  61.61 
 
 		 214 aa  274  8e-73  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1092  ABC transporter, ATP-binding protein  60 
 
 		 211 aa  258  3e-68  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0408  ABC transporter related protein  58.05 
 
 		 214 aa  248  4e-65  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1799  ABC transporter-related protein  53.05 
 
 		 214 aa  245  4e-64  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0549  ABC transporter, ATP-binding protein  59.51 
 
 		 211 aa  236  1e-61  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.977002  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1314  ABC transporter, ATP-binding protein  59.51 
 
 		 211 aa  237  1e-61  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.24854  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1195  ABC transporter, ATP-binding protein  59.51 
 
 		 211 aa  236  2e-61  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.762072  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3778  ABC transporter related  36.15 
 
 		 233 aa  163  2.0000000000000002e-39  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.691965  normal  0.46776 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1611  SalX-type ABC antimicrobial peptide transport system ATPase  39.41 
 
 		 357 aa  162  4.0000000000000004e-39  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2067  ABC transporter related  41.03 
 
 		 236 aa  160  2e-38  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.488124  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3231  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  35.44 
 
 		 258 aa  159  4e-38  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.15277  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0442  ABC transporter related  37 
 
 		 305 aa  158  5e-38  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0818201  normal  0.869538 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3238  ABC transporter related  41.06 
 
 		 223 aa  158  6e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0758948  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1972  ABC transporter related  37.13 
 
 		 228 aa  157  1e-37  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1471  ABC transporter related  35.24 
 
 		 232 aa  155  4e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.827608 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02180  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  34.91 
 
 		 259 aa  155  5.0000000000000005e-37  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05802  ABC transporter ATP-binding protein  39 
 
 		 233 aa  154  1e-36  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2847  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  36.89 
 
 		 227 aa  152  2.9999999999999998e-36  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0355331  normal  0.014272 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2397  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  35 
 
 		 232 aa  152  4e-36  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2754  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  34.47 
 
 		 226 aa  152  4e-36  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.662272  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3420  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  34.47 
 
 		 226 aa  152  4e-36  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0399135  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2297  ABC transporter ATP-binding protein  37.81 
 
 		 227 aa  152  5e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.101815  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2358  ABC transporter-related protein  37.81 
 
 		 225 aa  151  5.9999999999999996e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.816057 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1841  ABC transporter related  36.02 
 
 		 226 aa  151  5.9999999999999996e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.656554  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2269  ABC transporter, ATP-binding protein  38.31 
 
 		 224 aa  151  7e-36  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2361  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  36.5 
 
 		 227 aa  151  7e-36  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0014315  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3699  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  35.29 
 
 		 230 aa  150  1e-35  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.752092 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27150  ABC transporter ATP-binding protein  38 
 
 		 227 aa  150  1e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.358472  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1759  ABC transporter related  36.63 
 
 		 227 aa  150  1e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0432501  hitchhiker  0.0000000000939298 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1695  ABC transporter, ATP-binding protein  34.88 
 
 		 227 aa  150  2e-35  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07200  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  36.22 
 
 		 242 aa  150  2e-35  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.408967  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2408  ABC transporter related  36.82 
 
 		 219 aa  150  2e-35  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000980681 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2583  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  34.88 
 
 		 249 aa  149  3e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.484423  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1473  ABC transporter, ATP-binding protein  34.88 
 
 		 249 aa  149  3e-35  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3881  ABC transporter related  36.54 
 
 		 229 aa  149  3e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.770849  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3118  ABC transporter, ATP-binding protein  34.88 
 
 		 240 aa  149  3e-35  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.793068  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2200  ABC transporter, ATP-binding protein  34.88 
 
 		 240 aa  149  3e-35  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0723  ABC transporter, ATP-binding protein  39.36 
 
 		 225 aa  149  3e-35  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000098011  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2638  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  34.88 
 
 		 249 aa  149  3e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000167  predicted ABC-type transport system ATPase component  38.5 
 
 		 230 aa  149  4e-35  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.780039  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3732  ABC transporter related  38.28 
 
 		 235 aa  149  4e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.624286  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7376  ABC-type antimicrobial peptide transport system ATPase component-like protein  35.48 
 
 		 280 aa  149  4e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.628473  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0286  ABC transporter ATP-binding protein  38.97 
 
 		 224 aa  148  6e-35  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.441396  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2317  ABC transporter ATP-binding protein  36.14 
 
 		 228 aa  147  8e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0467206  hitchhiker  0.0000370874 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2755  efflux ABC transporter ATP-binding/permease  39.11 
 
 		 678 aa  147  8e-35  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000385404  normal  0.585052 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1311  efflux ABC transporter, ATP-binding/permease protein  39.11 
 
 		 678 aa  147  8e-35  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000105037  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0838  ABC transporter related protein  33.82 
 
 		 224 aa  147  8e-35  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1151  ABC transporter related  39.45 
 
