243 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_3521 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_3521  4-oxalocrotonate decarboxylase  100 
 
 		 257 aa  507  1e-143  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.285108 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0912  4-oxalocrotonate decarboxylase  58.37 
 
 		 259 aa  266  2e-70  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.704461  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1150  4-oxalocrotonate decarboxylase  54.2 
 
 		 254 aa  249  3e-65  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.454229  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1480  4-oxalocrotonate decarboxylase  52.65 
 
 		 254 aa  249  3e-65  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01663  4-oxalocrotonate decarboxylase protein  55.46 
 
 		 263 aa  247  1e-64  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0913733  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1406  4-oxalocrotonate decarboxylase  54.55 
 
 		 261 aa  248  1e-64  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3851  hydratase/decarboxylase  51.6 
 
 		 256 aa  240  2e-62  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0976371  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5210  4-oxalocrotonate decarboxylase  55.16 
 
 		 254 aa  230  2e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.39218  normal  0.210604 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9112  4-oxalocrotonate decarboxylase  47.08 
 
 		 255 aa  227  2e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2010  4-oxalocrotonate decarboxylase  55.02 
 
 		 256 aa  216  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1469  4-oxalocrotonate decarboxylase  47.98 
 
 		 257 aa  211  7.999999999999999e-54  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5500  4-oxalocrotonate decarboxylase  50 
 
 		 266 aa  210  2e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7643  4-oxalocrotonate decarboxylase  48.05 
 
 		 257 aa  207  1e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.905012 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5137  hydratase/decarboxylase  51.57 
 
 		 259 aa  206  3e-52  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.838757  normal  0.0331511 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3524  4-oxalocrotonate decarboxylase  52.4 
 
 		 257 aa  202  3e-51  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3899  4-oxalocrotonate decarboxylase  52.97 
 
 		 257 aa  194  1e-48  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.553446 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3781  hydratase/decarboxylase  43.2 
 
 		 262 aa  186  3e-46  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0303669  decreased coverage  0.000202677 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2158  4-oxalocrotonate decarboxylase  38 
 
 		 262 aa  183  3e-45  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0225  4-oxalocrotonate decarboxylase  42.34 
 
 		 262 aa  182  6e-45  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2773  hydratase/decarboxylase  42.11 
 
 		 262 aa  181  9.000000000000001e-45  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000493793  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3090  4-oxalocrotonate decarboxylase  42.11 
 
 		 262 aa  179  5.999999999999999e-44  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08680  4-oxalocrotonate decarboxylase.XylI  43.91 
 
 		 262 aa  175  5e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0225  4-oxalocrotonate decarboxylase  45.78 
 
 		 269 aa  172  5.999999999999999e-42  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  hitchhiker  0.00468493  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2299  4-oxalocrotonate decarboxylase  39.62 
 
 		 261 aa  170  2e-41  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0794  4-oxalocrotonate decarboxylase  39.76 
 
 		 261 aa  170  2e-41  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1318  hydratase/decarboxylase  41.39 
 
 		 262 aa  167  2e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.288999  normal  0.257061 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2958  4-oxalocrotonate decarboxylase  42.68 
 
 		 262 aa  165  5e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.351017  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0537  4-oxalocrotonate decarboxylase  44.94 
 
 		 260 aa  165  5.9999999999999996e-40  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1621  2-oxopent-4-enoate hydratase  39.92 
 
 		 264 aa  159  4e-38  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5692  4-oxalocrotonate decarboxylase  38.96 
 
 		 263 aa  157  2e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1618  4-oxalocrotonate decarboxylase  37.23 
 
 		 259 aa  155  6e-37  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3342  4-oxalocrotonate decarboxylase  37.75 
 
 		 262 aa  151  8e-36  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2272  4-oxalocrotonate decarboxylase  38.46 
 
 		 268 aa  152  8e-36  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.866391  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30600  4-oxalocrotonate decarboxylase; LapH  41.94 
 
 		 267 aa  151  8.999999999999999e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.0000150281  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3343  2-oxopent-4-enoate hydratase  37.65 
 
