273 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_2055 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_2055  4-oxalocrotonate decarboxylase  100 
 
 		 259 aa  505  9.999999999999999e-143  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0304181  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0225  4-oxalocrotonate decarboxylase  43.36 
 
 		 269 aa  170  2e-41  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  hitchhiker  0.00468493  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0537  4-oxalocrotonate decarboxylase  46.22 
 
 		 260 aa  169  3e-41  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1469  4-oxalocrotonate decarboxylase  44.34 
 
 		 257 aa  165  5e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3781  hydratase/decarboxylase  38 
 
 		 262 aa  161  9e-39  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0303669  decreased coverage  0.000202677 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0794  4-oxalocrotonate decarboxylase  39.15 
 
 		 261 aa  157  1e-37  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0225  4-oxalocrotonate decarboxylase  38 
 
 		 262 aa  157  2e-37  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1318  hydratase/decarboxylase  39.06 
 
 		 262 aa  154  1e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.288999  normal  0.257061 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1621  2-oxopent-4-enoate hydratase  39.76 
 
 		 264 aa  152  4e-36  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3090  4-oxalocrotonate decarboxylase  38.15 
 
 		 262 aa  152  5e-36  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2299  4-oxalocrotonate decarboxylase  34.38 
 
 		 261 aa  149  5e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2158  4-oxalocrotonate decarboxylase  33.73 
 
 		 262 aa  147  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4208  4-oxalocrotonate decarboxylase  41.73 
 
 		 261 aa  148  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7643  4-oxalocrotonate decarboxylase  43.17 
 
 		 257 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.905012 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30600  4-oxalocrotonate decarboxylase; LapH  37.65 
 
 		 267 aa  145  5e-34  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.0000150281  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2958  4-oxalocrotonate decarboxylase  40.98 
 
 		 262 aa  145  5e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.351017  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1480  4-oxalocrotonate decarboxylase  39.27 
 
 		 254 aa  145  7.0000000000000006e-34  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08680  4-oxalocrotonate decarboxylase.XylI  36.44 
 
 		 262 aa  143  3e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4085  2-oxopent-4-enoate hydratase  36.4 
 
 		 267 aa  142  5e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000524317 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2773  hydratase/decarboxylase  35.74 
 
 		 262 aa  140  1.9999999999999998e-32  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000493793  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5500  4-oxalocrotonate decarboxylase  43.84 
 
 		 266 aa  138  8.999999999999999e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5210  4-oxalocrotonate decarboxylase  42.24 
 
 		 254 aa  138  8.999999999999999e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.39218  normal  0.210604 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2125  4-oxalocrotonate decarboxylase  38.37 
 
 		 264 aa  137  1e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.740862  normal  0.868744 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3342  4-oxalocrotonate decarboxylase  34.01 
 
 		 262 aa  137  2e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5137  hydratase/decarboxylase  38.8 
 
 		 259 aa  136  3.0000000000000003e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.838757  normal  0.0331511 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2077  2-oxopent-4-enoate hydratase  34.78 
 
 		 261 aa  135  7.000000000000001e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.849096  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0272  4-oxalocrotonate decarboxylase  38.8 
 
 		 262 aa  135  8e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4537  4-oxalocrotonate decarboxylase  36.95 
 
 		 262 aa  135  9e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3521  4-oxalocrotonate decarboxylase  41.27 
 
 		 257 aa  132  5e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.285108 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3324  4-oxalocrotonate decarboxylase  37.6 
 
 		 264 aa  132  5e-30  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0905  hydratase/decarboxylase  36.51 
 
 		 263 aa  132  6e-30  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0436706  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1639  4-oxalocrotonate decarboxylase  38.49 
 
 		 259 aa  132  6e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.193054 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5691  4-oxalocrotonate decarboxylase  34.38 
 
 		 260 aa  132  6e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1321  hydratase/decarboxylase  34.36 
 
