273 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmz1t_2077 on replicon NC_011662
Organism: Thauera sp. MZ1T



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011662  Tmz1t_2077  2-oxopent-4-enoate hydratase  100 
 
 		 261 aa  526  1e-148  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.849096  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3785  hydratase/decarboxylase  73.08 
 
 		 260 aa  386  1e-106  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0026227  hitchhiker  0.00282888 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3091  2-oxopent-4-enoate hydratase  70.38 
 
 		 260 aa  375  1e-103  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.42559  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2774  hydratase/decarboxylase  68.85 
 
 		 260 aa  373  1e-102  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.00000469641  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1321  hydratase/decarboxylase  67.69 
 
 		 262 aa  372  1e-102  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0604012  normal  0.404919 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4144  4-oxalocrotonate decarboxylase  71.04 
 
 		 260 aa  370  1e-101  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.246439 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0222  4-oxalocrotonate decarboxylase  71.92 
 
 		 262 aa  370  1e-101  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1189  2-hydroxypenta-2,4-dienoate hydratase (BphH)  71.04 
 
 		 264 aa  365  1e-100  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.375643  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2961  4-oxalocrotonate decarboxylase  68.34 
 
 		 260 aa  340  9e-93  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.665549  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4620  2-oxopent-4-enoate hydratase  63.08 
 
 		 260 aa  337  1.9999999999999998e-91  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.275598  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3544  2-oxopent-4-enoate hydratase  63.08 
 
 		 260 aa  337  1.9999999999999998e-91  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.127016  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3343  2-oxopent-4-enoate hydratase  63.46 
 
 		 260 aa  336  2.9999999999999997e-91  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2460  4-oxalocrotonate decarboxylase  62.69 
 
 		 260 aa  333  2e-90  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.768834  normal  0.296337 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2273  4-oxalocrotonate decarboxylase  63.85 
 
 		 261 aa  333  2e-90  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2785  4-oxalocrotonate decarboxylase  63.08 
 
 		 261 aa  332  5e-90  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.197083 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5691  4-oxalocrotonate decarboxylase  62.9 
 
 		 260 aa  327  1.0000000000000001e-88  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1392  4-oxalocrotonate decarboxylase  60.24 
 
 		 263 aa  316  2e-85  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0975696 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30610  2-Hydroxypent-2,4-dienoate hydratase; LapE  60.23 
 
 		 265 aa  314  9e-85  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.000960153  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3325  4-oxalocrotonate decarboxylase  59.23 
 
 		 266 aa  313  1.9999999999999998e-84  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1510  4-oxalocrotonate decarboxylase  58.08 
 
 		 260 aa  303  2.0000000000000002e-81  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08670  4-oxo-4-pentenoate hydratase, XylJ  63.6 
 
 		 261 aa  293  2e-78  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1459  4-oxalocrotonate decarboxylase  55.77 
 
 		 260 aa  293  3e-78  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.512129  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2118  4-oxalocrotonate decarboxylase  55.38 
 
 		 271 aa  281  7.000000000000001e-75  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.609149  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4085  2-oxopent-4-enoate hydratase  50.77 
 
 		 267 aa  266  2e-70  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000524317 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3689  hydratase/decarboxylase  53.57 
 
 		 266 aa  266  2.9999999999999995e-70  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1777  4-oxalocrotonate decarboxylase  53.78 
 
 		 257 aa  258  5.0000000000000005e-68  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1149  2-oxopent-4-enoate hydratase  52.12 
 
 		 269 aa  251  1e-65  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.363401  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1621  2-oxopent-4-enoate hydratase  51.39 
 
 		 264 aa  239  2e-62  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1186  4-oxalocrotonate decarboxylase  47.49 
 
 		 264 aa  232  5e-60  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0763202  normal  0.362959 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2296  2-oxopent-4-enoate hydratase  47.04 
 
 		 259 aa  231  1e-59  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01662  putative hydratase protein  48.35 
 
 		 265 aa  227  2e-58  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.103932  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1477  4-oxalocrotonate decarboxylase  46.33 
 
