254 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_2773 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007298  Daro_2773  hydratase/decarboxylase  100 
 
 
262 aa  533  1e-150  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000493793  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3090  4-oxalocrotonate decarboxylase  91.6 
 
 
262 aa  478  1e-134  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3781  hydratase/decarboxylase  87.74 
 
 
262 aa  472  1e-132  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0303669  decreased coverage  0.000202677 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1318  hydratase/decarboxylase  73.28 
 
 
262 aa  410  1e-114  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.288999  normal  0.257061 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0225  4-oxalocrotonate decarboxylase  74.33 
 
 
262 aa  405  1.0000000000000001e-112  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2958  4-oxalocrotonate decarboxylase  69.47 
 
 
262 aa  382  1e-105  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.351017  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3342  4-oxalocrotonate decarboxylase  69.47 
 
 
262 aa  374  1e-103  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2272  4-oxalocrotonate decarboxylase  72.14 
 
 
268 aa  377  1e-103  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.866391  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08680  4-oxalocrotonate decarboxylase.XylI  66.41 
 
 
262 aa  360  9e-99  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5692  4-oxalocrotonate decarboxylase  67.56 
 
 
263 aa  354  6.999999999999999e-97  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3543  4-oxalocrotonate decarboxylase  67.56 
 
 
263 aa  352  2.9999999999999997e-96  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0271382  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4619  4-oxalocrotonate decarboxylase  67.56 
 
 
263 aa  352  2.9999999999999997e-96  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.118774  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2784  4-oxalocrotonate decarboxylase  71.26 
 
 
262 aa  350  1e-95  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.965988  normal  0.191345 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30600  4-oxalocrotonate decarboxylase; LapH  54.79 
 
 
267 aa  290  1e-77  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.0000150281  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3324  4-oxalocrotonate decarboxylase  52.67 
 
 
264 aa  271  1e-71  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2299  4-oxalocrotonate decarboxylase  48.61 
 
 
261 aa  246  4e-64  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2158  4-oxalocrotonate decarboxylase  43.37 
 
 
262 aa  224  1e-57  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1777  4-oxalocrotonate decarboxylase  48.51 
 
 
257 aa  214  8e-55  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3091  2-oxopent-4-enoate hydratase  42.31 
 
 
260 aa  210  2e-53  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.42559  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2774  hydratase/decarboxylase  43.46 
 
 
260 aa  208  6e-53  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.00000469641  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3785  hydratase/decarboxylase  43.08 
 
 
260 aa  205  6e-52  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0026227  hitchhiker  0.00282888 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1621  2-oxopent-4-enoate hydratase  45.24 
 
 
264 aa  200  1.9999999999999998e-50  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0537  4-oxalocrotonate decarboxylase  45.45 
 
 
260 aa  200  1.9999999999999998e-50  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4085  2-oxopent-4-enoate hydratase  42.86 
 
 
267 aa  198  6e-50  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000524317 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0225  4-oxalocrotonate decarboxylase  44.4 
 
 
269 aa  197  1.0000000000000001e-49  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  hitchhiker  0.00468493  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1321  hydratase/decarboxylase  42.53 
 
 
262 aa  197  1.0000000000000001e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0604012  normal  0.404919 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0794  4-oxalocrotonate decarboxylase  41.63 
 
 
261 aa  196  4.0000000000000005e-49  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4144  4-oxalocrotonate decarboxylase  45.95 
 
 
260 aa  194  8.000000000000001e-49  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.246439 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4208  4-oxalocrotonate decarboxylase  43.53 
 
 
261 aa  194  1e-48  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0222  4-oxalocrotonate decarboxylase  46.95 
 
 
262 aa  194  1e-48  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1189  2-hydroxypenta-2,4-dienoate hydratase (BphH)  45.17 
 
 
264 aa  193  3e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.375643  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0912  4-oxalocrotonate decarboxylase  43.67 
 
 
259 aa  191  7e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.704461  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1618  4-oxalocrotonate decarboxylase  41.43 
 
 
259 aa  190  2e-47  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2077  2-oxopent-4-enoate hydratase  41.15 
 