 		 262 aa  132  6e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0604012  normal  0.404919 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3851  hydratase/decarboxylase  38.07 
 
 		 256 aa  132  6.999999999999999e-30  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0976371  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3902  4-oxalocrotonate decarboxylase  41.43 
 
 		 265 aa  132  7.999999999999999e-30  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.561065 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1392  4-oxalocrotonate decarboxylase  34.15 
 
 		 263 aa  130  2.0000000000000002e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0975696 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5436  4-oxalocrotonate decarboxylase  37.7 
 
 		 274 aa  130  3e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  normal  0.635895 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5833  4-oxalocrotonate decarboxylase  37.7 
 
 		 274 aa  130  3e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0222  4-oxalocrotonate decarboxylase  36.14 
 
 		 262 aa  129  6e-29  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1520  4-oxalocrotonate decarboxylase  35.71 
 
 		 261 aa  129  7.000000000000001e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1149  2-oxopent-4-enoate hydratase  34.5 
 
 		 269 aa  128  8.000000000000001e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.363401  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1354  hydratase/decarboxylase  36.51 
 
 		 262 aa  127  1.0000000000000001e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000612409  decreased coverage  0.00000118865 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2111  4-oxalocrotonate decarboxylase  40.08 
 
 		 280 aa  128  1.0000000000000001e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2460  4-oxalocrotonate decarboxylase  35.41 
 
 		 260 aa  128  1.0000000000000001e-28  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.768834  normal  0.296337 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3091  2-oxopent-4-enoate hydratase  34.14 
 
 		 260 aa  128  1.0000000000000001e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.42559  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0595  4-oxalocrotonate decarboxylase  37.18 
 
 		 262 aa  127  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1477  4-oxalocrotonate decarboxylase  37.3 
 
 		 264 aa  126  3e-28  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13569  hydratase  35.74 
 
 		 261 aa  126  3e-28  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000748615 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2774  hydratase/decarboxylase  33.47 
 
 		 260 aa  126  3e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.00000469641  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0912  4-oxalocrotonate decarboxylase  38.94 
 
 		 259 aa  126  3e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.704461  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01663  4-oxalocrotonate decarboxylase protein  37.73 
 
 		 263 aa  126  4.0000000000000003e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0913733  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2272  4-oxalocrotonate decarboxylase  34.8 
 
 		 268 aa  126  4.0000000000000003e-28  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.866391  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4620  2-oxopent-4-enoate hydratase  33.2 
 
 		 260 aa  126  4.0000000000000003e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.275598  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3544  2-oxopent-4-enoate hydratase  33.2 
 
 		 260 aa  126  4.0000000000000003e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.127016  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4661  4-oxalocrotonate decarboxylase  34.66 
 
 		 261 aa  125  5e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.930854  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4749  4-oxalocrotonate decarboxylase  34.66 
 
 		 261 aa  125  5e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0856703  normal  0.088822 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5692  4-oxalocrotonate decarboxylase  33.6 
 
 		 263 aa  125  7e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3343  2-oxopent-4-enoate hydratase  32.81 
 
 		 260 aa  125  7e-28  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4569  4-oxalocrotonate decarboxylase  37.05 
 
 		 264 aa  125  8.000000000000001e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00147074 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9112  4-oxalocrotonate decarboxylase  38.64 
 
 		 255 aa  125  9e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1618  4-oxalocrotonate decarboxylase  35.08 
 
 		 259 aa  124  1e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3785  hydratase/decarboxylase  32.94 
 
 		 260 aa  124  1e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0026227  hitchhiker  0.00282888 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5044  4-oxalocrotonate decarboxylase  34.26 
 
 		 261 aa  124  1e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2118  4-oxalocrotonate decarboxylase  31.23 
 
 		 271 aa  124  1e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.609149  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5236  4-oxalocrotonate decarboxylase  35.06 
 
 		 261 aa  125  1e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.270652 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1777  4-oxalocrotonate decarboxylase  34.31 
 
