269 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_C7646 on replicon NC_007509
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007509  Bcep18194_C7646  4-oxalocrotonate decarboxylase  100 
 
 
274 aa  548  1e-155  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.573554 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1466  4-oxalocrotonate decarboxylase  83.7 
 
 
273 aa  454  1e-127  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5499  4-oxalocrotonate decarboxylase  70.23 
 
 
274 aa  363  2e-99  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5207  2-keto-4-pentenoate hydratase  73.15 
 
 
273 aa  360  2e-98  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.133138  normal  0.334182 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5134  hydratase/decarboxylase  67.32 
 
 
263 aa  341  8e-93  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.0285955 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2875  4-oxalocrotonate decarboxylase  65.06 
 
 
268 aa  322  5e-87  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0367853 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2011  4-oxalocrotonate decarboxylase  62.4 
 
 
260 aa  319  1.9999999999999998e-86  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.781375  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5220  4-oxalocrotonate decarboxylase  60.98 
 
 
264 aa  315  7e-85  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3548  2-hydroxypenta-2,4-dienoate hydratase (CmtF)  62.11 
 
 
262 aa  308  5e-83  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.107167 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1477  4-oxalocrotonate decarboxylase  62.6 
 
 
264 aa  308  5.9999999999999995e-83  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0905  hydratase/decarboxylase  66.12 
 
 
263 aa  306  2.0000000000000002e-82  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0436706  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1354  hydratase/decarboxylase  66.53 
 
 
262 aa  306  2.0000000000000002e-82  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000612409  decreased coverage  0.00000118865 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2890  4-oxalocrotonate decarboxylase  63.5 
 
 
262 aa  304  9.000000000000001e-82  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.254961 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0272  4-oxalocrotonate decarboxylase  63.08 
 
 
262 aa  304  9.000000000000001e-82  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3854  hydratase/decarboxylase  59.32 
 
 
264 aa  303  2.0000000000000002e-81  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.595722  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01662  putative hydratase protein  64.11 
 
 
265 aa  297  1e-79  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.103932  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1149  2-oxopent-4-enoate hydratase  56.64 
 
 
269 aa  296  2e-79  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.363401  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4537  4-oxalocrotonate decarboxylase  61.45 
 
 
262 aa  293  2e-78  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2884  4-oxalocrotonate decarboxylase  61.92 
 
 
288 aa  288  6e-77  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9115  2-oxopent-4-enoate hydratase  62.6 
 
 
265 aa  288  7e-77  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1982  2-keto-4-pentenoate hydratase  57.74 
 
 
264 aa  286  2e-76  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.572392 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1186  4-oxalocrotonate decarboxylase  57.14 
 
 
264 aa  282  4.0000000000000003e-75  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0763202  normal  0.362959 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3520  4-oxalocrotonate decarboxylase  59.3 
 
 
263 aa  281  6.000000000000001e-75  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0986627 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15110  2-keto-4-pentenoate hydratase  57.31 
 
 
264 aa  281  1e-74  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.473426  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0936  4-oxalocrotonate decarboxylase  58.46 
 
 
268 aa  276  3e-73  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.101712  normal  0.608159 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3902  4-oxalocrotonate decarboxylase  59.45 
 
 
265 aa  274  1.0000000000000001e-72  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.561065 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2327  putative 2-hydroxypenta-2,4-dienoate hydratase(MhpD)  57.2 
 
 
268 aa  274  1.0000000000000001e-72  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3527  4-oxalocrotonate decarboxylase  57.92 
 
 
265 aa  270  2e-71  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0911  4-oxalocrotonate decarboxylase  62.72 
 
 
277 aa  269  4e-71  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.625128 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0381  2-keto-4-pentenoate hydratase  53.05 
 
 
269 aa  267  2e-70  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.795138  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3275  2-keto-4-pentenoate hydratase  53.05 
 
 
269 aa  266  2.9999999999999995e-70  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.235013  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3256  4-oxalocrotonate decarboxylase  52.67 
 
 
269 aa  265  7e-70  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00304  2-keto-4-pentenoate hydratase  52.67 
 
