289 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_2405 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009767  Rcas_2405  4-oxalocrotonate decarboxylase  100 
 
 
267 aa  531  1e-150  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2578  4-oxalocrotonate decarboxylase  86.89 
 
 
276 aa  461  1e-129  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2039  4-oxalocrotonate decarboxylase  64.47 
 
 
273 aa  337  9e-92  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3091  2-oxopent-4-enoate hydratase  48.45 
 
 
260 aa  228  1e-58  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.42559  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2774  hydratase/decarboxylase  46.51 
 
 
260 aa  219  3.9999999999999997e-56  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.00000469641  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1510  4-oxalocrotonate decarboxylase  46.51 
 
 
260 aa  218  1e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1777  4-oxalocrotonate decarboxylase  50.62 
 
 
257 aa  217  1e-55  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3785  hydratase/decarboxylase  45.35 
 
 
260 aa  217  2e-55  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0026227  hitchhiker  0.00282888 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1459  4-oxalocrotonate decarboxylase  47.98 
 
 
260 aa  216  4e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.512129  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1621  2-oxopent-4-enoate hydratase  48.59 
 
 
264 aa  214  9.999999999999999e-55  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2118  4-oxalocrotonate decarboxylase  46.06 
 
 
271 aa  210  2e-53  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.609149  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2296  2-oxopent-4-enoate hydratase  48.35 
 
 
259 aa  207  1e-52  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2785  4-oxalocrotonate decarboxylase  44.74 
 
 
261 aa  207  2e-52  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.197083 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2077  2-oxopent-4-enoate hydratase  47.62 
 
 
261 aa  204  1e-51  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.849096  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3520  4-oxalocrotonate decarboxylase  45.38 
 
 
263 aa  203  2e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0986627 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5691  4-oxalocrotonate decarboxylase  45.97 
 
 
260 aa  202  4e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1149  2-oxopent-4-enoate hydratase  44.66 
 
 
269 aa  202  5e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.363401  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1392  4-oxalocrotonate decarboxylase  42.08 
 
 
263 aa  201  7e-51  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0975696 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0222  4-oxalocrotonate decarboxylase  48.45 
 
 
262 aa  201  8e-51  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4085  2-oxopent-4-enoate hydratase  45.8 
 
 
267 aa  201  9.999999999999999e-51  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000524317 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4620  2-oxopent-4-enoate hydratase  44.62 
 
 
260 aa  200  1.9999999999999998e-50  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.275598  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3544  2-oxopent-4-enoate hydratase  44.62 
 
 
260 aa  200  1.9999999999999998e-50  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.127016  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3343  2-oxopent-4-enoate hydratase  44.84 
 
 
260 aa  199  5e-50  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2961  4-oxalocrotonate decarboxylase  47.08 
 
 
260 aa  199  6e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.665549  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1321  hydratase/decarboxylase  44.4 
 
 
262 aa  197  1.0000000000000001e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0604012  normal  0.404919 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4537  4-oxalocrotonate decarboxylase  45.24 
 
 
262 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0272  4-oxalocrotonate decarboxylase  44.18 
 
 
262 aa  196  3e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30610  2-Hydroxypent-2,4-dienoate hydratase; LapE  44.32 
 
 
265 aa  193  3e-48  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.000960153  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4313  2-oxo-hepta-3-ene-1,7-dioic acid hydratase  44.15 
 
 
268 aa  192  4e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2460  4-oxalocrotonate decarboxylase  42.69 
 
 
260 aa  192  4e-48  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.768834  normal  0.296337 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4144  4-oxalocrotonate decarboxylase  44.79 
 
 
260 aa  192  4e-48  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.246439 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3689  hydratase/decarboxylase  44.4 
 
 
266 aa  190  2e-47  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1189  2-hydroxypenta-2,4-dienoate hydratase (BphH)  44.79 
 
 
264 aa  189  2.9999999999999997e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.375643  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2273  4-oxalocrotonate decarboxylase  43.02 
 
 
261 aa  189  5.999999999999999e-47  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4066  2-oxo-hepta-3-ene-1,7-dioic acid hydratase  44.66 
 
