283 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_0225 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_0225  4-oxalocrotonate decarboxylase  100 
 
 		 269 aa  535  1e-151  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  hitchhiker  0.00468493  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0537  4-oxalocrotonate decarboxylase  64.2 
 
 		 260 aa  296  2e-79  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4208  4-oxalocrotonate decarboxylase  61.09 
 
 		 261 aa  289  3e-77  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0794  4-oxalocrotonate decarboxylase  46.59 
 
 		 261 aa  221  9e-57  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30600  4-oxalocrotonate decarboxylase; LapH  45.45 
 
 		 267 aa  206  3e-52  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.0000150281  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3342  4-oxalocrotonate decarboxylase  46.58 
 
 		 262 aa  200  1.9999999999999998e-50  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0225  4-oxalocrotonate decarboxylase  44.92 
 
 		 262 aa  201  1.9999999999999998e-50  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2299  4-oxalocrotonate decarboxylase  41.2 
 
 		 261 aa  199  3.9999999999999996e-50  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08680  4-oxalocrotonate decarboxylase.XylI  46.78 
 
 		 262 aa  199  5e-50  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2158  4-oxalocrotonate decarboxylase  39.6 
 
 		 262 aa  197  1.0000000000000001e-49  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2272  4-oxalocrotonate decarboxylase  45.86 
 
 		 268 aa  197  1.0000000000000001e-49  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.866391  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3090  4-oxalocrotonate decarboxylase  46.18 
 
 		 262 aa  196  3e-49  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3781  hydratase/decarboxylase  44 
 
 		 262 aa  196  4.0000000000000005e-49  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0303669  decreased coverage  0.000202677 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1318  hydratase/decarboxylase  44.35 
 
 		 262 aa  194  2e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.288999  normal  0.257061 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2958  4-oxalocrotonate decarboxylase  48.32 
 
 		 262 aa  192  5e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.351017  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2773  hydratase/decarboxylase  44.4 
 
 		 262 aa  191  1e-47  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000493793  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5692  4-oxalocrotonate decarboxylase  47.01 
 
 		 263 aa  189  2.9999999999999997e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0534  2-oxopent-4-enoate hydratase  47.81 
 
 		 267 aa  185  6e-46  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3543  4-oxalocrotonate decarboxylase  45.3 
 
 		 263 aa  184  1.0000000000000001e-45  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0271382  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4619  4-oxalocrotonate decarboxylase  45.3 
 
 		 263 aa  184  1.0000000000000001e-45  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.118774  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1618  4-oxalocrotonate decarboxylase  42 
 
 		 259 aa  183  2.0000000000000003e-45  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1621  2-oxopent-4-enoate hydratase  43.32 
 
 		 264 aa  183  3e-45  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3324  4-oxalocrotonate decarboxylase  42.4 
 
 		 264 aa  182  4.0000000000000006e-45  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3785  hydratase/decarboxylase  40.57 
 
 		 260 aa  179  2.9999999999999997e-44  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0026227  hitchhiker  0.00282888 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3091  2-oxopent-4-enoate hydratase  39.36 
 
 		 260 aa  179  4.999999999999999e-44  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.42559  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2077  2-oxopent-4-enoate hydratase  39.52 
 
 		 261 aa  177  1e-43  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.849096  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2774  hydratase/decarboxylase  38.96 
 
 		 260 aa  178  1e-43  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.00000469641  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9115  2-oxopent-4-enoate hydratase  42.25 
 
 		 265 aa  177  2e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1510  4-oxalocrotonate decarboxylase  42.02 
 
 		 260 aa  176  3e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4085  2-oxopent-4-enoate hydratase  40.8 
 
 		 267 aa  176  3e-43  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000524317 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3544  2-oxopent-4-enoate hydratase  39.68 
 
 		 260 aa  173  1.9999999999999998e-42  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.127016  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4620  2-oxopent-4-enoate hydratase  39.68 
 
 		 260 aa  173  1.9999999999999998e-42  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.275598  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0222  4-oxalocrotonate decarboxylase  45.08 
 