 		 257 aa  124  2e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2327  putative 2-hydroxypenta-2,4-dienoate hydratase(MhpD)  35.69 
 
 		 268 aa  124  2e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0911  4-oxalocrotonate decarboxylase  37.85 
 
 		 277 aa  123  2e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.625128 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3689  hydratase/decarboxylase  34.01 
 
 		 266 aa  124  2e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2785  4-oxalocrotonate decarboxylase  33.2 
 
 		 261 aa  123  3e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.197083 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0224  2-oxopent-4-enoate hydratase  36.58 
 
 		 264 aa  123  3e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0261621  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3520  4-oxalocrotonate decarboxylase  36.8 
 
 		 263 aa  122  5e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0986627 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1150  4-oxalocrotonate decarboxylase  33.33 
 
 		 254 aa  122  5e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.454229  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3472  2-oxopent-4-enoate hydratase  33.46 
 
 		 260 aa  122  6e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.102578  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1189  2-hydroxypenta-2,4-dienoate hydratase (BphH)  33.33 
 
 		 264 aa  122  8e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.375643  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2875  4-oxalocrotonate decarboxylase  37.15 
 
 		 268 aa  121  9e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0367853 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2273  4-oxalocrotonate decarboxylase  34.14 
 
 		 261 aa  121  9.999999999999999e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1186  4-oxalocrotonate decarboxylase  35.94 
 
 		 264 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0763202  normal  0.362959 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1406  4-oxalocrotonate decarboxylase  34.98 
 
 		 261 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4144  4-oxalocrotonate decarboxylase  32.13 
 
 		 260 aa  120  1.9999999999999998e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.246439 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3524  4-oxalocrotonate decarboxylase  40.53 
 
 		 257 aa  120  3e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3899  4-oxalocrotonate decarboxylase  43.17 
 
 		 257 aa  120  3e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.553446 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1651  4-oxalocrotonate decarboxylase  38.4 
 
 		 275 aa  120  3e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.452701  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2296  2-oxopent-4-enoate hydratase  34.5 
 
 		 259 aa  119  6e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1510  4-oxalocrotonate decarboxylase  34.13 
 
 		 260 aa  118  9.999999999999999e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1466  4-oxalocrotonate decarboxylase  37.95 
 
 		 273 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3527  4-oxalocrotonate decarboxylase  38.49 
 
 		 265 aa  117  1.9999999999999998e-25  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3543  4-oxalocrotonate decarboxylase  31.58 
 
 		 263 aa  117  1.9999999999999998e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0271382  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4619  4-oxalocrotonate decarboxylase  31.58 
 
 		 263 aa  117  1.9999999999999998e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.118774  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2779  hydratase/decarboxylase  36.19 
 
 		 273 aa  117  1.9999999999999998e-25  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.963348  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4393  hydratase/decarboxylase  34.25 
 
 		 283 aa  117  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2784  4-oxalocrotonate decarboxylase  33.2 
 
 		 262 aa  117  1.9999999999999998e-25  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.965988  normal  0.191345 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30610  2-Hydroxypent-2,4-dienoate hydratase; LapE  34.66 
 
 		 265 aa  116  3.9999999999999997e-25  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.000960153  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4209  4-oxalocrotonate decarboxylase  35.97 
 
 		 264 aa  115  6.9999999999999995e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0534  2-oxopent-4-enoate hydratase  35.98 
 
 		 267 aa  115  6.9999999999999995e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4925  4-oxalocrotonate decarboxylase  36.82 
 
 		 260 aa  114  1.0000000000000001e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.624784  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2578  4-oxalocrotonate decarboxylase  36.86 
 
 		 276 aa  114  1.0000000000000001e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5207  2-keto-4-pentenoate hydratase  38.91 
 
 		 273 aa  114  1.0000000000000001e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.133138  normal  0.334182 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5499  4-oxalocrotonate decarboxylase  36.2 
 
 		 274 aa  114  2.0000000000000002e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>