More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_2603 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009484  Acry_2603  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 
272 aa  538  9.999999999999999e-153  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6708  glucose 1-dehydrogenase  50.37 
 
 
277 aa  257  1e-67  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0307985 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1863  glucose 1-dehydrogenase  45.66 
 
 
269 aa  243  1.9999999999999999e-63  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1811  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.87 
 
 
268 aa  242  3.9999999999999997e-63  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.271129  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2033  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.62 
 
 
270 aa  234  1.0000000000000001e-60  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3932  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.11 
 
 
268 aa  224  1e-57  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0840  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.33 
 
 
266 aa  223  3e-57  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.551106  normal  0.267139 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4858  glucose-1-dehydrogenase  41.73 
 
 
261 aa  194  9e-49  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4852  glucose-1-dehydrogenase  41.67 
 
 
261 aa  193  3e-48  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4448  glucose-1-dehydrogenase  41.34 
 
 
261 aa  192  4e-48  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4828  glucose-1-dehydrogenase  41.34 
 
 
261 aa  192  4e-48  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4612  glucose-1-dehydrogenase  41.96 
 
 
261 aa  192  5e-48  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.548081  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4466  glucose-1-dehydrogenase  41.96 
 
 
261 aa  192  5e-48  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4968  glucose-1-dehydrogenase  41.96 
 
 
261 aa  192  5e-48  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.188198  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4834  glucose-1-dehydrogenase  41.96 
 
 
261 aa  192  6e-48  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4547  glucose-1-dehydrogenase  41.34 
 
 
261 aa  191  9e-48  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0408  glucose-1-dehydrogenase  42.35 
 
 
261 aa  191  1e-47  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3132  glucose-1-dehydrogenase  39.76 
 
 
261 aa  185  6e-46  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0198  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.05 
 
 
261 aa  182  7e-45  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.499955 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4436  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.69 
 
 
265 aa  181  1e-44  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0368  glucose-1-dehydrogenase  41.11 
 
 
261 aa  180  2e-44  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0342914  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3509  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.78 
 
 
255 aa  179  5.999999999999999e-44  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1661  glucose 1-dehydrogenase  37.36 
 
 
268 aa  174  9.999999999999999e-43  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.218295  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1879  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.73 
 
 
261 aa  171  9e-42  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.828765 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2225  glucose 1-dehydrogenase, putative  41.73 
 
 
261 aa  171  9e-42  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2361  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.97 
 
 
258 aa  171  1e-41  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.11166  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1554  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.7 
 
 
270 aa  171  2e-41  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.763501 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1535  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.54 
 
 
261 aa  166  5.9999999999999996e-40  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0579067  normal  0.028281 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1857  glucose 1-dehydrogenase, putative  40.54 
 
 
261 aa  166  5.9999999999999996e-40  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.637675  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0697  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.56 
 
 
263 aa  162  4.0000000000000004e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0659178 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1182  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.75 
 
 
263 aa  161  1e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1573  3-oxoacyl-(acyl-carrier protein) reductase  36.58 
 
 
266 aa  160  2e-38  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.647658  normal  0.48808 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1317  Short-chain dehydrogenase  38.98 
 
 
288 aa  159  5e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.169913  normal  0.0434292 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1110  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  37.55 
 
 
246 aa  157  2e-37  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4047  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  40.78 
 
 
249 aa  157  2e-37  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3519  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.14 
 
 
252 aa  157  2e-37  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0635  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.2 
 
 
259 aa  157  3e-37  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.191846 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3865  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  38.49 
 
 
277 aa  155  5.0000000000000005e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2582  short chain dehydrogenase  42.25 
 
 
269 aa  155  5.0000000000000005e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1020  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  37.15 
 
 
246 aa  155  6e-37  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0122832  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1385  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.08 
 
 
248 aa  155  6e-37  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9124  gluconate 5-dehydrogenase  39.36 
 
 
256 aa  155  7e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.991877  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1837  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.13 
 
 
258 aa  155  9e-37  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00311801  normal  0.334735 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1258  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.27 
 
 
247 aa  155  1e-36  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.203668  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1089  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.7 
 
 
259 aa  154  1e-36  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0332234  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2306  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.98 
 
 
284 aa  153  2e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.361211  hitchhiker  0.00000740353 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1318  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.48 
 
 
261 aa  153  2.9999999999999998e-36  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.718128 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3434  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.84 
 
 
263 aa  152  4e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.101369  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7084  gluconate 5-dehydrogenase  37.05 
 
