280 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_0794 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013235  Namu_0794  4-oxalocrotonate decarboxylase  100 
 
 
261 aa  524  1e-148  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0225  4-oxalocrotonate decarboxylase  46.59 
 
 
269 aa  221  8e-57  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  hitchhiker  0.00468493  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2158  4-oxalocrotonate decarboxylase  41.94 
 
 
262 aa  210  2e-53  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2299  4-oxalocrotonate decarboxylase  41.73 
 
 
261 aa  202  6e-51  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0537  4-oxalocrotonate decarboxylase  47.2 
 
 
260 aa  200  1.9999999999999998e-50  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1621  2-oxopent-4-enoate hydratase  42.52 
 
 
264 aa  199  5e-50  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08680  4-oxalocrotonate decarboxylase.XylI  42.08 
 
 
262 aa  191  1e-47  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2774  hydratase/decarboxylase  40.89 
 
 
260 aa  189  5.999999999999999e-47  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.00000469641  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4313  2-oxo-hepta-3-ene-1,7-dioic acid hydratase  41.8 
 
 
268 aa  188  5.999999999999999e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3781  hydratase/decarboxylase  40.15 
 
 
262 aa  188  8e-47  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0303669  decreased coverage  0.000202677 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4208  4-oxalocrotonate decarboxylase  42.25 
 
 
261 aa  186  3e-46  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3091  2-oxopent-4-enoate hydratase  40.17 
 
 
260 aa  186  4e-46  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.42559  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3090  4-oxalocrotonate decarboxylase  42.41 
 
 
262 aa  186  4e-46  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2958  4-oxalocrotonate decarboxylase  42.86 
 
 
262 aa  185  8e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.351017  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2773  hydratase/decarboxylase  41.63 
 
 
262 aa  184  1.0000000000000001e-45  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000493793  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1618  4-oxalocrotonate decarboxylase  41.6 
 
 
259 aa  184  1.0000000000000001e-45  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0225  4-oxalocrotonate decarboxylase  40.54 
 
 
262 aa  182  4.0000000000000006e-45  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2273  4-oxalocrotonate decarboxylase  40.89 
 
 
261 aa  181  7e-45  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1318  hydratase/decarboxylase  40 
 
 
262 aa  182  7e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.288999  normal  0.257061 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2785  4-oxalocrotonate decarboxylase  40.89 
 
 
261 aa  181  1e-44  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.197083 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30600  4-oxalocrotonate decarboxylase; LapH  42.39 
 
 
267 aa  180  2e-44  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.0000150281  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1777  4-oxalocrotonate decarboxylase  41 
 
 
257 aa  179  2.9999999999999997e-44  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3343  2-oxopent-4-enoate hydratase  39.84 
 
 
260 aa  179  5.999999999999999e-44  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2077  2-oxopent-4-enoate hydratase  39.22 
 
 
261 aa  178  7e-44  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.849096  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2296  2-oxopent-4-enoate hydratase  38.65 
 
 
259 aa  176  4e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5691  4-oxalocrotonate decarboxylase  40 
 
 
260 aa  176  5e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3785  hydratase/decarboxylase  37.74 
 
 
260 aa  175  6e-43  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0026227  hitchhiker  0.00282888 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3524  2-oxo-hepta-3-ene-1,7-dioic acid hydratase  39.92 
 
 
261 aa  175  8e-43  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4271  2-oxo-hepta-3-ene-1,7-dioic acid hydratase  42.19 
 
 
268 aa  174  9.999999999999999e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.623769  normal  0.550033 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3342  4-oxalocrotonate decarboxylase  39.38 
 
 
262 aa  173  1.9999999999999998e-42  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0912  4-oxalocrotonate decarboxylase  40.36 
 
 
259 aa  172  2.9999999999999996e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.704461  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4085  2-oxopent-4-enoate hydratase  38.8 
 
 
267 aa  171  1e-41  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000524317 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1321  hydratase/decarboxylase  37.65 
 
 
262 aa  171  1e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0604012  normal  0.404919 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3502  2-oxo-hepta-3-ene-1,7-dioic acid hydratase  39.68 
 
 
267 aa  171  1e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.328452  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30610  2-Hydroxypent-2,4-dienoate hydratase; LapE  39.04 
 
