254 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_5137 on replicon NC_007949
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007949  Bpro_5137  hydratase/decarboxylase  100 
 
 
259 aa  528  1e-149  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.838757  normal  0.0331511 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1469  4-oxalocrotonate decarboxylase  64.82 
 
 
257 aa  329  2e-89  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7643  4-oxalocrotonate decarboxylase  65.34 
 
 
257 aa  311  9e-84  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.905012 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5210  4-oxalocrotonate decarboxylase  65.8 
 
 
254 aa  289  4e-77  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.39218  normal  0.210604 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5500  4-oxalocrotonate decarboxylase  63.91 
 
 
266 aa  270  1e-71  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0912  4-oxalocrotonate decarboxylase  50.6 
 
 
259 aa  244  9.999999999999999e-64  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.704461  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1150  4-oxalocrotonate decarboxylase  48.79 
 
 
254 aa  243  1.9999999999999999e-63  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.454229  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS01663  4-oxalocrotonate decarboxylase protein  50.4 
 
 
263 aa  234  7e-61  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0913733  normal 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3851  hydratase/decarboxylase  47.83 
 
 
256 aa  228  6e-59  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0976371  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1480  4-oxalocrotonate decarboxylase  47.79 
 
 
254 aa  227  1e-58  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9112  4-oxalocrotonate decarboxylase  45.78 
 
 
255 aa  216  4e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2010  4-oxalocrotonate decarboxylase  50.4 
 
 
256 aa  211  7e-54  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1406  4-oxalocrotonate decarboxylase  46.58 
 
 
261 aa  211  7.999999999999999e-54  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3521  4-oxalocrotonate decarboxylase  51.57 
 
 
257 aa  201  9.999999999999999e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.285108 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3524  4-oxalocrotonate decarboxylase  46.12 
 
 
257 aa  199  3e-50  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3899  4-oxalocrotonate decarboxylase  46.53 
 
 
257 aa  192  4e-48  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.553446 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3090  4-oxalocrotonate decarboxylase  39.68 
 
 
262 aa  168  1e-40  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2773  hydratase/decarboxylase  39.29 
 
 
262 aa  166  4e-40  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000493793  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3781  hydratase/decarboxylase  38.8 
 
 
262 aa  164  2.0000000000000002e-39  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0303669  decreased coverage  0.000202677 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0537  4-oxalocrotonate decarboxylase  41.18 
 
 
260 aa  161  1e-38  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0794  4-oxalocrotonate decarboxylase  37.94 
 
 
261 aa  159  3e-38  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08680  4-oxalocrotonate decarboxylase.XylI  37.3 
 
 
262 aa  157  2e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2299  4-oxalocrotonate decarboxylase  36.29 
 
 
261 aa  156  3e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0225  4-oxalocrotonate decarboxylase  40.94 
 
 
269 aa  156  4e-37  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  hitchhiker  0.00468493  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0225  4-oxalocrotonate decarboxylase  36.76 
 
 
262 aa  155  4e-37  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4208  4-oxalocrotonate decarboxylase  39 
 
 
261 aa  155  5.0000000000000005e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2158  4-oxalocrotonate decarboxylase  35.34 
 
 
262 aa  155  6e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3342  4-oxalocrotonate decarboxylase  36.9 
 
 
262 aa  155  8e-37  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1621  2-oxopent-4-enoate hydratase  34.92 
 
 
264 aa  153  2.9999999999999998e-36  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2784  4-oxalocrotonate decarboxylase  37.05 
 
 
262 aa  151  1e-35  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.965988  normal  0.191345 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1618  4-oxalocrotonate decarboxylase  34.65 
 
 
259 aa  149  3e-35  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1321  hydratase/decarboxylase  33.85 
 
 
262 aa  149  4e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0604012  normal  0.404919 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4619  4-oxalocrotonate decarboxylase  37.05 
 
 
263 aa  148  9e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.118774  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3543  4-oxalocrotonate decarboxylase  37.05 
 
