283 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene B21_00308 on replicon NC_012892
Organism: Escherichia coli BL21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_00304  2-keto-4-pentenoate hydratase  100 
 
 
269 aa  552  1e-156  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.503312  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00308  hypothetical protein  100 
 
 
269 aa  552  1e-156  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.527408  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3256  4-oxalocrotonate decarboxylase  99.63 
 
 
269 aa  550  1e-155  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3275  2-keto-4-pentenoate hydratase  99.26 
 
 
269 aa  548  1e-155  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.235013  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0425  2-keto-4-pentenoate hydratase  99.26 
 
 
269 aa  548  1e-155  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0374  2-keto-4-pentenoate hydratase  99.26 
 
 
269 aa  548  1e-155  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.832182  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0414  2-keto-4-pentenoate hydratase  99.26 
 
 
269 aa  548  1e-155  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0381  2-keto-4-pentenoate hydratase  98.88 
 
 
269 aa  546  1e-154  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.795138  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15110  2-keto-4-pentenoate hydratase  71.37 
 
 
264 aa  386  1e-106  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.473426  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1982  2-keto-4-pentenoate hydratase  70 
 
 
264 aa  379  1e-104  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.572392 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1149  2-oxopent-4-enoate hydratase  57.85 
 
 
269 aa  302  4.0000000000000003e-81  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.363401  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0905  hydratase/decarboxylase  56.43 
 
 
263 aa  288  7e-77  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0436706  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1354  hydratase/decarboxylase  56.85 
 
 
262 aa  287  1e-76  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000612409  decreased coverage  0.00000118865 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4537  4-oxalocrotonate decarboxylase  55.25 
 
 
262 aa  284  8e-76  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5220  4-oxalocrotonate decarboxylase  52.49 
 
 
264 aa  282  5.000000000000001e-75  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0272  4-oxalocrotonate decarboxylase  54.15 
 
 
262 aa  278  8e-74  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1466  4-oxalocrotonate decarboxylase  53.46 
 
 
273 aa  276  3e-73  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0936  4-oxalocrotonate decarboxylase  52.87 
 
 
268 aa  276  4e-73  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.101712  normal  0.608159 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3520  4-oxalocrotonate decarboxylase  54.09 
 
 
263 aa  275  8e-73  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0986627 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2875  4-oxalocrotonate decarboxylase  53.94 
 
 
268 aa  273  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0367853 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3854  hydratase/decarboxylase  50.97 
 
 
264 aa  273  2.0000000000000002e-72  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.595722  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01662  putative hydratase protein  57.26 
 
 
265 aa  271  9e-72  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.103932  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1186  4-oxalocrotonate decarboxylase  51.53 
 
 
264 aa  269  2.9999999999999997e-71  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0763202  normal  0.362959 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2884  4-oxalocrotonate decarboxylase  52.73 
 
 
288 aa  269  2.9999999999999997e-71  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2011  4-oxalocrotonate decarboxylase  52.92 
 
 
260 aa  267  1e-70  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.781375  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9115  2-oxopent-4-enoate hydratase  54.9 
 
 
265 aa  265  7e-70  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5207  2-keto-4-pentenoate hydratase  53.18 
 
 
273 aa  265  7e-70  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.133138  normal  0.334182 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7646  4-oxalocrotonate decarboxylase  52.67 
 
 
274 aa  264  1e-69  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.573554 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2327  putative 2-hydroxypenta-2,4-dienoate hydratase(MhpD)  53.64 
 
 
268 aa  260  2e-68  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5134  hydratase/decarboxylase  51.17 
 
 
263 aa  256  2e-67  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.0285955 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5499  4-oxalocrotonate decarboxylase  50 
 
 
274 aa  256  3e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3548  2-hydroxypenta-2,4-dienoate hydratase (CmtF)  56.95 
 
 
262 aa  254  9e-67  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.107167 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42150  2-hydroxypent-2,4-dienoate hydratase  51.85 
 
