262 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_42150 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012560  Avin_42150  2-hydroxypent-2,4-dienoate hydratase  100 
 
 
261 aa  516  1.0000000000000001e-145  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.293913  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3242  hydratase/decarboxylase  60.59 
 
 
260 aa  285  4e-76  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000968427  normal 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3854  hydratase/decarboxylase  54.58 
 
 
264 aa  275  7e-73  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.595722  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2875  4-oxalocrotonate decarboxylase  55.69 
 
 
268 aa  274  9e-73  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0367853 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1477  4-oxalocrotonate decarboxylase  56.5 
 
 
264 aa  270  1e-71  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1149  2-oxopent-4-enoate hydratase  53.85 
 
 
269 aa  268  7e-71  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.363401  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0911  4-oxalocrotonate decarboxylase  56.81 
 
 
277 aa  268  7e-71  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.625128 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3512  4-oxalocrotonate decarboxylase  54.65 
 
 
269 aa  267  1e-70  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0936  4-oxalocrotonate decarboxylase  58.3 
 
 
268 aa  267  1e-70  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.101712  normal  0.608159 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0905  hydratase/decarboxylase  56.43 
 
 
263 aa  265  5e-70  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0436706  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1354  hydratase/decarboxylase  56.02 
 
 
262 aa  262  4e-69  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000612409  decreased coverage  0.00000118865 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9115  2-oxopent-4-enoate hydratase  54.9 
 
 
265 aa  261  6e-69  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS01662  putative hydratase protein  55.56 
 
 
265 aa  259  2e-68  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.103932  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5207  2-keto-4-pentenoate hydratase  54.8 
 
 
273 aa  260  2e-68  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.133138  normal  0.334182 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5220  4-oxalocrotonate decarboxylase  53.73 
 
 
264 aa  259  3e-68  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1466  4-oxalocrotonate decarboxylase  54.26 
 
 
273 aa  259  3e-68  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2011  4-oxalocrotonate decarboxylase  52.94 
 
 
260 aa  259  4e-68  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.781375  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2884  4-oxalocrotonate decarboxylase  53.7 
 
 
288 aa  258  5.0000000000000005e-68  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7646  4-oxalocrotonate decarboxylase  54.65 
 
 
274 aa  256  3e-67  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.573554 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0381  2-keto-4-pentenoate hydratase  51.34 
 
 
269 aa  256  3e-67  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.795138  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3275  2-keto-4-pentenoate hydratase  51.34 
 
 
269 aa  255  4e-67  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.235013  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00304  2-keto-4-pentenoate hydratase  50.96 
 
 
269 aa  254  1.0000000000000001e-66  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.503312  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3256  4-oxalocrotonate decarboxylase  50.96 
 
 
269 aa  254  1.0000000000000001e-66  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00308  hypothetical protein  50.96 
 
 
269 aa  254  1.0000000000000001e-66  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.527408  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5499  4-oxalocrotonate decarboxylase  54.29 
 
 
274 aa  253  2.0000000000000002e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0414  2-keto-4-pentenoate hydratase  50.96 
 
 
269 aa  253  2.0000000000000002e-66  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0374  2-keto-4-pentenoate hydratase  50.96 
 
 
269 aa  253  2.0000000000000002e-66  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.832182  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0425  2-keto-4-pentenoate hydratase  51.97 
 
 
269 aa  250  2e-65  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3527  4-oxalocrotonate decarboxylase  53.33 
 
 
265 aa  249  3e-65  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15110  2-keto-4-pentenoate hydratase  52.14 
 
 
264 aa  249  5e-65  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.473426  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2111  4-oxalocrotonate decarboxylase  52.92 
 
 
280 aa  248  5e-65  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3902  4-oxalocrotonate decarboxylase  53.94 
 
 
265 aa  246  3e-64  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.561065 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5134  hydratase/decarboxylase  49.22 
 
 
263 aa  244  9.999999999999999e-64  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.0285955 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1982  2-keto-4-pentenoate hydratase  50.76 
 
