285 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcSMS35_0381 on replicon NC_010498
Organism: Escherichia coli SMS-3-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010498  EcSMS35_0381  2-keto-4-pentenoate hydratase  100 
 
 		 269 aa  552  1e-156  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.795138  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3256  4-oxalocrotonate decarboxylase  99.26 
 
 		 269 aa  548  1e-155  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3275  2-keto-4-pentenoate hydratase  99.63 
 
 		 269 aa  549  1e-155  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.235013  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00304  2-keto-4-pentenoate hydratase  98.88 
 
 		 269 aa  546  1e-154  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.503312  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00308  hypothetical protein  98.88 
 
 		 269 aa  546  1e-154  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.527408  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0414  2-keto-4-pentenoate hydratase  98.88 
 
 		 269 aa  546  1e-154  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0425  2-keto-4-pentenoate hydratase  98.88 
 
 		 269 aa  545  1e-154  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0374  2-keto-4-pentenoate hydratase  98.88 
 
 		 269 aa  546  1e-154  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.832182  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15110  2-keto-4-pentenoate hydratase  72.14 
 
 		 264 aa  389  1e-107  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.473426  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1982  2-keto-4-pentenoate hydratase  70.77 
 
 		 264 aa  383  1e-105  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.572392 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1149  2-oxopent-4-enoate hydratase  58.62 
 
 		 269 aa  306  2.0000000000000002e-82  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.363401  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0905  hydratase/decarboxylase  56.43 
 
 		 263 aa  288  8e-77  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0436706  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1354  hydratase/decarboxylase  56.85 
 
 		 262 aa  287  1e-76  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000612409  decreased coverage  0.00000118865 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4537  4-oxalocrotonate decarboxylase  55.64 
 
 		 262 aa  286  2e-76  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5220  4-oxalocrotonate decarboxylase  52.49 
 
 		 264 aa  282  3.0000000000000004e-75  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0272  4-oxalocrotonate decarboxylase  54.55 
 
 		 262 aa  280  1e-74  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1466  4-oxalocrotonate decarboxylase  53.85 
 
 		 273 aa  279  3e-74  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0936  4-oxalocrotonate decarboxylase  53.26 
 
 		 268 aa  279  3e-74  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.101712  normal  0.608159 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3854  hydratase/decarboxylase  50.96 
 
 		 264 aa  276  2e-73  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.595722  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3520  4-oxalocrotonate decarboxylase  54.47 
 
 		 263 aa  276  3e-73  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0986627 
 
 
-
 
NC_003296  RS01662  putative hydratase protein  57.68 
 
 		 265 aa  274  1.0000000000000001e-72  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.103932  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2875  4-oxalocrotonate decarboxylase  53.54 
 
 		 268 aa  273  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0367853 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1186  4-oxalocrotonate decarboxylase  52.29 
 
 		 264 aa  273  2.0000000000000002e-72  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0763202  normal  0.362959 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2884  4-oxalocrotonate decarboxylase  53.12 
 
 		 288 aa  271  7e-72  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2011  4-oxalocrotonate decarboxylase  53.7 
 
 		 260 aa  271  7e-72  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.781375  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5207  2-keto-4-pentenoate hydratase  53.93 
 
 		 273 aa  269  2.9999999999999997e-71  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.133138  normal  0.334182 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7646  4-oxalocrotonate decarboxylase  53.05 
 
 		 274 aa  267  1e-70  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.573554 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9115  2-oxopent-4-enoate hydratase  55.29 
 
 		 265 aa  267  1e-70  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2327  putative 2-hydroxypenta-2,4-dienoate hydratase(MhpD)  54.02 
 
 		 268 aa  262  4.999999999999999e-69  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5499  4-oxalocrotonate decarboxylase  50.37 
 
 		 274 aa  259  4e-68  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5134  hydratase/decarboxylase  51.17 
 
 		 263 aa  258  8e-68  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0285955 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3548  2-hydroxypenta-2,4-dienoate hydratase (CmtF)  57.4 
 
 		 262 aa  257  1e-67  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.107167 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42150  2-hydroxypent-2,4-dienoate hydratase  52.26 
 