 
274 aa  188  8e-47  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.597772 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3242  hydratase/decarboxylase  46.43 
 
 
260 aa  188  1e-46  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000968427  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1064  2-oxo-hepta-3-ene-1,7-dioic acid hydratase  39.85 
 
 
267 aa  187  1e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04192  hypothetical protein  39.85 
 
 
273 aa  187  1e-46  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04226  2-oxo-hept-3-ene-1,7-dioate hydratase  39.85 
 
 
267 aa  187  2e-46  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01662  putative hydratase protein  46.22 
 
 
265 aa  187  2e-46  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.103932  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2011  4-oxalocrotonate decarboxylase  42.45 
 
 
260 aa  187  2e-46  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.781375  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4580  2-oxo-hepta-3-ene-1,7-dioic acid hydratase  39.85 
 
 
267 aa  187  2e-46  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3902  4-oxalocrotonate decarboxylase  46.64 
 
 
265 aa  187  2e-46  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.561065 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1982  2-keto-4-pentenoate hydratase  42.52 
 
 
264 aa  187  2e-46  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.572392 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3706  2-oxo-hepta-3-ene-1,7-dioic acid hydratase  39.85 
 
 
267 aa  187  2e-46  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.29388 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1200  2-oxo-hepta-3-ene-1,7-dioic acid hydratase  39.85 
 
 
267 aa  186  2e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.775184  normal  0.780949 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1169  2-oxo-hepta-3-ene-1,7-dioic acid hydratase  39.85 
 
 
267 aa  186  3e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.135295  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1215  2-oxo-hepta-3-ene-1,7-dioic acid hydratase  39.85 
 
 
267 aa  186  3e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.033694  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1180  2-oxo-hepta-3-ene-1,7-dioic acid hydratase  39.85 
 
 
267 aa  186  3e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.850117  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4271  2-oxo-hepta-3-ene-1,7-dioic acid hydratase  41.15 
 
 
268 aa  186  4e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.623769  normal  0.550033 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3527  4-oxalocrotonate decarboxylase  45.06 
 
 
265 aa  185  5e-46  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3502  2-oxo-hepta-3-ene-1,7-dioic acid hydratase  40.6 
 
 
267 aa  185  7e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.328452  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1466  4-oxalocrotonate decarboxylase  41.79 
 
 
273 aa  184  9e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5220  4-oxalocrotonate decarboxylase  42.57 
 
 
264 aa  184  1.0000000000000001e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1186  4-oxalocrotonate decarboxylase  42.63 
 
 
264 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0763202  normal  0.362959 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3854  hydratase/decarboxylase  42.52 
 
 
264 aa  183  2.0000000000000003e-45  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.595722  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4745  4-oxalocrotonate decarboxylase  44.27 
 
 
270 aa  183  3e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3325  4-oxalocrotonate decarboxylase  43.24 
 
 
266 aa  183  3e-45  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9115  2-oxopent-4-enoate hydratase  45.31 
 
 
265 aa  182  4.0000000000000006e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2033  putative 2-oxo-hept-3-ene-1,7-dioate hydratase(HpaH)  44.53 
 
 
267 aa  182  5.0000000000000004e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.25595  normal  0.0822961 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5829  2-oxo-hepta-3-ene-1,7-dioic acid hydratase  44.14 
 
 
267 aa  182  7e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.193631  normal  0.310568 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10590  2-oxo-hept-3-ene-1,7-dioate hydratase  41.35 
 
 
267 aa  181  9.000000000000001e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2884  4-oxalocrotonate decarboxylase  43.08 
 
 
288 aa  181  1e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42150  2-hydroxypent-2,4-dienoate hydratase  45.69 
 
 
261 aa  180  2e-44  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.293913  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2111  4-oxalocrotonate decarboxylase  42.86 
 
 
280 aa  180  2e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0965  2-oxo-hept-3-ene-1,7-dioate hydratase  41.6 
 
 
267 aa  179  4e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0224  2-oxopent-4-enoate hydratase  43.82 
 
 
264 aa  179  4e-44  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0261621  n/a   
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3885  2-oxo-hepta-3-ene-1,7-dioic acid hydratase  40.91 
 
