273 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmz1t_3091 on replicon NC_011662
Organism: Thauera sp. MZ1T



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011662  Tmz1t_3091  2-oxopent-4-enoate hydratase  100 
 
 
260 aa  523  1e-147  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.42559  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2774  hydratase/decarboxylase  86.92 
 
 
260 aa  467  1.0000000000000001e-131  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.00000469641  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3785  hydratase/decarboxylase  82.69 
 
 
260 aa  446  1.0000000000000001e-124  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0026227  hitchhiker  0.00282888 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1321  hydratase/decarboxylase  71.04 
 
 
262 aa  392  1e-108  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0604012  normal  0.404919 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2077  2-oxopent-4-enoate hydratase  70.38 
 
 
261 aa  375  1e-103  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.849096  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0222  4-oxalocrotonate decarboxylase  72.31 
 
 
262 aa  369  1e-101  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2961  4-oxalocrotonate decarboxylase  69.11 
 
 
260 aa  365  1e-100  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.665549  normal 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4144  4-oxalocrotonate decarboxylase  68.73 
 
 
260 aa  363  2e-99  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.246439 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1189  2-hydroxypenta-2,4-dienoate hydratase (BphH)  68.73 
 
 
264 aa  361  8e-99  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.375643  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2273  4-oxalocrotonate decarboxylase  67.31 
 
 
261 aa  355  5e-97  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4620  2-oxopent-4-enoate hydratase  65.77 
 
 
260 aa  353  2e-96  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.275598  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3544  2-oxopent-4-enoate hydratase  65.77 
 
 
260 aa  353  2e-96  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.127016  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5691  4-oxalocrotonate decarboxylase  65 
 
 
260 aa  349  2e-95  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2785  4-oxalocrotonate decarboxylase  65 
 
 
261 aa  350  2e-95  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.197083 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3343  2-oxopent-4-enoate hydratase  65.38 
 
 
260 aa  344  7e-94  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2460  4-oxalocrotonate decarboxylase  60.77 
 
 
260 aa  332  3e-90  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.768834  normal  0.296337 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30610  2-Hydroxypent-2,4-dienoate hydratase; LapE  61.39 
 
 
265 aa  330  1e-89  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.000960153  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3325  4-oxalocrotonate decarboxylase  60.23 
 
 
266 aa  327  1.0000000000000001e-88  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1510  4-oxalocrotonate decarboxylase  58.85 
 
 
260 aa  318  3.9999999999999996e-86  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1459  4-oxalocrotonate decarboxylase  56.15 
 
 
260 aa  303  1.0000000000000001e-81  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.512129  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1392  4-oxalocrotonate decarboxylase  54.02 
 
 
263 aa  295  4e-79  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0975696 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08670  4-oxo-4-pentenoate hydratase, XylJ  59.39 
 
 
261 aa  275  6e-73  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2118  4-oxalocrotonate decarboxylase  55.06 
 
 
271 aa  274  1.0000000000000001e-72  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.609149  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1777  4-oxalocrotonate decarboxylase  55.23 
 
 
257 aa  273  1.0000000000000001e-72  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3689  hydratase/decarboxylase  53.73 
 
 
266 aa  271  7e-72  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1621  2-oxopent-4-enoate hydratase  51.75 
 
 
264 aa  264  1e-69  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4085  2-oxopent-4-enoate hydratase  47.83 
 
 
267 aa  256  3e-67  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000524317 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1149  2-oxopent-4-enoate hydratase  47.49 
 
 
269 aa  236  2e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.363401  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2296  2-oxopent-4-enoate hydratase  46.25 
 
 
259 aa  233  2.0000000000000002e-60  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1186  4-oxalocrotonate decarboxylase  47.49 
 
 
264 aa  232  5e-60  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0763202  normal  0.362959 
 
 
-
 
NC_003296  RS01662  putative hydratase protein  50.21 
 
 
265 aa  229  2e-59  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.103932  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3512  4-oxalocrotonate decarboxylase  43.63 
 
 
269 aa  224  1e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2011  4-oxalocrotonate decarboxylase  50.67 
 