 
264 aa  242  3.9999999999999997e-63  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.572392 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1186  4-oxalocrotonate decarboxylase  51.94 
 
 
264 aa  241  6e-63  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0763202  normal  0.362959 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0272  4-oxalocrotonate decarboxylase  50.96 
 
 
262 aa  241  7.999999999999999e-63  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3520  4-oxalocrotonate decarboxylase  49.21 
 
 
263 aa  232  5e-60  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0986627 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3548  2-hydroxypenta-2,4-dienoate hydratase (CmtF)  52.54 
 
 
262 aa  228  6e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.107167 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5436  4-oxalocrotonate decarboxylase  50 
 
 
274 aa  228  9e-59  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  normal  0.635895 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5833  4-oxalocrotonate decarboxylase  50 
 
 
274 aa  228  9e-59  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2890  4-oxalocrotonate decarboxylase  53.59 
 
 
262 aa  223  2e-57  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.254961 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3785  hydratase/decarboxylase  46.12 
 
 
260 aa  223  3e-57  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0026227  hitchhiker  0.00282888 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1639  4-oxalocrotonate decarboxylase  53.6 
 
 
259 aa  221  8e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.193054 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4537  4-oxalocrotonate decarboxylase  48.29 
 
 
262 aa  221  8e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3091  2-oxopent-4-enoate hydratase  45.53 
 
 
260 aa  218  7e-56  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.42559  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2327  putative 2-hydroxypenta-2,4-dienoate hydratase(MhpD)  48.31 
 
 
268 aa  218  7.999999999999999e-56  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4925  4-oxalocrotonate decarboxylase  51.56 
 
 
260 aa  217  1e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.624784  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2151  4-oxalocrotonate decarboxylase  48.44 
 
 
271 aa  217  2e-55  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2774  hydratase/decarboxylase  46.96 
 
 
260 aa  214  8e-55  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.00000469641  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2296  2-oxopent-4-enoate hydratase  46.61 
 
 
259 aa  213  2.9999999999999995e-54  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4745  4-oxalocrotonate decarboxylase  46.06 
 
 
270 aa  212  3.9999999999999995e-54  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1621  2-oxopent-4-enoate hydratase  46.51 
 
 
264 aa  212  4.9999999999999996e-54  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4085  2-oxopent-4-enoate hydratase  44.44 
 
 
267 aa  211  1e-53  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000524317 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2779  hydratase/decarboxylase  48.52 
 
 
273 aa  211  1e-53  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.963348  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1321  hydratase/decarboxylase  47.86 
 
 
262 aa  209  4e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0604012  normal  0.404919 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30610  2-Hydroxypent-2,4-dienoate hydratase; LapE  49.78 
 
 
265 aa  209  5e-53  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.000960153  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4620  2-oxopent-4-enoate hydratase  44.71 
 
 
260 aa  208  6e-53  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.275598  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3544  2-oxopent-4-enoate hydratase  44.71 
 
 
260 aa  208  6e-53  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.127016  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5691  4-oxalocrotonate decarboxylase  45.49 
 
 
260 aa  207  1e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2460  4-oxalocrotonate decarboxylase  45.88 
 
 
260 aa  207  1e-52  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.768834  normal  0.296337 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2077  2-oxopent-4-enoate hydratase  45 
 
 
261 aa  206  3e-52  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.849096  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2118  4-oxalocrotonate decarboxylase  45.12 
 
 
271 aa  205  7e-52  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.609149  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3325  4-oxalocrotonate decarboxylase  49.33 
 
 
266 aa  204  1e-51  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3343  2-oxopent-4-enoate hydratase  47.79 
 
 
260 aa  202  6e-51  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4393  hydratase/decarboxylase  47.79 
 
 
283 aa  202  6e-51  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2273  4-oxalocrotonate decarboxylase  44.71 
 
 
261 aa  198  6e-50  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2785  4-oxalocrotonate decarboxylase  43.14 
 
