146 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_1231 on replicon NC_010622
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010622  Bphy_1231  putative hydratase/decarboxylase  100 
 
 		 253 aa  508  1e-143  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.2162  normal  0.357566 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2003  putative hydratase/decarboxylase  78.26 
 
 		 253 aa  404  1e-111  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.378768  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2258  putative hydratase/decarboxylase  78.66 
 
 		 253 aa  369  1e-101  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0643634  normal  0.693124 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4255  2-keto-4-pentenoate hydratase-like protein  48.39 
 
 		 257 aa  218  1e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3024  2-keto-4-pentenoate hydratase-like  48 
 
 		 254 aa  209  4e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.332921 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6957  Hydratase/decarboxylase  47.37 
 
 		 249 aa  206  4e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3399  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  37.14 
 
 		 260 aa  145  6e-34  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0110  2-oxopent-4-enoate hydratase  36.74 
 
 		 254 aa  119  3.9999999999999996e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  decreased coverage  0.00322536  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0623  putative 2-keto-4-pentenoate hydratase-like protein  33.21 
 
 		 253 aa  100  2e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.602198  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3930  hydratase/decarboxylase  35.71 
 
 		 238 aa  98.6  8e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0554783  normal  0.0126992 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1911  putative 2-keto-4-pentenoate hydratase-like protein  34.62 
 
 		 256 aa  98.2  1e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.123637 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1543  hydratase/decarboxylase family protein  32.68 
 
 		 254 aa  87  2e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.112303  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7051  2-keto-4-pentenoate hydratase-like protein  33.33 
 
 		 253 aa  87.8  2e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1441  2-keto-4-pentenoate hydratase-like  33.33 
 
 		 253 aa  87  3e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6387  2-keto-4-pentenoate hydratase-like protein  33.33 
 
 		 253 aa  87  3e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.956579  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1322  hydratase/decarboxylase family protein  34.33 
 
 		 254 aa  86.3  4e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.831556  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5145  putative hydratase  26.69 
 
 		 257 aa  84  0.000000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0494321  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0042  hydratase/decarboxylase family protein  32.28 
 
 		 366 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2133  putative 2-keto-4-pentenoate hydratase  31.13 
 
 		 261 aa  82.8  0.000000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1455  hydratase/decarboxylase family protein  32.02 
 
 		 254 aa  82.8  0.000000000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.44965  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5715  2-keto-4-pentenoate hydratase-like protein  32.55 
 
 		 253 aa  82.8  0.000000000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.480508 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5380  2-keto-4-pentenoate hydratase-like protein  33.46 
 
 		 254 aa  82.8  0.000000000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.506501  normal  0.128473 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6468  2-keto-4-pentenoate hydratase-like protein  32.16 
 
 		 253 aa  82  0.000000000000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.391434 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6932  2-keto-4-pentenoate hydratase-like  32.13 
 
 		 253 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.228017  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2908  2-keto-4-pentenoate hydratase-like protein  28.94 
 
 		 252 aa  80.9  0.00000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.357805  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0175  putative hydratase/decarboxylase  30.59 
 
 		 261 aa  80.9  0.00000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.293299  normal  0.703391 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0561  2-keto-4-pentenoate hydratase-like  27.78 
 
 		 256 aa  78.6  0.00000000000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5513  putative hydratase/decarboxylase  28.23 
 
 		 263 aa  77.8  0.0000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.560438  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5795  2-keto-4-pentenoate hydratase-like protein  30.49 
 
 		 267 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0105  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  31.65 
 
 		 265 aa  73.2  0.000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5798  hydratase/decarboxylase family protein  29.57 
 
 		 269 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000000214426  normal  0.683371 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0650  putative hydratase  29.2 
 
 		 252 aa  70.1  0.00000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4832  2-oxopent-4-enoate hydratase  28.68 
 
 		 279 aa  70.1  0.00000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0838304  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3446  2-keto-4-pentenoate hydratase-like protein  31.02 
 
