258 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_0911 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_0911  4-oxalocrotonate decarboxylase  100 
 
 		 277 aa  555  1e-157  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.625128 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1477  4-oxalocrotonate decarboxylase  57.58 
 
 		 264 aa  296  3e-79  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3527  4-oxalocrotonate decarboxylase  59.23 
 
 		 265 aa  281  8.000000000000001e-75  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3854  hydratase/decarboxylase  57.59 
 
 		 264 aa  280  2e-74  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.595722  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5220  4-oxalocrotonate decarboxylase  51.71 
 
 		 264 aa  278  8e-74  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1466  4-oxalocrotonate decarboxylase  56.72 
 
 		 273 aa  273  2.0000000000000002e-72  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3902  4-oxalocrotonate decarboxylase  58.46 
 
 		 265 aa  270  2e-71  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.561065 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7646  4-oxalocrotonate decarboxylase  62.72 
 
 		 274 aa  269  4e-71  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.573554 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0905  hydratase/decarboxylase  57.98 
 
 		 263 aa  266  2.9999999999999995e-70  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0436706  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42150  2-hydroxypent-2,4-dienoate hydratase  59 
 
 		 261 aa  265  5e-70  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.293913  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1354  hydratase/decarboxylase  57.74 
 
 		 262 aa  263  2e-69  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000612409  decreased coverage  0.00000118865 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2884  4-oxalocrotonate decarboxylase  57.59 
 
 		 288 aa  264  2e-69  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1149  2-oxopent-4-enoate hydratase  50.75 
 
 		 269 aa  261  6.999999999999999e-69  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.363401  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5499  4-oxalocrotonate decarboxylase  53.65 
 
 		 274 aa  261  8.999999999999999e-69  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5207  2-keto-4-pentenoate hydratase  56.47 
 
 		 273 aa  260  1e-68  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.133138  normal  0.334182 
 
 
-
 
NC_003296  RS01662  putative hydratase protein  56.67 
 
 		 265 aa  259  3e-68  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.103932  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2011  4-oxalocrotonate decarboxylase  53.97 
 
 		 260 aa  255  6e-67  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.781375  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0272  4-oxalocrotonate decarboxylase  53.1 
 
 		 262 aa  253  3e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5134  hydratase/decarboxylase  53.1 
 
 		 263 aa  253  3e-66  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0285955 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2875  4-oxalocrotonate decarboxylase  54.3 
 
 		 268 aa  252  5.000000000000001e-66  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0367853 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4537  4-oxalocrotonate decarboxylase  53.18 
 
 		 262 aa  251  6e-66  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2111  4-oxalocrotonate decarboxylase  51.26 
 
 		 280 aa  251  6e-66  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1186  4-oxalocrotonate decarboxylase  53.94 
 
 		 264 aa  251  1e-65  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0763202  normal  0.362959 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3520  4-oxalocrotonate decarboxylase  53.15 
 
 		 263 aa  249  5e-65  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0986627 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9115  2-oxopent-4-enoate hydratase  52.51 
 
 		 265 aa  248  7e-65  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3512  4-oxalocrotonate decarboxylase  51.15 
 
 		 269 aa  247  2e-64  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0936  4-oxalocrotonate decarboxylase  51.7 
 
 		 268 aa  241  1e-62  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.101712  normal  0.608159 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3548  2-hydroxypenta-2,4-dienoate hydratase (CmtF)  50.79 
 
 		 262 aa  237  1e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.107167 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15110  2-keto-4-pentenoate hydratase  52.94 
 
 		 264 aa  236  3e-61  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.473426  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3242  hydratase/decarboxylase  50.84 
 
 		 260 aa  234  1.0000000000000001e-60  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000968427  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1639  4-oxalocrotonate decarboxylase  49.81 
 
 		 259 aa  231  1e-59  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.193054 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2890  4-oxalocrotonate decarboxylase  51.98 
 
 		 262 aa  230  2e-59  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.254961 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1982  2-keto-4-pentenoate hydratase  51.36 
 
 		 264 aa  229  4e-59  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.572392 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3275  2-keto-4-pentenoate hydratase  46.07 
 
