262 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_5134 on replicon NC_007949
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007949  Bpro_5134  hydratase/decarboxylase  100 
 
 		 263 aa  531  1e-150  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0285955 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1466  4-oxalocrotonate decarboxylase  67.7 
 
 		 273 aa  347  8e-95  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7646  4-oxalocrotonate decarboxylase  67.32 
 
 		 274 aa  341  8e-93  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.573554 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5207  2-keto-4-pentenoate hydratase  62.02 
 
 		 273 aa  307  1.0000000000000001e-82  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.133138  normal  0.334182 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5499  4-oxalocrotonate decarboxylase  61.09 
 
 		 274 aa  305  5.0000000000000004e-82  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2875  4-oxalocrotonate decarboxylase  60 
 
 		 268 aa  299  4e-80  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0367853 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0905  hydratase/decarboxylase  62.24 
 
 		 263 aa  295  6e-79  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0436706  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1354  hydratase/decarboxylase  62.66 
 
 		 262 aa  295  6e-79  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000612409  decreased coverage  0.00000118865 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3854  hydratase/decarboxylase  57.87 
 
 		 264 aa  290  2e-77  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.595722  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0272  4-oxalocrotonate decarboxylase  58.17 
 
 		 262 aa  286  2e-76  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5220  4-oxalocrotonate decarboxylase  57.37 
 
 		 264 aa  283  2.0000000000000002e-75  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2011  4-oxalocrotonate decarboxylase  55.56 
 
 		 260 aa  283  3.0000000000000004e-75  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.781375  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1477  4-oxalocrotonate decarboxylase  55.91 
 
 		 264 aa  281  6.000000000000001e-75  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3520  4-oxalocrotonate decarboxylase  56.39 
 
 		 263 aa  278  9e-74  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0986627 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3548  2-hydroxypenta-2,4-dienoate hydratase (CmtF)  55.3 
 
 		 262 aa  277  1e-73  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.107167 
 
 
-
 
NC_003296  RS01662  putative hydratase protein  59.26 
 
 		 265 aa  276  3e-73  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.103932  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4537  4-oxalocrotonate decarboxylase  55.64 
 
 		 262 aa  273  2.0000000000000002e-72  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1982  2-keto-4-pentenoate hydratase  56.3 
 
 		 264 aa  273  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.572392 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1149  2-oxopent-4-enoate hydratase  50.38 
 
 		 269 aa  270  1e-71  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.363401  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9115  2-oxopent-4-enoate hydratase  56.35 
 
 		 265 aa  269  2.9999999999999997e-71  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0936  4-oxalocrotonate decarboxylase  54.98 
 
 		 268 aa  266  2.9999999999999995e-70  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.101712  normal  0.608159 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2884  4-oxalocrotonate decarboxylase  55.12 
 
 		 288 aa  261  6.999999999999999e-69  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0414  2-keto-4-pentenoate hydratase  51.17 
 
 		 269 aa  258  7e-68  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0374  2-keto-4-pentenoate hydratase  51.17 
 
 		 269 aa  258  7e-68  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.832182  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0381  2-keto-4-pentenoate hydratase  51.17 
 
 		 269 aa  258  8e-68  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.795138  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2327  putative 2-hydroxypenta-2,4-dienoate hydratase(MhpD)  54.23 
 
 		 268 aa  258  1e-67  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00304  2-keto-4-pentenoate hydratase  51.17 
 
 		 269 aa  256  2e-67  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.503312  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3256  4-oxalocrotonate decarboxylase  51.17 
 
 		 269 aa  256  2e-67  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3275  2-keto-4-pentenoate hydratase  51.17 
 
 		 269 aa  256  2e-67  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.235013  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00308  hypothetical protein  51.17 
 
 		 269 aa  256  2e-67  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.527408  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1186  4-oxalocrotonate decarboxylase  53.31 
 
 		 264 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0763202  normal  0.362959 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15110  2-keto-4-pentenoate hydratase  51.54 
 
 		 264 aa  254  1.0000000000000001e-66  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.473426  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2890  4-oxalocrotonate decarboxylase  53.73 
 
