278 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_3785 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007298  Daro_3785  hydratase/decarboxylase  100 
 
 		 260 aa  525  1e-148  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0026227  hitchhiker  0.00282888 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2774  hydratase/decarboxylase  86.54 
 
 		 260 aa  461  1e-129  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.00000469641  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3091  2-oxopent-4-enoate hydratase  82.69 
 
 		 260 aa  446  1.0000000000000001e-124  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.42559  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1321  hydratase/decarboxylase  71.43 
 
 		 262 aa  394  1e-108  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0604012  normal  0.404919 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2077  2-oxopent-4-enoate hydratase  73.08 
 
 		 261 aa  386  1e-106  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.849096  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0222  4-oxalocrotonate decarboxylase  74.23 
 
 		 262 aa  380  1e-104  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1189  2-hydroxypenta-2,4-dienoate hydratase (BphH)  71.81 
 
 		 264 aa  365  1e-100  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.375643  normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4144  4-oxalocrotonate decarboxylase  71.04 
 
 		 260 aa  363  1e-99  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.246439 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2961  4-oxalocrotonate decarboxylase  68.73 
 
 		 260 aa  354  8.999999999999999e-97  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.665549  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2273  4-oxalocrotonate decarboxylase  65.77 
 
 		 261 aa  345  4e-94  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2785  4-oxalocrotonate decarboxylase  64.62 
 
 		 261 aa  345  5e-94  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.197083 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3343  2-oxopent-4-enoate hydratase  64.23 
 
 		 260 aa  340  1e-92  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4620  2-oxopent-4-enoate hydratase  63.46 
 
 		 260 aa  338  7e-92  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.275598  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2460  4-oxalocrotonate decarboxylase  61.92 
 
 		 260 aa  338  7e-92  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.768834  normal  0.296337 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3544  2-oxopent-4-enoate hydratase  63.46 
 
 		 260 aa  338  7e-92  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.127016  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5691  4-oxalocrotonate decarboxylase  62.69 
 
 		 260 aa  336  1.9999999999999998e-91  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3325  4-oxalocrotonate decarboxylase  60.23 
 
 		 266 aa  329  2e-89  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30610  2-Hydroxypent-2,4-dienoate hydratase; LapE  60.62 
 
 		 265 aa  326  3e-88  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.000960153  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1510  4-oxalocrotonate decarboxylase  58.08 
 
 		 260 aa  320  9.999999999999999e-87  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1459  4-oxalocrotonate decarboxylase  56.92 
 
 		 260 aa  310  1e-83  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.512129  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1392  4-oxalocrotonate decarboxylase  56.7 
 
 		 263 aa  307  9e-83  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0975696 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08670  4-oxo-4-pentenoate hydratase, XylJ  62.45 
 
 		 261 aa  291  5e-78  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2118  4-oxalocrotonate decarboxylase  53.88 
 
 		 271 aa  276  3e-73  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.609149  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3689  hydratase/decarboxylase  54.3 
 
 		 266 aa  272  4.0000000000000004e-72  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4085  2-oxopent-4-enoate hydratase  50.4 
 
 		 267 aa  268  8.999999999999999e-71  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000524317 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1777  4-oxalocrotonate decarboxylase  54.17 
 
 		 257 aa  263  3e-69  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1621  2-oxopent-4-enoate hydratase  51.17 
 
 		 264 aa  256  2e-67  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1186  4-oxalocrotonate decarboxylase  49.03 
 
 		 264 aa  247  2e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0763202  normal  0.362959 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1149  2-oxopent-4-enoate hydratase  47.1 
 
 		 269 aa  236  4e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.363401  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2296  2-oxopent-4-enoate hydratase  45.06 
 
 		 259 aa  231  1e-59  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2011  4-oxalocrotonate decarboxylase  47.62 
 
 		 260 aa  228  9e-59  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.781375  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0272  4-oxalocrotonate decarboxylase  45.21 
 
 		 262 aa  225  7e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01662  putative hydratase protein  49.17 
 