 		 228 aa  148  8e-35  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.023193  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4055  ABC transporter related  38.28 
 
 		 235 aa  148  8e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1422  ABC transporter related  39.11 
 
 		 678 aa  147  8e-35  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.155076  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2724  ABC transporter, ATP-binding protein  39.15 
 
 		 225 aa  147  9e-35  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.497191  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2067  ABC transporter  37.13 
 
 		 227 aa  147  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.168595  normal  0.288661 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3452  ABC transporter related  36.14 
 
 		 228 aa  147  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0356163  hitchhiker  0.0000197884 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2670  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  35.64 
 
 		 233 aa  147  1.0000000000000001e-34  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1542  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  34.8 
 
 		 237 aa  147  1.0000000000000001e-34  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.523279  normal  0.32706 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5419  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  34.15 
 
 		 252 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.912303  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1888  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  34.63 
 
 		 249 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2131  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  34.15 
 
 		 253 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.099841  normal  0.052889 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5964  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  34.15 
 
 		 253 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.115719  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2113  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  34.15 
 
 		 253 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0436359  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1393  ABC transporter related  34.65 
 
 		 230 aa  146  2.0000000000000003e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1919  ABC transporter related  36.14 
 
 		 227 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.000203037  hitchhiker  0.000000000000141091 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2659  ABC transporter, ATP-binding protein  37.84 
 
 		 256 aa  146  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00013766  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3255  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  34.7 
 
 		 318 aa  147  2.0000000000000003e-34  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3180  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  34.5 
 
 		 234 aa  147  2.0000000000000003e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.269698  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1211  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  33.98 
 
 		 225 aa  147  2.0000000000000003e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2897  ABC transporter related  39.69 
 
 		 246 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0555647  hitchhiker  0.000651722 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2002  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  37.5 
 
 		 234 aa  146  2.0000000000000003e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.286552  normal  0.0212812 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1567  ABC lipoprotein efflux pump, ATPase subunit  35.47 
 
 		 247 aa  146  2.0000000000000003e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.37654 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5553  ABC transporter related protein  35.29 
 
 		 258 aa  147  2.0000000000000003e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.48366  normal  0.985013 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2241  ABC transporter related  35.82 
 
 		 234 aa  145  3e-34  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0103221  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1445  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  37.56 
 
 		 247 aa  145  3e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.303456  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2748  ABC transporter, ATP-binding protein  37.84 
 
 		 256 aa  146  3e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.403092  hitchhiker  0.000000938072 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2349  ABC transporter, ATP-binding protein  37.39 
 
 		 256 aa  146  3e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0800376  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2990  hypothetical protein  36.95 
 
 		 229 aa  146  3e-34  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2850  hypothetical protein  36.95 
 
 		 229 aa  146  3e-34  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2713  ABC transporter related  36.68 
 
 		 224 aa  146  3e-34  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.889678  hitchhiker  0.0038315 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1760  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  38.42 
 
 		 226 aa  145  3e-34  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.585377  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2403  ABC transporter related  35.92 
 
 		 227 aa  145  3e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.155422  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4015  ABC transporter-like  39.8 
 
 		 227 aa  146  3e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000527031  normal  0.545183 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2566  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  35.32 
 
 		 247 aa  146  3e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0799342  normal  0.05105 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2367  ABC transporter related  38.46 
 
 		 249 aa  146  3e-34  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1157  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  34.63 
 
 		 252 aa  145  3e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.572225  normal  0.0166271 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0425  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  38.16 
 
 		 236 aa  145  3e-34  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0743  ABC transporter related  38.91 
 
 		 226 aa  146  3e-34  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2810  ABC transporter related  33.03 
 
 		 230 aa  145  3e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0257216  normal  0.633294 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2324  ABC transporter related  37.73 
 
 		 256 aa  145  4.0000000000000006e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.232947  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3422  ABC transporter related  34.16 
 
 		 224 aa  145  4.0000000000000006e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0775  ABC transporter related  36.94 
 
 		 236 aa  145  4.0000000000000006e-34  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.159069  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2383  ABC transporter, ATP-binding protein  37.39 
 
 		 256 aa  145  4.0000000000000006e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0355575  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0782  ABC lipoprotein exporter, ATPase subunit, LolD  38.28 
 
 		 226 aa  145  4.0000000000000006e-34  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.000690329  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2508  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  35.78 
 
 		 225 aa  145  4.0000000000000006e-34  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.711904  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0009  ABC transporter related protein  39.18 
 
 		 233 aa  145  4.0000000000000006e-34  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2094  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  37.8 
 
 		 225 aa  145  4.0000000000000006e-34  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0980636  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1439  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  35.58 
 
 		 236 aa  145  4.0000000000000006e-34  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.383265  normal  0.239297 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2267  ABC transporter, ATP-binding protein  36.63 
 
 		 227 aa  145  5e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0167995  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0097  macrolide-specific ABC-type efflux carrier MacB  39.3 
 
 		 668 aa  145  5e-34  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>