More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_6708 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009485  BBta_6708  glucose 1-dehydrogenase  100 
 
 
277 aa  561  1.0000000000000001e-159  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0307985 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2033  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  53.18 
 
 
270 aa  277  2e-73  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1863  glucose 1-dehydrogenase  50 
 
 
269 aa  270  2.9999999999999997e-71  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1811  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50.94 
 
 
268 aa  261  1e-68  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.271129  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2603  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.49 
 
 
272 aa  240  1e-62  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3932  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.25 
 
 
268 aa  241  1e-62  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0840  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.55 
 
 
266 aa  229  4e-59  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.551106  normal  0.267139 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3132  glucose-1-dehydrogenase  43.51 
 
 
261 aa  226  2e-58  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4858  glucose-1-dehydrogenase  43.46 
 
 
261 aa  221  9.999999999999999e-57  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4834  glucose-1-dehydrogenase  43.08 
 
 
261 aa  220  1.9999999999999999e-56  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4448  glucose-1-dehydrogenase  43.08 
 
 
261 aa  219  3e-56  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4852  glucose-1-dehydrogenase  43.08 
 
 
261 aa  219  3e-56  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4612  glucose-1-dehydrogenase  43.08 
 
 
261 aa  219  5e-56  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.548081  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4968  glucose-1-dehydrogenase  43.08 
 
 
261 aa  219  5e-56  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.188198  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4466  glucose-1-dehydrogenase  42.69 
 
 
261 aa  218  7e-56  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4828  glucose-1-dehydrogenase  42.69 
 
 
261 aa  218  7.999999999999999e-56  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4547  glucose-1-dehydrogenase  42.69 
 
 
261 aa  218  8.999999999999998e-56  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0408  glucose-1-dehydrogenase  42.69 
 
 
261 aa  217  1e-55  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0368  glucose-1-dehydrogenase  41.54 
 
 
261 aa  207  1e-52  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0342914  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4436  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.22 
 
 
265 aa  199  5e-50  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1573  3-oxoacyl-(acyl-carrier protein) reductase  40.31 
 
 
266 aa  192  4e-48  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.647658  normal  0.48808 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0198  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.77 
 
 
261 aa  185  5e-46  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.499955 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0357  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.36 
 
 
285 aa  181  2e-44  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.772817 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3349  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.91 
 
 
287 aa  177  2e-43  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.426721  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1228  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.94 
 
 
272 aa  176  4e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.178031  hitchhiker  0.00135629 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2303  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.93 
 
 
269 aa  176  5e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00148918 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1661  glucose 1-dehydrogenase  35.42 
 
 
268 aa  176  5e-43  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.218295  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3817  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  38.19 
 
 
247 aa  174  9.999999999999999e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000217117  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3136  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.17 
 
 
269 aa  170  3e-41  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1156  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  40.16 
 
 
248 aa  169  5e-41  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000536759  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1972  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  36.22 
 
 
247 aa  168  9e-41  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2119  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.55 
 
 
257 aa  167  1e-40  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1182  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.47 
 
 
263 aa  166  2.9999999999999998e-40  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0943  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  37.8 
 
 
246 aa  166  4e-40  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000752112  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05161  3-oxoacyl-[acyl-carrier protein] reductase  36.08 
 
 
249 aa  166  4e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.426884  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2361  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.57 
 
 
258 aa  165  6.9999999999999995e-40  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.11166  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3438  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  36.15 
 
 
252 aa  165  8e-40  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1839  glucose 1-dehydrogenase  33.85 
 
 
263 aa  164  1.0000000000000001e-39  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0372378  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3207  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  35.69 
 
 
246 aa  164  1.0000000000000001e-39  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.819769  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2225  glucose 1-dehydrogenase, putative  39.69 
 
 
261 aa  163  3e-39  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1879  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.69 
 
 
261 aa  163  3e-39  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.828765 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1097  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  38.25 
 
 
247 aa  162  4.0000000000000004e-39  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.00000000264481  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2520  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.32 
 
 
271 aa  162  6e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.40299  normal  0.0331692 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1381  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  38.89 
 
 
248 aa  162  7e-39  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.049098  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1857  glucose 1-dehydrogenase, putative  39.31 
 
 
261 aa  162  8.000000000000001e-39  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.637675  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1535  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.31 
 
 
261 aa  162  8.000000000000001e-39  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0579067  normal  0.028281 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1785  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  35.69 
 
 
250 aa  161  1e-38  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0012  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  36.86 
 
