264 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A3324 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008825  Mpe_A3324  4-oxalocrotonate decarboxylase  100 
 
 
264 aa  529  1e-149  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30600  4-oxalocrotonate decarboxylase; LapH  73.18 
 
 
267 aa  385  1e-106  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.0000150281  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3342  4-oxalocrotonate decarboxylase  57.63 
 
 
262 aa  308  6.999999999999999e-83  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5692  4-oxalocrotonate decarboxylase  57.25 
 
 
263 aa  289  4e-77  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2272  4-oxalocrotonate decarboxylase  56.49 
 
 
268 aa  288  7e-77  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.866391  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4619  4-oxalocrotonate decarboxylase  55.34 
 
 
263 aa  288  7e-77  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.118774  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3543  4-oxalocrotonate decarboxylase  55.34 
 
 
263 aa  288  7e-77  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0271382  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3781  hydratase/decarboxylase  54.02 
 
 
262 aa  285  5.999999999999999e-76  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0303669  decreased coverage  0.000202677 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2958  4-oxalocrotonate decarboxylase  56.49 
 
 
262 aa  281  6.000000000000001e-75  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.351017  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1318  hydratase/decarboxylase  53.82 
 
 
262 aa  280  1e-74  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.288999  normal  0.257061 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3090  4-oxalocrotonate decarboxylase  54.2 
 
 
262 aa  275  5e-73  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08680  4-oxalocrotonate decarboxylase.XylI  52.29 
 
 
262 aa  274  1.0000000000000001e-72  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0225  4-oxalocrotonate decarboxylase  54.41 
 
 
262 aa  271  9e-72  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2773  hydratase/decarboxylase  52.67 
 
 
262 aa  270  2e-71  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000493793  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2784  4-oxalocrotonate decarboxylase  54.02 
 
 
262 aa  263  2e-69  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.965988  normal  0.191345 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2299  4-oxalocrotonate decarboxylase  43.02 
 
 
261 aa  225  4e-58  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2158  4-oxalocrotonate decarboxylase  42.52 
 
 
262 aa  216  4e-55  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1777  4-oxalocrotonate decarboxylase  42.15 
 
 
257 aa  193  3e-48  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1621  2-oxopent-4-enoate hydratase  43.2 
 
 
264 aa  187  2e-46  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0225  4-oxalocrotonate decarboxylase  42.4 
 
 
269 aa  183  2.0000000000000003e-45  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  hitchhiker  0.00468493  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4085  2-oxopent-4-enoate hydratase  42.29 
 
 
267 aa  182  7e-45  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000524317 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1480  4-oxalocrotonate decarboxylase  42.13 
 
 
254 aa  181  8.000000000000001e-45  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1618  4-oxalocrotonate decarboxylase  41.27 
 
 
259 aa  181  8.000000000000001e-45  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2774  hydratase/decarboxylase  38.08 
 
 
260 aa  181  1e-44  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.00000469641  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3091  2-oxopent-4-enoate hydratase  39.23 
 
 
260 aa  181  1e-44  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.42559  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3785  hydratase/decarboxylase  36.15 
 
 
260 aa  178  8e-44  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0026227  hitchhiker  0.00282888 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42150  2-hydroxypent-2,4-dienoate hydratase  41.56 
 
 
261 aa  178  9e-44  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.293913  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2155  2-hydroxypenta-2,4-dienoate hydratase, putative  40.39 
 
 
255 aa  177  2e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4144  4-oxalocrotonate decarboxylase  40.55 
 
 
260 aa  177  2e-43  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.246439 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1321  hydratase/decarboxylase  36.78 
 
 
262 aa  176  3e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0604012  normal  0.404919 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1189  2-hydroxypenta-2,4-dienoate hydratase (BphH)  40.16 
 
 
264 aa  175  7e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.375643  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30610  2-Hydroxypent-2,4-dienoate hydratase; LapE  39.76 
 
 
265 aa  174  9.999999999999999e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.000960153  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2296  2-oxopent-4-enoate hydratase  38 
 
 
259 aa  173  1.9999999999999998e-42  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9115  2-oxopent-4-enoate hydratase  42 
 
