271 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_2779 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_2779  hydratase/decarboxylase  100 
 
 		 273 aa  535  1e-151  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.963348  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1651  4-oxalocrotonate decarboxylase  56.93 
 
 		 275 aa  268  7e-71  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.452701  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4745  4-oxalocrotonate decarboxylase  55.85 
 
 		 270 aa  260  1e-68  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2151  4-oxalocrotonate decarboxylase  55.13 
 
 		 271 aa  257  2e-67  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4393  hydratase/decarboxylase  55.29 
 
 		 283 aa  256  4e-67  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5436  4-oxalocrotonate decarboxylase  50.37 
 
 		 274 aa  245  6.999999999999999e-64  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  normal  0.635895 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5833  4-oxalocrotonate decarboxylase  50.37 
 
 		 274 aa  245  6.999999999999999e-64  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2884  4-oxalocrotonate decarboxylase  52.79 
 
 		 288 aa  235  6e-61  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0381  2-keto-4-pentenoate hydratase  50.59 
 
 		 269 aa  228  7e-59  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.795138  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3275  2-keto-4-pentenoate hydratase  50.59 
 
 		 269 aa  228  1e-58  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.235013  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00304  2-keto-4-pentenoate hydratase  50.2 
 
 		 269 aa  226  3e-58  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.503312  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3256  4-oxalocrotonate decarboxylase  50.2 
 
 		 269 aa  226  3e-58  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00308  hypothetical protein  50.2 
 
 		 269 aa  226  3e-58  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.527408  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0414  2-keto-4-pentenoate hydratase  50.2 
 
 		 269 aa  226  3e-58  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0374  2-keto-4-pentenoate hydratase  50.2 
 
 		 269 aa  226  3e-58  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.832182  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2875  4-oxalocrotonate decarboxylase  49.07 
 
 		 268 aa  224  1e-57  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0367853 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1477  4-oxalocrotonate decarboxylase  49.06 
 
 		 264 aa  224  1e-57  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0425  2-keto-4-pentenoate hydratase  51.42 
 
 		 269 aa  222  4.9999999999999996e-57  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3520  4-oxalocrotonate decarboxylase  51.95 
 
 		 263 aa  221  9e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0986627 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0936  4-oxalocrotonate decarboxylase  50 
 
 		 268 aa  221  9.999999999999999e-57  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.101712  normal  0.608159 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1466  4-oxalocrotonate decarboxylase  51.34 
 
 		 273 aa  220  1.9999999999999999e-56  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7646  4-oxalocrotonate decarboxylase  51.13 
 
 		 274 aa  220  1.9999999999999999e-56  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.573554 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1982  2-keto-4-pentenoate hydratase  49.8 
 
 		 264 aa  219  3e-56  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.572392 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15110  2-keto-4-pentenoate hydratase  49.61 
 
 		 264 aa  217  1e-55  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.473426  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1149  2-oxopent-4-enoate hydratase  50.39 
 
 		 269 aa  217  2e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.363401  normal  1 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3854  hydratase/decarboxylase  48.47 
 
 		 264 aa  214  9.999999999999999e-55  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.595722  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3548  2-hydroxypenta-2,4-dienoate hydratase (CmtF)  50.19 
 
 		 262 aa  213  1.9999999999999998e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.107167 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3512  4-oxalocrotonate decarboxylase  49.24 
 
 		 269 aa  211  7e-54  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0272  4-oxalocrotonate decarboxylase  47.89 
 
 		 262 aa  210  2e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2890  4-oxalocrotonate decarboxylase  50.97 
 
 		 262 aa  210  2e-53  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.254961 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2111  4-oxalocrotonate decarboxylase  48.24 
 
 		 280 aa  208  6e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5207  2-keto-4-pentenoate hydratase  49.81 
 
 		 273 aa  208  7e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.133138  normal  0.334182 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5134  hydratase/decarboxylase  45.76 
 
 		 263 aa  208  9e-53  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0285955 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3902  4-oxalocrotonate decarboxylase  51.91 
 