 
261 aa  198  6e-50  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.197083 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1651  4-oxalocrotonate decarboxylase  47.06 
 
 
275 aa  197  2.0000000000000003e-49  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.452701  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1510  4-oxalocrotonate decarboxylase  48 
 
 
260 aa  196  4.0000000000000005e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1459  4-oxalocrotonate decarboxylase  46.67 
 
 
260 aa  194  1e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.512129  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0439  2-oxopent-4-enoate hydratase  47.47 
 
 
263 aa  193  3e-48  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0138498 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4144  4-oxalocrotonate decarboxylase  50 
 
 
260 aa  192  5e-48  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.246439 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0534  2-oxopent-4-enoate hydratase  46.59 
 
 
267 aa  192  6e-48  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2961  4-oxalocrotonate decarboxylase  46.77 
 
 
260 aa  190  2e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.665549  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1189  2-hydroxypenta-2,4-dienoate hydratase (BphH)  49.56 
 
 
264 aa  190  2e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.375643  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0224  2-oxopent-4-enoate hydratase  44.44 
 
 
264 aa  188  7e-47  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0261621  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08670  4-oxo-4-pentenoate hydratase, XylJ  50 
 
 
261 aa  186  3e-46  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0222  4-oxalocrotonate decarboxylase  49.57 
 
 
262 aa  184  1.0000000000000001e-45  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3472  2-oxopent-4-enoate hydratase  42.31 
 
 
260 aa  182  4.0000000000000006e-45  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.102578  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1777  4-oxalocrotonate decarboxylase  43.1 
 
 
257 aa  182  6e-45  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2578  4-oxalocrotonate decarboxylase  44.06 
 
 
276 aa  181  2e-44  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2155  2-hydroxypenta-2,4-dienoate hydratase, putative  43.5 
 
 
255 aa  178  8e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1392  4-oxalocrotonate decarboxylase  42.13 
 
 
263 aa  177  1e-43  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0975696 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3324  4-oxalocrotonate decarboxylase  41.8 
 
 
264 aa  177  1e-43  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08680  4-oxalocrotonate decarboxylase.XylI  41.6 
 
 
262 aa  176  4e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0909  2-oxopent-4-enoate hydratase  38.8 
 
 
262 aa  175  6e-43  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3689  hydratase/decarboxylase  44.26 
 
 
266 aa  174  9.999999999999999e-43  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3781  hydratase/decarboxylase  41.04 
 
 
262 aa  174  1.9999999999999998e-42  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0303669  decreased coverage  0.000202677 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2158  4-oxalocrotonate decarboxylase  36.89 
 
 
262 aa  172  2.9999999999999996e-42  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2405  4-oxalocrotonate decarboxylase  43.08 
 
 
267 aa  171  1e-41  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2958  4-oxalocrotonate decarboxylase  41.32 
 
 
262 aa  170  2e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.351017  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3342  4-oxalocrotonate decarboxylase  37.98 
 
 
262 aa  170  2e-41  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3464  2-oxo-hepta-3-ene-1,7-dioic acid hydratase  37.45 
 
 
266 aa  170  2e-41  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3524  2-oxo-hepta-3-ene-1,7-dioic acid hydratase  38.08 
 
 
261 aa  171  2e-41  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3090  4-oxalocrotonate decarboxylase  41.09 
 
 
262 aa  170  3e-41  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3088  2-oxo-hepta-3-ene-1,7-dioic acid hydratase  38.84 
 
 
266 aa  169  3e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.325663  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2039  4-oxalocrotonate decarboxylase  42.74 
 
 
273 aa  169  4e-41  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3798  2-oxopent-4-enoate hydratase  41.22 
 
 
261 aa  168  1e-40  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.138107  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3612  2-oxo-hepta-3-ene-1,7-dioic acid hydratase  37.31 
 
 
261 aa  167  2e-40  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1476  2-oxo-hepta-3-ene-1,7-dioic acid hydratase  39.85 
 
 
260 aa  166  4e-40  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.161964 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>