251 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_3851 on replicon NC_009426
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009426  Saro_3851  hydratase/decarboxylase  100 
 
 		 256 aa  514  1.0000000000000001e-145  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0976371  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1480  4-oxalocrotonate decarboxylase  65.75 
 
 		 254 aa  328  8e-89  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01663  4-oxalocrotonate decarboxylase protein  62.55 
 
 		 263 aa  294  9e-79  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0913733  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1150  4-oxalocrotonate decarboxylase  60.66 
 
 		 254 aa  292  3e-78  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.454229  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0912  4-oxalocrotonate decarboxylase  58.27 
 
 		 259 aa  280  1e-74  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.704461  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1406  4-oxalocrotonate decarboxylase  51.34 
 
 		 261 aa  253  2.0000000000000002e-66  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2010  4-oxalocrotonate decarboxylase  55.78 
 
 		 256 aa  243  3e-63  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1469  4-oxalocrotonate decarboxylase  50.61 
 
 		 257 aa  241  9e-63  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7643  4-oxalocrotonate decarboxylase  50.79 
 
 		 257 aa  239  4e-62  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.905012 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3521  4-oxalocrotonate decarboxylase  51.6 
 
 		 257 aa  237  1e-61  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.285108 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5210  4-oxalocrotonate decarboxylase  51.79 
 
 		 254 aa  234  9e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.39218  normal  0.210604 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5137  hydratase/decarboxylase  47.83 
 
 		 259 aa  227  1e-58  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.838757  normal  0.0331511 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3524  4-oxalocrotonate decarboxylase  51.57 
 
 		 257 aa  220  9.999999999999999e-57  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5500  4-oxalocrotonate decarboxylase  50.43 
 
 		 266 aa  218  5e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3899  4-oxalocrotonate decarboxylase  52.76 
 
 		 257 aa  210  2e-53  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.553446 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9112  4-oxalocrotonate decarboxylase  45.49 
 
 		 255 aa  206  3e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0225  4-oxalocrotonate decarboxylase  40.39 
 
 		 262 aa  194  1e-48  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2158  4-oxalocrotonate decarboxylase  39.92 
 
 		 262 aa  188  8e-47  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1618  4-oxalocrotonate decarboxylase  41.8 
 
 		 259 aa  186  4e-46  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30600  4-oxalocrotonate decarboxylase; LapH  43.55 
 
 		 267 aa  185  6e-46  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.0000150281  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3090  4-oxalocrotonate decarboxylase  41.2 
 
 		 262 aa  184  8e-46  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3781  hydratase/decarboxylase  40.16 
 
 		 262 aa  184  1.0000000000000001e-45  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0303669  decreased coverage  0.000202677 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08680  4-oxalocrotonate decarboxylase.XylI  42.69 
 
 		 262 aa  184  1.0000000000000001e-45  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2773  hydratase/decarboxylase  40 
 
 		 262 aa  182  7e-45  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000493793  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2299  4-oxalocrotonate decarboxylase  44.89 
 
 		 261 aa  177  1e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2958  4-oxalocrotonate decarboxylase  41.34 
 
 		 262 aa  177  2e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.351017  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1318  hydratase/decarboxylase  38.58 
 
 		 262 aa  176  2e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.288999  normal  0.257061 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0225  4-oxalocrotonate decarboxylase  42.63 
 
 		 269 aa  176  3e-43  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  hitchhiker  0.00468493  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0794  4-oxalocrotonate decarboxylase  37.65 
 
 		 261 aa  173  2.9999999999999996e-42  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3342  4-oxalocrotonate decarboxylase  40.24 
 
 		 262 aa  172  5e-42  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1621  2-oxopent-4-enoate hydratase  36.61 
 
 		 264 aa  171  6.999999999999999e-42  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0537  4-oxalocrotonate decarboxylase  42.69 
 
 		 260 aa  165  8e-40  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2272  4-oxalocrotonate decarboxylase  40 
 
 		 268 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.866391  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2296  2-oxopent-4-enoate hydratase  36.86 
 