 
248 aa  161  1e-38  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0635  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.65 
 
 
259 aa  161  1e-38  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.191846 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2723  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.45 
 
 
251 aa  160  2e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1554  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.24 
 
 
270 aa  160  2e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.763501 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1326  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  35.83 
 
 
246 aa  160  2e-38  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2582  short chain dehydrogenase  41.89 
 
 
269 aa  160  2e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05081  3-oxoacyl-[acyl-carrier protein] reductase  35.69 
 
 
250 aa  160  2e-38  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.162194 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0453  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  34.9 
 
 
249 aa  160  3e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.465318  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4265  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  34.51 
 
 
250 aa  160  3e-38  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3509  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.28 
 
 
255 aa  160  3e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1837  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.13 
 
 
258 aa  160  3e-38  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00311801  normal  0.334735 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4325  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  34.51 
 
 
250 aa  160  3e-38  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00118279  normal  0.0328571 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2084  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  38.31 
 
 
250 aa  160  3e-38  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000558768  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1089  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.61 
 
 
259 aa  159  4e-38  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0332234  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05091  3-oxoacyl-[acyl-carrier protein] reductase  34.9 
 
 
249 aa  159  5e-38  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1290  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  35.74 
 
 
246 aa  159  7e-38  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.756389  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1315  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  35.74 
 
 
246 aa  159  7e-38  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1138  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  35.04 
 
 
246 aa  158  7e-38  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.697899  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0987  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  36.22 
 
 
250 aa  158  8e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.348394  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2992  short chain dehydrogenase  40.66 
 
 
269 aa  158  1e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04781  3-oxoacyl-[acyl-carrier protein] reductase  34.51 
 
 
249 aa  158  1e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2753  short chain dehydrogenase  41.42 
 
 
265 aa  156  3e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.26681  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0947  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.5 
 
 
269 aa  156  3e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0109  short chain dehydrogenase  38.43 
 
 
251 aa  156  4e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1088  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  35.69 
 
 
250 aa  156  4e-37  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.885603  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0551  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.5 
 
 
259 aa  156  4e-37  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0259011  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0533  short chain dehydrogenase  38.02 
 
 
257 aa  155  5.0000000000000005e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1352  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.55 
 
 
282 aa  155  6e-37  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.316546  normal  0.241504 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0684  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  38.82 
 
 
249 aa  155  8e-37  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1531  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  37.5 
 
 
249 aa  155  1e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.356437 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1110  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  37.11 
 
 
246 aa  154  1e-36  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05466  dehydrogenase oxidoreductase protein  38.93 
 
 
255 aa  154  2e-36  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.968817  normal  0.104137 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1552  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.16 
 
 
248 aa  154  2e-36  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0714452  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2492  oxidoreductase, short-chain dehydrogenase/reductase family  38.15 
 
 
266 aa  154  2e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1782  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  34.51 
 
 
244 aa  154  2e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.788783  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0661  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.04 
 
 
259 aa  154  2e-36  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.965402  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3764  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  34.62 
 
 
251 aa  154  2e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000212417  normal  0.0482294 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1060  3-oxoacyl-acyl carrier protein reductase  35.29 
 
 
250 aa  153  2e-36  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000409861  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1081  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  33.07 
 
 
246 aa  154  2e-36  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.46401  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1277  3-oxoacyl-acyl carrier protein reductase  34.9 
 
 
247 aa  153  2.9999999999999998e-36  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.038158  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2089  putative polyketide synthase  39 
 
 
2338 aa  153  2.9999999999999998e-36  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2380  putative polyketide synthase  39 
 
 
2287 aa  153  2.9999999999999998e-36  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1584  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.13 
 
 
264 aa  153  2.9999999999999998e-36  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.296993 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2848  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  33.85 
 
 
246 aa  152  4e-36  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2297  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.48 
 
 
266 aa  152  4e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.844738  decreased coverage  0.0000370278 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4047  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  37.35 
 
 
249 aa  152  4e-36  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1020  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  36.72 
 
 
246 aa  152  4e-36  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0122832  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3147  putative polyketide synthase  39 
 
 
2258 aa  152  4e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0346  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.25 
 
 
256 aa  152  4e-36  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0244456  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1840  glucose 1-dehydrogenase  37.17 
 
 
266 aa  152  5e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.714483  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0979  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.65 
 
 
246 aa  152  5e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0281  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  35.04 
 
 
250 aa  152  5e-36  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0874808  normal  0.889529 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0220  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.65 
 
 
247 aa  152  5.9999999999999996e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>