More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNB01810 on replicon NC_006684
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006684  CNB01810  conserved hypothetical protein  100 
 
 
259 aa  533  1e-150  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5978  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.84 
 
 
254 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.161271  normal  0.813705 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4710  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.1 
 
 
258 aa  226  3e-58  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.549149  normal  0.0208806 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3017  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.66 
 
 
250 aa  224  8e-58  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4180  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45 
 
 
253 aa  224  1e-57  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5277  putative oxidoreductase  45.14 
 
 
251 aa  223  2e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.241792  normal  0.218182 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2306  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.01 
 
 
253 aa  223  3e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2214  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.51 
 
 
254 aa  221  8e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.823927  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2398  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.92 
 
 
249 aa  221  9e-57  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0876  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.97 
 
 
255 aa  221  9.999999999999999e-57  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.389264  normal  0.105725 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3884  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.19 
 
 
249 aa  220  1.9999999999999999e-56  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.137189 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0616  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.3 
 
 
249 aa  219  3e-56  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.395016  normal  0.753333 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3165  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.97 
 
 
256 aa  219  3e-56  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.234214  normal  0.520266 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2595  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.92 
 
 
254 aa  218  1e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3587  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.27 
 
 
254 aa  217  1e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.302231 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1708  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  44.79 
 
 
252 aa  214  8e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0406387  normal  0.0847343 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2567  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.64 
 
 
251 aa  214  9.999999999999999e-55  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00491372 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4031  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.33 
 
 
252 aa  213  1.9999999999999998e-54  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.282406 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1762  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.47 
 
 
252 aa  213  2.9999999999999995e-54  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2466  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.41 
 
 
252 aa  212  3.9999999999999995e-54  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.03083  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1241  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.25 
 
 
262 aa  211  5.999999999999999e-54  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.675718  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0841  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.19 
 
 
254 aa  211  7e-54  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.327041  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4012  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.41 
 
 
252 aa  210  2e-53  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.448835 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2039  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.69 
 
 
250 aa  209  3e-53  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.664052 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1554  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.21 
 
 
253 aa  209  3e-53  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.135569  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3222  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.75 
 
 
253 aa  209  4e-53  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.916878 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2234  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.53 
 
 
254 aa  209  5e-53  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2235  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.08 
 
 
254 aa  209  5e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.225457 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4042  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.79 
 
 
252 aa  208  6e-53  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.782191 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4216  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.21 
 
 
252 aa  208  7e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.746291 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3192  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.31 
 
 
257 aa  207  1e-52  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1229  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.41 
 
 
252 aa  207  1e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.117991  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5601  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.97 
 
 
252 aa  206  4e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4500  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.77 
 
 
252 aa  205  5e-52  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1977  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.91 
 
 
251 aa  202  4e-51  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00188878  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4260  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.86 
 
 
249 aa  202  5e-51  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2987  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.62 
 
 
254 aa  201  9.999999999999999e-51  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.152214  normal  0.164805 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4326  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.17 
 
 
258 aa  199  3e-50  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0814456 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3411  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.69 
 
 
259 aa  199  3.9999999999999996e-50  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4852  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.18 
 
 
247 aa  199  5e-50  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.657394  normal  0.213318 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4376  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.47 
 
 
249 aa  198  7.999999999999999e-50  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.563003  normal  0.263695 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1788  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.13 
 
 
256 aa  197  1.0000000000000001e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.560112  normal  0.613587 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5691  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.09 
 
 
252 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0367815 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1493  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  42.64 
 
 
247 aa  197  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.517658 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3755  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.09 
 
 
252 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1960  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.15 
 
 
250 aa  196  2.0000000000000003e-49  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.223206  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4613  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.09 
 
 
252 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0226666 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6377  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.35 
 
 
252 aa  193  2e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.185899  normal  0.130679 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1719  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.19 
 
 
251 aa  192  4e-48  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4948  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.11 
 
 
252 aa  191  1e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3212  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.11 
 
 
252 aa  191  1e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6169  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.08 
 
 
256 aa  189  5e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00695804 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4392  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.33 
 
