More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_4392 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013235  Namu_4392  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 
251 aa  499  1e-140  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.276744  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4180  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  61.94 
 
 
253 aa  296  2e-79  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2306  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  61.54 
 
 
253 aa  295  3e-79  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4710  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  59.92 
 
 
258 aa  295  6e-79  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.549149  normal  0.0208806 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3587  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  60.32 
 
 
254 aa  292  4e-78  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.302231 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5978  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  58.7 
 
 
254 aa  289  3e-77  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.161271  normal  0.813705 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1977  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  61.54 
 
 
251 aa  288  6e-77  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00188878  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2214  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  58.3 
 
 
254 aa  288  6e-77  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.823927  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3884  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  59.6 
 
 
249 aa  286  2e-76  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.137189 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1241  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  59.11 
 
 
262 aa  283  1.0000000000000001e-75  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.675718  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5601  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  58.8 
 
 
252 aa  283  1.0000000000000001e-75  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3165  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  58.7 
 
 
256 aa  280  1e-74  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.234214  normal  0.520266 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3017  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  57.09 
 
 
250 aa  281  1e-74  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2567  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  58.7 
 
 
251 aa  279  3e-74  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00491372 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4260  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  57.49 
 
 
249 aa  279  4e-74  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4376  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  57.09 
 
 
249 aa  278  7e-74  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.563003  normal  0.263695 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1762  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  57.09 
 
 
252 aa  277  1e-73  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2466  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  59.51 
 
 
252 aa  276  2e-73  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.03083  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2235  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  60.24 
 
 
254 aa  276  2e-73  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.225457 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4852  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  57.09 
 
 
247 aa  276  3e-73  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.657394  normal  0.213318 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0616  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  59.92 
 
 
249 aa  274  8e-73  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.395016  normal  0.753333 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3222  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  59.04 
 
 
253 aa  274  9e-73  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.916878 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1960  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  55.78 
 
 
250 aa  271  6e-72  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.223206  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5277  putative oxidoreductase  57.2 
 
 
251 aa  271  8.000000000000001e-72  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.241792  normal  0.218182 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2398  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  57.49 
 
 
249 aa  270  1e-71  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2987  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  60.73 
 
 
254 aa  270  1e-71  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.152214  normal  0.164805 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2234  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  54.8 
 
 
254 aa  268  5e-71  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2595  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  59.51 
 
 
254 aa  268  5e-71  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1708  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  55.2 
 
 
252 aa  268  7e-71  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0406387  normal  0.0847343 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0876  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  54.84 
 
 
255 aa  264  8.999999999999999e-70  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.389264  normal  0.105725 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1554  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  54.25 
 
 
253 aa  263  3e-69  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.135569  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4500  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  58.3 
 
 
252 aa  261  6.999999999999999e-69  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4012  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  55.6 
 
 
252 aa  261  8e-69  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.448835 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1229  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  58.3 
 
 
252 aa  260  1e-68  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.117991  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4042  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  58.7 
 
 
252 aa  261  1e-68  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.782191 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2039  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  56.68 
 
 
250 aa  258  5.0000000000000005e-68  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.664052 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4031  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  58.7 
 
 
252 aa  258  8e-68  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.282406 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1719  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  55.06 
 
 
251 aa  253  2.0000000000000002e-66  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0841  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  53.44 
 
 
254 aa  253  2.0000000000000002e-66  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.327041  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4948  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  57.03 
 
 
252 aa  252  3e-66  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3212  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  57.03 
 
 
252 aa  252  3e-66  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5691  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  58.3 
 
 
252 aa  252  5.000000000000001e-66  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0367815 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6169  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  54 
 
 
256 aa  251  5.000000000000001e-66  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00695804 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3755  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  58.3 
 
 
252 aa  252  5.000000000000001e-66  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4613  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  58.3 
 
 
252 aa  252  5.000000000000001e-66  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0226666 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1981  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  56 
 
 
253 aa  251  1e-65  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00793153 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4216  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  55.56 
 
 
252 aa  250  2e-65  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.746291 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3192  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  54.58 
 
 
257 aa  250  2e-65  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4326  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  55.6 
 
 
258 aa  249  4e-65  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0814456 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6080  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  54.8 
 