 		 260 aa  151  1e-35  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3543  4-oxalocrotonate decarboxylase  37.75 
 
 		 263 aa  151  1e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0271382  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4619  4-oxalocrotonate decarboxylase  37.75 
 
 		 263 aa  151  1e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.118774  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2055  4-oxalocrotonate decarboxylase  41.27 
 
 		 259 aa  149  3e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0304181  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3324  4-oxalocrotonate decarboxylase  41.3 
 
 		 264 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2774  hydratase/decarboxylase  37.25 
 
 		 260 aa  146  3e-34  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.00000469641  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2296  2-oxopent-4-enoate hydratase  35.54 
 
 		 259 aa  146  3e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3091  2-oxopent-4-enoate hydratase  38.43 
 
 		 260 aa  146  3e-34  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.42559  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3785  hydratase/decarboxylase  38.1 
 
 		 260 aa  145  5e-34  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0026227  hitchhiker  0.00282888 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4208  4-oxalocrotonate decarboxylase  39.76 
 
 		 261 aa  144  1e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4569  4-oxalocrotonate decarboxylase  36.47 
 
 		 264 aa  144  1e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00147074 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2785  4-oxalocrotonate decarboxylase  36.03 
 
 		 261 aa  144  1e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.197083 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3544  2-oxopent-4-enoate hydratase  35.95 
 
 		 260 aa  144  2e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.127016  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4620  2-oxopent-4-enoate hydratase  35.95 
 
 		 260 aa  144  2e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.275598  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30610  2-Hydroxypent-2,4-dienoate hydratase; LapE  37.45 
 
 		 265 aa  143  3e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.000960153  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1321  hydratase/decarboxylase  37.12 
 
 		 262 aa  141  9.999999999999999e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0604012  normal  0.404919 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2273  4-oxalocrotonate decarboxylase  36.44 
 
 		 261 aa  141  9.999999999999999e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3472  2-oxopent-4-enoate hydratase  37.9 
 
 		 260 aa  140  1.9999999999999998e-32  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.102578  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3325  4-oxalocrotonate decarboxylase  35.66 
 
 		 266 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5691  4-oxalocrotonate decarboxylase  36.52 
 
 		 260 aa  139  3.9999999999999997e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4085  2-oxopent-4-enoate hydratase  37.04 
 
 		 267 aa  138  1e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000524317 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2111  4-oxalocrotonate decarboxylase  39.15 
 
 		 280 aa  137  2e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0439  2-oxopent-4-enoate hydratase  39.15 
 
 		 263 aa  135  4e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0138498 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2460  4-oxalocrotonate decarboxylase  36.29 
 
 		 260 aa  135  5e-31  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.768834  normal  0.296337 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2118  4-oxalocrotonate decarboxylase  37.23 
 
 		 271 aa  135  5e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.609149  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0936  4-oxalocrotonate decarboxylase  37.18 
 
 		 268 aa  135  6.0000000000000005e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.101712  normal  0.608159 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3902  4-oxalocrotonate decarboxylase  40.79 
 
 		 265 aa  135  8e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.561065 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1510  4-oxalocrotonate decarboxylase  35.22 
 
 		 260 aa  135  9e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0971  2-oxo-hepta-3-ene-1,7-dioic acid hydratase  37.8 
 
 		 260 aa  135  9e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.829684  normal  0.0126306 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0965  2-oxo-hept-3-ene-1,7-dioate hydratase  36.43 
 
 		 267 aa  135  9e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3502  2-oxo-hepta-3-ene-1,7-dioic acid hydratase  33.99 
 
 		 267 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.328452  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4832  2-oxopent-4-enoate hydratase  40.08 
 
 		 279 aa  133  3e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0838304  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2077  2-oxopent-4-enoate hydratase  36.28 
 
 		 261 aa  133  3e-30  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.849096  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4271  2-oxo-hepta-3-ene-1,7-dioic acid hydratase  35.32 
 