 		 262 aa  254  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.254961 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0911  4-oxalocrotonate decarboxylase  53.1 
 
 		 277 aa  253  2.0000000000000002e-66  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.625128 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0425  2-keto-4-pentenoate hydratase  51.42 
 
 		 269 aa  249  3e-65  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3527  4-oxalocrotonate decarboxylase  54.09 
 
 		 265 aa  249  3e-65  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3902  4-oxalocrotonate decarboxylase  52.11 
 
 		 265 aa  242  3.9999999999999997e-63  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.561065 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42150  2-hydroxypent-2,4-dienoate hydratase  50.21 
 
 		 261 aa  239  4e-62  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.293913  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3512  4-oxalocrotonate decarboxylase  46.18 
 
 		 269 aa  229  3e-59  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1651  4-oxalocrotonate decarboxylase  48.81 
 
 		 275 aa  228  7e-59  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.452701  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4745  4-oxalocrotonate decarboxylase  48.64 
 
 		 270 aa  228  1e-58  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5436  4-oxalocrotonate decarboxylase  48.63 
 
 		 274 aa  223  3e-57  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  normal  0.635895 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5833  4-oxalocrotonate decarboxylase  48.63 
 
 		 274 aa  223  3e-57  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2111  4-oxalocrotonate decarboxylase  48.45 
 
 		 280 aa  220  1.9999999999999999e-56  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4393  hydratase/decarboxylase  48.4 
 
 		 283 aa  211  1e-53  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2296  2-oxopent-4-enoate hydratase  44.05 
 
 		 259 aa  208  6e-53  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2779  hydratase/decarboxylase  45.76 
 
 		 273 aa  208  9e-53  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.963348  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3242  hydratase/decarboxylase  47.83 
 
 		 260 aa  207  2e-52  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000968427  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2151  4-oxalocrotonate decarboxylase  46.22 
 
 		 271 aa  206  3e-52  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4925  4-oxalocrotonate decarboxylase  46.27 
 
 		 260 aa  196  3e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.624784  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4085  2-oxopent-4-enoate hydratase  40.78 
 
 		 267 aa  196  4.0000000000000005e-49  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000524317 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1639  4-oxalocrotonate decarboxylase  44.53 
 
 		 259 aa  196  5.000000000000001e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.193054 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2077  2-oxopent-4-enoate hydratase  42.63 
 
 		 261 aa  194  1e-48  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.849096  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1321  hydratase/decarboxylase  40.89 
 
 		 262 aa  190  2e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0604012  normal  0.404919 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3544  2-oxopent-4-enoate hydratase  39.13 
 
 		 260 aa  187  2e-46  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.127016  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4620  2-oxopent-4-enoate hydratase  39.13 
 
 		 260 aa  187  2e-46  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.275598  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2774  hydratase/decarboxylase  40.47 
 
 		 260 aa  186  3e-46  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.00000469641  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3785  hydratase/decarboxylase  39.3 
 
 		 260 aa  186  3e-46  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0026227  hitchhiker  0.00282888 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4144  4-oxalocrotonate decarboxylase  41.8 
 
 		 260 aa  186  3e-46  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.246439 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3091  2-oxopent-4-enoate hydratase  41.25 
 
 		 260 aa  185  6e-46  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.42559  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2961  4-oxalocrotonate decarboxylase  41.6 
 
 		 260 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.665549  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5691  4-oxalocrotonate decarboxylase  37.65 
 
 		 260 aa  183  3e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3343  2-oxopent-4-enoate hydratase  38.74 
 
 		 260 aa  182  6e-45  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2460  4-oxalocrotonate decarboxylase  40.62 
 
 		 260 aa  182  6e-45  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.768834  normal  0.296337 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2273  4-oxalocrotonate decarboxylase  39.06 
 
 		 261 aa  181  1e-44  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2118  4-oxalocrotonate decarboxylase  37.94 
 
 		 271 aa  181  1e-44  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.609149  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1189  2-hydroxypenta-2,4-dienoate hydratase (BphH)  40.96 
 
