262 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_30610 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012560  Avin_30610  2-Hydroxypent-2,4-dienoate hydratase; LapE  100 
 
 		 265 aa  534  1e-151  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.000960153  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3325  4-oxalocrotonate decarboxylase  76.98 
 
 		 266 aa  419  1e-116  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2273  4-oxalocrotonate decarboxylase  67.18 
 
 		 261 aa  350  1e-95  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3343  2-oxopent-4-enoate hydratase  66.41 
 
 		 260 aa  347  1e-94  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2785  4-oxalocrotonate decarboxylase  64.86 
 
 		 261 aa  343  2e-93  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.197083 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5691  4-oxalocrotonate decarboxylase  64.09 
 
 		 260 aa  340  1e-92  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4620  2-oxopent-4-enoate hydratase  65.25 
 
 		 260 aa  340  1e-92  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.275598  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3544  2-oxopent-4-enoate hydratase  65.25 
 
 		 260 aa  340  1e-92  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.127016  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1321  hydratase/decarboxylase  61 
 
 		 262 aa  335  2.9999999999999997e-91  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0604012  normal  0.404919 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3091  2-oxopent-4-enoate hydratase  61.39 
 
 		 260 aa  330  1e-89  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.42559  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3785  hydratase/decarboxylase  60.62 
 
 		 260 aa  326  3e-88  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0026227  hitchhiker  0.00282888 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1189  2-hydroxypenta-2,4-dienoate hydratase (BphH)  62.55 
 
 		 264 aa  323  1e-87  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.375643  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2774  hydratase/decarboxylase  60.62 
 
 		 260 aa  323  2e-87  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.00000469641  normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4144  4-oxalocrotonate decarboxylase  61.78 
 
 		 260 aa  321  7e-87  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.246439 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2077  2-oxopent-4-enoate hydratase  60.23 
 
 		 261 aa  314  9.999999999999999e-85  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.849096  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2961  4-oxalocrotonate decarboxylase  60.77 
 
 		 260 aa  307  1.0000000000000001e-82  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.665549  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0222  4-oxalocrotonate decarboxylase  62.99 
 
 		 262 aa  306  2.0000000000000002e-82  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2460  4-oxalocrotonate decarboxylase  57.14 
 
 		 260 aa  303  2.0000000000000002e-81  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.768834  normal  0.296337 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1510  4-oxalocrotonate decarboxylase  58.3 
 
 		 260 aa  300  2e-80  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1459  4-oxalocrotonate decarboxylase  59.2 
 
 		 260 aa  295  4e-79  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.512129  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3689  hydratase/decarboxylase  56.64 
 
 		 266 aa  283  2.0000000000000002e-75  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2118  4-oxalocrotonate decarboxylase  54.69 
 
 		 271 aa  283  2.0000000000000002e-75  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.609149  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08670  4-oxo-4-pentenoate hydratase, XylJ  61.41 
 
 		 261 aa  278  9e-74  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1392  4-oxalocrotonate decarboxylase  50.78 
 
 		 263 aa  274  1.0000000000000001e-72  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0975696 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1621  2-oxopent-4-enoate hydratase  50.6 
 
 		 264 aa  240  1e-62  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2296  2-oxopent-4-enoate hydratase  50.21 
 
 		 259 aa  237  1e-61  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1777  4-oxalocrotonate decarboxylase  51.46 
 
 		 257 aa  234  8e-61  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4085  2-oxopent-4-enoate hydratase  45.53 
 
 		 267 aa  234  1.0000000000000001e-60  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000524317 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1149  2-oxopent-4-enoate hydratase  49.03 
 
 		 269 aa  233  2.0000000000000002e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.363401  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3902  4-oxalocrotonate decarboxylase  50.39 
 
 		 265 aa  224  1e-57  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.561065 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3527  4-oxalocrotonate decarboxylase  49.61 
 
 		 265 aa  221  8e-57  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2155  2-hydroxypenta-2,4-dienoate hydratase, putative  45.67 
 
 		 255 aa  214  1.9999999999999998e-54  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2011  4-oxalocrotonate decarboxylase  45.59 
 
