235 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_B5500 on replicon NC_007348
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007348  Reut_B5500  4-oxalocrotonate decarboxylase  100 
 
 		 266 aa  543  1e-153  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1469  4-oxalocrotonate decarboxylase  70.04 
 
 		 257 aa  341  5.999999999999999e-93  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7643  4-oxalocrotonate decarboxylase  68.58 
 
 		 257 aa  321  9.000000000000001e-87  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.905012 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5210  4-oxalocrotonate decarboxylase  71.24 
 
 		 254 aa  300  1e-80  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.39218  normal  0.210604 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5137  hydratase/decarboxylase  61.11 
 
 		 259 aa  275  8e-73  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.838757  normal  0.0331511 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1480  4-oxalocrotonate decarboxylase  49.8 
 
 		 254 aa  240  1e-62  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01663  4-oxalocrotonate decarboxylase protein  51.34 
 
 		 263 aa  238  9e-62  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0913733  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1150  4-oxalocrotonate decarboxylase  50.61 
 
 		 254 aa  236  3e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.454229  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0912  4-oxalocrotonate decarboxylase  52.65 
 
 		 259 aa  233  2.0000000000000002e-60  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.704461  normal  1 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3851  hydratase/decarboxylase  48.8 
 
 		 256 aa  223  2e-57  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0976371  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3521  4-oxalocrotonate decarboxylase  48.85 
 
 		 257 aa  214  9.999999999999999e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.285108 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2010  4-oxalocrotonate decarboxylase  53.41 
 
 		 256 aa  213  3.9999999999999995e-54  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1406  4-oxalocrotonate decarboxylase  48.37 
 
 		 261 aa  209  4e-53  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9112  4-oxalocrotonate decarboxylase  47.15 
 
 		 255 aa  208  6e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3524  4-oxalocrotonate decarboxylase  50.44 
 
 		 257 aa  193  2e-48  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3090  4-oxalocrotonate decarboxylase  41.92 
 
 		 262 aa  183  2.0000000000000003e-45  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3781  hydratase/decarboxylase  41.15 
 
 		 262 aa  183  3e-45  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0303669  decreased coverage  0.000202677 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3899  4-oxalocrotonate decarboxylase  49.59 
 
 		 257 aa  182  3e-45  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.553446 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2773  hydratase/decarboxylase  40.38 
 
 		 262 aa  180  2e-44  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000493793  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08680  4-oxalocrotonate decarboxylase.XylI  42.13 
 
 		 262 aa  172  5e-42  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0225  4-oxalocrotonate decarboxylase  40 
 
 		 262 aa  168  8e-41  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1318  hydratase/decarboxylase  41.08 
 
 		 262 aa  160  2e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.288999  normal  0.257061 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2272  4-oxalocrotonate decarboxylase  40.46 
 
 		 268 aa  160  2e-38  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.866391  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3342  4-oxalocrotonate decarboxylase  38.4 
 
 		 262 aa  159  3e-38  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2958  4-oxalocrotonate decarboxylase  39.92 
 
 		 262 aa  156  3e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.351017  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2784  4-oxalocrotonate decarboxylase  38.46 
 
 		 262 aa  153  2.9999999999999998e-36  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.965988  normal  0.191345 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5692  4-oxalocrotonate decarboxylase  38.35 
 
 		 263 aa  152  5.9999999999999996e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3324  4-oxalocrotonate decarboxylase  41.7 
 
 		 264 aa  151  1e-35  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2055  4-oxalocrotonate decarboxylase  42.98 
 
 		 259 aa  149  6e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0304181  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0537  4-oxalocrotonate decarboxylase  43.67 
 
 		 260 aa  147  1.0000000000000001e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2299  4-oxalocrotonate decarboxylase  36.33 
 
 		 261 aa  148  1.0000000000000001e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3543  4-oxalocrotonate decarboxylase  37.55 
 
 		 263 aa  147  2.0000000000000003e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0271382  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4619  4-oxalocrotonate decarboxylase  37.55 
 
