279 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlg_2460 on replicon NC_008340
Organism: Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008340  Mlg_2460  4-oxalocrotonate decarboxylase  100 
 
 
260 aa  526  1e-148  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.768834  normal  0.296337 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1321  hydratase/decarboxylase  64.86 
 
 
262 aa  362  3e-99  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0604012  normal  0.404919 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3343  2-oxopent-4-enoate hydratase  65.38 
 
 
260 aa  358  4e-98  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2273  4-oxalocrotonate decarboxylase  65.77 
 
 
261 aa  355  2.9999999999999997e-97  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3544  2-oxopent-4-enoate hydratase  64.23 
 
 
260 aa  355  5.999999999999999e-97  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.127016  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4620  2-oxopent-4-enoate hydratase  64.23 
 
 
260 aa  355  5.999999999999999e-97  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.275598  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5691  4-oxalocrotonate decarboxylase  63.08 
 
 
260 aa  351  5.9999999999999994e-96  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2785  4-oxalocrotonate decarboxylase  63.85 
 
 
261 aa  350  1e-95  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.197083 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2961  4-oxalocrotonate decarboxylase  67.95 
 
 
260 aa  345  5e-94  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.665549  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3785  hydratase/decarboxylase  61.92 
 
 
260 aa  338  7e-92  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0026227  hitchhiker  0.00282888 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2774  hydratase/decarboxylase  61.15 
 
 
260 aa  335  3.9999999999999995e-91  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.00000469641  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2077  2-oxopent-4-enoate hydratase  62.69 
 
 
261 aa  333  2e-90  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.849096  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3091  2-oxopent-4-enoate hydratase  60.77 
 
 
260 aa  332  3e-90  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.42559  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4144  4-oxalocrotonate decarboxylase  63.71 
 
 
260 aa  332  4e-90  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.246439 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1189  2-hydroxypenta-2,4-dienoate hydratase (BphH)  65.25 
 
 
264 aa  332  5e-90  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.375643  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3325  4-oxalocrotonate decarboxylase  58.3 
 
 
266 aa  315  5e-85  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0222  4-oxalocrotonate decarboxylase  64.31 
 
 
262 aa  312  2.9999999999999996e-84  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1392  4-oxalocrotonate decarboxylase  55.94 
 
 
263 aa  305  6e-82  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0975696 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30610  2-Hydroxypent-2,4-dienoate hydratase; LapE  57.14 
 
 
265 aa  303  2.0000000000000002e-81  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.000960153  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1510  4-oxalocrotonate decarboxylase  55.77 
 
 
260 aa  295  3e-79  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08670  4-oxo-4-pentenoate hydratase, XylJ  60.15 
 
 
261 aa  292  4e-78  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1459  4-oxalocrotonate decarboxylase  55.78 
 
 
260 aa  288  8e-77  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.512129  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2118  4-oxalocrotonate decarboxylase  53.12 
 
 
271 aa  274  1.0000000000000001e-72  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.609149  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1777  4-oxalocrotonate decarboxylase  53.72 
 
 
257 aa  265  5e-70  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1149  2-oxopent-4-enoate hydratase  49.42 
 
 
269 aa  255  6e-67  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.363401  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2296  2-oxopent-4-enoate hydratase  50.78 
 
 
259 aa  254  1.0000000000000001e-66  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1621  2-oxopent-4-enoate hydratase  50.58 
 
 
264 aa  247  2e-64  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3689  hydratase/decarboxylase  51.17 
 
 
266 aa  246  4e-64  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1186  4-oxalocrotonate decarboxylase  49.81 
 
 
264 aa  245  4e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0763202  normal  0.362959 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4085  2-oxopent-4-enoate hydratase  45.91 
 
 
267 aa  240  2e-62  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000524317 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0534  2-oxopent-4-enoate hydratase  46.54 
 
 
267 aa  227  2e-58  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0936  4-oxalocrotonate decarboxylase  45.91 
 
 
268 aa  224  1e-57  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.101712  normal  0.608159 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0439  2-oxopent-4-enoate hydratase  48.73 
 