 		 262 aa  173  1.9999999999999998e-42  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0224  2-oxopent-4-enoate hydratase  45.56 
 
 		 264 aa  173  2.9999999999999996e-42  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0261621  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5691  4-oxalocrotonate decarboxylase  39.27 
 
 		 260 aa  172  3.9999999999999995e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2273  4-oxalocrotonate decarboxylase  41.3 
 
 		 261 aa  172  3.9999999999999995e-42  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3343  2-oxopent-4-enoate hydratase  40.57 
 
 		 260 aa  172  5e-42  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01663  4-oxalocrotonate decarboxylase protein  46.26 
 
 		 263 aa  170  2e-41  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0913733  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2785  4-oxalocrotonate decarboxylase  38.4 
 
 		 261 aa  170  2e-41  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.197083 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2055  4-oxalocrotonate decarboxylase  43.36 
 
 		 259 aa  170  2e-41  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0304181  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2296  2-oxopent-4-enoate hydratase  39.11 
 
 		 259 aa  170  3e-41  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2784  4-oxalocrotonate decarboxylase  42.23 
 
 		 262 aa  169  6e-41  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.965988  normal  0.191345 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30610  2-Hydroxypent-2,4-dienoate hydratase; LapE  42.73 
 
 		 265 aa  167  1e-40  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.000960153  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1480  4-oxalocrotonate decarboxylase  44.74 
 
 		 254 aa  166  4e-40  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2460  4-oxalocrotonate decarboxylase  40.25 
 
 		 260 aa  166  5e-40  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.768834  normal  0.296337 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1777  4-oxalocrotonate decarboxylase  39.83 
 
 		 257 aa  165  9e-40  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1321  hydratase/decarboxylase  36.4 
 
 		 262 aa  164  1.0000000000000001e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0604012  normal  0.404919 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1150  4-oxalocrotonate decarboxylase  44.49 
 
 		 254 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.454229  normal  1 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3851  hydratase/decarboxylase  42.63 
 
 		 256 aa  162  4.0000000000000004e-39  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0976371  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2118  4-oxalocrotonate decarboxylase  34.94 
 
 		 271 aa  162  7e-39  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.609149  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4144  4-oxalocrotonate decarboxylase  41.04 
 
 		 260 aa  162  8.000000000000001e-39  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.246439 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1459  4-oxalocrotonate decarboxylase  38.96 
 
 		 260 aa  160  3e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.512129  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3689  hydratase/decarboxylase  40.82 
 
 		 266 aa  159  5e-38  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1149  2-oxopent-4-enoate hydratase  38.13 
 
 		 269 aa  159  6e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.363401  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1392  4-oxalocrotonate decarboxylase  37.39 
 
 		 263 aa  158  8e-38  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0975696 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3902  4-oxalocrotonate decarboxylase  43.89 
 
 		 265 aa  157  1e-37  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.561065 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1477  4-oxalocrotonate decarboxylase  38.8 
 
 		 264 aa  157  2e-37  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3521  4-oxalocrotonate decarboxylase  45.78 
 
 		 257 aa  157  2e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.285108 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3798  2-oxopent-4-enoate hydratase  43.09 
 
 		 261 aa  157  2e-37  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.138107  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0595  4-oxalocrotonate decarboxylase  41.53 
 
 		 262 aa  157  2e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01662  putative hydratase protein  40.34 
 
 		 265 aa  156  3e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.103932  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4066  2-oxo-hepta-3-ene-1,7-dioic acid hydratase  36.88 
 
 		 274 aa  156  4e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.597772 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1189  2-hydroxypenta-2,4-dienoate hydratase (BphH)  40.64 
 
 		 264 aa  155  6e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.375643  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1406  4-oxalocrotonate decarboxylase  42.6 
 
 		 261 aa  155  8e-37  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3524  4-oxalocrotonate decarboxylase  45.41 
 
 		 257 aa  155  9e-37  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4661  4-oxalocrotonate decarboxylase  37.4 
 
 		 261 aa  154  1e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.930854  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3527  4-oxalocrotonate decarboxylase  42.22 
 