 		 264 aa  181  1e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.375643  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1621  2-oxopent-4-enoate hydratase  40 
 
 		 264 aa  180  2e-44  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3325  4-oxalocrotonate decarboxylase  38.91 
 
 		 266 aa  180  2e-44  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0534  2-oxopent-4-enoate hydratase  42.35 
 
 		 267 aa  180  2e-44  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2785  4-oxalocrotonate decarboxylase  37.89 
 
 		 261 aa  179  4e-44  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.197083 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1777  4-oxalocrotonate decarboxylase  40.42 
 
 		 257 aa  178  8e-44  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30610  2-Hydroxypent-2,4-dienoate hydratase; LapE  38.37 
 
 		 265 aa  175  8e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.000960153  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1392  4-oxalocrotonate decarboxylase  38.98 
 
 		 263 aa  174  9e-43  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0975696 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2578  4-oxalocrotonate decarboxylase  42.34 
 
 		 276 aa  174  9.999999999999999e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1459  4-oxalocrotonate decarboxylase  38.55 
 
 		 260 aa  173  1.9999999999999998e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.512129  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0222  4-oxalocrotonate decarboxylase  41.5 
 
 		 262 aa  172  6.999999999999999e-42  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1510  4-oxalocrotonate decarboxylase  36.8 
 
 		 260 aa  171  1e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0224  2-oxopent-4-enoate hydratase  39.16 
 
 		 264 aa  171  1e-41  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0261621  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0439  2-oxopent-4-enoate hydratase  41.53 
 
 		 263 aa  170  2e-41  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0138498 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2405  4-oxalocrotonate decarboxylase  41.63 
 
 		 267 aa  164  2.0000000000000002e-39  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2039  4-oxalocrotonate decarboxylase  40 
 
 		 273 aa  162  5.0000000000000005e-39  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3499  2-oxo-hepta-3-ene-1,7-dioic acid hydratase  37.79 
 
 		 266 aa  157  1e-37  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00827858 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4832  2-oxopent-4-enoate hydratase  37.45 
 
 		 279 aa  157  2e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0838304  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3464  2-oxo-hepta-3-ene-1,7-dioic acid hydratase  35.74 
 
 		 266 aa  155  7e-37  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5928  hydratase/decarboxylase  34.75 
 
 		 268 aa  154  2e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3798  2-oxopent-4-enoate hydratase  38.62 
 
 		 261 aa  152  4e-36  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.138107  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4269  2-oxo-hepta-3-ene-1,7-dioic acid hydratase  35.38 
 
 		 282 aa  152  5e-36  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.238552  normal  0.686193 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1476  2-oxo-hepta-3-ene-1,7-dioic acid hydratase  34.88 
 
 		 260 aa  150  3e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.161964 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1520  4-oxalocrotonate decarboxylase  37.11 
 
 		 261 aa  149  4e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3472  2-oxopent-4-enoate hydratase  36.43 
 
 		 260 aa  149  4e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.102578  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2155  2-hydroxypenta-2,4-dienoate hydratase, putative  35.06 
 
 		 255 aa  149  6e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3689  hydratase/decarboxylase  37.34 
 
 		 266 aa  147  1.0000000000000001e-34  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13569  hydratase  37.45 
 
 		 261 aa  147  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000748615 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4209  4-oxalocrotonate decarboxylase  38.64 
 
 		 264 aa  148  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3088  2-oxo-hepta-3-ene-1,7-dioic acid hydratase  34.23 
 
 		 266 aa  147  2.0000000000000003e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.325663  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4661  4-oxalocrotonate decarboxylase  36.82 
 
 		 261 aa  147  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.930854  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4749  4-oxalocrotonate decarboxylase  36.82 
 
 		 261 aa  147  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0856703  normal  0.088822 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0909  2-oxopent-4-enoate hydratase  34.63 
 
 		 262 aa  146  3e-34  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08670  4-oxo-4-pentenoate hydratase, XylJ  38.72 
 
 		 261 aa  146  4.0000000000000006e-34  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>