 		 261 aa  251  6e-66  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.293913  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2111  4-oxalocrotonate decarboxylase  48.66 
 
 		 280 aa  244  9.999999999999999e-64  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5436  4-oxalocrotonate decarboxylase  47.13 
 
 		 274 aa  243  1.9999999999999999e-63  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  normal  0.635895 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5833  4-oxalocrotonate decarboxylase  47.13 
 
 		 274 aa  243  1.9999999999999999e-63  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1477  4-oxalocrotonate decarboxylase  46.74 
 
 		 264 aa  239  2.9999999999999997e-62  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3242  hydratase/decarboxylase  49.36 
 
 		 260 aa  238  5.999999999999999e-62  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000968427  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2890  4-oxalocrotonate decarboxylase  53.17 
 
 		 262 aa  236  3e-61  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.254961 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3512  4-oxalocrotonate decarboxylase  47.66 
 
 		 269 aa  233  2.0000000000000002e-60  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2151  4-oxalocrotonate decarboxylase  49.8 
 
 		 271 aa  234  2.0000000000000002e-60  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1639  4-oxalocrotonate decarboxylase  48.02 
 
 		 259 aa  231  7.000000000000001e-60  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.193054 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2779  hydratase/decarboxylase  50.59 
 
 		 273 aa  228  7e-59  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.963348  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4745  4-oxalocrotonate decarboxylase  47.31 
 
 		 270 aa  227  2e-58  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4925  4-oxalocrotonate decarboxylase  50.98 
 
 		 260 aa  226  4e-58  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.624784  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3902  4-oxalocrotonate decarboxylase  47.27 
 
 		 265 aa  225  5.0000000000000005e-58  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.561065 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0911  4-oxalocrotonate decarboxylase  46.07 
 
 		 277 aa  225  7e-58  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.625128 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3527  4-oxalocrotonate decarboxylase  46.48 
 
 		 265 aa  224  1e-57  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1651  4-oxalocrotonate decarboxylase  48.22 
 
 		 275 aa  223  2e-57  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.452701  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1510  4-oxalocrotonate decarboxylase  45.42 
 
 		 260 aa  217  2e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3785  hydratase/decarboxylase  42.69 
 
 		 260 aa  212  5.999999999999999e-54  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0026227  hitchhiker  0.00282888 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4393  hydratase/decarboxylase  45.97 
 
 		 283 aa  211  1e-53  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2077  2-oxopent-4-enoate hydratase  43.46 
 
 		 261 aa  207  2e-52  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.849096  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4085  2-oxopent-4-enoate hydratase  43.07 
 
 		 267 aa  206  3e-52  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000524317 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1321  hydratase/decarboxylase  41.31 
 
 		 262 aa  206  4e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0604012  normal  0.404919 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2774  hydratase/decarboxylase  41.7 
 
 		 260 aa  204  1e-51  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.00000469641  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2118  4-oxalocrotonate decarboxylase  40.87 
 
 		 271 aa  202  3e-51  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.609149  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2460  4-oxalocrotonate decarboxylase  41.31 
 
 		 260 aa  202  4e-51  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.768834  normal  0.296337 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1392  4-oxalocrotonate decarboxylase  41.15 
 
 		 263 aa  202  4e-51  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0975696 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2296  2-oxopent-4-enoate hydratase  42.29 
 
 		 259 aa  201  9.999999999999999e-51  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13569  hydratase  42.75 
 
 		 261 aa  201  9.999999999999999e-51  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000748615 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3091  2-oxopent-4-enoate hydratase  41.31 
 
 		 260 aa  199  3e-50  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.42559  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1459  4-oxalocrotonate decarboxylase  42.47 
 
 		 260 aa  199  3e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.512129  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1621  2-oxopent-4-enoate hydratase  42.8 
 
 		 264 aa  199  5e-50  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4144  4-oxalocrotonate decarboxylase  40.93 
 
 		 260 aa  196  4.0000000000000005e-49  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.246439 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3343  2-oxopent-4-enoate hydratase  39.31 
 