 		 265 aa  207  1e-52  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.561065 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5499  4-oxalocrotonate decarboxylase  48.3 
 
 		 274 aa  207  2e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0911  4-oxalocrotonate decarboxylase  48.35 
 
 		 277 aa  207  2e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.625128 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42150  2-hydroxypent-2,4-dienoate hydratase  49.8 
 
 		 261 aa  206  5e-52  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.293913  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2011  4-oxalocrotonate decarboxylase  48.05 
 
 		 260 aa  204  1e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.781375  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1354  hydratase/decarboxylase  49.6 
 
 		 262 aa  203  2e-51  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000612409  decreased coverage  0.00000118865 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9115  2-oxopent-4-enoate hydratase  46.89 
 
 		 265 aa  202  4e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3527  4-oxalocrotonate decarboxylase  49.81 
 
 		 265 aa  202  5e-51  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4537  4-oxalocrotonate decarboxylase  45.76 
 
 		 262 aa  202  7e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0905  hydratase/decarboxylase  49.19 
 
 		 263 aa  201  7e-51  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0436706  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1186  4-oxalocrotonate decarboxylase  47.37 
 
 		 264 aa  201  8e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0763202  normal  0.362959 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5220  4-oxalocrotonate decarboxylase  44.88 
 
 		 264 aa  195  7e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4925  4-oxalocrotonate decarboxylase  46.48 
 
 		 260 aa  191  9e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.624784  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3242  hydratase/decarboxylase  44.68 
 
 		 260 aa  190  2e-47  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000968427  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1510  4-oxalocrotonate decarboxylase  44.32 
 
 		 260 aa  188  7e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2296  2-oxopent-4-enoate hydratase  42.86 
 
 		 259 aa  185  7e-46  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3785  hydratase/decarboxylase  41.06 
 
 		 260 aa  184  2.0000000000000003e-45  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0026227  hitchhiker  0.00282888 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3091  2-oxopent-4-enoate hydratase  42.59 
 
 		 260 aa  182  4.0000000000000006e-45  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.42559  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1639  4-oxalocrotonate decarboxylase  44.14 
 
 		 259 aa  182  6e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.193054 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2327  putative 2-hydroxypenta-2,4-dienoate hydratase(MhpD)  44.66 
 
 		 268 aa  182  6e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1621  2-oxopent-4-enoate hydratase  43.3 
 
 		 264 aa  181  1e-44  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2961  4-oxalocrotonate decarboxylase  45.08 
 
 		 260 aa  180  2e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.665549  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2460  4-oxalocrotonate decarboxylase  42.69 
 
 		 260 aa  180  2e-44  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.768834  normal  0.296337 
 
 
-
 
NC_003296  RS01662  putative hydratase protein  45.2 
 
 		 265 aa  178  7e-44  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.103932  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0224  2-oxopent-4-enoate hydratase  43.73 
 
 		 264 aa  177  1e-43  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0261621  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4085  2-oxopent-4-enoate hydratase  41.06 
 
 		 267 aa  177  2e-43  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000524317 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1321  hydratase/decarboxylase  41.29 
 
 		 262 aa  177  2e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0604012  normal  0.404919 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2273  4-oxalocrotonate decarboxylase  42.15 
 
 		 261 aa  177  2e-43  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2785  4-oxalocrotonate decarboxylase  42.05 
 
 		 261 aa  176  3e-43  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.197083 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2077  2-oxopent-4-enoate hydratase  44.44 
 
 		 261 aa  174  1.9999999999999998e-42  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.849096  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4144  4-oxalocrotonate decarboxylase  42.97 
 
 		 260 aa  174  1.9999999999999998e-42  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.246439 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2118  4-oxalocrotonate decarboxylase  37.83 
 
 		 271 aa  173  2.9999999999999996e-42  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.609149  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2774  hydratase/decarboxylase  40.86 
 
 		 260 aa  173  2.9999999999999996e-42  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.00000469641  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5691  4-oxalocrotonate decarboxylase  40.62 
 