 
265 aa  169  3e-41  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.000960153  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0965  2-oxo-hept-3-ene-1,7-dioate hydratase  41.11 
 
 
267 aa  169  4e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2961  4-oxalocrotonate decarboxylase  42.26 
 
 
260 aa  169  5e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.665549  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1787  2-oxo-hepta-3-ene-1,7-dioic acid hydratase  39.38 
 
 
267 aa  168  8e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.995557  normal  0.779131 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10590  2-oxo-hept-3-ene-1,7-dioate hydratase  40.78 
 
 
267 aa  168  9e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3544  2-oxopent-4-enoate hydratase  38.56 
 
 
260 aa  168  1e-40  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.127016  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4620  2-oxopent-4-enoate hydratase  38.56 
 
 
260 aa  168  1e-40  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.275598  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3088  2-oxo-hepta-3-ene-1,7-dioic acid hydratase  39.38 
 
 
266 aa  167  2e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.325663  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3612  2-oxo-hepta-3-ene-1,7-dioic acid hydratase  38.34 
 
 
261 aa  166  2e-40  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5692  4-oxalocrotonate decarboxylase  42.37 
 
 
263 aa  166  2.9999999999999998e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3543  4-oxalocrotonate decarboxylase  39.61 
 
 
263 aa  166  2.9999999999999998e-40  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0271382  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4619  4-oxalocrotonate decarboxylase  39.61 
 
 
263 aa  166  2.9999999999999998e-40  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.118774  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3324  4-oxalocrotonate decarboxylase  39.84 
 
 
264 aa  166  2.9999999999999998e-40  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1469  4-oxalocrotonate decarboxylase  38.49 
 
 
257 aa  166  4e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4066  2-oxo-hepta-3-ene-1,7-dioic acid hydratase  39.53 
 
 
274 aa  166  4e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.597772 
 
 
-
 
NC_003296  RS01663  4-oxalocrotonate decarboxylase protein  39.91 
 
 
263 aa  166  5e-40  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0913733  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2460  4-oxalocrotonate decarboxylase  38.49 
 
 
260 aa  166  5e-40  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.768834  normal  0.296337 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1061  2-oxo-hepta-3-ene-1,7-dioic acid hydratase  37.16 
 
 
267 aa  165  8e-40  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.88697  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9115  2-oxopent-4-enoate hydratase  40.96 
 
 
265 aa  164  9e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0534  2-oxopent-4-enoate hydratase  40 
 
 
267 aa  164  9e-40  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2272  4-oxalocrotonate decarboxylase  40.93 
 
 
268 aa  164  1.0000000000000001e-39  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.866391  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1158  2-keto-4-pentenoate hydratase  36.78 
 
 
267 aa  164  2.0000000000000002e-39  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4445  2-oxo-hepta-3-ene-1,7-dioic acid hydratase  37.12 
 
 
267 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.549639  normal  0.132657 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0240  2-oxo-hepta-3-ene-1,7-dioic acid hydratase  36.88 
 
 
267 aa  164  2.0000000000000002e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3851  hydratase/decarboxylase  37.65 
 
 
256 aa  164  2.0000000000000002e-39  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0976371  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2784  4-oxalocrotonate decarboxylase  41.7 
 
 
262 aa  162  4.0000000000000004e-39  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.965988  normal  0.191345 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13569  hydratase  35.43 
 
 
261 aa  160  2e-38  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000748615 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1406  4-oxalocrotonate decarboxylase  39.29 
 
 
261 aa  160  2e-38  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1778  4-oxalocrotonate decarboxylase  37.21 
 
 
267 aa  160  2e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.110144 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20020  2-oxohept-3-enedioate hydratase  35.6 
 
 
261 aa  160  2e-38  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1392  4-oxalocrotonate decarboxylase  36.22 
 
 
263 aa  160  2e-38  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0975696 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1150  4-oxalocrotonate decarboxylase  37.1 
 
 
254 aa  159  6e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.454229  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4269  2-oxo-hepta-3-ene-1,7-dioic acid hydratase  37.11 
 
 
282 aa  159  6e-38  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.238552  normal  0.686193 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1480  4-oxalocrotonate decarboxylase  35.6 
 
