More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_3192 on replicon NC_011886
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011886  Achl_3192  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 
257 aa  518  1e-146  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3411  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  80.31 
 
 
259 aa  395  1e-109  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1719  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  57.72 
 
 
251 aa  273  3e-72  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4260  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  57.66 
 
 
249 aa  269  2.9999999999999997e-71  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4710  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  55.47 
 
 
258 aa  268  5e-71  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.549149  normal  0.0208806 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4376  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  56.85 
 
 
249 aa  268  8e-71  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.563003  normal  0.263695 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4852  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  56.91 
 
 
247 aa  267  1e-70  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.657394  normal  0.213318 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1554  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.8 
 
 
253 aa  262  3e-69  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.135569  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3017  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  53.85 
 
 
250 aa  262  4.999999999999999e-69  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5978  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  53.6 
 
 
254 aa  256  2e-67  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.161271  normal  0.813705 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2214  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  53.15 
 
 
254 aa  255  4e-67  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.823927  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3587  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  52.23 
 
 
254 aa  250  1e-65  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.302231 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5601  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  53.41 
 
 
252 aa  251  1e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2754  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  53.06 
 
 
245 aa  246  2e-64  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3884  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  53.23 
 
 
249 aa  245  6e-64  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.137189 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2306  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  52 
 
 
253 aa  243  3e-63  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1762  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50.6 
 
 
252 aa  240  1e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2234  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.41 
 
 
254 aa  241  1e-62  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4042  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.39 
 
 
252 aa  239  2e-62  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.782191 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4500  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51 
 
 
252 aa  239  2e-62  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0841  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.6 
 
 
254 aa  240  2e-62  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.327041  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2567  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50.4 
 
 
251 aa  238  8e-62  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00491372 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1241  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50.4 
 
 
262 aa  238  9e-62  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.675718  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3165  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.06 
 
 
256 aa  237  1e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.234214  normal  0.520266 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4180  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.6 
 
 
253 aa  237  1e-61  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0876  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.2 
 
 
255 aa  236  2e-61  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.389264  normal  0.105725 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1977  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  52.82 
 
 
251 aa  236  2e-61  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00188878  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2039  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  53.04 
 
 
250 aa  235  5.0000000000000005e-61  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.664052 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2987  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  53.33 
 
 
254 aa  235  5.0000000000000005e-61  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.152214  normal  0.164805 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4031  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  52.78 
 
 
252 aa  234  8e-61  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.282406 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1960  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50 
 
 
250 aa  233  2.0000000000000002e-60  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.223206  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2398  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50.6 
 
 
249 aa  231  6e-60  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1229  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50.6 
 
 
252 aa  231  8.000000000000001e-60  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.117991  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4216  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51 
 
 
252 aa  230  2e-59  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.746291 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0616  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.39 
 
 
249 aa  229  4e-59  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.395016  normal  0.753333 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3222  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.59 
 
 
253 aa  229  4e-59  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.916878 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2235  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.19 
 
 
254 aa  229  4e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.225457 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4392  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  53.71 
 
 
251 aa  228  6e-59  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.276744  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5691  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.39 
 
 
252 aa  227  1e-58  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0367815 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2595  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.46 
 
 
254 aa  228  1e-58  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3755  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.39 
 
 
252 aa  227  1e-58  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4613  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.39 
 
 
252 aa  227  1e-58  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0226666 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1708  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  48.4 
 
 
252 aa  226  3e-58  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0406387  normal  0.0847343 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2466  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.39 
 
 
252 aa  226  3e-58  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.03083  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4948  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50.2 
 
 
252 aa  224  9e-58  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3212  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50.2 
 
 
252 aa  224  9e-58  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6377  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.8 
 
 
252 aa  224  1e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.185899  normal  0.130679 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5277  putative oxidoreductase  47.79 
 
 
251 aa  224  2e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.241792  normal  0.218182 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6080  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.41 
 
 
252 aa  223  3e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.952753 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4012  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.8 
 
 
252 aa  222  4e-57  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.448835 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6169  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.9 
 
