278 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mjls_4209 on replicon NC_009077
Organism: Mycobacterium sp. JLS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009077  Mjls_4209  4-oxalocrotonate decarboxylase  100 
 
 
264 aa  533  1e-151  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0534  2-oxopent-4-enoate hydratase  62.79 
 
 
267 aa  299  4e-80  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0224  2-oxopent-4-enoate hydratase  55.43 
 
 
264 aa  267  1e-70  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0261621  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4085  2-oxopent-4-enoate hydratase  52.55 
 
 
267 aa  263  3e-69  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000524317 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3798  2-oxopent-4-enoate hydratase  55.24 
 
 
261 aa  257  1e-67  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.138107  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0439  2-oxopent-4-enoate hydratase  51.91 
 
 
263 aa  247  2e-64  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0138498 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1621  2-oxopent-4-enoate hydratase  49.04 
 
 
264 aa  234  1.0000000000000001e-60  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1321  hydratase/decarboxylase  45.17 
 
 
262 aa  233  3e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0604012  normal  0.404919 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2296  2-oxopent-4-enoate hydratase  48.21 
 
 
259 aa  228  1e-58  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9115  2-oxopent-4-enoate hydratase  48.06 
 
 
265 aa  226  3e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3520  4-oxalocrotonate decarboxylase  47.86 
 
 
263 aa  219  3e-56  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0986627 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1777  4-oxalocrotonate decarboxylase  47.7 
 
 
257 aa  219  3.9999999999999997e-56  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1149  2-oxopent-4-enoate hydratase  42.59 
 
 
269 aa  219  3.9999999999999997e-56  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.363401  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2460  4-oxalocrotonate decarboxylase  45.17 
 
 
260 aa  218  7e-56  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.768834  normal  0.296337 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3785  hydratase/decarboxylase  42.08 
 
 
260 aa  214  9e-55  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0026227  hitchhiker  0.00282888 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5691  4-oxalocrotonate decarboxylase  42.08 
 
 
260 aa  214  9.999999999999999e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3902  4-oxalocrotonate decarboxylase  47.51 
 
 
265 aa  214  9.999999999999999e-55  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.561065 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2774  hydratase/decarboxylase  43.48 
 
 
260 aa  213  1.9999999999999998e-54  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.00000469641  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1186  4-oxalocrotonate decarboxylase  44.32 
 
 
264 aa  213  1.9999999999999998e-54  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0763202  normal  0.362959 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2273  4-oxalocrotonate decarboxylase  41.76 
 
 
261 aa  211  7e-54  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3343  2-oxopent-4-enoate hydratase  42.69 
 
 
260 aa  211  9e-54  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2785  4-oxalocrotonate decarboxylase  41.7 
 
 
261 aa  211  1e-53  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.197083 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1477  4-oxalocrotonate decarboxylase  41.67 
 
 
264 aa  209  3e-53  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1189  2-hydroxypenta-2,4-dienoate hydratase (BphH)  45.17 
 
 
264 aa  208  7e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.375643  normal 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4144  4-oxalocrotonate decarboxylase  45.17 
 
 
260 aa  208  7e-53  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.246439 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2155  2-hydroxypenta-2,4-dienoate hydratase, putative  43.87 
 
 
255 aa  208  8e-53  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0240  2-oxo-hepta-3-ene-1,7-dioic acid hydratase  40.71 
 
 
267 aa  208  8e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5044  4-oxalocrotonate decarboxylase  45.77 
 
 
261 aa  208  9e-53  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3527  4-oxalocrotonate decarboxylase  45.77 
 
 
265 aa  207  1e-52  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30610  2-Hydroxypent-2,4-dienoate hydratase; LapE  41.92 
 
 
265 aa  206  2e-52  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.000960153  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2077  2-oxopent-4-enoate hydratase  42.86 
 
 
261 aa  207  2e-52  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.849096  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4661  4-oxalocrotonate decarboxylase  45.38 
 
 
261 aa  207  2e-52  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.930854  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2011  4-oxalocrotonate decarboxylase  43.97 
 
 
260 aa  207  2e-52  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.781375  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4749  4-oxalocrotonate decarboxylase  45.38 
 
 
261 aa  207  2e-52  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0856703  normal  0.088822 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3544  2-oxopent-4-enoate hydratase  40.93 
 