 		 268 aa  132  3.9999999999999996e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.623769  normal  0.550033 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1777  4-oxalocrotonate decarboxylase  35.5 
 
 		 257 aa  132  5e-30  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4661  4-oxalocrotonate decarboxylase  36.33 
 
 		 261 aa  132  6e-30  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.930854  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4749  4-oxalocrotonate decarboxylase  36.33 
 
 		 261 aa  132  6e-30  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0856703  normal  0.088822 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2784  4-oxalocrotonate decarboxylase  35.48 
 
 		 262 aa  132  6e-30  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.965988  normal  0.191345 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0534  2-oxopent-4-enoate hydratase  41.55 
 
 		 267 aa  131  1.0000000000000001e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10590  2-oxo-hept-3-ene-1,7-dioate hydratase  35.97 
 
 		 267 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1149  2-oxopent-4-enoate hydratase  36.4 
 
 		 269 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.363401  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1639  4-oxalocrotonate decarboxylase  37.07 
 
 		 259 aa  130  2.0000000000000002e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.193054 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5207  2-keto-4-pentenoate hydratase  38.39 
 
 		 273 aa  130  2.0000000000000002e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.133138  normal  0.334182 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4144  4-oxalocrotonate decarboxylase  40.38 
 
 		 260 aa  130  2.0000000000000002e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.246439 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5436  4-oxalocrotonate decarboxylase  38.6 
 
 		 274 aa  130  3e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  normal  0.635895 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5833  4-oxalocrotonate decarboxylase  38.6 
 
 		 274 aa  130  3e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5044  4-oxalocrotonate decarboxylase  35.92 
 
 		 261 aa  129  4.0000000000000003e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1466  4-oxalocrotonate decarboxylase  38.49 
 
 		 273 aa  129  4.0000000000000003e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2961  4-oxalocrotonate decarboxylase  37.89 
 
 		 260 aa  129  5.0000000000000004e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.665549  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1189  2-hydroxypenta-2,4-dienoate hydratase (BphH)  40.28 
 
 		 264 aa  128  7.000000000000001e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.375643  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9115  2-oxopent-4-enoate hydratase  39.02 
 
 		 265 aa  128  9.000000000000001e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1392  4-oxalocrotonate decarboxylase  33.62 
 
 		 263 aa  127  1.0000000000000001e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0975696 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3129  2-oxo-hepta-3-ene-1,7-dioic acid hydratase  37.45 
 
 		 266 aa  127  1.0000000000000001e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.159572  normal  0.889794 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2578  4-oxalocrotonate decarboxylase  42.67 
 
 		 276 aa  128  1.0000000000000001e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3527  4-oxalocrotonate decarboxylase  39.47 
 
 		 265 aa  127  1.0000000000000001e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13569  hydratase  35.74 
 
 		 261 aa  127  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000748615 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3689  hydratase/decarboxylase  37.96 
 
 		 266 aa  127  2.0000000000000002e-28  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3088  2-oxo-hepta-3-ene-1,7-dioic acid hydratase  34.77 
 
 		 266 aa  127  2.0000000000000002e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.325663  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3798  2-oxopent-4-enoate hydratase  38.43 
 
 		 261 aa  127  2.0000000000000002e-28  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.138107  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5499  4-oxalocrotonate decarboxylase  35.56 
 
 		 274 aa  127  2.0000000000000002e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1476  2-oxo-hepta-3-ene-1,7-dioic acid hydratase  37.7 
 
 		 260 aa  127  2.0000000000000002e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.161964 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5236  4-oxalocrotonate decarboxylase  35.95 
 
 		 261 aa  126  3e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.270652 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0222  4-oxalocrotonate decarboxylase  35.68 
 
 		 262 aa  126  3e-28  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42150  2-hydroxypent-2,4-dienoate hydratase  38.12 
 
 		 261 aa  125  5e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.293913  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4313  2-oxo-hepta-3-ene-1,7-dioic acid hydratase  34.39 
 
 		 268 aa  125  7e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2405  4-oxalocrotonate decarboxylase  41.63 
 
 		 267 aa  124  1e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>