 
265 aa  172  5e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1982  2-keto-4-pentenoate hydratase  38.7 
 
 
264 aa  172  5e-42  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.572392 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3612  2-oxo-hepta-3-ene-1,7-dioic acid hydratase  38.61 
 
 
261 aa  170  2e-41  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3854  hydratase/decarboxylase  37.93 
 
 
264 aa  171  2e-41  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.595722  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3527  4-oxalocrotonate decarboxylase  40.62 
 
 
265 aa  170  3e-41  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2273  4-oxalocrotonate decarboxylase  38.82 
 
 
261 aa  169  4e-41  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3524  2-oxo-hepta-3-ene-1,7-dioic acid hydratase  38.22 
 
 
261 aa  169  4e-41  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1150  4-oxalocrotonate decarboxylase  40.94 
 
 
254 aa  169  5e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.454229  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0794  4-oxalocrotonate decarboxylase  39.84 
 
 
261 aa  169  6e-41  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4313  2-oxo-hepta-3-ene-1,7-dioic acid hydratase  37.08 
 
 
268 aa  168  8e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS01662  putative hydratase protein  40.25 
 
 
265 aa  167  1e-40  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.103932  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0936  4-oxalocrotonate decarboxylase  42.79 
 
 
268 aa  168  1e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.101712  normal  0.608159 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0537  4-oxalocrotonate decarboxylase  42.25 
 
 
260 aa  168  1e-40  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04226  2-oxo-hept-3-ene-1,7-dioate hydratase  36.78 
 
 
267 aa  167  2e-40  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4580  2-oxo-hepta-3-ene-1,7-dioic acid hydratase  36.78 
 
 
267 aa  167  2e-40  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3902  4-oxalocrotonate decarboxylase  41.41 
 
 
265 aa  167  2e-40  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.561065 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2077  2-oxopent-4-enoate hydratase  36.92 
 
 
261 aa  167  2e-40  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.849096  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4832  2-oxopent-4-enoate hydratase  40.94 
 
 
279 aa  167  2e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0838304  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04192  hypothetical protein  36.78 
 
 
273 aa  167  2e-40  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3706  2-oxo-hepta-3-ene-1,7-dioic acid hydratase  36.78 
 
 
267 aa  167  2e-40  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.29388 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3343  2-oxopent-4-enoate hydratase  38.43 
 
 
260 aa  167  2e-40  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4620  2-oxopent-4-enoate hydratase  38.04 
 
 
260 aa  166  4e-40  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.275598  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1149  2-oxopent-4-enoate hydratase  38.34 
 
 
269 aa  166  4e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.363401  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3544  2-oxopent-4-enoate hydratase  38.04 
 
 
260 aa  166  4e-40  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.127016  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0911  4-oxalocrotonate decarboxylase  38.22 
 
 
277 aa  166  5e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.625128 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1186  4-oxalocrotonate decarboxylase  38.19 
 
 
264 aa  165  6.9999999999999995e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0763202  normal  0.362959 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0222  4-oxalocrotonate decarboxylase  40.84 
 
 
262 aa  165  9e-40  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2360  2-oxo-hepta-3-ene-1,7-dioic acid hydratase  35.07 
 
 
267 aa  163  2.0000000000000002e-39  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1459  4-oxalocrotonate decarboxylase  38.1 
 
 
260 aa  163  2.0000000000000002e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.512129  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2456  2-oxo-hepta-3-ene-1,7-dioic acid hydratase  35.07 
 
 
267 aa  163  2.0000000000000002e-39  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.228011  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1477  4-oxalocrotonate decarboxylase  38.22 
 
 
264 aa  163  3e-39  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8638  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  35 
 
 
259 aa  163  3e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.423963  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5691  4-oxalocrotonate decarboxylase  38.75 
 
 
260 aa  163  3e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1643  2-oxo-hept-3-ene-1,7-dioate hydratase  35.07 
 
 
267 aa  163  3e-39  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4279  2-oxo-hepta-3-ene-1,7-dioic acid hydratase  37.45 
 
 
268 aa  162  4.0000000000000004e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  decreased coverage  0.00917502  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2875  4-oxalocrotonate decarboxylase  37.01 
 
