281 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_0224 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013441  Gbro_0224  2-oxopent-4-enoate hydratase  100 
 
 
264 aa  527  1e-149  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0261621  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0534  2-oxopent-4-enoate hydratase  66.4 
 
 
267 aa  321  8e-87  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3798  2-oxopent-4-enoate hydratase  65.99 
 
 
261 aa  313  9.999999999999999e-85  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.138107  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4209  4-oxalocrotonate decarboxylase  55.43 
 
 
264 aa  248  7e-65  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0439  2-oxopent-4-enoate hydratase  53.16 
 
 
263 aa  241  7e-63  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0138498 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5691  4-oxalocrotonate decarboxylase  47.2 
 
 
260 aa  236  2e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3343  2-oxopent-4-enoate hydratase  46.61 
 
 
260 aa  231  6e-60  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1621  2-oxopent-4-enoate hydratase  46.59 
 
 
264 aa  231  1e-59  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3544  2-oxopent-4-enoate hydratase  46.22 
 
 
260 aa  229  3e-59  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.127016  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4620  2-oxopent-4-enoate hydratase  46.22 
 
 
260 aa  229  3e-59  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.275598  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2273  4-oxalocrotonate decarboxylase  45.7 
 
 
261 aa  228  5e-59  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2785  4-oxalocrotonate decarboxylase  45.02 
 
 
261 aa  225  6e-58  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.197083 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1321  hydratase/decarboxylase  44.62 
 
 
262 aa  224  1e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0604012  normal  0.404919 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3091  2-oxopent-4-enoate hydratase  44.22 
 
 
260 aa  219  3.9999999999999997e-56  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.42559  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9115  2-oxopent-4-enoate hydratase  49 
 
 
265 aa  219  5e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3785  hydratase/decarboxylase  44.62 
 
 
260 aa  218  6e-56  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0026227  hitchhiker  0.00282888 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2460  4-oxalocrotonate decarboxylase  44.49 
 
 
260 aa  217  1e-55  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.768834  normal  0.296337 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2077  2-oxopent-4-enoate hydratase  46.15 
 
 
261 aa  216  4e-55  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.849096  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30610  2-Hydroxypent-2,4-dienoate hydratase; LapE  45.63 
 
 
265 aa  213  1.9999999999999998e-54  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.000960153  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1777  4-oxalocrotonate decarboxylase  45.11 
 
 
257 aa  213  1.9999999999999998e-54  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3520  4-oxalocrotonate decarboxylase  45 
 
 
263 aa  213  2.9999999999999995e-54  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0986627 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0909  2-oxopent-4-enoate hydratase  47.2 
 
 
262 aa  211  1e-53  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2774  hydratase/decarboxylase  42.06 
 
 
260 aa  211  1e-53  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.00000469641  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1186  4-oxalocrotonate decarboxylase  46.06 
 
 
264 aa  210  2e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0763202  normal  0.362959 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4085  2-oxopent-4-enoate hydratase  45.2 
 
 
267 aa  209  4e-53  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000524317 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2884  4-oxalocrotonate decarboxylase  48 
 
 
288 aa  208  8e-53  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2961  4-oxalocrotonate decarboxylase  46.75 
 
 
260 aa  206  2e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.665549  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3902  4-oxalocrotonate decarboxylase  47.45 
 
 
265 aa  207  2e-52  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.561065 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3325  4-oxalocrotonate decarboxylase  43.7 
 
 
266 aa  204  9e-52  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3527  4-oxalocrotonate decarboxylase  45.04 
 
 
265 aa  203  2e-51  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2875  4-oxalocrotonate decarboxylase  44.44 
 
 
268 aa  203  2e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0367853 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1510  4-oxalocrotonate decarboxylase  45.14 
 
 
260 aa  202  4e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5044  4-oxalocrotonate decarboxylase  45.78 
 
 
261 aa  202  4e-51  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0936  4-oxalocrotonate decarboxylase  44.11 
 
 
268 aa  201  8e-51  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.101712  normal  0.608159 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3512  4-oxalocrotonate decarboxylase  43.46 
 
 
269 aa  201  8e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1477  4-oxalocrotonate decarboxylase  42.25 
 