 		 259 aa  162  3e-39  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2784  4-oxalocrotonate decarboxylase  40 
 
 		 262 aa  161  9e-39  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.965988  normal  0.191345 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3785  hydratase/decarboxylase  38.05 
 
 		 260 aa  161  1e-38  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0026227  hitchhiker  0.00282888 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4208  4-oxalocrotonate decarboxylase  41.86 
 
 		 261 aa  161  1e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3091  2-oxopent-4-enoate hydratase  37.1 
 
 		 260 aa  160  1e-38  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.42559  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1777  4-oxalocrotonate decarboxylase  40.27 
 
 		 257 aa  161  1e-38  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0534  2-oxopent-4-enoate hydratase  42.37 
 
 		 267 aa  157  1e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2774  hydratase/decarboxylase  37.61 
 
 		 260 aa  157  1e-37  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.00000469641  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3324  4-oxalocrotonate decarboxylase  40 
 
 		 264 aa  157  1e-37  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4085  2-oxopent-4-enoate hydratase  38.71 
 
 		 267 aa  157  2e-37  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000524317 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0439  2-oxopent-4-enoate hydratase  40.79 
 
 		 263 aa  157  2e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0138498 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2077  2-oxopent-4-enoate hydratase  36.59 
 
 		 261 aa  154  1e-36  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.849096  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3543  4-oxalocrotonate decarboxylase  39.02 
 
 		 263 aa  154  1e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0271382  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4619  4-oxalocrotonate decarboxylase  39.02 
 
 		 263 aa  154  1e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.118774  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3472  2-oxopent-4-enoate hydratase  39.67 
 
 		 260 aa  154  2e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.102578  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5692  4-oxalocrotonate decarboxylase  39.02 
 
 		 263 aa  152  4e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1186  4-oxalocrotonate decarboxylase  34.78 
 
 		 264 aa  150  1e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0763202  normal  0.362959 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4832  2-oxopent-4-enoate hydratase  40.34 
 
 		 279 aa  147  1.0000000000000001e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0838304  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2785  4-oxalocrotonate decarboxylase  34.84 
 
 		 261 aa  147  2.0000000000000003e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.197083 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3343  2-oxopent-4-enoate hydratase  33.86 
 
 		 260 aa  146  3e-34  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3464  2-oxo-hepta-3-ene-1,7-dioic acid hydratase  37.55 
 
 		 266 aa  146  3e-34  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1321  hydratase/decarboxylase  32.16 
 
 		 262 aa  145  5e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0604012  normal  0.404919 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2460  4-oxalocrotonate decarboxylase  32.94 
 
 		 260 aa  145  5e-34  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.768834  normal  0.296337 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1189  2-hydroxypenta-2,4-dienoate hydratase (BphH)  35.8 
 
 		 264 aa  142  4e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.375643  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2273  4-oxalocrotonate decarboxylase  32.54 
 
 		 261 aa  142  4e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4620  2-oxopent-4-enoate hydratase  31.2 
 
 		 260 aa  142  6e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.275598  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30610  2-Hydroxypent-2,4-dienoate hydratase; LapE  33.6 
 
 		 265 aa  142  6e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.000960153  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3544  2-oxopent-4-enoate hydratase  31.2 
 
 		 260 aa  142  6e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.127016  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1392  4-oxalocrotonate decarboxylase  36.2 
 
 		 263 aa  141  9.999999999999999e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0975696 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5691  4-oxalocrotonate decarboxylase  34.23 
 
 		 260 aa  140  1.9999999999999998e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4144  4-oxalocrotonate decarboxylase  34.57 
 
 		 260 aa  140  1.9999999999999998e-32  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.246439 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3527  4-oxalocrotonate decarboxylase  37.67 
 
 		 265 aa  140  1.9999999999999998e-32  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2111  4-oxalocrotonate decarboxylase  34.14 
 
 		 280 aa  140  3e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0224  2-oxopent-4-enoate hydratase  36.9 
 
 		 264 aa  139  3.9999999999999997e-32  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0261621  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0909  2-oxopent-4-enoate hydratase  34.41 
 
