More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_4852 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011757  Mchl_4852  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 
247 aa  498  1e-140  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.657394  normal  0.213318 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4376  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  98.38 
 
 
249 aa  490  9.999999999999999e-139  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.563003  normal  0.263695 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4260  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  93.12 
 
 
249 aa  464  9.999999999999999e-131  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2306  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  67.21 
 
 
253 aa  329  2e-89  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4180  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  65.59 
 
 
253 aa  322  3e-87  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3017  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  61.79 
 
 
250 aa  314  6e-85  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3587  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  62.45 
 
 
254 aa  310  1e-83  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.302231 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1960  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  62.2 
 
 
250 aa  307  8e-83  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.223206  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1762  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  59.11 
 
 
252 aa  307  9e-83  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5601  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  61.13 
 
 
252 aa  306  1.0000000000000001e-82  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2039  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  62.7 
 
 
250 aa  305  3e-82  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.664052 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4710  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  59.68 
 
 
258 aa  302  3.0000000000000004e-81  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.549149  normal  0.0208806 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1554  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  57.66 
 
 
253 aa  301  4.0000000000000003e-81  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.135569  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3165  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  61.13 
 
 
256 aa  301  7.000000000000001e-81  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.234214  normal  0.520266 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2234  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  60.73 
 
 
254 aa  301  9e-81  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1241  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  60.16 
 
 
262 aa  298  4e-80  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.675718  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2214  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  58.7 
 
 
254 aa  296  2e-79  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.823927  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0841  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  58.7 
 
 
254 aa  296  2e-79  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.327041  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5978  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  58.7 
 
 
254 aa  295  3e-79  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.161271  normal  0.813705 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0616  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  60.82 
 
 
249 aa  296  3e-79  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.395016  normal  0.753333 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1708  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  57.89 
 
 
252 aa  295  5e-79  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0406387  normal  0.0847343 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2567  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  59.35 
 
 
251 aa  293  2e-78  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00491372 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5277  putative oxidoreductase  58.37 
 
 
251 aa  289  3e-77  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.241792  normal  0.218182 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4012  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  58.7 
 
 
252 aa  288  4e-77  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.448835 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2398  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  60.64 
 
 
249 aa  288  5.0000000000000004e-77  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0876  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  57.66 
 
 
255 aa  288  7e-77  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.389264  normal  0.105725 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1719  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  59.84 
 
 
251 aa  287  1e-76  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2466  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  58.3 
 
 
252 aa  284  8e-76  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.03083  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2987  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  61.13 
 
 
254 aa  281  6.000000000000001e-75  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.152214  normal  0.164805 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2235  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  56.85 
 
 
254 aa  278  5e-74  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.225457 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2595  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  58.06 
 
 
254 aa  277  1e-73  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3222  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  56.45 
 
 
253 aa  276  2e-73  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.916878 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2754  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  60.82 
 
 
245 aa  276  2e-73  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3884  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  55.42 
 
 
249 aa  271  8.000000000000001e-72  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.137189 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1977  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  57.32 
 
 
251 aa  270  2e-71  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00188878  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3192  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  56.91 
 
 
257 aa  267  1e-70  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3100  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  57.26 
 
 
245 aa  264  1e-69  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.135621  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6080  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  53.82 
 
 
252 aa  261  6e-69  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.952753 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6169  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  55.28 
 
 
256 aa  260  2e-68  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00695804 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6377  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  53.41 
 
 
252 aa  259  3e-68  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.185899  normal  0.130679 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4326  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  56.22 
 
 
258 aa  259  4e-68  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0814456 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4948  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  54.66 
 
 
252 aa  259  4e-68  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3212  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  54.66 
 
 
252 aa  259  4e-68  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1229  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  53.85 
 
 
252 aa  255  5e-67  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.117991  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4031  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  55.06 
 
 
252 aa  254  7e-67  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.282406 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4216  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  53.85 
 
 
252 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.746291 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4500  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  52.63 
 
 
252 aa  252  5.000000000000001e-66  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5691  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  54.25 
 
 
252 aa  251  1e-65  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0367815 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3755  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  54.25 
 
 
252 aa  251  1e-65  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4042  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  53.63 
 
 
252 aa  250  1e-65  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.782191 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4613  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  54.25 
 