 
252 aa  246  3e-64  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.952753 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6377  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  55.87 
 
 
252 aa  245  6e-64  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.185899  normal  0.130679 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2754  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  54.62 
 
 
245 aa  240  1e-62  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1493  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  47.77 
 
 
247 aa  237  2e-61  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.517658 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3100  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  54.98 
 
 
245 aa  235  6e-61  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.135621  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3411  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  54.84 
 
 
259 aa  234  1.0000000000000001e-60  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1788  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  53.98 
 
 
256 aa  231  9e-60  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.560112  normal  0.613587 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2849  short-chain dehydrogenase/reductase  52.8 
 
 
243 aa  218  5e-56  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.154596  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2234  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50.42 
 
 
254 aa  219  5e-56  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  decreased coverage  0.00670227  normal  0.180357 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0846  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.21 
 
 
247 aa  212  4.9999999999999996e-54  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.140408 
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_35637  predicted protein  44.49 
 
 
635 aa  211  7.999999999999999e-54  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB01810  conserved hypothetical protein  43.73 
 
 
259 aa  202  3e-51  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1528  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.22 
 
 
286 aa  130  2.0000000000000002e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0921038  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1806  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.6 
 
 
279 aa  113  3e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.322178  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2186  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.17 
 
 
248 aa  109  5e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0361624 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4929  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.5 
 
 
270 aa  108  6e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.212781  normal  0.926969 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4547  glucose-1-dehydrogenase  35.38 
 
 
261 aa  108  8.000000000000001e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0157  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.27 
 
 
257 aa  108  9.000000000000001e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.0000174096  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0422  sorbitol-6-phosphate dehydrogenase  37.5 
 
 
265 aa  107  1e-22  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.0026318  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6036  NAD-dependent epimerase/dehydratase:Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.66 
 
 
254 aa  108  1e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0528417  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2410  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.5 
 
 
255 aa  107  2e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3110  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.63 
 
 
283 aa  107  2e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4448  glucose-1-dehydrogenase  34.36 
 
 
261 aa  106  3e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1914  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.77 
 
 
225 aa  106  3e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4858  glucose-1-dehydrogenase  34.36 
 
 
261 aa  106  4e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4828  glucose-1-dehydrogenase  34.87 
 
 
261 aa  106  4e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4612  glucose-1-dehydrogenase  34.36 
 
 
261 aa  105  5e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.548081  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4466  glucose-1-dehydrogenase  34.87 
 
 
261 aa  105  5e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4968  glucose-1-dehydrogenase  34.36 
 
 
261 aa  105  5e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.188198  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_12103  predicted protein  36.55 
 
 
273 aa  105  5e-22  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.932364  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4834  glucose-1-dehydrogenase  34.36 
 
 
261 aa  105  5e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2225  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.37 
 
 
267 aa  105  6e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.801106 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3782  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.91 
 
 
269 aa  105  8e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0777  2,5-dichloro-2,5-cyclohexadiene-1,4-diol dehydrogenase  32.86 
 
 
256 aa  105  8e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  unclonable  0.000000000602932 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1999  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.33 
 
 
225 aa  105  8e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.570082  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2517  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.95 
 
 
257 aa  104  1e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.401645  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1782  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  36.08 
 
 
244 aa  104  2e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.788783  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4887  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.11 
 
 
264 aa  104  2e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.845571  normal  0.46236 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4852  glucose-1-dehydrogenase  33.33 
 
 
261 aa  103  3e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1438  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  34.47 
 
 
245 aa  103  3e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3801  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.5 
 
 
251 aa  103  3e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  hitchhiker  0.00700482  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2206  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.45 
 
 
261 aa  102  4e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0587036  normal  0.882414 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2192  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.45 
 
 
256 aa  102  7e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0046226 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2759  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.94 
 
 
261 aa  102  8e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2848  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  35.57 
 
 
246 aa  102  8e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1936  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  34.2 
 
 
245 aa  101  9e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000245701  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1200  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.46 
 
 
287 aa  101  9e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1964  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.44 
 
 
225 aa  101  1e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.31851  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0265  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  35.68 
 
 
248 aa  101  1e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.534726  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2798  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.92 
 
 
235 aa  101  1e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2409  acetoin dehydrogenase  36.7 
 
 
260 aa  101  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>