292 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A2125 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008825  Mpe_A2125  4-oxalocrotonate decarboxylase  100 
 
 
264 aa  530  1e-149  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.740862  normal  0.868744 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1621  2-oxopent-4-enoate hydratase  42.06 
 
 
264 aa  172  5e-42  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08680  4-oxalocrotonate decarboxylase.XylI  40.08 
 
 
262 aa  168  1e-40  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4085  2-oxopent-4-enoate hydratase  37.31 
 
 
267 aa  166  2.9999999999999998e-40  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000524317 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3781  hydratase/decarboxylase  38.61 
 
 
262 aa  165  5.9999999999999996e-40  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0303669  decreased coverage  0.000202677 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1469  4-oxalocrotonate decarboxylase  41.63 
 
 
257 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3090  4-oxalocrotonate decarboxylase  39.77 
 
 
262 aa  160  2e-38  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2958  4-oxalocrotonate decarboxylase  42.02 
 
 
262 aa  157  1e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.351017  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0225  4-oxalocrotonate decarboxylase  38.13 
 
 
262 aa  157  2e-37  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0909  2-oxopent-4-enoate hydratase  35.46 
 
 
262 aa  156  3e-37  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3472  2-oxopent-4-enoate hydratase  39.13 
 
 
260 aa  156  4e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.102578  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1318  hydratase/decarboxylase  39.15 
 
 
262 aa  154  1e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.288999  normal  0.257061 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13569  hydratase  37.01 
 
 
261 aa  153  2.9999999999999998e-36  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000748615 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3342  4-oxalocrotonate decarboxylase  37.65 
 
 
262 aa  153  2.9999999999999998e-36  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5044  4-oxalocrotonate decarboxylase  37.07 
 
 
261 aa  152  4e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0225  4-oxalocrotonate decarboxylase  39.08 
 
 
269 aa  152  5.9999999999999996e-36  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  hitchhiker  0.00468493  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3091  2-oxopent-4-enoate hydratase  35.89 
 
 
260 aa  152  7e-36  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.42559  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2773  hydratase/decarboxylase  38.22 
 
 
262 aa  151  8.999999999999999e-36  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000493793  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4661  4-oxalocrotonate decarboxylase  36.29 
 
 
261 aa  151  1e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.930854  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4749  4-oxalocrotonate decarboxylase  36.29 
 
 
261 aa  151  1e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0856703  normal  0.088822 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0534  2-oxopent-4-enoate hydratase  39.08 
 
 
267 aa  150  2e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2296  2-oxopent-4-enoate hydratase  37.4 
 
 
259 aa  150  2e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1520  4-oxalocrotonate decarboxylase  38.25 
 
 
261 aa  149  3e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1777  4-oxalocrotonate decarboxylase  36.93 
 
 
257 aa  148  1.0000000000000001e-34  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2077  2-oxopent-4-enoate hydratase  34.75 
 
 
261 aa  147  2.0000000000000003e-34  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.849096  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1321  hydratase/decarboxylase  35.74 
 
 
262 aa  147  2.0000000000000003e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0604012  normal  0.404919 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5692  4-oxalocrotonate decarboxylase  37.74 
 
 
263 aa  146  4.0000000000000006e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2774  hydratase/decarboxylase  34.1 
 
 
260 aa  145  9e-34  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.00000469641  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4619  4-oxalocrotonate decarboxylase  36.58 
 
 
263 aa  144  1e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.118774  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3543  4-oxalocrotonate decarboxylase  36.58 
 
 
263 aa  144  1e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0271382  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2151  4-oxalocrotonate decarboxylase  36.19 
 
 
271 aa  144  1e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1459  4-oxalocrotonate decarboxylase  38.31 
 
 
260 aa  143  2e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.512129  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2460  4-oxalocrotonate decarboxylase  35.8 
 
 
260 aa  143  3e-33  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.768834  normal  0.296337 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5691  4-oxalocrotonate decarboxylase  33.87 
 
 
260 aa  142  5e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2273  4-oxalocrotonate decarboxylase  34.68 
 