 
263 aa  148  9e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0271382  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1318  hydratase/decarboxylase  37.2 
 
 
262 aa  147  2.0000000000000003e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.288999  normal  0.257061 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2958  4-oxalocrotonate decarboxylase  37.45 
 
 
262 aa  146  4.0000000000000006e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.351017  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3091  2-oxopent-4-enoate hydratase  32.93 
 
 
260 aa  144  1e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.42559  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2055  4-oxalocrotonate decarboxylase  38.8 
 
 
259 aa  144  1e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0304181  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2774  hydratase/decarboxylase  32.67 
 
 
260 aa  143  2e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.00000469641  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1777  4-oxalocrotonate decarboxylase  36.02 
 
 
257 aa  144  2e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2272  4-oxalocrotonate decarboxylase  36.9 
 
 
268 aa  142  4e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.866391  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3785  hydratase/decarboxylase  32.27 
 
 
260 aa  142  5e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0026227  hitchhiker  0.00282888 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5692  4-oxalocrotonate decarboxylase  36.11 
 
 
263 aa  142  6e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0224  2-oxopent-4-enoate hydratase  36.65 
 
 
264 aa  142  8e-33  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0261621  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0534  2-oxopent-4-enoate hydratase  34.77 
 
 
267 aa  141  8e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2077  2-oxopent-4-enoate hydratase  34.69 
 
 
261 aa  141  9.999999999999999e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.849096  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4085  2-oxopent-4-enoate hydratase  35.52 
 
 
267 aa  140  1.9999999999999998e-32  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000524317 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3324  4-oxalocrotonate decarboxylase  36.47 
 
 
264 aa  139  3.9999999999999997e-32  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30600  4-oxalocrotonate decarboxylase; LapH  37.29 
 
 
267 aa  135  9e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.0000150281  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3798  2-oxopent-4-enoate hydratase  35.62 
 
 
261 aa  134  9.999999999999999e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.138107  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3343  2-oxopent-4-enoate hydratase  31.62 
 
 
260 aa  134  9.999999999999999e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4144  4-oxalocrotonate decarboxylase  32.94 
 
 
260 aa  134  1.9999999999999998e-30  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.246439 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2460  4-oxalocrotonate decarboxylase  34.47 
 
 
260 aa  132  5e-30  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.768834  normal  0.296337 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4620  2-oxopent-4-enoate hydratase  30.83 
 
 
260 aa  132  6.999999999999999e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.275598  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5691  4-oxalocrotonate decarboxylase  31.62 
 
 
260 aa  132  6.999999999999999e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3544  2-oxopent-4-enoate hydratase  30.83 
 
 
260 aa  132  6.999999999999999e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.127016  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0222  4-oxalocrotonate decarboxylase  34.27 
 
 
262 aa  130  2.0000000000000002e-29  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1189  2-hydroxypenta-2,4-dienoate hydratase (BphH)  34.39 
 
 
264 aa  130  3e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.375643  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4209  4-oxalocrotonate decarboxylase  36.47 
 
 
264 aa  127  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2273  4-oxalocrotonate decarboxylase  31.1 
 
 
261 aa  125  5e-28  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4313  2-oxo-hepta-3-ene-1,7-dioic acid hydratase  32.68 
 
 
268 aa  125  6e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4661  4-oxalocrotonate decarboxylase  33.2 
 
 
261 aa  124  1e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.930854  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4749  4-oxalocrotonate decarboxylase  33.2 
 
 
261 aa  124  1e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0856703  normal  0.088822 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2785  4-oxalocrotonate decarboxylase  30.52 
 
 
261 aa  124  1e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.197083 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3502  2-oxo-hepta-3-ene-1,7-dioic acid hydratase  30.71 
 
 
267 aa  124  2e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.328452  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30610  2-Hydroxypent-2,4-dienoate hydratase; LapE  31.92 
 
 
265 aa  124  2e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.000960153  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4569  4-oxalocrotonate decarboxylase  33.2 
 
 
264 aa  123  2e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00147074 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5044  4-oxalocrotonate decarboxylase  33.2 
 
