257 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmz1t_3090 on replicon NC_011662
Organism: Thauera sp. MZ1T



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011662  Tmz1t_3090  4-oxalocrotonate decarboxylase  100 
 
 
262 aa  532  1e-150  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2773  hydratase/decarboxylase  91.6 
 
 
262 aa  477  1e-134  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000493793  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3781  hydratase/decarboxylase  88.51 
 
 
262 aa  474  1e-133  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0303669  decreased coverage  0.000202677 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1318  hydratase/decarboxylase  73.66 
 
 
262 aa  414  9.999999999999999e-116  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.288999  normal  0.257061 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0225  4-oxalocrotonate decarboxylase  75.48 
 
 
262 aa  405  1.0000000000000001e-112  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3342  4-oxalocrotonate decarboxylase  71.76 
 
 
262 aa  388  1e-107  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2958  4-oxalocrotonate decarboxylase  70.99 
 
 
262 aa  385  1e-106  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.351017  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2272  4-oxalocrotonate decarboxylase  72.14 
 
 
268 aa  378  1e-104  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.866391  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08680  4-oxalocrotonate decarboxylase.XylI  67.56 
 
 
262 aa  362  3e-99  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2784  4-oxalocrotonate decarboxylase  72.8 
 
 
262 aa  360  2e-98  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.965988  normal  0.191345 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5692  4-oxalocrotonate decarboxylase  68.7 
 
 
263 aa  357  8e-98  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3543  4-oxalocrotonate decarboxylase  67.18 
 
 
263 aa  349  3e-95  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0271382  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4619  4-oxalocrotonate decarboxylase  67.18 
 
 
263 aa  349  3e-95  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.118774  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30600  4-oxalocrotonate decarboxylase; LapH  55.94 
 
 
267 aa  289  3e-77  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.0000150281  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3324  4-oxalocrotonate decarboxylase  54.2 
 
 
264 aa  276  2e-73  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2299  4-oxalocrotonate decarboxylase  50.4 
 
 
261 aa  249  3e-65  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2158  4-oxalocrotonate decarboxylase  43.78 
 
 
262 aa  226  4e-58  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1777  4-oxalocrotonate decarboxylase  48.94 
 
 
257 aa  216  2.9999999999999998e-55  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3091  2-oxopent-4-enoate hydratase  43.08 
 
 
260 aa  216  4e-55  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.42559  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2774  hydratase/decarboxylase  44.62 
 
 
260 aa  213  2.9999999999999995e-54  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.00000469641  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3785  hydratase/decarboxylase  43.85 
 
 
260 aa  207  1e-52  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0026227  hitchhiker  0.00282888 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1621  2-oxopent-4-enoate hydratase  46.83 
 
 
264 aa  207  2e-52  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0537  4-oxalocrotonate decarboxylase  47.04 
 
 
260 aa  203  3e-51  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0225  4-oxalocrotonate decarboxylase  46.18 
 
 
269 aa  202  4e-51  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  hitchhiker  0.00468493  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4085  2-oxopent-4-enoate hydratase  42.69 
 
 
267 aa  200  1.9999999999999998e-50  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000524317 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1321  hydratase/decarboxylase  42.53 
 
 
262 aa  200  1.9999999999999998e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0604012  normal  0.404919 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4144  4-oxalocrotonate decarboxylase  46.72 
 
 
260 aa  199  5e-50  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.246439 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0222  4-oxalocrotonate decarboxylase  47.71 
 
 
262 aa  197  1.0000000000000001e-49  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0794  4-oxalocrotonate decarboxylase  42.41 
 
 
261 aa  197  2.0000000000000003e-49  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1189  2-hydroxypenta-2,4-dienoate hydratase (BphH)  46.33 
 
 
264 aa  196  3e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.375643  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2077  2-oxopent-4-enoate hydratase  44.06 
 
 
261 aa  196  3e-49  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.849096  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2273  4-oxalocrotonate decarboxylase  43.08 
 
 
261 aa  194  1e-48  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4208  4-oxalocrotonate decarboxylase  43.53 
 
 
261 aa  193  2e-48  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS01662  putative hydratase protein  43.59 
 