 
251 aa  188  7e-47  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.276744  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2754  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.25 
 
 
245 aa  188  8e-47  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_35637  predicted protein  40.7 
 
 
635 aa  188  8e-47  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6080  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.02 
 
 
252 aa  187  2e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.952753 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1981  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.91 
 
 
253 aa  181  1e-44  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00793153 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2234  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.91 
 
 
254 aa  172  5.999999999999999e-42  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  decreased coverage  0.00670227  normal  0.180357 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2849  short-chain dehydrogenase/reductase  41.73 
 
 
243 aa  162  5.0000000000000005e-39  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.154596  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3100  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.04 
 
 
245 aa  161  1e-38  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.135621  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0846  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.28 
 
 
247 aa  150  2e-35  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.140408 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0373  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  34.5 
 
 
272 aa  111  9e-24  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6656  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.06 
 
 
249 aa  105  1e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.790867  normal  0.270985 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2044  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  34.36 
 
 
242 aa  100  3e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.252391  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1819  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  34.36 
 
 
242 aa  100  3e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1793  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  34.36 
 
 
242 aa  100  3e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.512815  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1775  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  34.36 
 
 
242 aa  100  3e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0109  short chain dehydrogenase  33.01 
 
 
251 aa  100  3e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3364  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  34.36 
 
 
239 aa  100  3e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.115947  hitchhiker  0.00000000000000894376 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1958  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  34.36 
 
 
242 aa  100  3e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2065  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  34.36 
 
 
239 aa  100  3e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000861938  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1995  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  34.36 
 
 
239 aa  100  3e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.591310000000001e-44 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1964  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  34.36 
 
 
239 aa  100  3e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.130885  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1704  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.33 
 
 
327 aa  99  6e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.151565  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2033  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.26 
 
 
270 aa  99  7e-20  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1826  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  33.85 
 
 
239 aa  98.6  9e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2719  short chain dehydrogenase family protein  31.82 
 
 
273 aa  98.2  1e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.272681  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1494  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  33.85 
 
 
239 aa  98.2  1e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000128809  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3769  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.2 
 
 
247 aa  97.8  2e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7039  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.34 
 
 
258 aa  96.7  3e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.607221 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2512  3-oxoacyl-(acyl-carrier protein) reductase  33.87 
 
 
236 aa  95.9  5e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0588198  normal  0.237046 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2681  short chain dehydrogenase family protein  31.82 
 
 
273 aa  95.5  8e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00380586  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2186  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.93 
 
 
248 aa  95.5  8e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0361624 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0516  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.67 
 
 
249 aa  95.5  8e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.875683  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2238  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.88 
 
 
317 aa  95.1  1e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6708  glucose 1-dehydrogenase  31.5 
 
 
277 aa  94.7  1e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0307985 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0541  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.8 
 
 
251 aa  94  2e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4194  short chain dehydrogenase  35.05 
 
 
253 aa  93.2  3e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.896625 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0264  putative short-chain dehydrogenase  28.87 
 
 
262 aa  93.6  3e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0301  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.5 
 
 
305 aa  93.2  4e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0783167 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2971  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.04 
 
 
254 aa  92.8  5e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2499  short chain dehydrogenase  31.12 
 
 
272 aa  92.8  5e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.496805  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2549  short chain dehydrogenase  31.12 
 
 
272 aa  92.8  5e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3968  short chain dehydrogenase  31.13 
 
 
269 aa  92.4  6e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0231224  normal  0.018096 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1839  glucose 1-dehydrogenase  29.24 
 
 
263 aa  92.4  7e-18  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0372378  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0380  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.96 
 
 
266 aa  92.4  7e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.461648 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0159  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.04 
 
 
253 aa  92  8e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.501988  normal 
 
 
-
 
NC_011693  PHATRDRAFT_16295  predicted protein  33 
 
 
237 aa  92  8e-18  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0303319  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1575  short chain dehydrogenase  32.83 
 
 
249 aa  92  9e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2784  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  34.04 
 
 
254 aa  91.3  1e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.330689  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>