 		 264 aa  226  3e-58  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9115  2-oxopent-4-enoate hydratase  47.62 
 
 		 265 aa  223  2e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4537  4-oxalocrotonate decarboxylase  45.38 
 
 		 262 aa  223  3e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0534  2-oxopent-4-enoate hydratase  46.61 
 
 		 267 aa  220  9.999999999999999e-57  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0272  4-oxalocrotonate decarboxylase  46.01 
 
 		 262 aa  220  1.9999999999999999e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2155  2-hydroxypenta-2,4-dienoate hydratase, putative  47.9 
 
 		 255 aa  213  1.9999999999999998e-54  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2875  4-oxalocrotonate decarboxylase  46.46 
 
 		 268 aa  213  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0367853 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0911  4-oxalocrotonate decarboxylase  47.66 
 
 		 277 aa  213  2.9999999999999995e-54  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.625128 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0936  4-oxalocrotonate decarboxylase  45.14 
 
 		 268 aa  212  3.9999999999999995e-54  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.101712  normal  0.608159 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0225  4-oxalocrotonate decarboxylase  48.29 
 
 		 262 aa  212  3.9999999999999995e-54  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3527  4-oxalocrotonate decarboxylase  46.46 
 
 		 265 aa  211  9e-54  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1982  2-keto-4-pentenoate hydratase  45.75 
 
 		 264 aa  211  1e-53  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.572392 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3902  4-oxalocrotonate decarboxylase  48.41 
 
 		 265 aa  211  1e-53  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.561065 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2011  4-oxalocrotonate decarboxylase  46.4 
 
 		 260 aa  210  2e-53  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.781375  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3520  4-oxalocrotonate decarboxylase  46.46 
 
 		 263 aa  209  2e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0986627 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2299  4-oxalocrotonate decarboxylase  45.6 
 
 		 261 aa  210  2e-53  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3512  4-oxalocrotonate decarboxylase  42.86 
 
 		 269 aa  210  2e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5207  2-keto-4-pentenoate hydratase  43.98 
 
 		 273 aa  209  5e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.133138  normal  0.334182 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7646  4-oxalocrotonate decarboxylase  45.25 
 
 		 274 aa  208  6e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.573554 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2578  4-oxalocrotonate decarboxylase  46.85 
 
 		 276 aa  207  1e-52  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0905  hydratase/decarboxylase  45.83 
 
 		 263 aa  207  1e-52  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0436706  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5499  4-oxalocrotonate decarboxylase  43.77 
 
 		 274 aa  207  1e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0224  2-oxopent-4-enoate hydratase  46.15 
 
 		 264 aa  207  1e-52  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0261621  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0381  2-keto-4-pentenoate hydratase  43.46 
 
 		 269 aa  207  2e-52  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.795138  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1639  4-oxalocrotonate decarboxylase  44.88 
 
 		 259 aa  206  3e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.193054 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3275  2-keto-4-pentenoate hydratase  43.46 
 
 		 269 aa  206  3e-52  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.235013  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1354  hydratase/decarboxylase  45.83 
 
 		 262 aa  206  4e-52  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000612409  decreased coverage  0.00000118865 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2327  putative 2-hydroxypenta-2,4-dienoate hydratase(MhpD)  48.86 
 
 		 268 aa  205  5e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1466  4-oxalocrotonate decarboxylase  44.75 
 
 		 273 aa  205  6e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0414  2-keto-4-pentenoate hydratase  43.46 
 
 		 269 aa  205  7e-52  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0374  2-keto-4-pentenoate hydratase  43.46 
 
 		 269 aa  205  7e-52  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.832182  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3256  4-oxalocrotonate decarboxylase  43.08 
 
 		 269 aa  204  9e-52  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00304  2-keto-4-pentenoate hydratase  43.08 
 
 		 269 aa  204  2e-51  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.503312  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00308  hypothetical protein  43.08 
 
 		 269 aa  204  2e-51  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.527408  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2158  4-oxalocrotonate decarboxylase  40.65 
 
 		 262 aa  202  3e-51  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2884  4-oxalocrotonate decarboxylase  45.91 
 