 
254 aa  158  8e-38  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4369  2-oxo-hepta-3-ene-1,7-dioic acid hydratase  37.31 
 
 
267 aa  158  9e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.455554  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0272  4-oxalocrotonate decarboxylase  38.98 
 
 
262 aa  157  1e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1510  4-oxalocrotonate decarboxylase  38.3 
 
 
260 aa  157  1e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2033  putative 2-oxo-hept-3-ene-1,7-dioate hydratase(HpaH)  38.28 
 
 
267 aa  157  1e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.25595  normal  0.0822961 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2055  4-oxalocrotonate decarboxylase  39.15 
 
 
259 aa  157  1e-37  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0304181  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3499  2-oxo-hepta-3-ene-1,7-dioic acid hydratase  34.09 
 
 
266 aa  157  2e-37  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00827858 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0224  2-oxopent-4-enoate hydratase  37.1 
 
 
264 aa  157  2e-37  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0261621  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5829  2-oxo-hepta-3-ene-1,7-dioic acid hydratase  38.28 
 
 
267 aa  157  2e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.193631  normal  0.310568 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2420  2-oxo-hepta-3-ene-1,7-dioic acid hydratase  36.84 
 
 
278 aa  156  3e-37  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3281  2-oxo-hepta-3-ene-1,7-dioic acid hydratase  37.35 
 
 
267 aa  156  4e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0269586  normal  0.185525 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4132  2-oxo-hepta-3-ene-1,7-dioic acid hydratase  36.82 
 
 
267 aa  156  4e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.138195  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4130  2-oxo-hepta-3-ene-1,7-dioic acid hydratase  37.35 
 
 
267 aa  156  4e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0570046  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4236  2-oxo-hepta-3-ene-1,7-dioic acid hydratase  37.35 
 
 
267 aa  156  4e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.119671  normal  0.0833029 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2118  4-oxalocrotonate decarboxylase  38.49 
 
 
271 aa  156  4e-37  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.609149  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4144  4-oxalocrotonate decarboxylase  39.15 
 
 
260 aa  155  4e-37  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.246439 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5040  2-oxo-hepta-3-ene-1,7-dioic acid hydratase  35.06 
 
 
260 aa  155  5.0000000000000005e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.444899  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3658  2-oxo-hepta-3-ene-1,7-dioic acid hydratase  36.43 
 
 
267 aa  155  6e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.504721 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3325  4-oxalocrotonate decarboxylase  37.25 
 
 
266 aa  155  7e-37  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3521  4-oxalocrotonate decarboxylase  39.76 
 
 
257 aa  155  7e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.285108 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5210  4-oxalocrotonate decarboxylase  38.26 
 
 
254 aa  155  9e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.39218  normal  0.210604 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1189  2-hydroxypenta-2,4-dienoate hydratase (BphH)  38.52 
 
 
264 aa  154  1e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.375643  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0101  2-oxo-hepta-3-ene-1,7-dioic acid hydratase  36.98 
 
 
277 aa  153  2e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1627  2-oxo-hepta-3-ene-1,7-dioic acid hydratase  37.25 
 
 
267 aa  154  2e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.72873 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2504  2-oxo-hepta-3-ene-1,7-dioic acid hydratase  34.15 
 
 
266 aa  154  2e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4209  4-oxalocrotonate decarboxylase  39.92 
 
 
264 aa  153  2e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3520  4-oxalocrotonate decarboxylase  40.97 
 
 
263 aa  153  2.9999999999999998e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0986627 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04226  2-oxo-hept-3-ene-1,7-dioate hydratase  35.18 
 
 
267 aa  152  4e-36  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4580  2-oxo-hepta-3-ene-1,7-dioic acid hydratase  35.18 
 
 
267 aa  152  4e-36  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5137  hydratase/decarboxylase  37.94 
 
 
259 aa  152  4e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.838757  normal  0.0331511 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04192  hypothetical protein  35.18 
 
 
273 aa  152  4e-36  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1200  2-oxo-hepta-3-ene-1,7-dioic acid hydratase  35.18 
 
 
267 aa  152  4e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.775184  normal  0.780949 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3706  2-oxo-hepta-3-ene-1,7-dioic acid hydratase  35.18 
 
 
267 aa  152  4e-36  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.29388 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>