281 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_4144 on replicon NC_008757
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008757  Pnap_4144  4-oxalocrotonate decarboxylase  100 
 
 		 260 aa  532  1e-150  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.246439 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1189  2-hydroxypenta-2,4-dienoate hydratase (BphH)  93.08 
 
 		 264 aa  480  1e-135  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.375643  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1321  hydratase/decarboxylase  82.69 
 
 		 262 aa  447  1e-125  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0604012  normal  0.404919 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2077  2-oxopent-4-enoate hydratase  71.04 
 
 		 261 aa  384  1e-106  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.849096  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2774  hydratase/decarboxylase  69.88 
 
 		 260 aa  382  1e-105  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.00000469641  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3785  hydratase/decarboxylase  71.04 
 
 		 260 aa  381  1e-105  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0026227  hitchhiker  0.00282888 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2961  4-oxalocrotonate decarboxylase  73.36 
 
 		 260 aa  375  1e-103  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.665549  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3091  2-oxopent-4-enoate hydratase  68.73 
 
 		 260 aa  377  1e-103  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.42559  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0222  4-oxalocrotonate decarboxylase  73.36 
 
 		 262 aa  373  1e-102  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2273  4-oxalocrotonate decarboxylase  66.02 
 
 		 261 aa  354  6.999999999999999e-97  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4620  2-oxopent-4-enoate hydratase  66.14 
 
 		 260 aa  352  4e-96  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.275598  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3544  2-oxopent-4-enoate hydratase  66.14 
 
 		 260 aa  352  4e-96  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.127016  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2460  4-oxalocrotonate decarboxylase  63.71 
 
 		 260 aa  351  8e-96  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.768834  normal  0.296337 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2785  4-oxalocrotonate decarboxylase  64.48 
 
 		 261 aa  350  2e-95  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.197083 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3343  2-oxopent-4-enoate hydratase  64.96 
 
 		 260 aa  346  2e-94  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5691  4-oxalocrotonate decarboxylase  65.6 
 
 		 260 aa  344  7e-94  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3325  4-oxalocrotonate decarboxylase  61.54 
 
 		 266 aa  338  4e-92  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30610  2-Hydroxypent-2,4-dienoate hydratase; LapE  61.78 
 
 		 265 aa  335  2.9999999999999997e-91  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.000960153  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1510  4-oxalocrotonate decarboxylase  59.07 
 
 		 260 aa  313  1.9999999999999998e-84  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1392  4-oxalocrotonate decarboxylase  56.92 
 
 		 263 aa  311  6.999999999999999e-84  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0975696 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1459  4-oxalocrotonate decarboxylase  58.3 
 
 		 260 aa  310  1e-83  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.512129  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08670  4-oxo-4-pentenoate hydratase, XylJ  64.23 
 
 		 261 aa  300  2e-80  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2118  4-oxalocrotonate decarboxylase  55.2 
 
 		 271 aa  279  4e-74  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.609149  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4085  2-oxopent-4-enoate hydratase  50.59 
 
 		 267 aa  269  2.9999999999999997e-71  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000524317 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3689  hydratase/decarboxylase  53.54 
 
 		 266 aa  268  5.9999999999999995e-71  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1777  4-oxalocrotonate decarboxylase  54.01 
 
 		 257 aa  258  1e-67  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1149  2-oxopent-4-enoate hydratase  50 
 
 		 269 aa  255  5e-67  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.363401  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2296  2-oxopent-4-enoate hydratase  52.32 
 
 		 259 aa  249  2e-65  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1621  2-oxopent-4-enoate hydratase  49.01 
 
 		 264 aa  250  2e-65  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2155  2-hydroxypenta-2,4-dienoate hydratase, putative  49.21 
 
 		 255 aa  239  4e-62  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1186  4-oxalocrotonate decarboxylase  47.1 
 
 		 264 aa  236  3e-61  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0763202  normal  0.362959 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1477  4-oxalocrotonate decarboxylase  46.33 
 
 		 264 aa  227  1e-58  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3527  4-oxalocrotonate decarboxylase  48.25 
 