 		 269 aa  226  4e-58  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.235013  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2327  putative 2-hydroxypenta-2,4-dienoate hydratase(MhpD)  49.05 
 
 		 268 aa  225  7e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0381  2-keto-4-pentenoate hydratase  46.07 
 
 		 269 aa  225  8e-58  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.795138  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3256  4-oxalocrotonate decarboxylase  45.69 
 
 		 269 aa  224  1e-57  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0374  2-keto-4-pentenoate hydratase  45.69 
 
 		 269 aa  223  3e-57  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.832182  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0414  2-keto-4-pentenoate hydratase  45.69 
 
 		 269 aa  223  3e-57  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00304  2-keto-4-pentenoate hydratase  45.32 
 
 		 269 aa  222  4.9999999999999996e-57  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.503312  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00308  hypothetical protein  45.32 
 
 		 269 aa  222  4.9999999999999996e-57  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.527408  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4925  4-oxalocrotonate decarboxylase  50.59 
 
 		 260 aa  219  3.9999999999999997e-56  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.624784  normal  1 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5436  4-oxalocrotonate decarboxylase  47.57 
 
 		 274 aa  218  7.999999999999999e-56  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  normal  0.635895 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5833  4-oxalocrotonate decarboxylase  47.57 
 
 		 274 aa  218  7.999999999999999e-56  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0425  2-keto-4-pentenoate hydratase  47.04 
 
 		 269 aa  218  1e-55  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2296  2-oxopent-4-enoate hydratase  47.04 
 
 		 259 aa  216  2.9999999999999998e-55  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3785  hydratase/decarboxylase  46.72 
 
 		 260 aa  214  9.999999999999999e-55  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0026227  hitchhiker  0.00282888 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4393  hydratase/decarboxylase  50.4 
 
 		 283 aa  214  9.999999999999999e-55  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2151  4-oxalocrotonate decarboxylase  46.24 
 
 		 271 aa  213  2.9999999999999995e-54  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2077  2-oxopent-4-enoate hydratase  47.66 
 
 		 261 aa  213  3.9999999999999995e-54  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.849096  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2774  hydratase/decarboxylase  46.46 
 
 		 260 aa  211  7e-54  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.00000469641  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4085  2-oxopent-4-enoate hydratase  44.15 
 
 		 267 aa  211  7e-54  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000524317 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3091  2-oxopent-4-enoate hydratase  46.88 
 
 		 260 aa  211  1e-53  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.42559  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2460  4-oxalocrotonate decarboxylase  47.37 
 
 		 260 aa  210  2e-53  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.768834  normal  0.296337 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4144  4-oxalocrotonate decarboxylase  47.1 
 
 		 260 aa  210  2e-53  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.246439 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1189  2-hydroxypenta-2,4-dienoate hydratase (BphH)  49.79 
 
 		 264 aa  207  1e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.375643  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2779  hydratase/decarboxylase  48.35 
 
 		 273 aa  207  2e-52  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.963348  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1321  hydratase/decarboxylase  46.38 
 
 		 262 aa  206  4e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0604012  normal  0.404919 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1392  4-oxalocrotonate decarboxylase  43.89 
 
 		 263 aa  206  5e-52  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0975696 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30610  2-Hydroxypent-2,4-dienoate hydratase; LapE  45.17 
 
 		 265 aa  205  6e-52  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.000960153  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2961  4-oxalocrotonate decarboxylase  48.59 
 
 		 260 aa  205  8e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.665549  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1621  2-oxopent-4-enoate hydratase  44.71 
 
 		 264 aa  202  4e-51  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3343  2-oxopent-4-enoate hydratase  45.31 
 
 		 260 aa  202  4e-51  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1510  4-oxalocrotonate decarboxylase  45.8 
 
 		 260 aa  201  9.999999999999999e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2785  4-oxalocrotonate decarboxylase  43.97 
 
 		 261 aa  199  5e-50  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.197083 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3544  2-oxopent-4-enoate hydratase  44.76 
 
 		 260 aa  199  6e-50  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.127016  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4620  2-oxopent-4-enoate hydratase  44.76 
 
 		 260 aa  199  6e-50  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.275598  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3325  4-oxalocrotonate decarboxylase  44.79 
 