 		 260 aa  195  5.000000000000001e-49  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4620  2-oxopent-4-enoate hydratase  41.67 
 
 		 260 aa  195  8.000000000000001e-49  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.275598  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3544  2-oxopent-4-enoate hydratase  41.67 
 
 		 260 aa  195  8.000000000000001e-49  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.127016  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2961  4-oxalocrotonate decarboxylase  41.92 
 
 		 260 aa  194  9e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.665549  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3325  4-oxalocrotonate decarboxylase  41.31 
 
 		 266 aa  194  1e-48  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2273  4-oxalocrotonate decarboxylase  40.08 
 
 		 261 aa  192  4e-48  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3472  2-oxopent-4-enoate hydratase  41.92 
 
 		 260 aa  190  2e-47  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.102578  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5691  4-oxalocrotonate decarboxylase  40.17 
 
 		 260 aa  189  4e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2785  4-oxalocrotonate decarboxylase  38.55 
 
 		 261 aa  188  5.999999999999999e-47  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.197083 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0909  2-oxopent-4-enoate hydratase  39.53 
 
 		 262 aa  187  1e-46  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1189  2-hydroxypenta-2,4-dienoate hydratase (BphH)  40.15 
 
 		 264 aa  186  3e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.375643  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4661  4-oxalocrotonate decarboxylase  39 
 
 		 261 aa  184  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.930854  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4749  4-oxalocrotonate decarboxylase  39 
 
 		 261 aa  184  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0856703  normal  0.088822 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5236  4-oxalocrotonate decarboxylase  40 
 
 		 261 aa  183  3e-45  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.270652 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0222  4-oxalocrotonate decarboxylase  41.7 
 
 		 262 aa  183  3e-45  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5044  4-oxalocrotonate decarboxylase  38.61 
 
 		 261 aa  181  9.000000000000001e-45  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30610  2-Hydroxypent-2,4-dienoate hydratase; LapE  42.15 
 
 		 265 aa  179  4.999999999999999e-44  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.000960153  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2155  2-hydroxypenta-2,4-dienoate hydratase, putative  40.16 
 
 		 255 aa  178  7e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1520  4-oxalocrotonate decarboxylase  38.74 
 
 		 261 aa  178  7e-44  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1777  4-oxalocrotonate decarboxylase  40.71 
 
 		 257 aa  177  2e-43  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2039  4-oxalocrotonate decarboxylase  39.02 
 
 		 273 aa  176  2e-43  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0534  2-oxopent-4-enoate hydratase  40.68 
 
 		 267 aa  176  4e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2578  4-oxalocrotonate decarboxylase  39.69 
 
 		 276 aa  174  9.999999999999999e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3689  hydratase/decarboxylase  42.92 
 
 		 266 aa  174  1.9999999999999998e-42  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4209  4-oxalocrotonate decarboxylase  40.38 
 
 		 264 aa  171  2e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0224  2-oxopent-4-enoate hydratase  42.63 
 
 		 264 aa  169  3e-41  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0261621  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0439  2-oxopent-4-enoate hydratase  39.83 
 
 		 263 aa  168  9e-41  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0138498 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4271  2-oxo-hepta-3-ene-1,7-dioic acid hydratase  36.64 
 
 		 268 aa  166  5e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.623769  normal  0.550033 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2405  4-oxalocrotonate decarboxylase  38.13 
 
 		 267 aa  166  5e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3502  2-oxo-hepta-3-ene-1,7-dioic acid hydratase  36.64 
 
 		 267 aa  159  4e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.328452  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2158  4-oxalocrotonate decarboxylase  34.53 
 
 		 262 aa  159  5e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4066  2-oxo-hepta-3-ene-1,7-dioic acid hydratase  36 
 
 		 274 aa  157  1e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.597772 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2420  2-oxo-hepta-3-ene-1,7-dioic acid hydratase  34.85 
 
 		 278 aa  156  3e-37  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3088  2-oxo-hepta-3-ene-1,7-dioic acid hydratase  32.96 
 
 		 266 aa  156  4e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.325663  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3324  4-oxalocrotonate decarboxylase  35.14 
 
 		 264 aa  156  4e-37  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>