More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_6169 on replicon NC_010625
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010625  Bphy_6169  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 
256 aa  523  1e-147  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00695804 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2595  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  71.95 
 
 
254 aa  359  3e-98  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1241  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  71.14 
 
 
262 aa  353  1e-96  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.675718  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2567  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  70.73 
 
 
251 aa  351  8e-96  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00491372 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1788  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  68.58 
 
 
256 aa  316  2e-85  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.560112  normal  0.613587 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1977  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  66 
 
 
251 aa  317  2e-85  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00188878  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2987  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  65.99 
 
 
254 aa  313  9.999999999999999e-85  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.152214  normal  0.164805 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4710  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  58.14 
 
 
258 aa  300  1e-80  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.549149  normal  0.0208806 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3017  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  58.94 
 
 
250 aa  291  5e-78  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2466  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  58.13 
 
 
252 aa  290  2e-77  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.03083  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3587  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  58.54 
 
 
254 aa  289  3e-77  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.302231 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0876  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  57.6 
 
 
255 aa  288  8e-77  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.389264  normal  0.105725 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5978  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  55.78 
 
 
254 aa  286  2.9999999999999996e-76  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.161271  normal  0.813705 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2398  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  60.08 
 
 
249 aa  284  1.0000000000000001e-75  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2214  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  55.38 
 
 
254 aa  284  1.0000000000000001e-75  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.823927  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0616  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  59.68 
 
 
249 aa  278  4e-74  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.395016  normal  0.753333 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2235  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  56.45 
 
 
254 aa  278  7e-74  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.225457 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5601  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  56.57 
 
 
252 aa  278  9e-74  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3222  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  56.05 
 
 
253 aa  275  5e-73  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.916878 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5277  putative oxidoreductase  56.1 
 
 
251 aa  274  1.0000000000000001e-72  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.241792  normal  0.218182 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3165  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  55.28 
 
 
256 aa  274  1.0000000000000001e-72  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.234214  normal  0.520266 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2306  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  55.87 
 
 
253 aa  271  9e-72  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4180  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  54.66 
 
 
253 aa  270  2e-71  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2039  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  53.91 
 
 
250 aa  266  2e-70  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.664052 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1762  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  54.25 
 
 
252 aa  265  4e-70  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1960  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  53.66 
 
 
250 aa  262  3e-69  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.223206  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1554  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.36 
 
 
253 aa  261  6e-69  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.135569  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4852  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  55.28 
 
 
247 aa  260  2e-68  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.657394  normal  0.213318 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4376  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  55.28 
 
 
249 aa  260  2e-68  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.563003  normal  0.263695 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4260  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  56.1 
 
 
249 aa  260  2e-68  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2234  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  53.39 
 
 
254 aa  256  3e-67  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3884  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  54.66 
 
 
249 aa  250  1e-65  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.137189 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1981  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  56.08 
 
 
253 aa  249  3e-65  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00793153 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3100  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  52 
 
 
245 aa  247  1e-64  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.135621  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0841  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50.99 
 
 
254 aa  246  2e-64  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.327041  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1229  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  52.61 
 
 
252 aa  243  1.9999999999999999e-63  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.117991  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4031  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  53.85 
 
 
252 aa  243  3e-63  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.282406 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4326  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  52.71 
 
 
258 aa  241  7e-63  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0814456 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4216  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  52.23 
 
 
252 aa  238  5e-62  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.746291 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4500  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.41 
 
 
252 aa  238  9e-62  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6080  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  52.21 
 
 
252 aa  236  3e-61  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.952753 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1719  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50 
 
 
251 aa  235  5.0000000000000005e-61  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1708  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  48.61 
 
 
252 aa  235  6e-61  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0406387  normal  0.0847343 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4948  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.81 
 
 
252 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4042  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.01 
 
 
252 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.782191 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3212  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.81 
 
 
252 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4012  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49 
 
 
252 aa  231  7.000000000000001e-60  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.448835 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6377  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.41 
 
 
252 aa  231  8.000000000000001e-60  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.185899  normal  0.130679 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3755  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  53.17 
 