 
260 aa  206  4e-52  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.127016  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4620  2-oxopent-4-enoate hydratase  40.93 
 
 
260 aa  206  4e-52  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.275598  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13569  hydratase  44.44 
 
 
261 aa  205  5e-52  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000748615 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1520  4-oxalocrotonate decarboxylase  46.25 
 
 
261 aa  205  6e-52  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3091  2-oxopent-4-enoate hydratase  41.31 
 
 
260 aa  205  6e-52  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.42559  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3472  2-oxopent-4-enoate hydratase  45.38 
 
 
260 aa  204  1e-51  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.102578  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01662  putative hydratase protein  44.4 
 
 
265 aa  203  2e-51  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.103932  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1510  4-oxalocrotonate decarboxylase  43.63 
 
 
260 aa  201  7e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10590  2-oxo-hept-3-ene-1,7-dioate hydratase  42.47 
 
 
267 aa  201  7e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3854  hydratase/decarboxylase  42.64 
 
 
264 aa  201  9e-51  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.595722  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4313  2-oxo-hepta-3-ene-1,7-dioic acid hydratase  41.7 
 
 
268 aa  200  1.9999999999999998e-50  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4066  2-oxo-hepta-3-ene-1,7-dioic acid hydratase  41.38 
 
 
274 aa  200  1.9999999999999998e-50  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.597772 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2420  2-oxo-hepta-3-ene-1,7-dioic acid hydratase  42.47 
 
 
278 aa  200  1.9999999999999998e-50  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0965  2-oxo-hept-3-ene-1,7-dioate hydratase  42.58 
 
 
267 aa  200  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2299  4-oxalocrotonate decarboxylase  42.58 
 
 
261 aa  200  1.9999999999999998e-50  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3325  4-oxalocrotonate decarboxylase  42.08 
 
 
266 aa  199  3e-50  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3512  4-oxalocrotonate decarboxylase  42.91 
 
 
269 aa  200  3e-50  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1466  4-oxalocrotonate decarboxylase  42.47 
 
 
273 aa  199  3e-50  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4279  2-oxo-hepta-3-ene-1,7-dioic acid hydratase  40.07 
 
 
268 aa  199  3.9999999999999996e-50  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  decreased coverage  0.00917502  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3589  2-oxo-hepta-3-ene-1,7-dioic acid hydratase  40.45 
 
 
268 aa  199  5e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.82541  normal  0.773607 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1787  2-oxo-hepta-3-ene-1,7-dioic acid hydratase  41.47 
 
 
267 aa  198  7e-50  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.995557  normal  0.779131 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5499  4-oxalocrotonate decarboxylase  42.26 
 
 
274 aa  197  1.0000000000000001e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7646  4-oxalocrotonate decarboxylase  44.71 
 
 
274 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.573554 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4537  4-oxalocrotonate decarboxylase  42.29 
 
 
262 aa  196  2.0000000000000003e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2961  4-oxalocrotonate decarboxylase  45.63 
 
 
260 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.665549  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2941  2-oxo-hepta-3-ene-1,7-dioate hydratase  41.67 
 
 
268 aa  197  2.0000000000000003e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1982  2-keto-4-pentenoate hydratase  41.86 
 
 
264 aa  196  4.0000000000000005e-49  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.572392 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1708  2-oxo-hepta-3-ene-1,7-dioic acid hydratase  40 
 
 
268 aa  196  4.0000000000000005e-49  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.899066  normal  0.363906 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2884  4-oxalocrotonate decarboxylase  43.7 
 
 
288 aa  195  6e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0909  2-oxopent-4-enoate hydratase  43.08 
 
 
262 aa  194  9e-49  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0943  2-oxo-hepta-3-ene-1,7-dioic acid hydratase  41.63 
 
 
267 aa  194  1e-48  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3524  2-oxo-hepta-3-ene-1,7-dioic acid hydratase  40.64 
 
 
261 aa  194  1e-48  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1028  2-oxo-hepta-3-ene-1,7-dioic acid hydratase  41.63 
 
 
267 aa  193  2e-48  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1135  2-oxo-hepta-3-ene-1,7-dioate hydratase  41.63 
 
 
267 aa  193  2e-48  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2269  2-oxo-hepta-3-ene-1,7-dioic acid hydratase  41.63 
 
