268 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_5207 on replicon NC_007974
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007974  Rmet_5207  2-keto-4-pentenoate hydratase  100 
 
 		 273 aa  546  1e-154  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.133138  normal  0.334182 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5499  4-oxalocrotonate decarboxylase  80.29 
 
 		 274 aa  438  9.999999999999999e-123  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7646  4-oxalocrotonate decarboxylase  73.54 
 
 		 274 aa  369  1e-101  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.573554 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1466  4-oxalocrotonate decarboxylase  72.87 
 
 		 273 aa  362  4e-99  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2875  4-oxalocrotonate decarboxylase  64.73 
 
 		 268 aa  314  9.999999999999999e-85  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0367853 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5134  hydratase/decarboxylase  62.79 
 
 		 263 aa  313  1.9999999999999998e-84  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0285955 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0272  4-oxalocrotonate decarboxylase  59.7 
 
 		 262 aa  306  2.0000000000000002e-82  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1477  4-oxalocrotonate decarboxylase  60.75 
 
 		 264 aa  304  8.000000000000001e-82  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5220  4-oxalocrotonate decarboxylase  60.23 
 
 		 264 aa  303  2.0000000000000002e-81  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2011  4-oxalocrotonate decarboxylase  60 
 
 		 260 aa  303  3.0000000000000004e-81  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.781375  normal  1 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3854  hydratase/decarboxylase  60.38 
 
 		 264 aa  301  6.000000000000001e-81  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.595722  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3520  4-oxalocrotonate decarboxylase  61.83 
 
 		 263 aa  301  7.000000000000001e-81  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0986627 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9115  2-oxopent-4-enoate hydratase  62.6 
 
 		 265 aa  301  8.000000000000001e-81  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01662  putative hydratase protein  64.63 
 
 		 265 aa  300  1e-80  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.103932  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2884  4-oxalocrotonate decarboxylase  61.15 
 
 		 288 aa  295  6e-79  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1354  hydratase/decarboxylase  62.6 
 
 		 262 aa  293  2e-78  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000612409  decreased coverage  0.00000118865 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1982  2-keto-4-pentenoate hydratase  60.38 
 
 		 264 aa  293  2e-78  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.572392 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0905  hydratase/decarboxylase  61.79 
 
 		 263 aa  292  4e-78  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0436706  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3548  2-hydroxypenta-2,4-dienoate hydratase (CmtF)  58.91 
 
 		 262 aa  292  5e-78  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.107167 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2327  putative 2-hydroxypenta-2,4-dienoate hydratase(MhpD)  60.23 
 
 		 268 aa  283  2.0000000000000002e-75  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15110  2-keto-4-pentenoate hydratase  58.02 
 
 		 264 aa  280  2e-74  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.473426  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4537  4-oxalocrotonate decarboxylase  57.98 
 
 		 262 aa  278  5e-74  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0936  4-oxalocrotonate decarboxylase  57.47 
 
 		 268 aa  276  3e-73  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.101712  normal  0.608159 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2890  4-oxalocrotonate decarboxylase  59.53 
 
 		 262 aa  276  4e-73  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.254961 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0381  2-keto-4-pentenoate hydratase  54.31 
 
 		 269 aa  274  1.0000000000000001e-72  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.795138  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1149  2-oxopent-4-enoate hydratase  54.62 
 
 		 269 aa  274  1.0000000000000001e-72  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.363401  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3275  2-keto-4-pentenoate hydratase  54.31 
 
 		 269 aa  273  2.0000000000000002e-72  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.235013  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3256  4-oxalocrotonate decarboxylase  53.93 
 
 		 269 aa  272  6e-72  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00304  2-keto-4-pentenoate hydratase  53.56 
 
 		 269 aa  270  2e-71  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.503312  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0374  2-keto-4-pentenoate hydratase  53.56 
 
 		 269 aa  270  2e-71  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.832182  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0414  2-keto-4-pentenoate hydratase  53.56 
 
 		 269 aa  270  2e-71  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00308  hypothetical protein  53.56 
 
 		 269 aa  270  2e-71  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.527408  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3902  4-oxalocrotonate decarboxylase  56.64 
 
 		 265 aa  264  1e-69  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.561065 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1186  4-oxalocrotonate decarboxylase  53.96 
 
 		 264 aa  263  2e-69  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0763202  normal  0.362959 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0425  2-keto-4-pentenoate hydratase  54.05 
 
 		 269 aa  263  3e-69  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42150  2-hydroxypent-2,4-dienoate hydratase  55.24 
 
 		 261 aa  262  4e-69  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.293913  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0911  4-oxalocrotonate decarboxylase  56.47 
 
 		 277 aa  261  6e-69  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.625128 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3527  4-oxalocrotonate decarboxylase  56.64 
 
 		 265 aa  261  6e-69  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5436  4-oxalocrotonate decarboxylase  50.93 
 
 		 274 aa  242  6e-63  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  normal  0.635895 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5833  4-oxalocrotonate decarboxylase  50.93 
 
 		 274 aa  242  6e-63  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2111  4-oxalocrotonate decarboxylase  51.3 
 