 
263 aa  223  2e-57  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0138498 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3512  4-oxalocrotonate decarboxylase  45.95 
 
 
269 aa  218  6e-56  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2155  2-hydroxypenta-2,4-dienoate hydratase, putative  47.9 
 
 
255 aa  217  1e-55  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01662  putative hydratase protein  47.3 
 
 
265 aa  217  2e-55  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.103932  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2011  4-oxalocrotonate decarboxylase  46.48 
 
 
260 aa  213  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.781375  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1466  4-oxalocrotonate decarboxylase  45.42 
 
 
273 aa  213  2.9999999999999995e-54  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0909  2-oxopent-4-enoate hydratase  42.51 
 
 
262 aa  212  4.9999999999999996e-54  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2875  4-oxalocrotonate decarboxylase  46.99 
 
 
268 aa  211  1e-53  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0367853 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9115  2-oxopent-4-enoate hydratase  45.75 
 
 
265 aa  210  2e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3520  4-oxalocrotonate decarboxylase  45.28 
 
 
263 aa  209  2e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0986627 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0911  4-oxalocrotonate decarboxylase  47.37 
 
 
277 aa  210  2e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.625128 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0224  2-oxopent-4-enoate hydratase  44.49 
 
 
264 aa  209  3e-53  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0261621  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1477  4-oxalocrotonate decarboxylase  44.02 
 
 
264 aa  209  4e-53  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4537  4-oxalocrotonate decarboxylase  44.75 
 
 
262 aa  209  5e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1354  hydratase/decarboxylase  46.06 
 
 
262 aa  206  2e-52  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000612409  decreased coverage  0.00000118865 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0272  4-oxalocrotonate decarboxylase  47.62 
 
 
262 aa  206  4e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42150  2-hydroxypent-2,4-dienoate hydratase  47.72 
 
 
261 aa  205  6e-52  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.293913  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3902  4-oxalocrotonate decarboxylase  47.06 
 
 
265 aa  205  7e-52  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.561065 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13569  hydratase  41.9 
 
 
261 aa  204  8e-52  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000748615 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0905  hydratase/decarboxylase  45.64 
 
 
263 aa  204  1e-51  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0436706  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1982  2-keto-4-pentenoate hydratase  42.86 
 
 
264 aa  203  2e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.572392 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7646  4-oxalocrotonate decarboxylase  48.44 
 
 
274 aa  203  2e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.573554 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3527  4-oxalocrotonate decarboxylase  46.77 
 
 
265 aa  203  2e-51  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0381  2-keto-4-pentenoate hydratase  41.31 
 
 
269 aa  202  3e-51  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.795138  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5207  2-keto-4-pentenoate hydratase  49.1 
 
 
273 aa  202  3e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.133138  normal  0.334182 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2111  4-oxalocrotonate decarboxylase  45.38 
 
 
280 aa  203  3e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4313  2-oxo-hepta-3-ene-1,7-dioic acid hydratase  44.73 
 
 
268 aa  202  5e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3275  2-keto-4-pentenoate hydratase  41.31 
 
 
269 aa  202  5e-51  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.235013  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4569  4-oxalocrotonate decarboxylase  44.53 
 
 
264 aa  202  5e-51  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00147074 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3502  2-oxo-hepta-3-ene-1,7-dioic acid hydratase  40.23 
 
 
267 aa  202  6e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.328452  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4661  4-oxalocrotonate decarboxylase  42.11 
 
 
261 aa  201  8e-51  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.930854  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4749  4-oxalocrotonate decarboxylase  42.11 
 
 
261 aa  201  8e-51  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0856703  normal  0.088822 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3256  4-oxalocrotonate decarboxylase  40.93 
 
 
269 aa  201  9.999999999999999e-51  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5499  4-oxalocrotonate decarboxylase  48.2 
 
 
274 aa  200  9.999999999999999e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0414  2-keto-4-pentenoate hydratase  41.31 
 
 
269 aa  201  9.999999999999999e-51  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0374  2-keto-4-pentenoate hydratase  41.31 
 
 
269 aa  201  9.999999999999999e-51  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.832182  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00304  2-keto-4-pentenoate hydratase  40.93 
 
