273 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cagg_2039 on replicon NC_011831
Organism: Chloroflexus aggregans DSM 9485



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011831  Cagg_2039  4-oxalocrotonate decarboxylase  100 
 
 
273 aa  547  1e-155  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2578  4-oxalocrotonate decarboxylase  66.3 
 
 
276 aa  353  1e-96  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2405  4-oxalocrotonate decarboxylase  64.47 
 
 
267 aa  332  4e-90  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1621  2-oxopent-4-enoate hydratase  47.3 
 
 
264 aa  209  3e-53  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1510  4-oxalocrotonate decarboxylase  44.4 
 
 
260 aa  206  4e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3785  hydratase/decarboxylase  43.77 
 
 
260 aa  205  6e-52  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0026227  hitchhiker  0.00282888 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3091  2-oxopent-4-enoate hydratase  43.94 
 
 
260 aa  205  6e-52  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.42559  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1777  4-oxalocrotonate decarboxylase  49.38 
 
 
257 aa  205  8e-52  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1392  4-oxalocrotonate decarboxylase  42.31 
 
 
263 aa  201  9.999999999999999e-51  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0975696 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2774  hydratase/decarboxylase  42.53 
 
 
260 aa  200  3e-50  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.00000469641  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1459  4-oxalocrotonate decarboxylase  43.92 
 
 
260 aa  196  3e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.512129  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1149  2-oxopent-4-enoate hydratase  43.9 
 
 
269 aa  196  5.000000000000001e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.363401  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1321  hydratase/decarboxylase  43.19 
 
 
262 aa  194  1e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0604012  normal  0.404919 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2961  4-oxalocrotonate decarboxylase  45.74 
 
 
260 aa  194  2e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.665549  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4085  2-oxopent-4-enoate hydratase  44.15 
 
 
267 aa  193  2e-48  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000524317 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2077  2-oxopent-4-enoate hydratase  42.91 
 
 
261 aa  192  7e-48  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.849096  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2118  4-oxalocrotonate decarboxylase  41.44 
 
 
271 aa  191  8e-48  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.609149  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1982  2-keto-4-pentenoate hydratase  41.73 
 
 
264 aa  191  1e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.572392 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2460  4-oxalocrotonate decarboxylase  41.7 
 
 
260 aa  191  1e-47  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.768834  normal  0.296337 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2296  2-oxopent-4-enoate hydratase  44.77 
 
 
259 aa  190  2e-47  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30610  2-Hydroxypent-2,4-dienoate hydratase; LapE  41.09 
 
 
265 aa  187  1e-46  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.000960153  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4745  4-oxalocrotonate decarboxylase  41.79 
 
 
270 aa  188  1e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2785  4-oxalocrotonate decarboxylase  40.38 
 
 
261 aa  186  5e-46  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.197083 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0936  4-oxalocrotonate decarboxylase  41.98 
 
 
268 aa  182  4.0000000000000006e-45  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.101712  normal  0.608159 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3520  4-oxalocrotonate decarboxylase  47.06 
 
 
263 aa  182  4.0000000000000006e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0986627 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3242  hydratase/decarboxylase  41.84 
 
 
260 aa  182  6e-45  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000968427  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0272  4-oxalocrotonate decarboxylase  40.56 
 
 
262 aa  182  6e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4537  4-oxalocrotonate decarboxylase  42.4 
 
 
262 aa  182  7e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3689  hydratase/decarboxylase  42.26 
 
 
266 aa  181  9.000000000000001e-45  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3343  2-oxopent-4-enoate hydratase  40.31 
 
 
260 aa  181  1e-44  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0911  4-oxalocrotonate decarboxylase  40.91 
 
 
277 aa  180  2e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.625128 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1189  2-hydroxypenta-2,4-dienoate hydratase (BphH)  42.8 
 
 
264 aa  180  2e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.375643  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3275  2-keto-4-pentenoate hydratase  39.02 
 
 
269 aa  179  2.9999999999999997e-44  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.235013  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0425  2-keto-4-pentenoate hydratase  40 
 