 		 263 aa  147  2.0000000000000003e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.118774  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2158  4-oxalocrotonate decarboxylase  36.29 
 
 		 262 aa  145  7.0000000000000006e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30600  4-oxalocrotonate decarboxylase; LapH  37.64 
 
 		 267 aa  144  1e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.0000150281  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0794  4-oxalocrotonate decarboxylase  40.48 
 
 		 261 aa  144  2e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1618  4-oxalocrotonate decarboxylase  39.51 
 
 		 259 aa  137  1e-31  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0225  4-oxalocrotonate decarboxylase  40 
 
 		 269 aa  137  1e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  hitchhiker  0.00468493  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4208  4-oxalocrotonate decarboxylase  40.97 
 
 		 261 aa  137  1e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1621  2-oxopent-4-enoate hydratase  33.96 
 
 		 264 aa  134  1.9999999999999998e-30  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0534  2-oxopent-4-enoate hydratase  37.84 
 
 		 267 aa  132  7.999999999999999e-30  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2125  4-oxalocrotonate decarboxylase  35.74 
 
 		 264 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.740862  normal  0.868744 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2111  4-oxalocrotonate decarboxylase  37.12 
 
 		 280 aa  126  5e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1777  4-oxalocrotonate decarboxylase  35.11 
 
 		 257 aa  123  3e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3472  2-oxopent-4-enoate hydratase  35.66 
 
 		 260 aa  123  3e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.102578  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4569  4-oxalocrotonate decarboxylase  35.96 
 
 		 264 aa  121  9.999999999999999e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00147074 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0224  2-oxopent-4-enoate hydratase  36.1 
 
 		 264 aa  121  9.999999999999999e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0261621  n/a   
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3854  hydratase/decarboxylase  34.98 
 
 		 264 aa  121  9.999999999999999e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.595722  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3091  2-oxopent-4-enoate hydratase  31.35 
 
 		 260 aa  120  1.9999999999999998e-26  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.42559  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2296  2-oxopent-4-enoate hydratase  36.06 
 
 		 259 aa  120  1.9999999999999998e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0381  2-keto-4-pentenoate hydratase  34.63 
 
 		 269 aa  119  3.9999999999999996e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.795138  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4832  2-oxopent-4-enoate hydratase  35.22 
 
 		 279 aa  119  3.9999999999999996e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0838304  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1321  hydratase/decarboxylase  33.33 
 
 		 262 aa  118  9.999999999999999e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0604012  normal  0.404919 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0595  4-oxalocrotonate decarboxylase  35.5 
 
 		 262 aa  117  9.999999999999999e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3520  4-oxalocrotonate decarboxylase  34.33 
 
 		 263 aa  117  1.9999999999999998e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0986627 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3275  2-keto-4-pentenoate hydratase  34.2 
 
 		 269 aa  117  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.235013  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3256  4-oxalocrotonate decarboxylase  33.77 
 
 		 269 aa  115  5e-25  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2774  hydratase/decarboxylase  31.25 
 
 		 260 aa  115  6e-25  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.00000469641  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3785  hydratase/decarboxylase  31.53 
 
 		 260 aa  115  6e-25  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0026227  hitchhiker  0.00282888 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4085  2-oxopent-4-enoate hydratase  37.21 
 
 		 267 aa  115  6e-25  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000524317 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0414  2-keto-4-pentenoate hydratase  33.77 
 
 		 269 aa  115  6.9999999999999995e-25  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0374  2-keto-4-pentenoate hydratase  33.77 
 
 		 269 aa  115  6.9999999999999995e-25  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.832182  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15110  2-keto-4-pentenoate hydratase  33.2 
 
 		 264 aa  114  1.0000000000000001e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.473426  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3512  4-oxalocrotonate decarboxylase  35.42 
 
 		 269 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1149  2-oxopent-4-enoate hydratase  35.29 
 
 		 269 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.363401  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3343  2-oxopent-4-enoate hydratase  33.33 
 
