More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_0846 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007802  Jann_0846  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 
247 aa  502  1e-141  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.140408 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3100  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  61.73 
 
 
245 aa  293  3e-78  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.135621  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2849  short-chain dehydrogenase/reductase  58.33 
 
 
243 aa  275  5e-73  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.154596  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2754  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  57.26 
 
 
245 aa  256  2e-67  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4376  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  52.63 
 
 
249 aa  245  4e-64  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.563003  normal  0.263695 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4852  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  52.63 
 
 
247 aa  243  1.9999999999999999e-63  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.657394  normal  0.213318 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1719  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.63 
 
 
251 aa  242  3.9999999999999997e-63  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4260  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  52.23 
 
 
249 aa  242  3.9999999999999997e-63  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4710  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  53.17 
 
 
258 aa  242  5e-63  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.549149  normal  0.0208806 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1960  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  52.85 
 
 
250 aa  239  2e-62  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.223206  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3192  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.63 
 
 
257 aa  238  8e-62  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3411  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50.2 
 
 
259 aa  234  1.0000000000000001e-60  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5601  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.59 
 
 
252 aa  233  2.0000000000000002e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2306  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50.39 
 
 
253 aa  229  3e-59  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1241  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.4 
 
 
262 aa  229  3e-59  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.675718  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3017  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.01 
 
 
250 aa  228  7e-59  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2567  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49 
 
 
251 aa  226  2e-58  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00491372 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5978  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.22 
 
 
254 aa  226  4e-58  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.161271  normal  0.813705 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3587  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.8 
 
 
254 aa  226  4e-58  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.302231 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4180  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.22 
 
 
253 aa  224  8e-58  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1762  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.8 
 
 
252 aa  222  4e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2214  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.45 
 
 
254 aa  221  6e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.823927  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2987  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49 
 
 
254 aa  218  8.999999999999998e-56  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.152214  normal  0.164805 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1554  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.14 
 
 
253 aa  218  8.999999999999998e-56  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.135569  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2398  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.61 
 
 
249 aa  216  2e-55  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1977  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.24 
 
 
251 aa  216  2.9999999999999998e-55  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00188878  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4500  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.18 
 
 
252 aa  216  4e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1981  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50.99 
 
 
253 aa  215  5e-55  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00793153 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3884  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.99 
 
 
249 aa  214  9.999999999999999e-55  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.137189 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4042  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.15 
 
 
252 aa  213  1.9999999999999998e-54  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.782191 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2595  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.64 
 
 
254 aa  213  1.9999999999999998e-54  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2234  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.61 
 
 
254 aa  211  1e-53  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4392  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  52.23 
 
 
251 aa  210  2e-53  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.276744  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1229  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.83 
 
 
252 aa  209  3e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.117991  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2039  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.45 
 
 
250 aa  209  4e-53  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.664052 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0876  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.01 
 
 
255 aa  209  5e-53  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.389264  normal  0.105725 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0616  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.18 
 
 
249 aa  208  8e-53  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.395016  normal  0.753333 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0841  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.2 
 
 
254 aa  208  8e-53  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.327041  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6169  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.61 
 
 
256 aa  207  2e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00695804 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4216  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.56 
 
 
252 aa  203  2e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.746291 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6377  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.62 
 
 
252 aa  203  3e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.185899  normal  0.130679 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2466  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.1 
 
 
252 aa  202  4e-51  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.03083  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5691  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.22 
 
 
252 aa  202  5e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0367815 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5277  putative oxidoreductase  44.49 
 
 
251 aa  202  5e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.241792  normal  0.218182 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3755  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.22 
 
 
252 aa  202  5e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4613  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.22 
 
 
252 aa  202  5e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0226666 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1708  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  45.7 
 
 
252 aa  201  6e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0406387  normal  0.0847343 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3165  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.27 
 
 
256 aa  201  9e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.234214  normal  0.520266 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6080  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.22 
 
 
252 aa  200  1.9999999999999998e-50  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.952753 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4012  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.88 
 