 
252 aa  251  1e-65  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0226666 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1981  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  54.8 
 
 
253 aa  248  5e-65  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00793153 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4392  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  55.36 
 
 
251 aa  248  7e-65  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.276744  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1788  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  56.19 
 
 
256 aa  247  2e-64  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.560112  normal  0.613587 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1493  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  48.57 
 
 
247 aa  246  3e-64  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.517658 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2849  short-chain dehydrogenase/reductase  55.6 
 
 
243 aa  243  3e-63  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.154596  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3411  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  55.1 
 
 
259 aa  240  1e-62  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_35637  predicted protein  54.03 
 
 
635 aa  239  2.9999999999999997e-62  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0846  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  52.63 
 
 
247 aa  225  4e-58  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.140408 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2234  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.29 
 
 
254 aa  215  5e-55  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  decreased coverage  0.00670227  normal  0.180357 
 
 
-
 
NC_006684  CNB01810  conserved hypothetical protein  41.18 
 
 
259 aa  199  5e-50  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1552  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.91 
 
 
248 aa  143  3e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0714452  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1352  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.91 
 
 
282 aa  141  9e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.316546  normal  0.241504 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1782  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  38.08 
 
 
244 aa  132  3.9999999999999996e-30  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.788783  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2639  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.17 
 
 
238 aa  132  6e-30  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.37123  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1156  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  36.4 
 
 
248 aa  130  2.0000000000000002e-29  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000536759  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2206  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.9 
 
 
261 aa  130  2.0000000000000002e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0587036  normal  0.882414 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1056  oxidoreductase, short chain dehydrogenase/reductase family  48.5 
 
 
254 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1080  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  35.68 
 
 
246 aa  127  2.0000000000000002e-28  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.38691  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0904  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.71 
 
 
254 aa  125  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2848  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  40.61 
 
 
246 aa  125  5e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2049  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  32.63 
 
 
230 aa  125  7e-28  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1122  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  35.4 
 
 
246 aa  125  7e-28  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0726405  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1438  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  36.36 
 
 
245 aa  124  1e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03260  conserved hypothetical protein  40.93 
 
 
554 aa  123  2e-27  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0684  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  41.7 
 
 
249 aa  123  3e-27  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3438  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  39.09 
 
 
252 aa  123  3e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2555  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.85 
 
 
231 aa  122  4e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.459049  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2505  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.85 
 
 
231 aa  122  4e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6036  NAD-dependent epimerase/dehydratase:Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.72 
 
 
254 aa  122  5e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0528417  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1374  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.27 
 
 
253 aa  122  5e-27  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.542817  normal  0.89387 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4929  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.02 
 
 
270 aa  122  6e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.212781  normal  0.926969 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3207  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  34.45 
 
 
246 aa  120  1.9999999999999998e-26  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.819769  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_12103  predicted protein  38.78 
 
 
273 aa  119  3e-26  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.932364  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2119  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.91 
 
 
257 aa  120  3e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1954  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  34.65 
 
 
250 aa  119  3.9999999999999996e-26  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0542  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.25 
 
 
244 aa  119  4.9999999999999996e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0635  putative short-chain dehydrogenase/reductase  39.48 
 
 
246 aa  118  9e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.660542  normal  0.0297002 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3801  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.88 
 
 
251 aa  118  9e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  hitchhiker  0.00700482  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1528  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35 
 
 
286 aa  117  9.999999999999999e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0921038  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1088  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  38.12 
 
 
250 aa  118  9.999999999999999e-26  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.885603  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2284  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.98 
 
 
259 aa  118  9.999999999999999e-26  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.496594  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3764  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  36.13 
 
 
251 aa  117  9.999999999999999e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000212417  normal  0.0482294 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3729  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.39 
 
 
249 aa  117  9.999999999999999e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1575  short chain dehydrogenase  36.22 
 
 
249 aa  117  1.9999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2798  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.06 
 
 
235 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1806  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.48 
 
 
279 aa  117  1.9999999999999998e-25  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.322178  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1326  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.79 
 
 
254 aa  116  3e-25  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.393683 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2517  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.71 
 
 
257 aa  116  3e-25  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.401645  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1277  3-oxoacyl-acyl carrier protein reductase  39 
 
 
247 aa  116  3.9999999999999997e-25  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.038158  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>