 
268 aa  162  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0367853 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3178  2-oxo-hepta-3-ene-1,7-dioic acid hydratase  33.96 
 
 
267 aa  162  4.0000000000000004e-39  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.128545  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5499  4-oxalocrotonate decarboxylase  40 
 
 
274 aa  162  5.0000000000000005e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0943  2-oxo-hepta-3-ene-1,7-dioic acid hydratase  36.6 
 
 
267 aa  162  5.0000000000000005e-39  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4445  2-oxo-hepta-3-ene-1,7-dioic acid hydratase  34.46 
 
 
267 aa  162  6e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.549639  normal  0.132657 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2785  4-oxalocrotonate decarboxylase  36.08 
 
 
261 aa  162  6e-39  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.197083 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4569  4-oxalocrotonate decarboxylase  39.23 
 
 
264 aa  162  7e-39  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00147074 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10590  2-oxo-hept-3-ene-1,7-dioate hydratase  35.98 
 
 
267 aa  162  7e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1135  2-oxo-hepta-3-ene-1,7-dioate hydratase  36.6 
 
 
267 aa  162  8.000000000000001e-39  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2269  2-oxo-hepta-3-ene-1,7-dioic acid hydratase  36.6 
 
 
267 aa  162  8.000000000000001e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0105  2-oxo-hepta-3-ene-1,7-dioic acid hydratase  36.6 
 
 
267 aa  162  8.000000000000001e-39  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.274919  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1028  2-oxo-hepta-3-ene-1,7-dioic acid hydratase  36.6 
 
 
267 aa  162  8.000000000000001e-39  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0912  4-oxalocrotonate decarboxylase  40.4 
 
 
259 aa  161  8.000000000000001e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.704461  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1508  2-oxo-hepta-3-ene-1,7-dioic acid hydratase  36.6 
 
 
267 aa  162  8.000000000000001e-39  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.576593  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5220  4-oxalocrotonate decarboxylase  36.99 
 
 
264 aa  161  9e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5236  4-oxalocrotonate decarboxylase  38.74 
 
 
261 aa  161  9e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.270652 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1215  2-oxo-hepta-3-ene-1,7-dioic acid hydratase  36.02 
 
 
267 aa  161  1e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.033694  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1169  2-oxo-hepta-3-ene-1,7-dioic acid hydratase  36.02 
 
 
267 aa  161  1e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.135295  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1730  2-oxo-hepta-3-ene-1,7-dioic acid hydratase  35.85 
 
 
267 aa  161  1e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4661  4-oxalocrotonate decarboxylase  37.55 
 
 
261 aa  160  1e-38  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.930854  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2460  4-oxalocrotonate decarboxylase  35.29 
 
 
260 aa  161  1e-38  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.768834  normal  0.296337 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1180  2-oxo-hepta-3-ene-1,7-dioic acid hydratase  36.02 
 
 
267 aa  161  1e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.850117  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4749  4-oxalocrotonate decarboxylase  37.55 
 
 
261 aa  160  1e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0856703  normal  0.088822 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0630  2-oxo-hepta-3-ene-1,7-dioic acid hydratase  35.69 
 
 
267 aa  161  1e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.337949  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0909  2-oxopent-4-enoate hydratase  35.18 
 
 
262 aa  160  2e-38  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3499  2-oxo-hepta-3-ene-1,7-dioic acid hydratase  35.47 
 
 
266 aa  160  2e-38  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00827858 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3589  2-oxo-hepta-3-ene-1,7-dioic acid hydratase  37.45 
 
 
268 aa  160  2e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.82541  normal  0.773607 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1064  2-oxo-hepta-3-ene-1,7-dioic acid hydratase  36.02 
 
 
267 aa  160  2e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5044  4-oxalocrotonate decarboxylase  37.94 
 
 
261 aa  160  2e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2011  4-oxalocrotonate decarboxylase  37.55 
 
 
260 aa  160  2e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.781375  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2111  4-oxalocrotonate decarboxylase  38.67 
 
 
280 aa  160  2e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13569  hydratase  39.53 
 
 
261 aa  160  2e-38  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000748615 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>