 
255 aa  152  5e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6053  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.8 
 
 
285 aa  151  8.999999999999999e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0516293 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1228  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.23 
 
 
272 aa  151  1e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.178031  hitchhiker  0.00135629 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3349  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.6 
 
 
287 aa  150  1e-35  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.426721  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2089  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.69 
 
 
276 aa  151  1e-35  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.185872  hitchhiker  0.0000125896 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2119  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.96 
 
 
257 aa  150  2e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2810  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.16 
 
 
298 aa  150  2e-35  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0661  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.3 
 
 
259 aa  150  2e-35  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.965402  normal 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3136  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.71 
 
 
269 aa  149  4e-35  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2520  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.7 
 
 
271 aa  149  4e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.40299  normal  0.0331692 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0357  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.02 
 
 
285 aa  149  5e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.772817 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1368  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.4 
 
 
285 aa  149  5e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00277313  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6461  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.4 
 
 
285 aa  149  5e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1551  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.56 
 
 
270 aa  149  5e-35  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.2513  normal  0.363007 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4127  acetoacetyl-CoA reductase  40.41 
 
 
247 aa  149  6e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1241  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.04 
 
 
260 aa  149  6e-35  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0407787  normal  0.415093 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2067  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.65 
 
 
246 aa  148  8e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0870  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  35.77 
 
 
249 aa  148  8e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1531  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  37.15 
 
 
249 aa  148  9e-35  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.356437 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3184  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.2 
 
 
249 aa  148  9e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0196402  normal  0.84005 
 
 
-
 
NC_004310  BR1122  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  38.55 
 
 
246 aa  148  1.0000000000000001e-34  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0726405  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0943  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  37.4 
 
 
246 aa  148  1.0000000000000001e-34  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000752112  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4376  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.71 
 
 
285 aa  148  1.0000000000000001e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.896027  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3057  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  41.43 
 
 
246 aa  148  1.0000000000000001e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.030998  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2046  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.56 
 
 
263 aa  148  1.0000000000000001e-34  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  decreased coverage  0.00404736  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6190  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.25 
 
 
335 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1292  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.55 
 
 
339 aa  147  2.0000000000000003e-34  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4545  acetoacetyl-CoA reductase  38.21 
 
 
248 aa  147  2.0000000000000003e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00570408 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1080  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  38.25 
 
 
246 aa  147  2.0000000000000003e-34  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.38691  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1869  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.16 
 
 
263 aa  147  2.0000000000000003e-34  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04660  2-hydroxycyclohexane-1-carbonyl-CoA dehydrogenase  40.93 
 
 
261 aa  147  2.0000000000000003e-34  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3986  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.05 
 
 
297 aa  147  2.0000000000000003e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2303  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.45 
 
 
269 aa  147  2.0000000000000003e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00148918 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4297  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.6 
 
 
246 aa  147  2.0000000000000003e-34  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.408574  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2790  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.6 
 
 
269 aa  147  2.0000000000000003e-34  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4412  acetoacetyl-CoA reductase  38.21 
 
 
248 aa  147  2.0000000000000003e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.785302 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4672  putative 3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  41.13 
 
 
253 aa  146  4.0000000000000006e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.572467  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2799  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  40.16 
 
 
246 aa  146  4.0000000000000006e-34  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.786413  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2992  short chain dehydrogenase  40.84 
 
 
269 aa  145  5e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2025  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.29 
 
 
288 aa  145  5e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000209901 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1619  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.8 
 
 
253 aa  145  5e-34  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.901509  normal  0.0346671 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6555  acetoacetyl-CoA reductase  37.4 
 
 
247 aa  145  5e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.660753 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1315  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  36.18 
 
 
246 aa  145  5e-34  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1290  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  36.18 
 
 
246 aa  145  5e-34  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.756389  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2307  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  37.05 
 
 
247 aa  145  5e-34  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1246  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.85 
 
 
335 aa  145  6e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.927114  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6586  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.85 
 
 
335 aa  145  6e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.830153  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0797  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  35.77 
 
 
244 aa  145  7.0000000000000006e-34  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1373  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  37.35 
 
 
248 aa  145  7.0000000000000006e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.124306  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3237  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.01 
 
 
308 aa  145  9e-34  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.278854  normal  0.143787 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1526  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.89 
 
 
254 aa  145  9e-34  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2397  oxidoreductase, short chain dehydrogenase/reductase family  36.68 
 
 
254 aa  144  1e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0465114  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>