 		 266 aa  197  1.0000000000000001e-49  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5691  4-oxalocrotonate decarboxylase  45.16 
 
 		 260 aa  197  1.0000000000000001e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0222  4-oxalocrotonate decarboxylase  47.88 
 
 		 262 aa  197  1.0000000000000001e-49  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1459  4-oxalocrotonate decarboxylase  46.5 
 
 		 260 aa  195  6e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.512129  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4745  4-oxalocrotonate decarboxylase  46.51 
 
 		 270 aa  195  7e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0534  2-oxopent-4-enoate hydratase  46.94 
 
 		 267 aa  194  1e-48  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2273  4-oxalocrotonate decarboxylase  44.94 
 
 		 261 aa  193  2e-48  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1651  4-oxalocrotonate decarboxylase  42.37 
 
 		 275 aa  194  2e-48  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.452701  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0224  2-oxopent-4-enoate hydratase  43.46 
 
 		 264 aa  188  1e-46  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0261621  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2118  4-oxalocrotonate decarboxylase  40.31 
 
 		 271 aa  186  3e-46  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.609149  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1777  4-oxalocrotonate decarboxylase  43.7 
 
 		 257 aa  184  1.0000000000000001e-45  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2578  4-oxalocrotonate decarboxylase  42.53 
 
 		 276 aa  181  1e-44  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1318  hydratase/decarboxylase  39.23 
 
 		 262 aa  179  2.9999999999999997e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.288999  normal  0.257061 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2299  4-oxalocrotonate decarboxylase  38.89 
 
 		 261 aa  179  4e-44  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2039  4-oxalocrotonate decarboxylase  40.91 
 
 		 273 aa  179  5.999999999999999e-44  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0225  4-oxalocrotonate decarboxylase  39.62 
 
 		 262 aa  178  1e-43  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30600  4-oxalocrotonate decarboxylase; LapH  38.72 
 
 		 267 aa  175  8e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.0000150281  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4313  2-oxo-hepta-3-ene-1,7-dioic acid hydratase  37.59 
 
 		 268 aa  174  1.9999999999999998e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3524  2-oxo-hepta-3-ene-1,7-dioic acid hydratase  39.77 
 
 		 261 aa  172  3.9999999999999995e-42  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2405  4-oxalocrotonate decarboxylase  43.58 
 
 		 267 aa  172  5.999999999999999e-42  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0439  2-oxopent-4-enoate hydratase  43.16 
 
 		 263 aa  171  1e-41  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0138498 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08670  4-oxo-4-pentenoate hydratase, XylJ  48.54 
 
 		 261 aa  171  1e-41  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2941  2-oxo-hepta-3-ene-1,7-dioate hydratase  39.63 
 
 		 268 aa  171  1e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3612  2-oxo-hepta-3-ene-1,7-dioic acid hydratase  38.61 
 
 		 261 aa  169  3e-41  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3781  hydratase/decarboxylase  38.31 
 
 		 262 aa  168  7e-41  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0303669  decreased coverage  0.000202677 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3589  2-oxo-hepta-3-ene-1,7-dioic acid hydratase  39.85 
 
 		 268 aa  168  8e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.82541  normal  0.773607 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2155  2-hydroxypenta-2,4-dienoate hydratase, putative  39.66 
 
 		 255 aa  167  1e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5928  hydratase/decarboxylase  35.96 
 
 		 268 aa  167  1e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4130  2-oxo-hepta-3-ene-1,7-dioic acid hydratase  36.6 
 
 		 267 aa  166  2.9999999999999998e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0570046  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4236  2-oxo-hepta-3-ene-1,7-dioic acid hydratase  36.6 
 
 		 267 aa  166  2.9999999999999998e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.119671  normal  0.0833029 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3281  2-oxo-hepta-3-ene-1,7-dioic acid hydratase  36.6 
 
 		 267 aa  166  2.9999999999999998e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0269586  normal  0.185525 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3090  4-oxalocrotonate decarboxylase  38.85 
 
 		 262 aa  166  5e-40  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3472  2-oxopent-4-enoate hydratase  38.71 
 
 		 260 aa  166  5e-40  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.102578  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>