 
269 aa  200  1.9999999999999998e-50  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.503312  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4066  2-oxo-hepta-3-ene-1,7-dioic acid hydratase  43.18 
 
 
274 aa  200  1.9999999999999998e-50  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.597772 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00308  hypothetical protein  40.93 
 
 
269 aa  200  1.9999999999999998e-50  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.527408  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5044  4-oxalocrotonate decarboxylase  42.11 
 
 
261 aa  200  1.9999999999999998e-50  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3854  hydratase/decarboxylase  43.3 
 
 
264 aa  197  1.0000000000000001e-49  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.595722  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3472  2-oxopent-4-enoate hydratase  42.91 
 
 
260 aa  197  1.0000000000000001e-49  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.102578  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3242  hydratase/decarboxylase  47.51 
 
 
260 aa  197  2.0000000000000003e-49  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000968427  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3798  2-oxopent-4-enoate hydratase  45.53 
 
 
261 aa  196  3e-49  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.138107  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0425  2-keto-4-pentenoate hydratase  41.11 
 
 
269 aa  196  4.0000000000000005e-49  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1639  4-oxalocrotonate decarboxylase  42.97 
 
 
259 aa  196  4.0000000000000005e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.193054 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5236  4-oxalocrotonate decarboxylase  42.44 
 
 
261 aa  196  4.0000000000000005e-49  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.270652 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10590  2-oxo-hept-3-ene-1,7-dioate hydratase  43.64 
 
 
267 aa  195  6e-49  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2420  2-oxo-hepta-3-ene-1,7-dioic acid hydratase  41.02 
 
 
278 aa  194  8.000000000000001e-49  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3612  2-oxo-hepta-3-ene-1,7-dioic acid hydratase  40.54 
 
 
261 aa  194  1e-48  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1520  4-oxalocrotonate decarboxylase  39.77 
 
 
261 aa  194  1e-48  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3524  2-oxo-hepta-3-ene-1,7-dioic acid hydratase  40.54 
 
 
261 aa  194  1e-48  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4209  4-oxalocrotonate decarboxylase  45.17 
 
 
264 aa  194  1e-48  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4271  2-oxo-hepta-3-ene-1,7-dioic acid hydratase  41.11 
 
 
268 aa  193  2e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.623769  normal  0.550033 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1955  2-oxo-hepta-3-ene-1,7-dioic acid hydratase  38.49 
 
 
267 aa  192  4e-48  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.504182  normal  0.0219036 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0965  2-oxo-hept-3-ene-1,7-dioate hydratase  43.22 
 
 
267 aa  192  5e-48  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3885  2-oxo-hepta-3-ene-1,7-dioic acid hydratase  42.28 
 
 
271 aa  192  5e-48  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.294519  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15110  2-keto-4-pentenoate hydratase  43.24 
 
 
264 aa  191  8e-48  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.473426  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2299  4-oxalocrotonate decarboxylase  40.87 
 
 
261 aa  191  1e-47  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5040  2-oxo-hepta-3-ene-1,7-dioic acid hydratase  40.16 
 
 
260 aa  191  1e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.444899  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2884  4-oxalocrotonate decarboxylase  44.13 
 
 
288 aa  190  2e-47  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20020  2-oxohept-3-enedioate hydratase  39.76 
 
 
261 aa  191  2e-47  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5220  4-oxalocrotonate decarboxylase  39.77 
 
 
264 aa  190  2e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1627  2-oxo-hepta-3-ene-1,7-dioic acid hydratase  39.76 
 
 
267 aa  190  2e-47  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.72873 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1778  4-oxalocrotonate decarboxylase  37.36 
 
 
267 aa  190  2e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.110144 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3457  2-oxo-hepta-3-ene-1,7-dioic acid hydratase  39.6 
 
 
260 aa  190  2e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0225  4-oxalocrotonate decarboxylase  41.02 
 
 
262 aa  190  2e-47  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0630  2-oxo-hepta-3-ene-1,7-dioic acid hydratase  38.35 
 
 
267 aa  190  2e-47  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.337949  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>