 
267 aa  193  2e-48  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1508  2-oxo-hepta-3-ene-1,7-dioic acid hydratase  41.63 
 
 
267 aa  193  2e-48  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.576593  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0105  2-oxo-hepta-3-ene-1,7-dioic acid hydratase  41.63 
 
 
267 aa  193  2e-48  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.274919  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1778  4-oxalocrotonate decarboxylase  41.09 
 
 
267 aa  193  3e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.110144 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2875  4-oxalocrotonate decarboxylase  41.54 
 
 
268 aa  192  3e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0367853 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5829  2-oxo-hepta-3-ene-1,7-dioic acid hydratase  40.08 
 
 
267 aa  192  6e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.193631  normal  0.310568 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2033  putative 2-oxo-hept-3-ene-1,7-dioate hydratase(HpaH)  40.46 
 
 
267 aa  192  7e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.25595  normal  0.0822961 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3612  2-oxo-hepta-3-ene-1,7-dioic acid hydratase  39.84 
 
 
261 aa  191  7e-48  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1730  2-oxo-hepta-3-ene-1,7-dioic acid hydratase  41.25 
 
 
267 aa  191  8e-48  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3502  2-oxo-hepta-3-ene-1,7-dioic acid hydratase  40.38 
 
 
267 aa  191  8e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.328452  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0905  hydratase/decarboxylase  42.5 
 
 
263 aa  191  1e-47  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0436706  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1790  4-oxalocrotonate decarboxylase  41.73 
 
 
263 aa  191  1e-47  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0308919  normal  0.205885 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5207  2-keto-4-pentenoate hydratase  43.02 
 
 
273 aa  191  1e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.133138  normal  0.334182 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1354  hydratase/decarboxylase  42.92 
 
 
262 aa  190  2e-47  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000612409  decreased coverage  0.00000118865 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0381  2-keto-4-pentenoate hydratase  40.38 
 
 
269 aa  190  2e-47  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.795138  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5236  4-oxalocrotonate decarboxylase  43.85 
 
 
261 aa  190  2e-47  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.270652 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3281  2-oxo-hepta-3-ene-1,7-dioic acid hydratase  41.09 
 
 
267 aa  189  2.9999999999999997e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0269586  normal  0.185525 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4271  2-oxo-hepta-3-ene-1,7-dioic acid hydratase  40.54 
 
 
268 aa  189  2.9999999999999997e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.623769  normal  0.550033 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4130  2-oxo-hepta-3-ene-1,7-dioic acid hydratase  41.09 
 
 
267 aa  189  2.9999999999999997e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0570046  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4236  2-oxo-hepta-3-ene-1,7-dioic acid hydratase  41.09 
 
 
267 aa  189  2.9999999999999997e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.119671  normal  0.0833029 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3275  2-keto-4-pentenoate hydratase  40.38 
 
 
269 aa  189  2.9999999999999997e-47  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.235013  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30600  4-oxalocrotonate decarboxylase; LapH  41.76 
 
 
267 aa  189  5e-47  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.0000150281  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3658  2-oxo-hepta-3-ene-1,7-dioic acid hydratase  40.7 
 
 
267 aa  188  5.999999999999999e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.504721 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08670  4-oxo-4-pentenoate hydratase, XylJ  47.54 
 
 
261 aa  188  8e-47  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3256  4-oxalocrotonate decarboxylase  40 
 
 
269 aa  188  9e-47  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00304  2-keto-4-pentenoate hydratase  40 
 
 
269 aa  187  1e-46  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.503312  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4132  2-oxo-hepta-3-ene-1,7-dioic acid hydratase  40.7 
 
 
267 aa  188  1e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.138195  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2158  4-oxalocrotonate decarboxylase  37.8 
 
 
262 aa  188  1e-46  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0414  2-keto-4-pentenoate hydratase  40 
 
 
269 aa  187  1e-46  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0374  2-keto-4-pentenoate hydratase  40 
 
 
269 aa  187  1e-46  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.832182  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4445  2-oxo-hepta-3-ene-1,7-dioic acid hydratase  39.93 
 
 
267 aa  188  1e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.549639  normal  0.132657 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00308  hypothetical protein  40 
 
 
269 aa  187  1e-46  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.527408  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>