 		 265 aa  224  1e-57  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.103932  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0936  4-oxalocrotonate decarboxylase  44.57 
 
 		 268 aa  221  9.999999999999999e-57  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.101712  normal  0.608159 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2155  2-hydroxypenta-2,4-dienoate hydratase, putative  47.04 
 
 		 255 aa  220  1.9999999999999999e-56  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42150  2-hydroxypent-2,4-dienoate hydratase  47.92 
 
 		 261 aa  219  3.9999999999999997e-56  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.293913  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1466  4-oxalocrotonate decarboxylase  43.89 
 
 		 273 aa  219  5e-56  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1477  4-oxalocrotonate decarboxylase  44.79 
 
 		 264 aa  218  5e-56  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3512  4-oxalocrotonate decarboxylase  42.08 
 
 		 269 aa  218  6e-56  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1982  2-keto-4-pentenoate hydratase  44.02 
 
 		 264 aa  218  1e-55  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.572392 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2875  4-oxalocrotonate decarboxylase  44.09 
 
 		 268 aa  216  2e-55  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0367853 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4537  4-oxalocrotonate decarboxylase  43.41 
 
 		 262 aa  216  2.9999999999999998e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9115  2-oxopent-4-enoate hydratase  46.27 
 
 		 265 aa  216  4e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2111  4-oxalocrotonate decarboxylase  45.56 
 
 		 280 aa  215  5.9999999999999996e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7646  4-oxalocrotonate decarboxylase  43.35 
 
 		 274 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.573554 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0911  4-oxalocrotonate decarboxylase  46.72 
 
 		 277 aa  214  9.999999999999999e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.625128 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5207  2-keto-4-pentenoate hydratase  42.64 
 
 		 273 aa  213  1.9999999999999998e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.133138  normal  0.334182 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3902  4-oxalocrotonate decarboxylase  46.59 
 
 		 265 aa  213  1.9999999999999998e-54  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.561065 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3527  4-oxalocrotonate decarboxylase  45.78 
 
 		 265 aa  213  2.9999999999999995e-54  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0534  2-oxopent-4-enoate hydratase  43.46 
 
 		 267 aa  212  4.9999999999999996e-54  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0381  2-keto-4-pentenoate hydratase  42.69 
 
 		 269 aa  212  5.999999999999999e-54  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.795138  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5499  4-oxalocrotonate decarboxylase  42.26 
 
 		 274 aa  211  1e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0225  4-oxalocrotonate decarboxylase  43.63 
 
 		 262 aa  211  1e-53  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3275  2-keto-4-pentenoate hydratase  42.69 
 
 		 269 aa  210  2e-53  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.235013  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3520  4-oxalocrotonate decarboxylase  44.19 
 
 		 263 aa  210  2e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0986627 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0905  hydratase/decarboxylase  45.83 
 
 		 263 aa  209  3e-53  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0436706  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3256  4-oxalocrotonate decarboxylase  42.31 
 
 		 269 aa  208  6e-53  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00304  2-keto-4-pentenoate hydratase  42.31 
 
 		 269 aa  208  8e-53  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.503312  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00308  hypothetical protein  42.31 
 
 		 269 aa  208  8e-53  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.527408  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0414  2-keto-4-pentenoate hydratase  42.31 
 
 		 269 aa  207  1e-52  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0374  2-keto-4-pentenoate hydratase  42.31 
 
 		 269 aa  207  1e-52  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.832182  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2578  4-oxalocrotonate decarboxylase  46.5 
 
 		 276 aa  207  1e-52  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0224  2-oxopent-4-enoate hydratase  44.62 
 
 		 264 aa  207  1e-52  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0261621  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0425  2-keto-4-pentenoate hydratase  43.31 
 
 		 269 aa  207  2e-52  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3781  hydratase/decarboxylase  43.24 
 
 		 262 aa  206  2e-52  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0303669  decreased coverage  0.000202677 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15110  2-keto-4-pentenoate hydratase  43.58 
 
 		 264 aa  206  3e-52  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.473426  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2884  4-oxalocrotonate decarboxylase  44.92 
 