 		 288 aa  203  3e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3242  hydratase/decarboxylase  48.66 
 
 		 260 aa  201  9e-51  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000968427  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42150  2-hydroxypent-2,4-dienoate hydratase  48.67 
 
 		 261 aa  201  9.999999999999999e-51  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.293913  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0425  2-keto-4-pentenoate hydratase  43.31 
 
 		 269 aa  200  1.9999999999999998e-50  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3781  hydratase/decarboxylase  43.24 
 
 		 262 aa  200  1.9999999999999998e-50  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0303669  decreased coverage  0.000202677 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2111  4-oxalocrotonate decarboxylase  46.28 
 
 		 280 aa  199  3.9999999999999996e-50  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3854  hydratase/decarboxylase  42.47 
 
 		 264 aa  198  6e-50  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.595722  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3548  2-hydroxypenta-2,4-dienoate hydratase (CmtF)  42.69 
 
 		 262 aa  198  9e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.107167 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2958  4-oxalocrotonate decarboxylase  43.08 
 
 		 262 aa  194  8.000000000000001e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.351017  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5134  hydratase/decarboxylase  42.63 
 
 		 263 aa  194  9e-49  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0285955 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15110  2-keto-4-pentenoate hydratase  43.46 
 
 		 264 aa  193  2e-48  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.473426  n/a   
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5436  4-oxalocrotonate decarboxylase  43.7 
 
 		 274 aa  193  3e-48  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  normal  0.635895 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13569  hydratase  38.46 
 
 		 261 aa  193  3e-48  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000748615 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5833  4-oxalocrotonate decarboxylase  43.7 
 
 		 274 aa  193  3e-48  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1318  hydratase/decarboxylase  44.26 
 
 		 262 aa  192  4e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.288999  normal  0.257061 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4661  4-oxalocrotonate decarboxylase  38.85 
 
 		 261 aa  192  5e-48  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.930854  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4749  4-oxalocrotonate decarboxylase  38.85 
 
 		 261 aa  192  5e-48  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0856703  normal  0.088822 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5044  4-oxalocrotonate decarboxylase  39.23 
 
 		 261 aa  192  6e-48  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2405  4-oxalocrotonate decarboxylase  47.62 
 
 		 267 aa  191  1e-47  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4271  2-oxo-hepta-3-ene-1,7-dioic acid hydratase  39.25 
 
 		 268 aa  190  2e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.623769  normal  0.550033 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3090  4-oxalocrotonate decarboxylase  44.06 
 
 		 262 aa  189  2.9999999999999997e-47  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4925  4-oxalocrotonate decarboxylase  45.14 
 
 		 260 aa  189  2.9999999999999997e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.624784  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3502  2-oxo-hepta-3-ene-1,7-dioic acid hydratase  37.83 
 
 		 267 aa  189  4e-47  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.328452  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4569  4-oxalocrotonate decarboxylase  40.08 
 
 		 264 aa  188  1e-46  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00147074 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10590  2-oxo-hept-3-ene-1,7-dioate hydratase  38.58 
 
 		 267 aa  187  1e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5220  4-oxalocrotonate decarboxylase  39.77 
 
 		 264 aa  187  2e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4066  2-oxo-hepta-3-ene-1,7-dioic acid hydratase  40.31 
 
 		 274 aa  186  2e-46  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.597772 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3798  2-oxopent-4-enoate hydratase  44.03 
 
 		 261 aa  187  2e-46  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.138107  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4209  4-oxalocrotonate decarboxylase  42.86 
 
 		 264 aa  187  2e-46  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0965  2-oxo-hept-3-ene-1,7-dioate hydratase  38.58 
 
 		 267 aa  186  3e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1520  4-oxalocrotonate decarboxylase  40.49 
 
 		 261 aa  186  3e-46  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2039  4-oxalocrotonate decarboxylase  42.91 
 
 		 273 aa  186  4e-46  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4745  4-oxalocrotonate decarboxylase  43.11 
 
 		 270 aa  186  4e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1627  2-oxo-hepta-3-ene-1,7-dioic acid hydratase  37.83 
 
 		 267 aa  185  6e-46  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.72873 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>