 		 262 aa  139  4.999999999999999e-32  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2055  4-oxalocrotonate decarboxylase  35.22 
 
 		 259 aa  139  6e-32  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0304181  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3902  4-oxalocrotonate decarboxylase  38.12 
 
 		 265 aa  138  8.999999999999999e-32  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.561065 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5236  4-oxalocrotonate decarboxylase  37.55 
 
 		 261 aa  137  1e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.270652 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2011  4-oxalocrotonate decarboxylase  33.33 
 
 		 260 aa  136  4e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.781375  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1520  4-oxalocrotonate decarboxylase  37.05 
 
 		 261 aa  136  4e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2504  2-oxo-hepta-3-ene-1,7-dioic acid hydratase  34.07 
 
 		 266 aa  135  9e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2961  4-oxalocrotonate decarboxylase  34.98 
 
 		 260 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.665549  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0936  4-oxalocrotonate decarboxylase  33.2 
 
 		 268 aa  134  9.999999999999999e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.101712  normal  0.608159 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13569  hydratase  35.08 
 
 		 261 aa  134  9.999999999999999e-31  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000748615 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4661  4-oxalocrotonate decarboxylase  36.69 
 
 		 261 aa  134  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.930854  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4749  4-oxalocrotonate decarboxylase  36.69 
 
 		 261 aa  134  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0856703  normal  0.088822 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9115  2-oxopent-4-enoate hydratase  34.13 
 
 		 265 aa  133  3e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3502  2-oxo-hepta-3-ene-1,7-dioic acid hydratase  33.33 
 
 		 267 aa  133  3e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.328452  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2151  4-oxalocrotonate decarboxylase  36.7 
 
 		 271 aa  133  3e-30  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4569  4-oxalocrotonate decarboxylase  35.56 
 
 		 264 aa  132  3.9999999999999996e-30  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00147074 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1639  4-oxalocrotonate decarboxylase  34.51 
 
 		 259 aa  132  3.9999999999999996e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.193054 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4313  2-oxo-hepta-3-ene-1,7-dioic acid hydratase  33.73 
 
 		 268 aa  132  5e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3088  2-oxo-hepta-3-ene-1,7-dioic acid hydratase  33.46 
 
 		 266 aa  132  6.999999999999999e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.325663  normal  1 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3854  hydratase/decarboxylase  37 
 
 		 264 aa  131  7.999999999999999e-30  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.595722  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5044  4-oxalocrotonate decarboxylase  36.29 
 
 		 261 aa  131  9e-30  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3689  hydratase/decarboxylase  34.58 
 
 		 266 aa  131  9e-30  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3524  2-oxo-hepta-3-ene-1,7-dioic acid hydratase  34.26 
 
 		 261 aa  131  1.0000000000000001e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1477  4-oxalocrotonate decarboxylase  34.98 
 
 		 264 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2125  4-oxalocrotonate decarboxylase  35.51 
 
 		 264 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.740862  normal  0.868744 
 
 
-
 
NC_003296  RS01662  putative hydratase protein  35 
 
 		 265 aa  130  3e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.103932  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5220  4-oxalocrotonate decarboxylase  34.13 
 
 		 264 aa  129  3e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3499  2-oxo-hepta-3-ene-1,7-dioic acid hydratase  32.95 
 
 		 266 aa  129  4.0000000000000003e-29  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00827858 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0222  4-oxalocrotonate decarboxylase  35.43 
 
 		 262 aa  129  4.0000000000000003e-29  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20020  2-oxohept-3-enedioate hydratase  32.8 
 
 		 261 aa  129  5.0000000000000004e-29  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0595  4-oxalocrotonate decarboxylase  37.1 
 
 		 262 aa  129  5.0000000000000004e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3512  4-oxalocrotonate decarboxylase  33.46 
 
 		 269 aa  129  7.000000000000001e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0965  2-oxo-hept-3-ene-1,7-dioate hydratase  32.94 
 
 		 267 aa  128  7.000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>