 
261 aa  122  4e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2961  4-oxalocrotonate decarboxylase  32.66 
 
 
260 aa  122  4e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.665549  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2125  4-oxalocrotonate decarboxylase  35.44 
 
 
264 aa  122  4e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.740862  normal  0.868744 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1392  4-oxalocrotonate decarboxylase  30.12 
 
 
263 aa  122  6e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0975696 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0909  2-oxopent-4-enoate hydratase  33.86 
 
 
262 aa  121  9e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3325  4-oxalocrotonate decarboxylase  32.33 
 
 
266 aa  121  9.999999999999999e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3689  hydratase/decarboxylase  34.7 
 
 
266 aa  120  1.9999999999999998e-26  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0101  2-oxo-hepta-3-ene-1,7-dioic acid hydratase  30.86 
 
 
277 aa  120  1.9999999999999998e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0240  2-oxo-hepta-3-ene-1,7-dioic acid hydratase  27.38 
 
 
267 aa  118  7.999999999999999e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3885  2-oxo-hepta-3-ene-1,7-dioic acid hydratase  29.55 
 
 
271 aa  118  7.999999999999999e-26  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.294519  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0439  2-oxopent-4-enoate hydratase  32.24 
 
 
263 aa  118  9e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0138498 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2296  2-oxopent-4-enoate hydratase  32.79 
 
 
259 aa  118  9.999999999999999e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1186  4-oxalocrotonate decarboxylase  33.33 
 
 
264 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0763202  normal  0.362959 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0936  4-oxalocrotonate decarboxylase  30.74 
 
 
268 aa  117  1.9999999999999998e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.101712  normal  0.608159 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2155  2-hydroxypenta-2,4-dienoate hydratase, putative  32.4 
 
 
255 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3658  2-oxo-hepta-3-ene-1,7-dioic acid hydratase  28.57 
 
 
267 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.504721 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5236  4-oxalocrotonate decarboxylase  32.05 
 
 
261 aa  117  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.270652 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1510  4-oxalocrotonate decarboxylase  31.45 
 
 
260 aa  116  3e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0595  4-oxalocrotonate decarboxylase  34.2 
 
 
262 aa  116  3e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4745  4-oxalocrotonate decarboxylase  32.13 
 
 
270 aa  115  5e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3512  4-oxalocrotonate decarboxylase  33.73 
 
 
269 aa  115  6.9999999999999995e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1955  2-oxo-hepta-3-ene-1,7-dioic acid hydratase  29.81 
 
 
267 aa  115  7.999999999999999e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.504182  normal  0.0219036 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3281  2-oxo-hepta-3-ene-1,7-dioic acid hydratase  28.19 
 
 
267 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0269586  normal  0.185525 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4130  2-oxo-hepta-3-ene-1,7-dioic acid hydratase  28.19 
 
 
267 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0570046  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4236  2-oxo-hepta-3-ene-1,7-dioic acid hydratase  28.19 
 
 
267 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.119671  normal  0.0833029 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4132  2-oxo-hepta-3-ene-1,7-dioic acid hydratase  28.19 
 
 
267 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.138195  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1627  2-oxo-hepta-3-ene-1,7-dioic acid hydratase  30.38 
 
 
267 aa  113  2.0000000000000002e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.72873 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1778  4-oxalocrotonate decarboxylase  28.19 
 
 
267 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.110144 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2578  4-oxalocrotonate decarboxylase  33.2 
 
 
276 aa  114  2.0000000000000002e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10590  2-oxo-hept-3-ene-1,7-dioate hydratase  30.71 
 
 
267 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1639  4-oxalocrotonate decarboxylase  36.05 
 
 
259 aa  113  3e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.193054 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1787  2-oxo-hepta-3-ene-1,7-dioic acid hydratase  28.19 
 
 
267 aa  113  3e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.995557  normal  0.779131 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0965  2-oxo-hept-3-ene-1,7-dioate hydratase  30.71 
 
 
267 aa  113  3e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>