 
269 aa  179  2.9999999999999997e-44  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0381  2-keto-4-pentenoate hydratase  39.02 
 
 
269 aa  180  2.9999999999999997e-44  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.795138  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3325  4-oxalocrotonate decarboxylase  40.61 
 
 
266 aa  180  2.9999999999999997e-44  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2111  4-oxalocrotonate decarboxylase  43.53 
 
 
280 aa  179  4e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0222  4-oxalocrotonate decarboxylase  44.66 
 
 
262 aa  179  4.999999999999999e-44  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00304  2-keto-4-pentenoate hydratase  38.64 
 
 
269 aa  178  7e-44  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.503312  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0374  2-keto-4-pentenoate hydratase  38.64 
 
 
269 aa  178  7e-44  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.832182  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0414  2-keto-4-pentenoate hydratase  38.64 
 
 
269 aa  178  7e-44  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00308  hypothetical protein  38.64 
 
 
269 aa  178  7e-44  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.527408  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4144  4-oxalocrotonate decarboxylase  43.51 
 
 
260 aa  178  7e-44  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.246439 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3256  4-oxalocrotonate decarboxylase  38.64 
 
 
269 aa  178  9e-44  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9115  2-oxopent-4-enoate hydratase  43.02 
 
 
265 aa  177  2e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2011  4-oxalocrotonate decarboxylase  42.51 
 
 
260 aa  176  4e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.781375  normal 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3854  hydratase/decarboxylase  40.62 
 
 
264 aa  175  9e-43  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.595722  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1520  4-oxalocrotonate decarboxylase  42.64 
 
 
261 aa  174  9.999999999999999e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4661  4-oxalocrotonate decarboxylase  41.51 
 
 
261 aa  174  9.999999999999999e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.930854  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4749  4-oxalocrotonate decarboxylase  41.51 
 
 
261 aa  174  9.999999999999999e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0856703  normal  0.088822 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5044  4-oxalocrotonate decarboxylase  41.89 
 
 
261 aa  174  9.999999999999999e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5691  4-oxalocrotonate decarboxylase  40.24 
 
 
260 aa  173  1.9999999999999998e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2273  4-oxalocrotonate decarboxylase  40.24 
 
 
261 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4620  2-oxopent-4-enoate hydratase  38.8 
 
 
260 aa  174  1.9999999999999998e-42  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.275598  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3544  2-oxopent-4-enoate hydratase  38.8 
 
 
260 aa  174  1.9999999999999998e-42  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.127016  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3902  4-oxalocrotonate decarboxylase  45.22 
 
 
265 aa  173  1.9999999999999998e-42  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.561065 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5236  4-oxalocrotonate decarboxylase  42.35 
 
 
261 aa  174  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.270652 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5436  4-oxalocrotonate decarboxylase  40.15 
 
 
274 aa  172  3.9999999999999995e-42  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  normal  0.635895 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13569  hydratase  40.77 
 
 
261 aa  172  3.9999999999999995e-42  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000748615 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5833  4-oxalocrotonate decarboxylase  40.15 
 
 
274 aa  172  3.9999999999999995e-42  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2875  4-oxalocrotonate decarboxylase  43.33 
 
 
268 aa  172  6.999999999999999e-42  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0367853 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42150  2-hydroxypent-2,4-dienoate hydratase  42.74 
 
 
261 aa  171  7.999999999999999e-42  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.293913  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3472  2-oxopent-4-enoate hydratase  41.29 
 
 
260 aa  171  2e-41  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.102578  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3527  4-oxalocrotonate decarboxylase  46.15 
 
 
265 aa  169  4e-41  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5499  4-oxalocrotonate decarboxylase  44.2 
 
 
274 aa  169  5e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2779  hydratase/decarboxylase  40 
 
 
273 aa  169  6e-41  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.963348  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4393  hydratase/decarboxylase  41.56 
 
 
283 aa  168  9e-41  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5220  4-oxalocrotonate decarboxylase  39.92 
 
 
264 aa  167  1e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1477  4-oxalocrotonate decarboxylase  45.21 
 