 		 276 aa  69.3  0.00000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1165  putative hydratase protein  31.2 
 
 		 251 aa  65.9  0.0000000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.371203 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2148  putative hydratase/decarboxylase  29.03 
 
 		 266 aa  65.9  0.0000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.691188 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2038  putative hydratase  31.58 
 
 		 268 aa  63.9  0.000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.450204  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0224  2-oxopent-4-enoate hydratase  30.77 
 
 		 264 aa  62  0.000000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0261621  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4537  4-oxalocrotonate decarboxylase  25.86 
 
 		 262 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2125  4-oxalocrotonate decarboxylase  23.91 
 
 		 264 aa  60.8  0.00000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.740862  normal  0.868744 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0259  hydratase/decarboxylase  25.6 
 
 		 263 aa  60.8  0.00000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000347099  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1790  4-oxalocrotonate decarboxylase  26.29 
 
 		 263 aa  60.1  0.00000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0308919  normal  0.205885 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3056  hydratase/decarboxylase family protein  28.78 
 
 		 271 aa  59.7  0.00000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2075  hydratase/decarboxylase family protein  25.3 
 
 		 258 aa  59.3  0.00000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.488863  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00080  conserved hypothetical protein  26.21 
 
 		 387 aa  58.5  0.00000009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2889  hydratase/decarboxylase  25.73 
 
 		 169 aa  58.2  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1904  hydratase/decarboxylase  23.55 
 
 		 270 aa  57.4  0.0000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0212  hypothetical protein  25.28 
 
 		 272 aa  56.6  0.0000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3044  2-keto-4-pentenoate hydratase, putative  28.15 
 
 		 260 aa  55.8  0.0000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.111412 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3472  2-oxopent-4-enoate hydratase  26.88 
 
 		 260 aa  55.5  0.0000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.102578  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0595  4-oxalocrotonate decarboxylase  28.27 
 
 		 262 aa  55.5  0.0000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3520  4-oxalocrotonate decarboxylase  25.97 
 
 		 263 aa  55.5  0.0000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0986627 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2652  hydratase/decarboxylase  24.65 
 
 		 261 aa  54.3  0.000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1459  4-oxalocrotonate decarboxylase  29.01 
 
 		 260 aa  54.7  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.512129  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3499  2-oxo-hepta-3-ene-1,7-dioic acid hydratase  25.97 
 
 		 266 aa  54.3  0.000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00827858 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3592  hydratase/decarboxylase  25.52 
 
 		 260 aa  54.3  0.000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.148442  normal  0.0625876 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0548  hydratase/decarboxylase family protein  26.38 
 
 		 267 aa  53.5  0.000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1982  2-keto-4-pentenoate hydratase  28.35 
 
 		 264 aa  53.5  0.000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.572392 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2159  hydratase/decarboxylase  24.65 
 
 		 261 aa  53.1  0.000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0061  2-keto-4-pentenoate hydratase, putative  23.57 
 
 		 259 aa  52.4  0.000006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.394693  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3762  hydratase/decarboxylase family protein  26.38 
 
 		 267 aa  52.8  0.000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0742  2-keto-4-pentenoate hydratase-like protein  26.23 
 
 		 281 aa  52.4  0.000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.273498 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2327  putative 2-hydroxypenta-2,4-dienoate hydratase(MhpD)  26.04 
 
 		 268 aa  52.4  0.000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2151  4-oxalocrotonate decarboxylase  27.32 
 
 		 271 aa  52.4  0.000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0577  hydratase/decarboxylase family protein  25.96 
 
 		 267 aa  51.6  0.00001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0572  hydratase/decarboxylase family protein  25.96 
 
 		 267 aa  51.2  0.00001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.733432 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3153  hydratase/decarboxylase  24.11 
 
 		 261 aa  52  0.00001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4042  hydratase/decarboxylase family protein  24.31 
 