 
261 aa  190  2.9999999999999997e-47  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.849096  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1150  4-oxalocrotonate decarboxylase  41.43 
 
 
254 aa  187  1e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.454229  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2273  4-oxalocrotonate decarboxylase  40.77 
 
 
261 aa  187  2e-46  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS01662  putative hydratase protein  41.88 
 
 
265 aa  186  3e-46  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.103932  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3343  2-oxopent-4-enoate hydratase  39.62 
 
 
260 aa  184  1.0000000000000001e-45  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2460  4-oxalocrotonate decarboxylase  38.85 
 
 
260 aa  184  2.0000000000000003e-45  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.768834  normal  0.296337 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0534  2-oxopent-4-enoate hydratase  43.08 
 
 
267 aa  182  4.0000000000000006e-45  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0909  2-oxopent-4-enoate hydratase  39.46 
 
 
262 aa  182  4.0000000000000006e-45  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2785  4-oxalocrotonate decarboxylase  38.85 
 
 
261 aa  181  1e-44  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.197083 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2296  2-oxopent-4-enoate hydratase  39.2 
 
 
259 aa  180  2.9999999999999997e-44  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2961  4-oxalocrotonate decarboxylase  42.47 
 
 
260 aa  179  4.999999999999999e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.665549  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5691  4-oxalocrotonate decarboxylase  42.13 
 
 
260 aa  178  9e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4313  2-oxo-hepta-3-ene-1,7-dioic acid hydratase  38.52 
 
 
268 aa  177  1e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1186  4-oxalocrotonate decarboxylase  39.16 
 
 
264 aa  177  1e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0763202  normal  0.362959 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1480  4-oxalocrotonate decarboxylase  40.64 
 
 
254 aa  176  2e-43  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1469  4-oxalocrotonate decarboxylase  40.55 
 
 
257 aa  177  2e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3851  hydratase/decarboxylase  40 
 
 
256 aa  176  3e-43  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0976371  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3544  2-oxopent-4-enoate hydratase  41.7 
 
 
260 aa  176  5e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.127016  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4620  2-oxopent-4-enoate hydratase  41.7 
 
 
260 aa  176  5e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.275598  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3689  hydratase/decarboxylase  41.13 
 
 
266 aa  174  1.9999999999999998e-42  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01663  4-oxalocrotonate decarboxylase protein  40.47 
 
 
263 aa  174  1.9999999999999998e-42  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0913733  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13569  hydratase  39 
 
 
261 aa  173  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000748615 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3521  4-oxalocrotonate decarboxylase  42.11 
 
 
257 aa  171  1e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.285108 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10590  2-oxo-hept-3-ene-1,7-dioate hydratase  37.22 
 
 
267 aa  171  1e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5044  4-oxalocrotonate decarboxylase  40.15 
 
 
261 aa  170  2e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0965  2-oxo-hept-3-ene-1,7-dioate hydratase  37.22 
 
 
267 aa  170  2e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4661  4-oxalocrotonate decarboxylase  39.77 
 
 
261 aa  171  2e-41  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.930854  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4749  4-oxalocrotonate decarboxylase  39.77 
 
 
261 aa  171  2e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0856703  normal  0.088822 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1477  4-oxalocrotonate decarboxylase  40.23 
 
 
264 aa  171  2e-41  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7643  4-oxalocrotonate decarboxylase  39.76 
 
 
257 aa  169  4e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.905012 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1149  2-oxopent-4-enoate hydratase  39.38 
 
 
269 aa  169  5e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.363401  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3527  4-oxalocrotonate decarboxylase  41.92 
 
 
265 aa  168  7e-41  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3178  2-oxo-hepta-3-ene-1,7-dioic acid hydratase  38.49 
 
 
267 aa  168  8e-41  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.128545  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2011  4-oxalocrotonate decarboxylase  40.81 
 
 
260 aa  168  9e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.781375  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1787  2-oxo-hepta-3-ene-1,7-dioic acid hydratase  36.6 
 
 
267 aa  168  1e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.995557  normal  0.779131 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3325  4-oxalocrotonate decarboxylase  38.22 
 