 
265 aa  191  2e-47  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.103932  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3343  2-oxopent-4-enoate hydratase  41.54 
 
 
260 aa  190  2e-47  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2460  4-oxalocrotonate decarboxylase  40.38 
 
 
260 aa  189  4e-47  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.768834  normal  0.296337 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1618  4-oxalocrotonate decarboxylase  40.64 
 
 
259 aa  188  5.999999999999999e-47  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2785  4-oxalocrotonate decarboxylase  41.15 
 
 
261 aa  187  1e-46  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.197083 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5691  4-oxalocrotonate decarboxylase  44.68 
 
 
260 aa  186  3e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4620  2-oxopent-4-enoate hydratase  41.15 
 
 
260 aa  186  4e-46  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.275598  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3544  2-oxopent-4-enoate hydratase  41.15 
 
 
260 aa  186  4e-46  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.127016  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2296  2-oxopent-4-enoate hydratase  40.71 
 
 
259 aa  185  7e-46  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0534  2-oxopent-4-enoate hydratase  42.69 
 
 
267 aa  183  2.0000000000000003e-45  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0909  2-oxopent-4-enoate hydratase  39.46 
 
 
262 aa  183  3e-45  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4313  2-oxo-hepta-3-ene-1,7-dioic acid hydratase  39.63 
 
 
268 aa  182  3e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1787  2-oxo-hepta-3-ene-1,7-dioic acid hydratase  39.62 
 
 
267 aa  182  6e-45  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.995557  normal  0.779131 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1469  4-oxalocrotonate decarboxylase  40.71 
 
 
257 aa  181  8.000000000000001e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0912  4-oxalocrotonate decarboxylase  41.13 
 
 
259 aa  181  1e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.704461  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1186  4-oxalocrotonate decarboxylase  39.85 
 
 
264 aa  180  2e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0763202  normal  0.362959 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2961  4-oxalocrotonate decarboxylase  42.86 
 
 
260 aa  179  4.999999999999999e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.665549  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1480  4-oxalocrotonate decarboxylase  41.43 
 
 
254 aa  179  5.999999999999999e-44  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3851  hydratase/decarboxylase  41.2 
 
 
256 aa  178  8e-44  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0976371  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1149  2-oxopent-4-enoate hydratase  41.31 
 
 
269 aa  177  1e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.363401  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13569  hydratase  40.54 
 
 
261 aa  176  4e-43  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000748615 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1150  4-oxalocrotonate decarboxylase  39.76 
 
 
254 aa  175  5e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.454229  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5829  2-oxo-hepta-3-ene-1,7-dioic acid hydratase  37.97 
 
 
267 aa  175  5e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.193631  normal  0.310568 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1477  4-oxalocrotonate decarboxylase  40.15 
 
 
264 aa  175  6e-43  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42150  2-hydroxypent-2,4-dienoate hydratase  43.46 
 
 
261 aa  174  9.999999999999999e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.293913  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4271  2-oxo-hepta-3-ene-1,7-dioic acid hydratase  38.95 
 
 
268 aa  174  9.999999999999999e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.623769  normal  0.550033 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2155  2-hydroxypenta-2,4-dienoate hydratase, putative  43.92 
 
 
255 aa  173  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1510  4-oxalocrotonate decarboxylase  38.82 
 
 
260 aa  173  2.9999999999999996e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2033  putative 2-oxo-hept-3-ene-1,7-dioate hydratase(HpaH)  37.22 
 
 
267 aa  172  2.9999999999999996e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.25595  normal  0.0822961 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3178  2-oxo-hepta-3-ene-1,7-dioic acid hydratase  37.74 
 
 
267 aa  172  5e-42  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.128545  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3325  4-oxalocrotonate decarboxylase  40.15 
 
 
266 aa  172  5.999999999999999e-42  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS01663  4-oxalocrotonate decarboxylase protein  40 
 
 
263 aa  171  7.999999999999999e-42  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0913733  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2111  4-oxalocrotonate decarboxylase  39.3 
 
 
280 aa  171  1e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4445  2-oxo-hepta-3-ene-1,7-dioic acid hydratase  35.47 
 