 		 288 aa  206  4e-52  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5436  4-oxalocrotonate decarboxylase  42.52 
 
 		 274 aa  205  5e-52  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  normal  0.635895 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5833  4-oxalocrotonate decarboxylase  42.52 
 
 		 274 aa  205  5e-52  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1639  4-oxalocrotonate decarboxylase  45.83 
 
 		 259 aa  205  6e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.193054 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1354  hydratase/decarboxylase  44.58 
 
 		 262 aa  204  1e-51  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000612409  decreased coverage  0.00000118865 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0439  2-oxopent-4-enoate hydratase  44.16 
 
 		 263 aa  203  2e-51  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0138498 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3242  hydratase/decarboxylase  47.96 
 
 		 260 aa  203  3e-51  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000968427  normal  1 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3854  hydratase/decarboxylase  42.47 
 
 		 264 aa  202  3e-51  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.595722  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5220  4-oxalocrotonate decarboxylase  39.77 
 
 		 264 aa  202  6e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2327  putative 2-hydroxypenta-2,4-dienoate hydratase(MhpD)  46.12 
 
 		 268 aa  202  6e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2405  4-oxalocrotonate decarboxylase  45.35 
 
 		 267 aa  201  9.999999999999999e-51  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2158  4-oxalocrotonate decarboxylase  39.68 
 
 		 262 aa  201  9.999999999999999e-51  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3090  4-oxalocrotonate decarboxylase  43.85 
 
 		 262 aa  201  9.999999999999999e-51  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2299  4-oxalocrotonate decarboxylase  42.23 
 
 		 261 aa  201  9.999999999999999e-51  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2773  hydratase/decarboxylase  43.08 
 
 		 262 aa  198  7e-50  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000493793  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4745  4-oxalocrotonate decarboxylase  43.56 
 
 		 270 aa  197  1.0000000000000001e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2039  4-oxalocrotonate decarboxylase  43.77 
 
 		 273 aa  197  2.0000000000000003e-49  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1318  hydratase/decarboxylase  39.62 
 
 		 262 aa  196  3e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.288999  normal  0.257061 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3548  2-hydroxypenta-2,4-dienoate hydratase (CmtF)  46.4 
 
 		 262 aa  196  4.0000000000000005e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.107167 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4832  2-oxopent-4-enoate hydratase  41.35 
 
 		 279 aa  194  1e-48  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0838304  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0909  2-oxopent-4-enoate hydratase  37.07 
 
 		 262 aa  194  2e-48  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2890  4-oxalocrotonate decarboxylase  48.79 
 
 		 262 aa  192  4e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.254961 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4569  4-oxalocrotonate decarboxylase  40.87 
 
 		 264 aa  191  7e-48  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00147074 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30600  4-oxalocrotonate decarboxylase; LapH  38.61 
 
 		 267 aa  190  2e-47  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.0000150281  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4209  4-oxalocrotonate decarboxylase  42.08 
 
 		 264 aa  189  2.9999999999999997e-47  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3524  2-oxo-hepta-3-ene-1,7-dioic acid hydratase  40.54 
 
 		 261 aa  189  4e-47  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5044  4-oxalocrotonate decarboxylase  40.48 
 
 		 261 aa  189  5e-47  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4661  4-oxalocrotonate decarboxylase  40.08 
 
 		 261 aa  188  5.999999999999999e-47  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.930854  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4749  4-oxalocrotonate decarboxylase  40.08 
 
 		 261 aa  188  5.999999999999999e-47  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0856703  normal  0.088822 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5134  hydratase/decarboxylase  39.3 
 
 		 263 aa  186  2e-46  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0285955 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2958  4-oxalocrotonate decarboxylase  39.61 
 
 		 262 aa  186  3e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.351017  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13569  hydratase  38.49 
 
 		 261 aa  186  4e-46  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000748615 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1520  4-oxalocrotonate decarboxylase  40.08 
 
 		 261 aa  186  4e-46  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3612  2-oxo-hepta-3-ene-1,7-dioic acid hydratase  38.61 
 
 		 261 aa  186  5e-46  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>