 
264 aa  201  9e-51  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13569  hydratase  44.58 
 
 
261 aa  201  9.999999999999999e-51  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000748615 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4661  4-oxalocrotonate decarboxylase  44.98 
 
 
261 aa  201  9.999999999999999e-51  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.930854  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1520  4-oxalocrotonate decarboxylase  45.38 
 
 
261 aa  201  9.999999999999999e-51  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4749  4-oxalocrotonate decarboxylase  44.98 
 
 
261 aa  201  9.999999999999999e-51  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0856703  normal  0.088822 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3472  2-oxopent-4-enoate hydratase  42.74 
 
 
260 aa  199  3.9999999999999996e-50  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.102578  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0905  hydratase/decarboxylase  44.3 
 
 
263 aa  198  7e-50  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0436706  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0222  4-oxalocrotonate decarboxylase  46.22 
 
 
262 aa  198  7e-50  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS01662  putative hydratase protein  45.16 
 
 
265 aa  197  1.0000000000000001e-49  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.103932  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1149  2-oxopent-4-enoate hydratase  45.78 
 
 
269 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.363401  normal 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4144  4-oxalocrotonate decarboxylase  44.22 
 
 
260 aa  197  1.0000000000000001e-49  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.246439 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4537  4-oxalocrotonate decarboxylase  42.75 
 
 
262 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1354  hydratase/decarboxylase  43.7 
 
 
262 aa  196  2.0000000000000003e-49  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000612409  decreased coverage  0.00000118865 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0911  4-oxalocrotonate decarboxylase  45.2 
 
 
277 aa  196  2.0000000000000003e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.625128 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2296  2-oxopent-4-enoate hydratase  41.43 
 
 
259 aa  194  1e-48  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5220  4-oxalocrotonate decarboxylase  40.86 
 
 
264 aa  193  3e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1189  2-hydroxypenta-2,4-dienoate hydratase (BphH)  44.31 
 
 
264 aa  192  5e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.375643  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2011  4-oxalocrotonate decarboxylase  42.64 
 
 
260 aa  191  7e-48  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.781375  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10590  2-oxo-hept-3-ene-1,7-dioate hydratase  40.31 
 
 
267 aa  191  7e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0272  4-oxalocrotonate decarboxylase  44.49 
 
 
262 aa  191  1e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1955  2-oxo-hepta-3-ene-1,7-dioic acid hydratase  40.7 
 
 
267 aa  191  1e-47  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.504182  normal  0.0219036 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3854  hydratase/decarboxylase  41.63 
 
 
264 aa  191  1e-47  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.595722  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42150  2-hydroxypent-2,4-dienoate hydratase  44.17 
 
 
261 aa  190  2.9999999999999997e-47  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.293913  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1982  2-keto-4-pentenoate hydratase  44.22 
 
 
264 aa  189  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.572392 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5499  4-oxalocrotonate decarboxylase  40.68 
 
 
274 aa  189  5e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4279  2-oxo-hepta-3-ene-1,7-dioic acid hydratase  39.16 
 
 
268 aa  189  5e-47  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  decreased coverage  0.00917502  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0965  2-oxo-hept-3-ene-1,7-dioate hydratase  39.92 
 
 
267 aa  188  8e-47  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3589  2-oxo-hepta-3-ene-1,7-dioic acid hydratase  39.02 
 
 
268 aa  188  8e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.82541  normal  0.773607 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4066  2-oxo-hepta-3-ene-1,7-dioic acid hydratase  41.9 
 
 
274 aa  187  1e-46  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.597772 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0240  2-oxo-hepta-3-ene-1,7-dioic acid hydratase  38.4 
 
 
267 aa  187  1e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5236  4-oxalocrotonate decarboxylase  43.37 
 
 
261 aa  187  1e-46  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.270652 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2155  2-hydroxypenta-2,4-dienoate hydratase, putative  41.3 
 
 
255 aa  187  2e-46  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15110  2-keto-4-pentenoate hydratase  43.14 
 
 
264 aa  187  2e-46  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.473426  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1708  2-oxo-hepta-3-ene-1,7-dioic acid hydratase  37.64 
 