 		 260 aa  115  1.0000000000000001e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00304  2-keto-4-pentenoate hydratase  33.33 
 
 		 269 aa  114  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.503312  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00308  hypothetical protein  33.33 
 
 		 269 aa  114  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.527408  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2077  2-oxopent-4-enoate hydratase  32.41 
 
 		 261 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.849096  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0425  2-keto-4-pentenoate hydratase  34.43 
 
 		 269 aa  113  3e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00080  conserved hypothetical protein  30.57 
 
 		 387 aa  113  4.0000000000000004e-24  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0936  4-oxalocrotonate decarboxylase  34.06 
 
 		 268 aa  112  5e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.101712  normal  0.608159 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2273  4-oxalocrotonate decarboxylase  33.05 
 
 		 261 aa  112  7.000000000000001e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5691  4-oxalocrotonate decarboxylase  34.42 
 
 		 260 aa  112  8.000000000000001e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1392  4-oxalocrotonate decarboxylase  33.07 
 
 		 263 aa  112  9e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0975696 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2785  4-oxalocrotonate decarboxylase  31.88 
 
 		 261 aa  111  1.0000000000000001e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.197083 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1510  4-oxalocrotonate decarboxylase  33.74 
 
 		 260 aa  110  2.0000000000000002e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2779  hydratase/decarboxylase  37.66 
 
 		 273 aa  110  2.0000000000000002e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.963348  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4144  4-oxalocrotonate decarboxylase  33.95 
 
 		 260 aa  110  2.0000000000000002e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.246439 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1466  4-oxalocrotonate decarboxylase  35.04 
 
 		 273 aa  110  3e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13569  hydratase  34.48 
 
 		 261 aa  109  4.0000000000000004e-23  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000748615 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1186  4-oxalocrotonate decarboxylase  37.02 
 
 		 264 aa  109  4.0000000000000004e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0763202  normal  0.362959 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3544  2-oxopent-4-enoate hydratase  32.17 
 
 		 260 aa  109  4.0000000000000004e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.127016  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4620  2-oxopent-4-enoate hydratase  32.17 
 
 		 260 aa  109  4.0000000000000004e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.275598  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01662  putative hydratase protein  34.67 
 
 		 265 aa  109  5e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.103932  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3798  2-oxopent-4-enoate hydratase  33.18 
 
 		 261 aa  109  5e-23  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.138107  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3689  hydratase/decarboxylase  36.41 
 
 		 266 aa  109  5e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4745  4-oxalocrotonate decarboxylase  34.77 
 
 		 270 aa  108  6e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2151  4-oxalocrotonate decarboxylase  32.57 
 
 		 271 aa  109  6e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42150  2-hydroxypent-2,4-dienoate hydratase  35.11 
 
 		 261 aa  108  8.000000000000001e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.293913  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4209  4-oxalocrotonate decarboxylase  36.76 
 
 		 264 aa  108  8.000000000000001e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2155  2-hydroxypenta-2,4-dienoate hydratase, putative  33.33 
 
 		 255 aa  108  1e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2578  4-oxalocrotonate decarboxylase  37.07 
 
 		 276 aa  108  1e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1189  2-hydroxypenta-2,4-dienoate hydratase (BphH)  34.42 
 
 		 264 aa  108  1e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.375643  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9115  2-oxopent-4-enoate hydratase  33.07 
 
 		 265 aa  108  1e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0439  2-oxopent-4-enoate hydratase  32.14 
 
 		 263 aa  107  2e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0138498 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5207  2-keto-4-pentenoate hydratase  33.91 
 
 		 273 aa  107  2e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.133138  normal  0.334182 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2460  4-oxalocrotonate decarboxylase  32.5 
 
 		 260 aa  107  2e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.768834  normal  0.296337 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0909  2-oxopent-4-enoate hydratase  32.61 
 
 		 262 aa  107  2e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3527  4-oxalocrotonate decarboxylase  33.76 
 
 		 265 aa  107  2e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>