 
252 aa  230  2e-59  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5691  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  53.17 
 
 
252 aa  230  2e-59  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0367815 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4613  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  53.17 
 
 
252 aa  230  2e-59  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0226666 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4392  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  52.89 
 
 
251 aa  224  9e-58  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.276744  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3192  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.9 
 
 
257 aa  220  1.9999999999999999e-56  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2754  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50.61 
 
 
245 aa  219  1.9999999999999999e-56  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2234  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  53.25 
 
 
254 aa  217  2e-55  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  decreased coverage  0.00670227  normal  0.180357 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1493  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  45.16 
 
 
247 aa  213  1.9999999999999998e-54  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.517658 
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_35637  predicted protein  48.4 
 
 
635 aa  203  3e-51  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2849  short-chain dehydrogenase/reductase  46.64 
 
 
243 aa  200  1.9999999999999998e-50  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.154596  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3411  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.42 
 
 
259 aa  198  7e-50  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB01810  conserved hypothetical protein  40.08 
 
 
259 aa  189  4e-47  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0846  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.61 
 
 
247 aa  185  5e-46  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.140408 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1300  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.47 
 
 
262 aa  113  3e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1601  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  34.98 
 
 
246 aa  112  4.0000000000000004e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0250629  normal  0.870822 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2353  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.7 
 
 
260 aa  112  4.0000000000000004e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.108288  normal  0.0726815 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8333  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.03 
 
 
257 aa  112  6e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.319832  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1584  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.27 
 
 
264 aa  111  1.0000000000000001e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.296993 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2639  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.89 
 
 
238 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.37123  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0541  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40 
 
 
251 aa  109  3e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5557  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.51 
 
 
272 aa  110  3e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0455  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.84 
 
 
269 aa  110  3e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1352  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.98 
 
 
282 aa  109  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.316546  normal  0.241504 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0818  short chain dehydrogenase  38.42 
 
 
242 aa  109  5e-23  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2317  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.35 
 
 
263 aa  108  6e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.49068  normal  0.325129 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2751  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.12 
 
 
252 aa  108  7.000000000000001e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.995251  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3801  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.24 
 
 
251 aa  108  7.000000000000001e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  hitchhiker  0.00700482  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4853  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.76 
 
 
248 aa  107  1e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.154391  normal  0.241568 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0974  acetoin reductase  35.75 
 
 
253 aa  108  1e-22  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1552  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.45 
 
 
248 aa  108  1e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0714452  normal 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4841  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.38 
 
 
258 aa  108  1e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.166683  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4257  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.34 
 
 
262 aa  107  2e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0797349  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2618  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.96 
 
 
255 aa  107  2e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1562  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.5 
 
 
275 aa  107  3e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0498761  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2410  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.89 
 
 
255 aa  107  3e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2368  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.87 
 
 
274 aa  106  3e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.448097 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4929  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.33 
 
 
270 aa  107  3e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.212781  normal  0.926969 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2367  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.92 
 
 
272 aa  106  4e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.264463 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1449  acetoin reductase  33.99 
 
 
257 aa  106  4e-22  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000100161  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0373  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  31.84 
 
 
272 aa  105  6e-22  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2059  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.71 
 
 
252 aa  105  8e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2737  acetoin dehydrogenase  36.55 
 
 
257 aa  104  1e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2434  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.33 
 
 
252 aa  104  1e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000391653  normal  0.106705 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1007  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.74 
 
 
245 aa  104  1e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.553727  normal  0.0273902 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2394  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.33 
 
 
270 aa  104  1e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.883346  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2192  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.63 
 
 
256 aa  103  2e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0046226 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4158  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.84 
 
 
262 aa  104  2e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.526951  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1833  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.75 
 
 
263 aa  103  3e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.50771  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3123  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  37.06 
 
 
251 aa  103  3e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0932491  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6893  putative 3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  36.92 
 
 
266 aa  103  3e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  hitchhiker  0.00227102  normal  0.0503904 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5457  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.11 
 
 
285 aa  103  4e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00217132 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5225  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.54 
 
 
257 aa  103  4e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>