 
261 aa  142  5e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5236  4-oxalocrotonate decarboxylase  35.86 
 
 
261 aa  142  5e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.270652 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1149  2-oxopent-4-enoate hydratase  34.96 
 
 
269 aa  142  6e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.363401  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5210  4-oxalocrotonate decarboxylase  41.56 
 
 
254 aa  142  6e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.39218  normal  0.210604 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0595  4-oxalocrotonate decarboxylase  39.33 
 
 
262 aa  142  6e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2272  4-oxalocrotonate decarboxylase  38.31 
 
 
268 aa  142  8e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.866391  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4209  4-oxalocrotonate decarboxylase  40.4 
 
 
264 aa  141  9e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2884  4-oxalocrotonate decarboxylase  37.85 
 
 
288 aa  141  9.999999999999999e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3544  2-oxopent-4-enoate hydratase  34.17 
 
 
260 aa  141  9.999999999999999e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.127016  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0537  4-oxalocrotonate decarboxylase  43.64 
 
 
260 aa  141  9.999999999999999e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4620  2-oxopent-4-enoate hydratase  34.17 
 
 
260 aa  141  9.999999999999999e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.275598  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30600  4-oxalocrotonate decarboxylase; LapH  39.41 
 
 
267 aa  140  9.999999999999999e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.0000150281  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1354  hydratase/decarboxylase  37.24 
 
 
262 aa  140  1.9999999999999998e-32  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000612409  decreased coverage  0.00000118865 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3499  2-oxo-hepta-3-ene-1,7-dioic acid hydratase  35.43 
 
 
266 aa  140  1.9999999999999998e-32  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00827858 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2784  4-oxalocrotonate decarboxylase  39.11 
 
 
262 aa  140  1.9999999999999998e-32  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.965988  normal  0.191345 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1189  2-hydroxypenta-2,4-dienoate hydratase (BphH)  37.45 
 
 
264 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.375643  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3798  2-oxopent-4-enoate hydratase  39.84 
 
 
261 aa  140  1.9999999999999998e-32  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.138107  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3527  4-oxalocrotonate decarboxylase  41.74 
 
 
265 aa  140  3e-32  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3785  hydratase/decarboxylase  34.14 
 
 
260 aa  139  3.9999999999999997e-32  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0026227  hitchhiker  0.00282888 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4832  2-oxopent-4-enoate hydratase  37.85 
 
 
279 aa  139  3.9999999999999997e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0838304  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1477  4-oxalocrotonate decarboxylase  35.52 
 
 
264 aa  139  3.9999999999999997e-32  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0905  hydratase/decarboxylase  37.89 
 
 
263 aa  139  4.999999999999999e-32  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0436706  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2299  4-oxalocrotonate decarboxylase  34.78 
 
 
261 aa  139  4.999999999999999e-32  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0439  2-oxopent-4-enoate hydratase  38.14 
 
 
263 aa  139  4.999999999999999e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0138498 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1186  4-oxalocrotonate decarboxylase  38.3 
 
 
264 aa  139  6e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0763202  normal  0.362959 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2961  4-oxalocrotonate decarboxylase  37.35 
 
 
260 aa  138  7.999999999999999e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.665549  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42150  2-hydroxypent-2,4-dienoate hydratase  38.49 
 
 
261 aa  138  7.999999999999999e-32  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.293913  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4569  4-oxalocrotonate decarboxylase  38.58 
 
 
264 aa  138  8.999999999999999e-32  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00147074 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9115  2-oxopent-4-enoate hydratase  37.97 
 
 
265 aa  138  8.999999999999999e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4445  2-oxo-hepta-3-ene-1,7-dioic acid hydratase  37.21 
 
 
267 aa  137  1e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.549639  normal  0.132657 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2055  4-oxalocrotonate decarboxylase  38.37 
 
 
259 aa  137  1e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0304181  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01662  putative hydratase protein  38.08 
 
 
265 aa  137  2e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.103932  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3343  2-oxopent-4-enoate hydratase  32.93 
 
 
260 aa  137  2e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0794  4-oxalocrotonate decarboxylase  37.45 
 