 		 265 aa  224  1e-57  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0534  2-oxopent-4-enoate hydratase  46.43 
 
 		 267 aa  224  1e-57  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1466  4-oxalocrotonate decarboxylase  44.36 
 
 		 273 aa  223  2e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0911  4-oxalocrotonate decarboxylase  47.1 
 
 		 277 aa  223  2e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.625128 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2299  4-oxalocrotonate decarboxylase  44.96 
 
 		 261 aa  223  3e-57  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4537  4-oxalocrotonate decarboxylase  44.31 
 
 		 262 aa  221  6e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3512  4-oxalocrotonate decarboxylase  45.28 
 
 		 269 aa  221  9e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3902  4-oxalocrotonate decarboxylase  49.03 
 
 		 265 aa  221  9.999999999999999e-57  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.561065 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2875  4-oxalocrotonate decarboxylase  45.53 
 
 		 268 aa  221  9.999999999999999e-57  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0367853 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3520  4-oxalocrotonate decarboxylase  46.46 
 
 		 263 aa  220  1.9999999999999999e-56  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0986627 
 
 
-
 
NC_003296  RS01662  putative hydratase protein  47.68 
 
 		 265 aa  219  3e-56  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.103932  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7646  4-oxalocrotonate decarboxylase  48.44 
 
 		 274 aa  219  3e-56  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.573554 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5499  4-oxalocrotonate decarboxylase  45.32 
 
 		 274 aa  219  3.9999999999999997e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0225  4-oxalocrotonate decarboxylase  44.4 
 
 		 262 aa  219  5e-56  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5207  2-keto-4-pentenoate hydratase  49.33 
 
 		 273 aa  216  2e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.133138  normal  0.334182 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3781  hydratase/decarboxylase  46.33 
 
 		 262 aa  215  5e-55  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0303669  decreased coverage  0.000202677 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2011  4-oxalocrotonate decarboxylase  46.48 
 
 		 260 aa  214  8e-55  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.781375  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0936  4-oxalocrotonate decarboxylase  44.75 
 
 		 268 aa  211  7e-54  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.101712  normal  0.608159 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9115  2-oxopent-4-enoate hydratase  45.2 
 
 		 265 aa  211  1e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1982  2-keto-4-pentenoate hydratase  43.75 
 
 		 264 aa  210  2e-53  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.572392 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0272  4-oxalocrotonate decarboxylase  42.41 
 
 		 262 aa  209  4e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0905  hydratase/decarboxylase  45.57 
 
 		 263 aa  208  6e-53  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0436706  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0381  2-keto-4-pentenoate hydratase  40.93 
 
 		 269 aa  208  7e-53  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.795138  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2884  4-oxalocrotonate decarboxylase  45.34 
 
 		 288 aa  208  8e-53  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42150  2-hydroxypent-2,4-dienoate hydratase  50 
 
 		 261 aa  207  1e-52  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.293913  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3090  4-oxalocrotonate decarboxylase  46.72 
 
 		 262 aa  207  1e-52  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3275  2-keto-4-pentenoate hydratase  40.93 
 
 		 269 aa  206  2e-52  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.235013  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2158  4-oxalocrotonate decarboxylase  41.3 
 
 		 262 aa  206  2e-52  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1354  hydratase/decarboxylase  44.73 
 
 		 262 aa  206  2e-52  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000612409  decreased coverage  0.00000118865 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4661  4-oxalocrotonate decarboxylase  40.77 
 
 		 261 aa  207  2e-52  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.930854  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4749  4-oxalocrotonate decarboxylase  40.77 
 
 		 261 aa  207  2e-52  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0856703  normal  0.088822 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0374  2-keto-4-pentenoate hydratase  40.93 
 
 		 269 aa  205  5e-52  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.832182  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1318  hydratase/decarboxylase  44.92 
 
 		 262 aa  205  5e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.288999  normal  0.257061 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0439  2-oxopent-4-enoate hydratase  43.46 
 
 		 263 aa  205  5e-52  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0138498 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0414  2-keto-4-pentenoate hydratase  40.93 
 