 
260 aa  221  7e-57  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.781375  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2578  4-oxalocrotonate decarboxylase  48.84 
 
 
276 aa  219  3.9999999999999997e-56  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2155  2-hydroxypenta-2,4-dienoate hydratase, putative  44.71 
 
 
255 aa  218  6e-56  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1982  2-keto-4-pentenoate hydratase  45.95 
 
 
264 aa  218  7e-56  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.572392 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9115  2-oxopent-4-enoate hydratase  48 
 
 
265 aa  218  7.999999999999999e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0936  4-oxalocrotonate decarboxylase  46.67 
 
 
268 aa  217  1e-55  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.101712  normal  0.608159 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42150  2-hydroxypent-2,4-dienoate hydratase  47.9 
 
 
261 aa  217  1e-55  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.293913  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0534  2-oxopent-4-enoate hydratase  43.85 
 
 
267 aa  217  2e-55  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1477  4-oxalocrotonate decarboxylase  44.79 
 
 
264 aa  216  2.9999999999999998e-55  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2111  4-oxalocrotonate decarboxylase  46.3 
 
 
280 aa  214  9.999999999999999e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3781  hydratase/decarboxylase  42.47 
 
 
262 aa  213  1.9999999999999998e-54  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0303669  decreased coverage  0.000202677 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4537  4-oxalocrotonate decarboxylase  43.8 
 
 
262 aa  213  1.9999999999999998e-54  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0272  4-oxalocrotonate decarboxylase  44.09 
 
 
262 aa  213  2.9999999999999995e-54  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2405  4-oxalocrotonate decarboxylase  48.45 
 
 
267 aa  213  2.9999999999999995e-54  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0439  2-oxopent-4-enoate hydratase  46.38 
 
 
263 aa  213  2.9999999999999995e-54  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0138498 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2875  4-oxalocrotonate decarboxylase  44.98 
 
 
268 aa  213  3.9999999999999995e-54  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0367853 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0225  4-oxalocrotonate decarboxylase  44.36 
 
 
262 aa  212  4.9999999999999996e-54  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2158  4-oxalocrotonate decarboxylase  41.7 
 
 
262 aa  211  9e-54  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0911  4-oxalocrotonate decarboxylase  46.88 
 
 
277 aa  211  9e-54  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.625128 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1466  4-oxalocrotonate decarboxylase  43.13 
 
 
273 aa  211  1e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5220  4-oxalocrotonate decarboxylase  42.08 
 
 
264 aa  210  2e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3090  4-oxalocrotonate decarboxylase  43.08 
 
 
262 aa  210  2e-53  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7646  4-oxalocrotonate decarboxylase  43.89 
 
 
274 aa  209  4e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.573554 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0224  2-oxopent-4-enoate hydratase  44.22 
 
 
264 aa  209  4e-53  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0261621  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3902  4-oxalocrotonate decarboxylase  48.12 
 
 
265 aa  209  5e-53  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.561065 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2299  4-oxalocrotonate decarboxylase  42.86 
 
 
261 aa  208  8e-53  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15110  2-keto-4-pentenoate hydratase  44.36 
 
 
264 aa  208  8e-53  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.473426  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3527  4-oxalocrotonate decarboxylase  45.78 
 
 
265 aa  206  3e-52  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5207  2-keto-4-pentenoate hydratase  48.2 
 
 
273 aa  206  4e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.133138  normal  0.334182 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3612  2-oxo-hepta-3-ene-1,7-dioic acid hydratase  40.93 
 
 
261 aa  204  8e-52  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1639  4-oxalocrotonate decarboxylase  48.1 
 
 
259 aa  204  1e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.193054 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2773  hydratase/decarboxylase  42.31 
 
 
262 aa  204  1e-51  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000493793  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5499  4-oxalocrotonate decarboxylase  43.02 
 
 
274 aa  204  1e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3524  2-oxo-hepta-3-ene-1,7-dioic acid hydratase  41.31 
 
 
261 aa  203  2e-51  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3854  hydratase/decarboxylase  43.63 
 