 
261 aa  137  2e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0911  4-oxalocrotonate decarboxylase  36.43 
 
 
277 aa  136  3.0000000000000003e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.625128 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2158  4-oxalocrotonate decarboxylase  35.25 
 
 
262 aa  136  4e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1406  4-oxalocrotonate decarboxylase  36.8 
 
 
261 aa  135  5e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3902  4-oxalocrotonate decarboxylase  40 
 
 
265 aa  135  7.000000000000001e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.561065 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4144  4-oxalocrotonate decarboxylase  34.59 
 
 
260 aa  135  7.000000000000001e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.246439 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30610  2-Hydroxypent-2,4-dienoate hydratase; LapE  35.89 
 
 
265 aa  135  8e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.000960153  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0272  4-oxalocrotonate decarboxylase  37.4 
 
 
262 aa  135  9e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7643  4-oxalocrotonate decarboxylase  39.13 
 
 
257 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.905012 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1618  4-oxalocrotonate decarboxylase  35.32 
 
 
259 aa  134  1.9999999999999998e-30  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3512  4-oxalocrotonate decarboxylase  35.08 
 
 
269 aa  133  3e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3689  hydratase/decarboxylase  37.08 
 
 
266 aa  133  3e-30  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008766  Ajs_4284  hydratase/decarboxylase  45.79 
 
 
264 aa  133  3e-30  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4313  2-oxo-hepta-3-ene-1,7-dioic acid hydratase  35.69 
 
 
268 aa  132  5e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1480  4-oxalocrotonate decarboxylase  39.66 
 
 
254 aa  132  5e-30  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0224  2-oxopent-4-enoate hydratase  35.04 
 
 
264 aa  132  5e-30  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0261621  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4279  2-oxo-hepta-3-ene-1,7-dioic acid hydratase  34.94 
 
 
268 aa  132  6e-30  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  decreased coverage  0.00917502  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4208  4-oxalocrotonate decarboxylase  39.3 
 
 
261 aa  132  7.999999999999999e-30  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1708  2-oxo-hepta-3-ene-1,7-dioic acid hydratase  36.82 
 
 
268 aa  131  9e-30  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.899066  normal  0.363906 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3464  2-oxo-hepta-3-ene-1,7-dioic acid hydratase  33.59 
 
 
266 aa  131  1.0000000000000001e-29  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2785  4-oxalocrotonate decarboxylase  32.13 
 
 
261 aa  131  1.0000000000000001e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.197083 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3281  2-oxo-hepta-3-ene-1,7-dioic acid hydratase  36.74 
 
 
267 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0269586  normal  0.185525 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5134  hydratase/decarboxylase  35.34 
 
 
263 aa  130  2.0000000000000002e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.0285955 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3520  4-oxalocrotonate decarboxylase  38.16 
 
 
263 aa  130  2.0000000000000002e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0986627 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4130  2-oxo-hepta-3-ene-1,7-dioic acid hydratase  36.74 
 
 
267 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0570046  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4236  2-oxo-hepta-3-ene-1,7-dioic acid hydratase  36.74 
 
 
267 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.119671  normal  0.0833029 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2111  4-oxalocrotonate decarboxylase  34.92 
 
 
280 aa  130  2.0000000000000002e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2941  2-oxo-hepta-3-ene-1,7-dioate hydratase  35.32 
 
 
268 aa  130  3e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1061  2-oxo-hepta-3-ene-1,7-dioic acid hydratase  35.66 
 
 
267 aa  129  4.0000000000000003e-29  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.88697  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3524  4-oxalocrotonate decarboxylase  42.93 
 
 
257 aa  129  4.0000000000000003e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS01663  4-oxalocrotonate decarboxylase protein  41.74 
 
 
263 aa  129  5.0000000000000004e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0913733  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1158  2-keto-4-pentenoate hydratase  35.66 
 
 
267 aa  129  5.0000000000000004e-29  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2118  4-oxalocrotonate decarboxylase  34.43 
 
 
271 aa  129  7.000000000000001e-29  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.609149  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>