 
256 aa  220  1.9999999999999999e-56  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00695804 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3100  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.39 
 
 
245 aa  220  1.9999999999999999e-56  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.135621  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4326  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.51 
 
 
258 aa  218  6e-56  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0814456 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0846  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.63 
 
 
247 aa  217  1e-55  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.140408 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2849  short-chain dehydrogenase/reductase  48.58 
 
 
243 aa  216  2e-55  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.154596  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2234  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.57 
 
 
254 aa  214  9e-55  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  decreased coverage  0.00670227  normal  0.180357 
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_35637  predicted protein  45.97 
 
 
635 aa  210  2e-53  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1788  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.56 
 
 
256 aa  208  7e-53  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.560112  normal  0.613587 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1981  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.56 
 
 
253 aa  208  7e-53  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00793153 
 
 
-
 
NC_006684  CNB01810  conserved hypothetical protein  42.31 
 
 
259 aa  207  1e-52  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1493  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  41.3 
 
 
247 aa  197  1.0000000000000001e-49  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.517658 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2639  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.09 
 
 
238 aa  123  3e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.37123  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1552  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.27 
 
 
248 aa  118  9.999999999999999e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0714452  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1007  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.92 
 
 
245 aa  116  3e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.553727  normal  0.0273902 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1352  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.22 
 
 
282 aa  115  6.9999999999999995e-25  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.316546  normal  0.241504 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3131  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.33 
 
 
245 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0152  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.04 
 
 
223 aa  114  1.0000000000000001e-24  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2517  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.22 
 
 
257 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.401645  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2798  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.04 
 
 
235 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2737  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.33 
 
 
245 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1782  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  38.27 
 
 
244 aa  114  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.788783  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0808  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.47 
 
 
252 aa  113  3e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2186  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.75 
 
 
248 aa  111  1.0000000000000001e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0361624 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3563  p-cumic alcohol dehydrogenase (CymB)  37.77 
 
 
252 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.822337  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5464  NAD-dependent epimerase/dehydratase:Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.39 
 
 
253 aa  110  2.0000000000000002e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.852927  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2905  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.23 
 
 
252 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.432541  normal  0.506504 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3779  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.92 
 
 
266 aa  110  2.0000000000000002e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  hitchhiker  0.00111461  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1117  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.36 
 
 
233 aa  110  3e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.000000223483  normal  0.996665 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3743  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.1 
 
 
254 aa  109  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0159  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.72 
 
 
253 aa  109  4.0000000000000004e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.501988  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1547  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.11 
 
 
269 aa  109  5e-23  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.255418  n/a   
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3972  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  36.36 
 
 
263 aa  108  9.000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4258  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.59 
 
 
253 aa  107  2e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.53611  normal  0.414505 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2206  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.91 
 
 
261 aa  107  3e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0587036  normal  0.882414 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2517  acetoin dehydrogenase  30.98 
 
 
260 aa  107  3e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4887  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.94 
 
 
264 aa  106  4e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.845571  normal  0.46236 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0156  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.57 
 
 
253 aa  106  4e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000000282185  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2405  acetoin dehydrogenase  31.35 
 
 
260 aa  106  4e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0247  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.48 
 
 
223 aa  106  4e-22  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2275  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.46 
 
 
254 aa  106  4e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2316  acetoin dehydrogenase  31.35 
 
 
260 aa  106  4e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2360  acetoin dehydrogenase  31.35 
 
 
253 aa  106  5e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2468  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.73 
 
 
254 aa  106  5e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2409  acetoin dehydrogenase  31.35 
 
 
260 aa  105  5e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2751  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.65 
 
 
252 aa  105  5e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.995251  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2284  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.44 
 
 
259 aa  105  6e-22  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.496594  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2848  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  35.33 
 
 
246 aa  105  7e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4012  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.08 
 
 
276 aa  105  8e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7045  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.46 
 
 
250 aa  105  8e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011693  PHATRDRAFT_16295  predicted protein  36.2 
 
 
237 aa  105  8e-22  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0303319  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>