 
264 aa  168  1e-40  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1466  4-oxalocrotonate decarboxylase  39.33 
 
 
273 aa  168  1e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS01662  putative hydratase protein  41.45 
 
 
265 aa  167  2e-40  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.103932  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7646  4-oxalocrotonate decarboxylase  43.81 
 
 
274 aa  167  2e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.573554 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2327  putative 2-hydroxypenta-2,4-dienoate hydratase(MhpD)  40.08 
 
 
268 aa  167  2e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3512  4-oxalocrotonate decarboxylase  38.55 
 
 
269 aa  166  2.9999999999999998e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0905  hydratase/decarboxylase  41.91 
 
 
263 aa  166  4e-40  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0436706  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4271  2-oxo-hepta-3-ene-1,7-dioic acid hydratase  38.43 
 
 
268 aa  166  4e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.623769  normal  0.550033 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15110  2-keto-4-pentenoate hydratase  38.4 
 
 
264 aa  166  5e-40  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.473426  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4269  2-oxo-hepta-3-ene-1,7-dioic acid hydratase  41.11 
 
 
282 aa  165  8e-40  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.238552  normal  0.686193 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3885  2-oxo-hepta-3-ene-1,7-dioic acid hydratase  36.86 
 
 
271 aa  165  9e-40  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.294519  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5134  hydratase/decarboxylase  40 
 
 
263 aa  165  9e-40  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.0285955 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1354  hydratase/decarboxylase  42.08 
 
 
262 aa  164  1.0000000000000001e-39  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000612409  decreased coverage  0.00000118865 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4832  2-oxopent-4-enoate hydratase  48.1 
 
 
279 aa  164  1.0000000000000001e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0838304  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5207  2-keto-4-pentenoate hydratase  43.17 
 
 
273 aa  163  2.0000000000000002e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.133138  normal  0.334182 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1955  2-oxo-hepta-3-ene-1,7-dioic acid hydratase  40.16 
 
 
267 aa  163  2.0000000000000002e-39  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.504182  normal  0.0219036 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1186  4-oxalocrotonate decarboxylase  38.15 
 
 
264 aa  163  3e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0763202  normal  0.362959 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2151  4-oxalocrotonate decarboxylase  37.27 
 
 
271 aa  163  3e-39  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0439  2-oxopent-4-enoate hydratase  42.98 
 
 
263 aa  162  5.0000000000000005e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0138498 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2155  2-hydroxypenta-2,4-dienoate hydratase, putative  42.44 
 
 
255 aa  162  6e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0101  2-oxo-hepta-3-ene-1,7-dioic acid hydratase  37.09 
 
 
277 aa  161  8.000000000000001e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4313  2-oxo-hepta-3-ene-1,7-dioic acid hydratase  38.87 
 
 
268 aa  161  1e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2884  4-oxalocrotonate decarboxylase  41.48 
 
 
288 aa  161  1e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1627  2-oxo-hepta-3-ene-1,7-dioic acid hydratase  39.2 
 
 
267 aa  161  1e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.72873 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1639  4-oxalocrotonate decarboxylase  43.88 
 
 
259 aa  160  3e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.193054 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4132  2-oxo-hepta-3-ene-1,7-dioic acid hydratase  40 
 
 
267 aa  159  4e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.138195  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1651  4-oxalocrotonate decarboxylase  38.43 
 
 
275 aa  159  4e-38  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.452701  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04226  2-oxo-hept-3-ene-1,7-dioate hydratase  38.29 
 
 
267 aa  159  6e-38  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4580  2-oxo-hepta-3-ene-1,7-dioic acid hydratase  38.29 
 
 
267 aa  159  6e-38  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04192  hypothetical protein  37.59 
 
 
273 aa  159  6e-38  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4369  2-oxo-hepta-3-ene-1,7-dioic acid hydratase  40.39 
 
 
267 aa  159  6e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.455554  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3706  2-oxo-hepta-3-ene-1,7-dioic acid hydratase  38.29 
 
 
267 aa  159  6e-38  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.29388 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>