 		 260 aa  172  5.999999999999999e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1189  2-hydroxypenta-2,4-dienoate hydratase (BphH)  45.85 
 
 		 264 aa  172  5.999999999999999e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.375643  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1777  4-oxalocrotonate decarboxylase  42.51 
 
 		 257 aa  172  6.999999999999999e-42  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0439  2-oxopent-4-enoate hydratase  45.49 
 
 		 263 aa  171  1e-41  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0138498 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3343  2-oxopent-4-enoate hydratase  42.74 
 
 		 260 aa  169  3e-41  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3325  4-oxalocrotonate decarboxylase  45.89 
 
 		 266 aa  168  8e-41  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5044  4-oxalocrotonate decarboxylase  39.37 
 
 		 261 aa  168  1e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13569  hydratase  42.49 
 
 		 261 aa  167  2e-40  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000748615 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4661  4-oxalocrotonate decarboxylase  38.98 
 
 		 261 aa  167  2e-40  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.930854  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4749  4-oxalocrotonate decarboxylase  38.98 
 
 		 261 aa  167  2e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0856703  normal  0.088822 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2039  4-oxalocrotonate decarboxylase  40 
 
 		 273 aa  166  2.9999999999999998e-40  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2578  4-oxalocrotonate decarboxylase  42.39 
 
 		 276 aa  166  4e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0534  2-oxopent-4-enoate hydratase  43.63 
 
 		 267 aa  166  5e-40  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30610  2-Hydroxypent-2,4-dienoate hydratase; LapE  44.87 
 
 		 265 aa  164  1.0000000000000001e-39  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.000960153  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3544  2-oxopent-4-enoate hydratase  40.15 
 
 		 260 aa  164  1.0000000000000001e-39  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.127016  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3689  hydratase/decarboxylase  45.25 
 
 		 266 aa  164  1.0000000000000001e-39  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4620  2-oxopent-4-enoate hydratase  40.15 
 
 		 260 aa  164  1.0000000000000001e-39  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.275598  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0595  4-oxalocrotonate decarboxylase  47.28 
 
 		 262 aa  164  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2155  2-hydroxypenta-2,4-dienoate hydratase, putative  38.67 
 
 		 255 aa  162  8.000000000000001e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0909  2-oxopent-4-enoate hydratase  37.8 
 
 		 262 aa  160  2e-38  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1459  4-oxalocrotonate decarboxylase  40.62 
 
 		 260 aa  159  5e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.512129  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3472  2-oxopent-4-enoate hydratase  38.76 
 
 		 260 aa  159  5e-38  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.102578  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1520  4-oxalocrotonate decarboxylase  37.8 
 
 		 261 aa  158  1e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4569  4-oxalocrotonate decarboxylase  42.74 
 
 		 264 aa  156  3e-37  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00147074 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1392  4-oxalocrotonate decarboxylase  40.61 
 
 		 263 aa  155  7e-37  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0975696 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0222  4-oxalocrotonate decarboxylase  45.53 
 
 		 262 aa  154  1e-36  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2405  4-oxalocrotonate decarboxylase  41.39 
 
 		 267 aa  154  2e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5236  4-oxalocrotonate decarboxylase  36.61 
 
 		 261 aa  152  8e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.270652 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2299  4-oxalocrotonate decarboxylase  39.83 
 
 		 261 aa  151  8.999999999999999e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2158  4-oxalocrotonate decarboxylase  33.88 
 
 		 262 aa  150  2e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4209  4-oxalocrotonate decarboxylase  41.86 
 
 		 264 aa  150  2e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4832  2-oxopent-4-enoate hydratase  39.22 
 
 		 279 aa  145  6e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0838304  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3499  2-oxo-hepta-3-ene-1,7-dioic acid hydratase  37.13 
 
 		 266 aa  141  9.999999999999999e-33  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00827858 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08670  4-oxo-4-pentenoate hydratase, XylJ  41.5 
 
 		 261 aa  139  3.9999999999999997e-32  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>