 
266 aa  167  1e-40  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4271  2-oxo-hepta-3-ene-1,7-dioic acid hydratase  37.45 
 
 
268 aa  167  2e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.623769  normal  0.550033 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3520  4-oxalocrotonate decarboxylase  37.4 
 
 
263 aa  166  2e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0986627 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42150  2-hydroxypent-2,4-dienoate hydratase  41.77 
 
 
261 aa  167  2e-40  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.293913  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9115  2-oxopent-4-enoate hydratase  38.58 
 
 
265 aa  166  2.9999999999999998e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2111  4-oxalocrotonate decarboxylase  41.59 
 
 
280 aa  166  2.9999999999999998e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1778  4-oxalocrotonate decarboxylase  37.36 
 
 
267 aa  166  4e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.110144 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2155  2-hydroxypenta-2,4-dienoate hydratase, putative  42.35 
 
 
255 aa  165  5.9999999999999996e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5829  2-oxo-hepta-3-ene-1,7-dioic acid hydratase  37.22 
 
 
267 aa  165  6.9999999999999995e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.193631  normal  0.310568 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30610  2-Hydroxypent-2,4-dienoate hydratase; LapE  37.84 
 
 
265 aa  164  1.0000000000000001e-39  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.000960153  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7646  4-oxalocrotonate decarboxylase  41.52 
 
 
274 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.573554 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1982  2-keto-4-pentenoate hydratase  37.16 
 
 
264 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.572392 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5500  4-oxalocrotonate decarboxylase  40 
 
 
266 aa  164  2.0000000000000002e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3472  2-oxopent-4-enoate hydratase  38.22 
 
 
260 aa  164  2.0000000000000002e-39  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.102578  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1392  4-oxalocrotonate decarboxylase  38.28 
 
 
263 aa  163  2.0000000000000002e-39  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0975696 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3524  2-oxo-hepta-3-ene-1,7-dioic acid hydratase  36.68 
 
 
261 aa  163  2.0000000000000002e-39  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3854  hydratase/decarboxylase  38.7 
 
 
264 aa  164  2.0000000000000002e-39  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.595722  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1708  2-oxo-hepta-3-ene-1,7-dioic acid hydratase  36.7 
 
 
268 aa  163  3e-39  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.899066  normal  0.363906 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3524  4-oxalocrotonate decarboxylase  43.04 
 
 
257 aa  163  3e-39  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3902  4-oxalocrotonate decarboxylase  41.48 
 
 
265 aa  163  3e-39  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.561065 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1459  4-oxalocrotonate decarboxylase  40.89 
 
 
260 aa  162  4.0000000000000004e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.512129  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4445  2-oxo-hepta-3-ene-1,7-dioic acid hydratase  35.47 
 
 
267 aa  162  4.0000000000000004e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.549639  normal  0.132657 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04226  2-oxo-hept-3-ene-1,7-dioate hydratase  33.83 
 
 
267 aa  162  5.0000000000000005e-39  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4580  2-oxo-hepta-3-ene-1,7-dioic acid hydratase  33.83 
 
 
267 aa  162  5.0000000000000005e-39  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3706  2-oxo-hepta-3-ene-1,7-dioic acid hydratase  33.83 
 
 
267 aa  162  5.0000000000000005e-39  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.29388 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04192  hypothetical protein  33.83 
 
 
273 aa  162  6e-39  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3658  2-oxo-hepta-3-ene-1,7-dioic acid hydratase  36.92 
 
 
267 aa  162  7e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.504721 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5210  4-oxalocrotonate decarboxylase  41.07 
 
 
254 aa  161  9e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.39218  normal  0.210604 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3612  2-oxo-hepta-3-ene-1,7-dioic acid hydratase  35.52 
 
 
261 aa  161  1e-38  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4132  2-oxo-hepta-3-ene-1,7-dioic acid hydratase  36.6 
 
 
267 aa  161  1e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.138195  normal 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5137  hydratase/decarboxylase  39.29 
 
 
259 aa  160  1e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.838757  normal  0.0331511 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2010  4-oxalocrotonate decarboxylase  40.32 
 
 
256 aa  161  1e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>