 		 265 aa  154  1e-36  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4749  4-oxalocrotonate decarboxylase  37.4 
 
 		 261 aa  154  1e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0856703  normal  0.088822 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5044  4-oxalocrotonate decarboxylase  37.4 
 
 		 261 aa  154  2e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3325  4-oxalocrotonate decarboxylase  41.52 
 
 		 266 aa  153  2.9999999999999998e-36  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1520  4-oxalocrotonate decarboxylase  37.14 
 
 		 261 aa  152  4e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2125  4-oxalocrotonate decarboxylase  39.08 
 
 		 264 aa  152  5.9999999999999996e-36  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.740862  normal  0.868744 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1186  4-oxalocrotonate decarboxylase  39.27 
 
 		 264 aa  152  7e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0763202  normal  0.362959 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4569  4-oxalocrotonate decarboxylase  39.52 
 
 		 264 aa  151  8.999999999999999e-36  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00147074 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3612  2-oxo-hepta-3-ene-1,7-dioic acid hydratase  36.29 
 
 		 261 aa  151  1e-35  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3472  2-oxopent-4-enoate hydratase  39.18 
 
 		 260 aa  151  1e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.102578  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4209  4-oxalocrotonate decarboxylase  42.57 
 
 		 264 aa  151  1e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2961  4-oxalocrotonate decarboxylase  38.15 
 
 		 260 aa  150  2e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.665549  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5210  4-oxalocrotonate decarboxylase  42.79 
 
 		 254 aa  150  2e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.39218  normal  0.210604 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5137  hydratase/decarboxylase  40.94 
 
 		 259 aa  149  3e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.838757  normal  0.0331511 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5236  4-oxalocrotonate decarboxylase  36.73 
 
 		 261 aa  150  3e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.270652 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0971  2-oxo-hepta-3-ene-1,7-dioic acid hydratase  37.35 
 
 		 260 aa  149  5e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.829684  normal  0.0126306 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42150  2-hydroxypent-2,4-dienoate hydratase  40.66 
 
 		 261 aa  149  5e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.293913  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2151  4-oxalocrotonate decarboxylase  38.28 
 
 		 271 aa  149  6e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0912  4-oxalocrotonate decarboxylase  44.59 
 
 		 259 aa  149  7e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.704461  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2884  4-oxalocrotonate decarboxylase  39.13 
 
 		 288 aa  147  1.0000000000000001e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2111  4-oxalocrotonate decarboxylase  39.82 
 
 		 280 aa  147  1.0000000000000001e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3512  4-oxalocrotonate decarboxylase  38.67 
 
 		 269 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3524  2-oxo-hepta-3-ene-1,7-dioic acid hydratase  35.08 
 
 		 261 aa  147  1.0000000000000001e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13569  hydratase  36.99 
 
 		 261 aa  147  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000748615 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9112  4-oxalocrotonate decarboxylase  40.17 
 
 		 255 aa  147  2.0000000000000003e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2578  4-oxalocrotonate decarboxylase  44.13 
 
 		 276 aa  147  2.0000000000000003e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1476  2-oxo-hepta-3-ene-1,7-dioic acid hydratase  36.65 
 
 		 260 aa  146  4.0000000000000006e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.161964 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4445  2-oxo-hepta-3-ene-1,7-dioic acid hydratase  33.46 
 
 		 267 aa  146  4.0000000000000006e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.549639  normal  0.132657 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0909  2-oxopent-4-enoate hydratase  37.93 
 
 		 262 aa  146  4.0000000000000006e-34  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3899  4-oxalocrotonate decarboxylase  46.29 
 
 		 257 aa  145  7.0000000000000006e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.553446 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1466  4-oxalocrotonate decarboxylase  38.74 
 
 		 273 aa  144  1e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7646  4-oxalocrotonate decarboxylase  39.04 
 
 		 274 aa  144  2e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.573554 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5220  4-oxalocrotonate decarboxylase  40.27 
 
 		 264 aa  143  3e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4313  2-oxo-hepta-3-ene-1,7-dioic acid hydratase  34.51 
 
 		 268 aa  142  4e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>