 		 269 aa  205  5e-52  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5044  4-oxalocrotonate decarboxylase  40.77 
 
 		 261 aa  205  5e-52  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3256  4-oxalocrotonate decarboxylase  40.54 
 
 		 269 aa  205  6e-52  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0224  2-oxopent-4-enoate hydratase  44.22 
 
 		 264 aa  205  6e-52  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0261621  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13569  hydratase  40.16 
 
 		 261 aa  204  9e-52  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000748615 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00304  2-keto-4-pentenoate hydratase  40.54 
 
 		 269 aa  204  1e-51  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.503312  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00308  hypothetical protein  40.54 
 
 		 269 aa  204  1e-51  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.527408  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2773  hydratase/decarboxylase  45.95 
 
 		 262 aa  203  2e-51  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000493793  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0425  2-keto-4-pentenoate hydratase  41.5 
 
 		 269 aa  204  2e-51  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3854  hydratase/decarboxylase  45.14 
 
 		 264 aa  203  2e-51  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.595722  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2111  4-oxalocrotonate decarboxylase  45.15 
 
 		 280 aa  202  3e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15110  2-keto-4-pentenoate hydratase  42.47 
 
 		 264 aa  202  6e-51  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.473426  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4313  2-oxo-hepta-3-ene-1,7-dioic acid hydratase  41.13 
 
 		 268 aa  201  9.999999999999999e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2958  4-oxalocrotonate decarboxylase  43.63 
 
 		 262 aa  200  1.9999999999999998e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.351017  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3548  2-hydroxypenta-2,4-dienoate hydratase (CmtF)  43.75 
 
 		 262 aa  200  1.9999999999999998e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.107167 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08680  4-oxalocrotonate decarboxylase.XylI  42.08 
 
 		 262 aa  200  1.9999999999999998e-50  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3612  2-oxo-hepta-3-ene-1,7-dioic acid hydratase  40.38 
 
 		 261 aa  200  1.9999999999999998e-50  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0909  2-oxopent-4-enoate hydratase  38.58 
 
 		 262 aa  199  3e-50  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4209  4-oxalocrotonate decarboxylase  45.17 
 
 		 264 aa  199  3e-50  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5134  hydratase/decarboxylase  41.8 
 
 		 263 aa  199  3.9999999999999996e-50  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0285955 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1639  4-oxalocrotonate decarboxylase  45.15 
 
 		 259 aa  198  7.999999999999999e-50  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.193054 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1520  4-oxalocrotonate decarboxylase  40.47 
 
 		 261 aa  196  2.0000000000000003e-49  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3524  2-oxo-hepta-3-ene-1,7-dioic acid hydratase  41.18 
 
 		 261 aa  197  2.0000000000000003e-49  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3242  hydratase/decarboxylase  45.98 
 
 		 260 aa  196  3e-49  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000968427  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5236  4-oxalocrotonate decarboxylase  39.23 
 
 		 261 aa  196  3e-49  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.270652 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2578  4-oxalocrotonate decarboxylase  43.97 
 
 		 276 aa  196  4.0000000000000005e-49  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2327  putative 2-hydroxypenta-2,4-dienoate hydratase(MhpD)  42.47 
 
 		 268 aa  194  9e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5220  4-oxalocrotonate decarboxylase  37.84 
 
 		 264 aa  194  2e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4569  4-oxalocrotonate decarboxylase  40.78 
 
 		 264 aa  193  2e-48  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00147074 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3281  2-oxo-hepta-3-ene-1,7-dioic acid hydratase  38.72 
 
 		 267 aa  192  4e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0269586  normal  0.185525 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5436  4-oxalocrotonate decarboxylase  42.19 
 
 		 274 aa  192  4e-48  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  normal  0.635895 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4236  2-oxo-hepta-3-ene-1,7-dioic acid hydratase  38.72 
 
 		 267 aa  192  4e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.119671  normal  0.0833029 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2405  4-oxalocrotonate decarboxylase  44.79 
 
 		 267 aa  192  4e-48  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5833  4-oxalocrotonate decarboxylase  42.19 
 
 		 274 aa  192  4e-48  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>