 
268 aa  186  4e-46  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.899066  normal  0.363906 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1392  4-oxalocrotonate decarboxylase  40 
 
 
263 aa  185  5e-46  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0975696 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4130  2-oxo-hepta-3-ene-1,7-dioic acid hydratase  39.62 
 
 
267 aa  186  5e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0570046  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4236  2-oxo-hepta-3-ene-1,7-dioic acid hydratase  39.62 
 
 
267 aa  186  5e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.119671  normal  0.0833029 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2151  4-oxalocrotonate decarboxylase  43.14 
 
 
271 aa  185  5e-46  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3281  2-oxo-hepta-3-ene-1,7-dioic acid hydratase  39.62 
 
 
267 aa  186  5e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0269586  normal  0.185525 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04226  2-oxo-hept-3-ene-1,7-dioate hydratase  37.8 
 
 
267 aa  185  6e-46  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2941  2-oxo-hepta-3-ene-1,7-dioate hydratase  38.02 
 
 
268 aa  185  6e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3706  2-oxo-hepta-3-ene-1,7-dioic acid hydratase  37.8 
 
 
267 aa  185  6e-46  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.29388 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0225  4-oxalocrotonate decarboxylase  45.56 
 
 
269 aa  185  6e-46  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  hitchhiker  0.00468493  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4580  2-oxo-hepta-3-ene-1,7-dioic acid hydratase  37.8 
 
 
267 aa  185  6e-46  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1778  4-oxalocrotonate decarboxylase  39.23 
 
 
267 aa  185  7e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.110144 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04192  hypothetical protein  37.8 
 
 
273 aa  185  7e-46  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1459  4-oxalocrotonate decarboxylase  42.51 
 
 
260 aa  184  9e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.512129  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1627  2-oxo-hepta-3-ene-1,7-dioic acid hydratase  40.31 
 
 
267 aa  184  1.0000000000000001e-45  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.72873 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2779  hydratase/decarboxylase  43.73 
 
 
273 aa  184  1.0000000000000001e-45  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.963348  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1790  4-oxalocrotonate decarboxylase  40.32 
 
 
263 aa  184  2.0000000000000003e-45  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0308919  normal  0.205885 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1466  4-oxalocrotonate decarboxylase  40.3 
 
 
273 aa  182  4.0000000000000006e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3658  2-oxo-hepta-3-ene-1,7-dioic acid hydratase  38.85 
 
 
267 aa  182  5.0000000000000004e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.504721 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08670  4-oxo-4-pentenoate hydratase, XylJ  47.5 
 
 
261 aa  182  5.0000000000000004e-45  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2327  putative 2-hydroxypenta-2,4-dienoate hydratase(MhpD)  43.08 
 
 
268 aa  182  6e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1200  2-oxo-hepta-3-ene-1,7-dioic acid hydratase  37.4 
 
 
267 aa  182  6e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.775184  normal  0.780949 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4132  2-oxo-hepta-3-ene-1,7-dioic acid hydratase  39.23 
 
 
267 aa  182  7e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.138195  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4832  2-oxopent-4-enoate hydratase  44.35 
 
 
279 aa  181  8.000000000000001e-45  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0838304  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5207  2-keto-4-pentenoate hydratase  44.64 
 
 
273 aa  181  8.000000000000001e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.133138  normal  0.334182 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1180  2-oxo-hepta-3-ene-1,7-dioic acid hydratase  37.4 
 
 
267 aa  181  1e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.850117  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5928  hydratase/decarboxylase  37.4 
 
 
268 aa  181  1e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7646  4-oxalocrotonate decarboxylase  42.64 
 
 
274 aa  181  1e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.573554 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1215  2-oxo-hepta-3-ene-1,7-dioic acid hydratase  37.4 
 
 
267 aa  181  1e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.033694  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1169  2-oxo-hepta-3-ene-1,7-dioic acid hydratase  37.4 
 
 
267 aa  181  1e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.135295  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4269  2-oxo-hepta-3-ene-1,7-dioic acid hydratase  39.25 
 
 
282 aa  181  1e-44  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.238552  normal  0.686193 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2578  4-oxalocrotonate decarboxylase  43.25 
 
 
276 aa  180  2e-44  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>