 
261 aa  249  3e-65  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.293913  n/a   
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5436  4-oxalocrotonate decarboxylase  47.13 
 
 
274 aa  243  1.9999999999999999e-63  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  normal  0.635895 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5833  4-oxalocrotonate decarboxylase  47.13 
 
 
274 aa  243  1.9999999999999999e-63  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2111  4-oxalocrotonate decarboxylase  47.89 
 
 
280 aa  239  2.9999999999999997e-62  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3242  hydratase/decarboxylase  48.93 
 
 
260 aa  236  2e-61  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000968427  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1477  4-oxalocrotonate decarboxylase  46.36 
 
 
264 aa  236  3e-61  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2890  4-oxalocrotonate decarboxylase  53.01 
 
 
262 aa  233  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.254961 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1639  4-oxalocrotonate decarboxylase  48.02 
 
 
259 aa  233  3e-60  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.193054 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3512  4-oxalocrotonate decarboxylase  47.27 
 
 
269 aa  231  1e-59  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2151  4-oxalocrotonate decarboxylase  49.41 
 
 
271 aa  231  1e-59  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2779  hydratase/decarboxylase  50.2 
 
 
273 aa  226  3e-58  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.963348  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4745  4-oxalocrotonate decarboxylase  46.92 
 
 
270 aa  225  7e-58  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4925  4-oxalocrotonate decarboxylase  50.2 
 
 
260 aa  224  2e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.624784  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3902  4-oxalocrotonate decarboxylase  46.88 
 
 
265 aa  222  4.9999999999999996e-57  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.561065 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0911  4-oxalocrotonate decarboxylase  45.32 
 
 
277 aa  222  4.9999999999999996e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.625128 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1651  4-oxalocrotonate decarboxylase  47.83 
 
 
275 aa  222  4.9999999999999996e-57  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.452701  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3527  4-oxalocrotonate decarboxylase  46.09 
 
 
265 aa  221  9.999999999999999e-57  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1510  4-oxalocrotonate decarboxylase  44.66 
 
 
260 aa  213  2.9999999999999995e-54  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4393  hydratase/decarboxylase  45.97 
 
 
283 aa  208  6e-53  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3785  hydratase/decarboxylase  42.31 
 
 
260 aa  208  9e-53  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0026227  hitchhiker  0.00282888 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4085  2-oxopent-4-enoate hydratase  42.7 
 
 
267 aa  204  2e-51  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000524317 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2077  2-oxopent-4-enoate hydratase  43.08 
 
 
261 aa  204  2e-51  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.849096  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2118  4-oxalocrotonate decarboxylase  40.87 
 
 
271 aa  202  5e-51  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.609149  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1321  hydratase/decarboxylase  40.93 
 
 
262 aa  202  7e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0604012  normal  0.404919 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2774  hydratase/decarboxylase  41.31 
 
 
260 aa  200  1.9999999999999998e-50  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.00000469641  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2460  4-oxalocrotonate decarboxylase  40.93 
 
 
260 aa  200  1.9999999999999998e-50  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.768834  normal  0.296337 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13569  hydratase  42.75 
 
 
261 aa  199  3e-50  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000748615 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2296  2-oxopent-4-enoate hydratase  41.9 
 
 
259 aa  199  3.9999999999999996e-50  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1392  4-oxalocrotonate decarboxylase  40.38 
 
 
263 aa  197  1.0000000000000001e-49  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0975696 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1459  4-oxalocrotonate decarboxylase  42.08 
 
 
260 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.512129  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3091  2-oxopent-4-enoate hydratase  40.93 
 
 
260 aa  196  5.000000000000001e-49  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.42559  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1621  2-oxopent-4-enoate hydratase  42 
 
 
264 aa  194  1e-48  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3343  2-oxopent-4-enoate hydratase  38.93 
 
 
260 aa  192  4e-48  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2961  4-oxalocrotonate decarboxylase  41.54 
 
 
260 aa  192  7e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.665549  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3544  2-oxopent-4-enoate hydratase  41.25 
 