 
269 aa  264  1e-69  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.503312  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0414  2-keto-4-pentenoate hydratase  52.67 
 
 
269 aa  264  1e-69  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00308  hypothetical protein  52.67 
 
 
269 aa  264  1e-69  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.527408  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0374  2-keto-4-pentenoate hydratase  52.67 
 
 
269 aa  264  1e-69  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.832182  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3512  4-oxalocrotonate decarboxylase  52.61 
 
 
269 aa  261  8.999999999999999e-69  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0425  2-keto-4-pentenoate hydratase  52.76 
 
 
269 aa  256  4e-67  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42150  2-hydroxypent-2,4-dienoate hydratase  55.28 
 
 
261 aa  250  1e-65  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.293913  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2111  4-oxalocrotonate decarboxylase  56.43 
 
 
280 aa  246  3e-64  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2151  4-oxalocrotonate decarboxylase  51.35 
 
 
271 aa  243  3e-63  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1651  4-oxalocrotonate decarboxylase  54.51 
 
 
275 aa  242  3.9999999999999997e-63  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.452701  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2296  2-oxopent-4-enoate hydratase  50 
 
 
259 aa  240  2e-62  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5436  4-oxalocrotonate decarboxylase  50.56 
 
 
274 aa  238  6.999999999999999e-62  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  normal  0.635895 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5833  4-oxalocrotonate decarboxylase  50.56 
 
 
274 aa  238  6.999999999999999e-62  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4745  4-oxalocrotonate decarboxylase  51.71 
 
 
270 aa  238  8e-62  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3242  hydratase/decarboxylase  55.25 
 
 
260 aa  234  1.0000000000000001e-60  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000968427  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4085  2-oxopent-4-enoate hydratase  48.09 
 
 
267 aa  231  9e-60  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000524317 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4393  hydratase/decarboxylase  52.57 
 
 
283 aa  222  4e-57  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2779  hydratase/decarboxylase  51.13 
 
 
273 aa  220  1.9999999999999999e-56  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.963348  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2774  hydratase/decarboxylase  44.66 
 
 
260 aa  216  2.9999999999999998e-55  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.00000469641  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1639  4-oxalocrotonate decarboxylase  50.21 
 
 
259 aa  215  7e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.193054 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3785  hydratase/decarboxylase  43.35 
 
 
260 aa  214  9.999999999999999e-55  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0026227  hitchhiker  0.00282888 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4925  4-oxalocrotonate decarboxylase  52.89 
 
 
260 aa  211  7e-54  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.624784  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3091  2-oxopent-4-enoate hydratase  43.89 
 
 
260 aa  209  4e-53  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.42559  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1621  2-oxopent-4-enoate hydratase  44.57 
 
 
264 aa  209  5e-53  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1321  hydratase/decarboxylase  41.98 
 
 
262 aa  209  6e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0604012  normal  0.404919 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2077  2-oxopent-4-enoate hydratase  45.25 
 
 
261 aa  208  6e-53  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.849096  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4144  4-oxalocrotonate decarboxylase  48.23 
 
 
260 aa  204  2e-51  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.246439 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1189  2-hydroxypenta-2,4-dienoate hydratase (BphH)  48.89 
 
 
264 aa  203  3e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.375643  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2460  4-oxalocrotonate decarboxylase  48.44 
 
 
260 aa  203  3e-51  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.768834  normal  0.296337 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2961  4-oxalocrotonate decarboxylase  44.87 
 
 
260 aa  200  1.9999999999999998e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.665549  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0534  2-oxopent-4-enoate hydratase  45.08 
 
 
267 aa  200  1.9999999999999998e-50  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4620  2-oxopent-4-enoate hydratase  41.22 
 
 
260 aa  197  1.0000000000000001e-49  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.275598  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3544  2-oxopent-4-enoate hydratase  41.22 
 
 
260 aa  197  1.0000000000000001e-49  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.127016  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3325  4-oxalocrotonate decarboxylase  47.11 
 
 
266 aa  196  3e-49  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5691  4-oxalocrotonate decarboxylase  41.22 
 