 
271 aa  179  5.999999999999999e-44  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.294519  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1354  hydratase/decarboxylase  42.98 
 
 
262 aa  178  5.999999999999999e-44  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000612409  decreased coverage  0.00000118865 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0936  4-oxalocrotonate decarboxylase  43.44 
 
 
268 aa  179  5.999999999999999e-44  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.101712  normal  0.608159 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0911  4-oxalocrotonate decarboxylase  43.58 
 
 
277 aa  178  7e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.625128 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1627  2-oxo-hepta-3-ene-1,7-dioic acid hydratase  40.15 
 
 
267 aa  178  9e-44  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.72873 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0439  2-oxopent-4-enoate hydratase  47.62 
 
 
263 aa  177  1e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0138498 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1708  2-oxo-hepta-3-ene-1,7-dioic acid hydratase  44.62 
 
 
268 aa  177  1e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.899066  normal  0.363906 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0630  2-oxo-hepta-3-ene-1,7-dioic acid hydratase  40.15 
 
 
267 aa  177  2e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.337949  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4279  2-oxo-hepta-3-ene-1,7-dioic acid hydratase  44.09 
 
 
268 aa  176  4e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  decreased coverage  0.00917502  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0905  hydratase/decarboxylase  42.56 
 
 
263 aa  176  4e-43  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0436706  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1477  4-oxalocrotonate decarboxylase  41.67 
 
 
264 aa  176  4e-43  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1955  2-oxo-hepta-3-ene-1,7-dioic acid hydratase  41.27 
 
 
267 aa  176  4e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.504182  normal  0.0219036 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00304  2-keto-4-pentenoate hydratase  38.13 
 
 
269 aa  176  5e-43  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.503312  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00308  hypothetical protein  38.13 
 
 
269 aa  176  5e-43  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.527408  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0381  2-keto-4-pentenoate hydratase  38.13 
 
 
269 aa  176  5e-43  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.795138  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0534  2-oxopent-4-enoate hydratase  45.23 
 
 
267 aa  175  6e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0425  2-keto-4-pentenoate hydratase  38.96 
 
 
269 aa  175  7e-43  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2941  2-oxo-hepta-3-ene-1,7-dioate hydratase  43.14 
 
 
268 aa  175  7e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3256  4-oxalocrotonate decarboxylase  38.13 
 
 
269 aa  174  9e-43  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5928  hydratase/decarboxylase  38.72 
 
 
268 aa  175  9e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2875  4-oxalocrotonate decarboxylase  44.05 
 
 
268 aa  175  9e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0367853 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3275  2-keto-4-pentenoate hydratase  38.13 
 
 
269 aa  175  9e-43  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.235013  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4269  2-oxo-hepta-3-ene-1,7-dioic acid hydratase  42.51 
 
 
282 aa  175  9e-43  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.238552  normal  0.686193 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4832  2-oxopent-4-enoate hydratase  46.86 
 
 
279 aa  174  9.999999999999999e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0838304  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0374  2-keto-4-pentenoate hydratase  37.74 
 
 
269 aa  174  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.832182  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2327  putative 2-hydroxypenta-2,4-dienoate hydratase(MhpD)  40.23 
 
 
268 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3589  2-oxo-hepta-3-ene-1,7-dioic acid hydratase  44.22 
 
 
268 aa  174  1.9999999999999998e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.82541  normal  0.773607 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0414  2-keto-4-pentenoate hydratase  37.74 
 
 
269 aa  174  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2158  4-oxalocrotonate decarboxylase  38.96 
 
 
262 aa  173  2.9999999999999996e-42  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13569  hydratase  41.54 
 
 
261 aa  173  2.9999999999999996e-42  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000748615 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3512  4-oxalocrotonate decarboxylase  40.86 
 
 
269 aa  172  2.9999999999999996e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5499  4-oxalocrotonate decarboxylase  41.5 
 
 
274 aa  172  3.9999999999999995e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2360  2-oxo-hepta-3-ene-1,7-dioic acid hydratase  41.77 
 
 
267 aa  172  3.9999999999999995e-42  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>