 
260 aa  192  7e-48  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.127016  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4620  2-oxopent-4-enoate hydratase  41.25 
 
 
260 aa  192  7e-48  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.275598  normal 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4144  4-oxalocrotonate decarboxylase  40.54 
 
 
260 aa  191  8e-48  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.246439 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3325  4-oxalocrotonate decarboxylase  40.93 
 
 
266 aa  191  9e-48  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2273  4-oxalocrotonate decarboxylase  39.69 
 
 
261 aa  189  4e-47  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0909  2-oxopent-4-enoate hydratase  39.53 
 
 
262 aa  186  2e-46  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3472  2-oxopent-4-enoate hydratase  41.54 
 
 
260 aa  187  2e-46  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.102578  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5691  4-oxalocrotonate decarboxylase  39.75 
 
 
260 aa  186  3e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2785  4-oxalocrotonate decarboxylase  38.17 
 
 
261 aa  185  6e-46  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.197083 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1189  2-hydroxypenta-2,4-dienoate hydratase (BphH)  39.77 
 
 
264 aa  182  4.0000000000000006e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.375643  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4661  4-oxalocrotonate decarboxylase  38.61 
 
 
261 aa  181  1e-44  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.930854  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4749  4-oxalocrotonate decarboxylase  38.61 
 
 
261 aa  181  1e-44  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0856703  normal  0.088822 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0222  4-oxalocrotonate decarboxylase  41.31 
 
 
262 aa  180  2e-44  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5236  4-oxalocrotonate decarboxylase  39.62 
 
 
261 aa  180  2.9999999999999997e-44  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.270652 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5044  4-oxalocrotonate decarboxylase  38.22 
 
 
261 aa  178  8e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2578  4-oxalocrotonate decarboxylase  40.08 
 
 
276 aa  176  4e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1520  4-oxalocrotonate decarboxylase  38.34 
 
 
261 aa  175  6e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2039  4-oxalocrotonate decarboxylase  38.64 
 
 
273 aa  175  7e-43  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30610  2-Hydroxypent-2,4-dienoate hydratase; LapE  41.7 
 
 
265 aa  175  8e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.000960153  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1777  4-oxalocrotonate decarboxylase  40.27 
 
 
257 aa  174  9.999999999999999e-43  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2155  2-hydroxypenta-2,4-dienoate hydratase, putative  39.37 
 
 
255 aa  173  2.9999999999999996e-42  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0534  2-oxopent-4-enoate hydratase  40.3 
 
 
267 aa  173  2.9999999999999996e-42  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3689  hydratase/decarboxylase  42.73 
 
 
266 aa  171  1e-41  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0224  2-oxopent-4-enoate hydratase  42.63 
 
 
264 aa  169  5e-41  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0261621  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0439  2-oxopent-4-enoate hydratase  39.83 
 
 
263 aa  167  1e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0138498 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4209  4-oxalocrotonate decarboxylase  40 
 
 
264 aa  168  1e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2405  4-oxalocrotonate decarboxylase  38.13 
 
 
267 aa  166  4e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4271  2-oxo-hepta-3-ene-1,7-dioic acid hydratase  35.88 
 
 
268 aa  161  8.000000000000001e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.623769  normal  0.550033 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3502  2-oxo-hepta-3-ene-1,7-dioic acid hydratase  36.64 
 
 
267 aa  158  1e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.328452  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2158  4-oxalocrotonate decarboxylase  34.53 
 
 
262 aa  157  2e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4066  2-oxo-hepta-3-ene-1,7-dioic acid hydratase  36 
 
 
274 aa  157  2e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.597772 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2456  2-oxo-hepta-3-ene-1,7-dioic acid hydratase  33.58 
 
 
267 aa  154  1e-36  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.228011  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2360  2-oxo-hepta-3-ene-1,7-dioic acid hydratase  33.58 
 
 
267 aa  154  1e-36  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1643  2-oxo-hept-3-ene-1,7-dioate hydratase  33.58 
 
 
267 aa  154  1e-36  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>