 
260 aa  196  5.000000000000001e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2273  4-oxalocrotonate decarboxylase  41.22 
 
 
261 aa  194  1e-48  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3343  2-oxopent-4-enoate hydratase  44.74 
 
 
260 aa  194  1e-48  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2118  4-oxalocrotonate decarboxylase  41.18 
 
 
271 aa  194  2e-48  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.609149  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1510  4-oxalocrotonate decarboxylase  41.63 
 
 
260 aa  193  3e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1459  4-oxalocrotonate decarboxylase  44.88 
 
 
260 aa  192  3e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.512129  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2785  4-oxalocrotonate decarboxylase  41.22 
 
 
261 aa  192  3e-48  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.197083 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30610  2-Hydroxypent-2,4-dienoate hydratase; LapE  46.19 
 
 
265 aa  189  4e-47  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.000960153  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1392  4-oxalocrotonate decarboxylase  44.98 
 
 
263 aa  188  7e-47  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0975696 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1777  4-oxalocrotonate decarboxylase  43.33 
 
 
257 aa  186  3e-46  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0439  2-oxopent-4-enoate hydratase  47.06 
 
 
263 aa  181  8.000000000000001e-45  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0138498 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2578  4-oxalocrotonate decarboxylase  43.08 
 
 
276 aa  181  9.000000000000001e-45  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0222  4-oxalocrotonate decarboxylase  48 
 
 
262 aa  179  4e-44  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2155  2-hydroxypenta-2,4-dienoate hydratase, putative  41.25 
 
 
255 aa  179  4.999999999999999e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4209  4-oxalocrotonate decarboxylase  44.71 
 
 
264 aa  176  3e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0224  2-oxopent-4-enoate hydratase  42.64 
 
 
264 aa  175  9e-43  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0261621  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2299  4-oxalocrotonate decarboxylase  42.79 
 
 
261 aa  173  2.9999999999999996e-42  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3472  2-oxopent-4-enoate hydratase  41.53 
 
 
260 aa  173  2.9999999999999996e-42  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.102578  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4661  4-oxalocrotonate decarboxylase  41.02 
 
 
261 aa  172  3.9999999999999995e-42  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.930854  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4749  4-oxalocrotonate decarboxylase  41.02 
 
 
261 aa  172  3.9999999999999995e-42  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0856703  normal  0.088822 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0909  2-oxopent-4-enoate hydratase  38.31 
 
 
262 aa  172  5.999999999999999e-42  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5044  4-oxalocrotonate decarboxylase  40.86 
 
 
261 aa  171  1e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3781  hydratase/decarboxylase  42.22 
 
 
262 aa  167  2e-40  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0303669  decreased coverage  0.000202677 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1520  4-oxalocrotonate decarboxylase  40.47 
 
 
261 aa  166  2.9999999999999998e-40  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4271  2-oxo-hepta-3-ene-1,7-dioic acid hydratase  38.46 
 
 
268 aa  166  4e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.623769  normal  0.550033 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5236  4-oxalocrotonate decarboxylase  40.62 
 
 
261 aa  166  4e-40  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.270652 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4313  2-oxo-hepta-3-ene-1,7-dioic acid hydratase  38.66 
 
 
268 aa  166  5e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4269  2-oxo-hepta-3-ene-1,7-dioic acid hydratase  39.46 
 
 
282 aa  166  5e-40  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.238552  normal  0.686193 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3090  4-oxalocrotonate decarboxylase  38.78 
 
 
262 aa  165  8e-40  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13569  hydratase  40.81 
 
 
261 aa  165  9e-40  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000748615 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0225  4-oxalocrotonate decarboxylase  42.22 
 
 
262 aa  164  2.0000000000000002e-39  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2039  4-oxalocrotonate decarboxylase  43.81 
 
 
273 aa  163  3e-39  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2158  4-oxalocrotonate decarboxylase  35.57 
 
 
262 aa  163  3e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3689  hydratase/decarboxylase  41.48 
 
 
266 aa  162  4.0000000000000004e-39  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>