 
267 aa  171  1e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.549639  normal  0.132657 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7643  4-oxalocrotonate decarboxylase  38.96 
 
 
257 aa  171  1e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.905012 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1708  2-oxo-hepta-3-ene-1,7-dioic acid hydratase  36.7 
 
 
268 aa  171  1e-41  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.899066  normal  0.363906 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0911  4-oxalocrotonate decarboxylase  38.85 
 
 
277 aa  171  1e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.625128 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3520  4-oxalocrotonate decarboxylase  39.37 
 
 
263 aa  171  1e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0986627 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1061  2-oxo-hepta-3-ene-1,7-dioic acid hydratase  35.71 
 
 
267 aa  171  1e-41  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.88697  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3689  hydratase/decarboxylase  40.59 
 
 
266 aa  170  2e-41  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1158  2-keto-4-pentenoate hydratase  35.71 
 
 
267 aa  171  2e-41  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1466  4-oxalocrotonate decarboxylase  38.55 
 
 
273 aa  170  2e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3521  4-oxalocrotonate decarboxylase  42.11 
 
 
257 aa  170  2e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.285108 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4279  2-oxo-hepta-3-ene-1,7-dioic acid hydratase  37.45 
 
 
268 aa  169  3e-41  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  decreased coverage  0.00917502  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3527  4-oxalocrotonate decarboxylase  43.67 
 
 
265 aa  169  4e-41  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0943  2-oxo-hepta-3-ene-1,7-dioic acid hydratase  37.36 
 
 
267 aa  169  6e-41  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5044  4-oxalocrotonate decarboxylase  40.54 
 
 
261 aa  168  7e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3854  hydratase/decarboxylase  39.46 
 
 
264 aa  168  7e-41  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.595722  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4661  4-oxalocrotonate decarboxylase  40.15 
 
 
261 aa  168  7e-41  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.930854  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4749  4-oxalocrotonate decarboxylase  40.15 
 
 
261 aa  168  7e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0856703  normal  0.088822 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1392  4-oxalocrotonate decarboxylase  39.45 
 
 
263 aa  168  7e-41  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0975696 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7646  4-oxalocrotonate decarboxylase  38.78 
 
 
274 aa  168  8e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.573554 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5210  4-oxalocrotonate decarboxylase  42.86 
 
 
254 aa  168  8e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.39218  normal  0.210604 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9115  2-oxopent-4-enoate hydratase  39.68 
 
 
265 aa  168  9e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3612  2-oxo-hepta-3-ene-1,7-dioic acid hydratase  36.68 
 
 
261 aa  167  1e-40  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1135  2-oxo-hepta-3-ene-1,7-dioate hydratase  36.98 
 
 
267 aa  166  2e-40  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3902  4-oxalocrotonate decarboxylase  43.67 
 
 
265 aa  167  2e-40  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.561065 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2269  2-oxo-hepta-3-ene-1,7-dioic acid hydratase  36.98 
 
 
267 aa  166  2e-40  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1508  2-oxo-hepta-3-ene-1,7-dioic acid hydratase  36.98 
 
 
267 aa  166  2e-40  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.576593  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0105  2-oxo-hepta-3-ene-1,7-dioic acid hydratase  36.98 
 
 
267 aa  166  2e-40  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.274919  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10590  2-oxo-hept-3-ene-1,7-dioate hydratase  36.84 
 
 
267 aa  166  2e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1028  2-oxo-hepta-3-ene-1,7-dioic acid hydratase  36.98 
 
 
267 aa  166  2e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30610  2-Hydroxypent-2,4-dienoate hydratase; LapE  39 
 
 
265 aa  166  2e-40  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.000960153  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2125  4-oxalocrotonate decarboxylase  39.77 
 
 
264 aa  167  2e-40  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.740862  normal  0.868744 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2578  4-oxalocrotonate decarboxylase  39.92 
 
 
276 aa  166  2.9999999999999998e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1730  2-oxo-hepta-3-ene-1,7-dioic acid hydratase  36.6 
 
 
267 aa  166  2.9999999999999998e-40  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3524  4-oxalocrotonate decarboxylase  44.35 
 
 
257 aa  166  4e-40  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>