 		 260 aa  211  1e-53  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.781375  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1477  4-oxalocrotonate decarboxylase  43.94 
 
 		 264 aa  211  1e-53  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1186  4-oxalocrotonate decarboxylase  44.79 
 
 		 264 aa  210  2e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0763202  normal  0.362959 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0936  4-oxalocrotonate decarboxylase  50 
 
 		 268 aa  210  2e-53  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.101712  normal  0.608159 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42150  2-hydroxypent-2,4-dienoate hydratase  49.78 
 
 		 261 aa  208  7e-53  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.293913  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9115  2-oxopent-4-enoate hydratase  44.96 
 
 		 265 aa  208  9e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1982  2-keto-4-pentenoate hydratase  44.44 
 
 		 264 aa  207  1e-52  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.572392 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0224  2-oxopent-4-enoate hydratase  45.63 
 
 		 264 aa  207  2e-52  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0261621  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5207  2-keto-4-pentenoate hydratase  48 
 
 		 273 aa  206  4e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.133138  normal  0.334182 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0911  4-oxalocrotonate decarboxylase  45.17 
 
 		 277 aa  205  6e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.625128 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2875  4-oxalocrotonate decarboxylase  44.57 
 
 		 268 aa  204  1e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0367853 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0534  2-oxopent-4-enoate hydratase  44.44 
 
 		 267 aa  203  3e-51  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5220  4-oxalocrotonate decarboxylase  42.8 
 
 		 264 aa  202  4e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3524  2-oxo-hepta-3-ene-1,7-dioic acid hydratase  42.47 
 
 		 261 aa  202  4e-51  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2884  4-oxalocrotonate decarboxylase  46.51 
 
 		 288 aa  202  4e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01662  putative hydratase protein  44.21 
 
 		 265 aa  202  6e-51  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.103932  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5499  4-oxalocrotonate decarboxylase  43.54 
 
 		 274 aa  201  9.999999999999999e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4537  4-oxalocrotonate decarboxylase  43.63 
 
 		 262 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0272  4-oxalocrotonate decarboxylase  44.18 
 
 		 262 aa  199  3e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1790  4-oxalocrotonate decarboxylase  41.57 
 
 		 263 aa  199  3.9999999999999996e-50  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0308919  normal  0.205885 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4569  4-oxalocrotonate decarboxylase  43.95 
 
 		 264 aa  197  1.0000000000000001e-49  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00147074 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20020  2-oxohept-3-enedioate hydratase  40 
 
 		 261 aa  196  4.0000000000000005e-49  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3612  2-oxo-hepta-3-ene-1,7-dioic acid hydratase  40.93 
 
 		 261 aa  196  4.0000000000000005e-49  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3520  4-oxalocrotonate decarboxylase  43.31 
 
 		 263 aa  193  2e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0986627 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2327  putative 2-hydroxypenta-2,4-dienoate hydratase(MhpD)  47.51 
 
 		 268 aa  193  2e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3798  2-oxopent-4-enoate hydratase  46.47 
 
 		 261 aa  193  3e-48  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.138107  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1466  4-oxalocrotonate decarboxylase  41.35 
 
 		 273 aa  192  4e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2420  2-oxo-hepta-3-ene-1,7-dioic acid hydratase  43.21 
 
 		 278 aa  192  5e-48  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0439  2-oxopent-4-enoate hydratase  44.72 
 
 		 263 aa  192  6e-48  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0138498 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2158  4-oxalocrotonate decarboxylase  37.86 
 
 		 262 aa  191  1e-47  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3854  hydratase/decarboxylase  42.59 
 
 		 264 aa  191  1e-47  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.595722  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0225  4-oxalocrotonate decarboxylase  40.77 
 
 		 262 aa  190  2e-47  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0905  hydratase/decarboxylase  45.12 
 
 		 263 aa  189  4e-47  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0436706  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7646  4-oxalocrotonate decarboxylase  46.19 
 
 		 274 aa  189  4e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.573554 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5436  4-oxalocrotonate decarboxylase  43.13 
 
 		 274 aa  188  8e-47  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  normal  0.635895 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5833  4-oxalocrotonate decarboxylase  43.13 
 