 
252 aa  200  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.448835 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4031  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.77 
 
 
252 aa  199  3.9999999999999996e-50  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.282406 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4948  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.7 
 
 
252 aa  198  7.999999999999999e-50  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3212  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.7 
 
 
252 aa  198  7.999999999999999e-50  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2235  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.22 
 
 
254 aa  197  2.0000000000000003e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.225457 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1493  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  44.49 
 
 
247 aa  195  5.000000000000001e-49  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.517658 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3222  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.75 
 
 
253 aa  194  9e-49  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.916878 
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_35637  predicted protein  42.4 
 
 
635 aa  190  2e-47  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1788  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.02 
 
 
256 aa  186  3e-46  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.560112  normal  0.613587 
 
 
-
 
NC_006684  CNB01810  conserved hypothetical protein  39.45 
 
 
259 aa  167  1e-40  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4326  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.55 
 
 
258 aa  167  2e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0814456 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2234  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.41 
 
 
254 aa  166  4e-40  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  decreased coverage  0.00670227  normal  0.180357 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1117  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.22 
 
 
233 aa  118  9.999999999999999e-26  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.000000223483  normal  0.996665 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1080  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  34.33 
 
 
246 aa  116  3.9999999999999997e-25  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.38691  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2186  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.68 
 
 
248 aa  115  7.999999999999999e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0361624 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2067  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.29 
 
 
246 aa  115  8.999999999999998e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1122  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  34.33 
 
 
246 aa  114  1.0000000000000001e-24  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0726405  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1803  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.84 
 
 
262 aa  111  9e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.225984 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3801  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.47 
 
 
251 aa  109  4.0000000000000004e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  hitchhiker  0.00700482  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0488  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.26 
 
 
261 aa  109  5e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2759  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.23 
 
 
261 aa  109  5e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2517  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.56 
 
 
257 aa  108  1e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.401645  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2536  short chain dehydrogenase  35.24 
 
 
241 aa  107  2e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1178  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.14 
 
 
262 aa  107  2e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0026  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.22 
 
 
269 aa  107  2e-22  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1552  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.78 
 
 
248 aa  107  2e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0714452  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2637  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.19 
 
 
249 aa  106  3e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2816  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  32.91 
 
 
257 aa  105  5e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6893  putative 3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  38.64 
 
 
266 aa  105  5e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  hitchhiker  0.00227102  normal  0.0503904 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3438  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  34.95 
 
 
252 aa  104  1e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3329  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  35.35 
 
 
260 aa  103  2e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4660  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.18 
 
 
261 aa  103  2e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.268545  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3453  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.68 
 
 
267 aa  103  2e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.282255  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1528  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.52 
 
 
286 aa  103  2e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0921038  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3310  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.22 
 
 
276 aa  103  2e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4853  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.84 
 
 
248 aa  103  3e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.154391  normal  0.241568 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1352  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.33 
 
 
282 aa  103  3e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.316546  normal  0.241504 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1171  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.98 
 
 
238 aa  102  4e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.399765 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0066  dehydrogenase/reductase  39.88 
 
 
252 aa  102  4e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000301861 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0979  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.41 
 
 
254 aa  102  4e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.495407 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2306  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.51 
 
 
284 aa  102  4e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.361211  hitchhiker  0.00000740353 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2798  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.08 
 
 
235 aa  102  4e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0943  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.47 
 
 
293 aa  102  5e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6801  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.99 
 
 
263 aa  102  6e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0053445  hitchhiker  0.00000000168997 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0925  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  34.92 
 
 
251 aa  102  6e-21  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.568448  n/a   
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3972  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  33.33 
 
 
263 aa  102  7e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4257  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.15 
 
 
262 aa  102  7e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0797349  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6378  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.1 
 
 
280 aa  102  7e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3652  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.35 
 
 
269 aa  102  7e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.368434  normal  0.604753 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2629  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.9 
 
 
317 aa  102  8e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2411  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  31.4 
 
 
260 aa  102  8e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.520745  normal  0.812558 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>