 		 274 aa  50.8  0.00002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1651  4-oxalocrotonate decarboxylase  26.64 
 
 		 275 aa  51.2  0.00002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.452701  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0633  hydratase/decarboxylase family protein  27.54 
 
 		 268 aa  50.8  0.00002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2077  2-oxopent-4-enoate hydratase  24.82 
 
 		 261 aa  50.4  0.00003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.849096  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15110  2-keto-4-pentenoate hydratase  26.36 
 
 		 264 aa  50.4  0.00003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.473426  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0272  4-oxalocrotonate decarboxylase  25.32 
 
 		 262 aa  50.1  0.00003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2273  4-oxalocrotonate decarboxylase  26.71 
 
 		 261 aa  50.1  0.00003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2884  4-oxalocrotonate decarboxylase  29.8 
 
 		 288 aa  50.1  0.00003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3129  2-oxo-hepta-3-ene-1,7-dioic acid hydratase  27.87 
 
 		 266 aa  50.4  0.00003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.159572  normal  0.889794 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3428  hydratase/decarboxylase family protein  25.43 
 
 		 280 aa  49.7  0.00004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0534  2-oxopent-4-enoate hydratase  28.65 
 
 		 267 aa  49.7  0.00005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1321  hydratase/decarboxylase  24.86 
 
 		 262 aa  49.7  0.00005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0604012  normal  0.404919 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2410  2-oxo-hepta-3-ene-1,7-dioic acid hydratase  28.74 
 
 		 270 aa  49.3  0.00005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0149257  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6716  hypothetical protein  26.5 
 
 		 252 aa  49.7  0.00005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.296075  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01663  4-oxalocrotonate decarboxylase protein  28.93 
 
 		 263 aa  49.3  0.00006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0913733  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1150  4-oxalocrotonate decarboxylase  26.37 
 
 		 254 aa  49.3  0.00006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.454229  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3464  2-oxo-hepta-3-ene-1,7-dioic acid hydratase  25.21 
 
 		 266 aa  49.3  0.00006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3689  hydratase/decarboxylase  27.94 
 
 		 266 aa  49.3  0.00006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0225  4-oxalocrotonate decarboxylase  27.67 
 
 		 269 aa  48.9  0.00007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  hitchhiker  0.00468493  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3798  2-oxopent-4-enoate hydratase  25.27 
 
 		 261 aa  48.9  0.00007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.138107  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5134  hydratase/decarboxylase  25.33 
 
 		 263 aa  48.9  0.00008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0285955 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2785  4-oxalocrotonate decarboxylase  26.59 
 
 		 261 aa  48.9  0.00008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.197083 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0524  hydratase/decarboxylase family protein  26.24 
 
 		 280 aa  48.5  0.00009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3785  hydratase/decarboxylase  26.71 
 
 		 260 aa  48.5  0.0001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0026227  hitchhiker  0.00282888 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0439  2-oxopent-4-enoate hydratase  28.48 
 
 		 263 aa  48.5  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0138498 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5815  hypothetical protein  25.96 
 
 		 252 aa  47.8  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0839503 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1476  2-oxo-hepta-3-ene-1,7-dioic acid hydratase  27.68 
 
 		 260 aa  47.8  0.0002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.161964 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1149  2-oxopent-4-enoate hydratase  29.29 
 
 		 269 aa  47.8  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.363401  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3343  2-oxopent-4-enoate hydratase  26.09 
 
 		 260 aa  47.4  0.0002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3602  hydratase/decarboxylase family protein  26.67 
 
 		 271 aa  47.8  0.0002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2779  hydratase/decarboxylase  29.77 
 
 		 273 aa  47.8  0.0002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.963348  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3324  4-oxalocrotonate decarboxylase  30.86 
 
 		 264 aa  47.8  0.0002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0344  2-oxo-hepta-3-ene-1,7-dioic acid hydratase  28.12 
 
 		 147 aa  47.4  0.0002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.713008 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>