 		 274 aa  188  8e-47  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3512  4-oxalocrotonate decarboxylase  41 
 
 		 269 aa  187  1e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4313  2-oxo-hepta-3-ene-1,7-dioic acid hydratase  40.98 
 
 		 268 aa  188  1e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4271  2-oxo-hepta-3-ene-1,7-dioic acid hydratase  41.88 
 
 		 268 aa  187  2e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.623769  normal  0.550033 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3548  2-hydroxypenta-2,4-dienoate hydratase (CmtF)  44.21 
 
 		 262 aa  187  2e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.107167 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4209  4-oxalocrotonate decarboxylase  41.92 
 
 		 264 aa  186  3e-46  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30600  4-oxalocrotonate decarboxylase; LapH  41.67 
 
 		 267 aa  185  6e-46  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.0000150281  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3242  hydratase/decarboxylase  45.54 
 
 		 260 aa  184  2.0000000000000003e-45  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000968427  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2578  4-oxalocrotonate decarboxylase  43.73 
 
 		 276 aa  183  2.0000000000000003e-45  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2299  4-oxalocrotonate decarboxylase  39.29 
 
 		 261 aa  183  3e-45  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1639  4-oxalocrotonate decarboxylase  42.44 
 
 		 259 aa  183  3e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.193054 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1354  hydratase/decarboxylase  43.21 
 
 		 262 aa  182  4.0000000000000006e-45  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000612409  decreased coverage  0.00000118865 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2039  4-oxalocrotonate decarboxylase  41.09 
 
 		 273 aa  182  4.0000000000000006e-45  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2151  4-oxalocrotonate decarboxylase  42.41 
 
 		 271 aa  182  5.0000000000000004e-45  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2111  4-oxalocrotonate decarboxylase  42.37 
 
 		 280 aa  181  8.000000000000001e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13569  hydratase  39.11 
 
 		 261 aa  181  9.000000000000001e-45  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000748615 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15110  2-keto-4-pentenoate hydratase  43.57 
 
 		 264 aa  179  2.9999999999999997e-44  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.473426  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2890  4-oxalocrotonate decarboxylase  46.19 
 
 		 262 aa  179  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.254961 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0381  2-keto-4-pentenoate hydratase  42.15 
 
 		 269 aa  179  4e-44  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.795138  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1520  4-oxalocrotonate decarboxylase  37.55 
 
 		 261 aa  179  4e-44  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4445  2-oxo-hepta-3-ene-1,7-dioic acid hydratase  37.31 
 
 		 267 aa  179  4e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.549639  normal  0.132657 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3885  2-oxo-hepta-3-ene-1,7-dioic acid hydratase  41.34 
 
 		 271 aa  179  4e-44  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.294519  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2405  4-oxalocrotonate decarboxylase  44.32 
 
 		 267 aa  179  5.999999999999999e-44  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1627  2-oxo-hepta-3-ene-1,7-dioic acid hydratase  39.62 
 
 		 267 aa  177  1e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.72873 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3275  2-keto-4-pentenoate hydratase  42.15 
 
 		 269 aa  177  1e-43  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.235013  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4269  2-oxo-hepta-3-ene-1,7-dioic acid hydratase  40.53 
 
 		 282 aa  176  2e-43  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.238552  normal  0.686193 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4066  2-oxo-hepta-3-ene-1,7-dioic acid hydratase  42.55 
 
 		 274 aa  176  3e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.597772 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3256  4-oxalocrotonate decarboxylase  41.7 
 
 		 269 aa  176  4e-43  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0414  2-keto-4-pentenoate hydratase  42.15 
 
 		 269 aa  176  4e-43  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0374  2-keto-4-pentenoate hydratase  42.15 
 
 		 269 aa  176  4e-43  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.832182  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4279  2-oxo-hepta-3-ene-1,7-dioic acid hydratase  39.33 
 
 		 268 aa  175  5e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  decreased coverage  0.00917502  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00304  2-keto-4-pentenoate hydratase  41.7 
 
 		 269 aa  175  7e-43  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.503312  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00308  hypothetical protein  41.7 
 
 		 269 aa  175  7e-43  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.527408  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>