 
264 aa  203  3e-51  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.595722  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3520  4-oxalocrotonate decarboxylase  45.1 
 
 
263 aa  203  3e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0986627 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2884  4-oxalocrotonate decarboxylase  46.64 
 
 
288 aa  201  9e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0905  hydratase/decarboxylase  46.84 
 
 
263 aa  200  1.9999999999999998e-50  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0436706  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0381  2-keto-4-pentenoate hydratase  41.31 
 
 
269 aa  199  3e-50  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.795138  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1354  hydratase/decarboxylase  45.8 
 
 
262 aa  199  3.9999999999999996e-50  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000612409  decreased coverage  0.00000118865 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2327  putative 2-hydroxypenta-2,4-dienoate hydratase(MhpD)  42.59 
 
 
268 aa  199  3.9999999999999996e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4569  4-oxalocrotonate decarboxylase  42.91 
 
 
264 aa  199  3.9999999999999996e-50  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00147074 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20020  2-oxohept-3-enedioate hydratase  39.38 
 
 
261 aa  199  3.9999999999999996e-50  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3242  hydratase/decarboxylase  47.96 
 
 
260 aa  199  5e-50  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000968427  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4745  4-oxalocrotonate decarboxylase  42.41 
 
 
270 aa  199  5e-50  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13569  hydratase  41.57 
 
 
261 aa  198  6e-50  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000748615 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3548  2-hydroxypenta-2,4-dienoate hydratase (CmtF)  45.11 
 
 
262 aa  198  6e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.107167 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1318  hydratase/decarboxylase  39.23 
 
 
262 aa  198  6e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.288999  normal  0.257061 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3275  2-keto-4-pentenoate hydratase  41.31 
 
 
269 aa  197  1.0000000000000001e-49  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.235013  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2039  4-oxalocrotonate decarboxylase  43.94 
 
 
273 aa  197  1.0000000000000001e-49  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0414  2-keto-4-pentenoate hydratase  41.31 
 
 
269 aa  196  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0374  2-keto-4-pentenoate hydratase  41.31 
 
 
269 aa  196  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.832182  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3256  4-oxalocrotonate decarboxylase  40.93 
 
 
269 aa  196  3e-49  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00304  2-keto-4-pentenoate hydratase  40.93 
 
 
269 aa  196  4.0000000000000005e-49  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.503312  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0909  2-oxopent-4-enoate hydratase  37.45 
 
 
262 aa  196  4.0000000000000005e-49  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00308  hypothetical protein  40.93 
 
 
269 aa  196  4.0000000000000005e-49  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.527408  n/a   
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5436  4-oxalocrotonate decarboxylase  46.46 
 
 
274 aa  195  6e-49  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  normal  0.635895 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5833  4-oxalocrotonate decarboxylase  46.46 
 
 
274 aa  195  6e-49  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4661  4-oxalocrotonate decarboxylase  41.11 
 
 
261 aa  195  7e-49  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.930854  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4749  4-oxalocrotonate decarboxylase  41.11 
 
 
261 aa  195  7e-49  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0856703  normal  0.088822 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0425  2-keto-4-pentenoate hydratase  41.9 
 
 
269 aa  194  8.000000000000001e-49  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5044  4-oxalocrotonate decarboxylase  41.11 
 
 
261 aa  194  9e-49  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4271  2-oxo-hepta-3-ene-1,7-dioic acid hydratase  40.38 
 
 
268 aa  194  1e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.623769  normal  0.550033 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4832  2-oxopent-4-enoate hydratase  43.31 
 
 
279 aa  194  2e-48  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0838304  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3472  2-oxopent-4-enoate hydratase  41.09 
 
 
260 aa  192  3e-48  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.102578  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30600  4-oxalocrotonate decarboxylase; LapH  42.02 
 
 
267 aa  191  7e-48  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.0000150281  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2890  4-oxalocrotonate decarboxylase  45.02 
 
 
262 aa  191  7e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.254961 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4313  2-oxo-hepta-3-ene-1,7-dioic acid hydratase  40 
 
 
268 aa  191  8e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>