 		 280 aa  241  1e-62  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1651  4-oxalocrotonate decarboxylase  52.53 
 
 		 275 aa  238  6.999999999999999e-62  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.452701  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3512  4-oxalocrotonate decarboxylase  52.96 
 
 		 269 aa  238  1e-61  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2151  4-oxalocrotonate decarboxylase  50.39 
 
 		 271 aa  232  5e-60  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3242  hydratase/decarboxylase  53.78 
 
 		 260 aa  225  6e-58  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000968427  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1639  4-oxalocrotonate decarboxylase  54.46 
 
 		 259 aa  223  2e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.193054 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2296  2-oxopent-4-enoate hydratase  50.9 
 
 		 259 aa  222  4.9999999999999996e-57  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4925  4-oxalocrotonate decarboxylase  49.24 
 
 		 260 aa  218  1e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.624784  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2774  hydratase/decarboxylase  46.04 
 
 		 260 aa  216  2.9999999999999998e-55  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.00000469641  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3785  hydratase/decarboxylase  43.61 
 
 		 260 aa  216  2.9999999999999998e-55  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0026227  hitchhiker  0.00282888 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1321  hydratase/decarboxylase  48.43 
 
 		 262 aa  216  2.9999999999999998e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0604012  normal  0.404919 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4085  2-oxopent-4-enoate hydratase  45.35 
 
 		 267 aa  215  7e-55  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000524317 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2779  hydratase/decarboxylase  50.19 
 
 		 273 aa  213  1.9999999999999998e-54  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.963348  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4393  hydratase/decarboxylase  48.83 
 
 		 283 aa  213  1.9999999999999998e-54  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4745  4-oxalocrotonate decarboxylase  48.63 
 
 		 270 aa  213  2.9999999999999995e-54  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2077  2-oxopent-4-enoate hydratase  44.36 
 
 		 261 aa  208  6e-53  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.849096  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5691  4-oxalocrotonate decarboxylase  48.65 
 
 		 260 aa  208  8e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30610  2-Hydroxypent-2,4-dienoate hydratase; LapE  43.66 
 
 		 265 aa  207  2e-52  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.000960153  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3091  2-oxopent-4-enoate hydratase  48.2 
 
 		 260 aa  206  3e-52  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.42559  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3325  4-oxalocrotonate decarboxylase  48.43 
 
 		 266 aa  206  4e-52  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1621  2-oxopent-4-enoate hydratase  43.85 
 
 		 264 aa  204  2e-51  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3343  2-oxopent-4-enoate hydratase  47.3 
 
 		 260 aa  203  2e-51  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2460  4-oxalocrotonate decarboxylase  49.1 
 
 		 260 aa  202  3e-51  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.768834  normal  0.296337 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1510  4-oxalocrotonate decarboxylase  44.62 
 
 		 260 aa  201  9e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4144  4-oxalocrotonate decarboxylase  49.33 
 
 		 260 aa  201  9.999999999999999e-51  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.246439 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2961  4-oxalocrotonate decarboxylase  50 
 
 		 260 aa  199  3.9999999999999996e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.665549  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1189  2-hydroxypenta-2,4-dienoate hydratase (BphH)  48.43 
 
 		 264 aa  199  3.9999999999999996e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.375643  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3544  2-oxopent-4-enoate hydratase  46.4 
 
 		 260 aa  199  5e-50  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.127016  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4620  2-oxopent-4-enoate hydratase  46.4 
 
 		 260 aa  199  5e-50  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.275598  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0534  2-oxopent-4-enoate hydratase  47.67 
 
 		 267 aa  193  2e-48  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2785  4-oxalocrotonate decarboxylase  41.95 
 
 		 261 aa  194  2e-48  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.197083 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2273  4-oxalocrotonate decarboxylase  45.95 
 
 		 261 aa  193  3e-48  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1392  4-oxalocrotonate decarboxylase  45.29 
 
 		 263 aa  189  4e-47  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0975696 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1777  4-oxalocrotonate decarboxylase  46.85 
 
 		 257 aa  187  1e-46  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1459  4-oxalocrotonate decarboxylase  45.95 
 
 		 260 aa  186  4e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.512129  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0222  4-oxalocrotonate decarboxylase  44.53 
 
 		 262 aa  181  1e-44  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2118  4-oxalocrotonate decarboxylase  39.92 
 
 		 271 aa  179  2.9999999999999997e-44  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.609149  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08670  4-oxo-4-pentenoate hydratase, XylJ  46.37 
 
 		 261 aa  177  1e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0224  2-oxopent-4-enoate hydratase  42.52 
 
 		 264 aa  177  2e-43  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0261621  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2578  4-oxalocrotonate decarboxylase  41.42 
 
 		 276 aa  177  2e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0439  2-oxopent-4-enoate hydratase  45.25 
 
 		 263 aa  176  3e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0138498 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3798  2-oxopent-4-enoate hydratase  45 
 
 		 261 aa  172  5.999999999999999e-42  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.138107  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4209  4-oxalocrotonate decarboxylase  43.02 
 
 		 264 aa  171  2e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4661  4-oxalocrotonate decarboxylase  42.15 
 
 		 261 aa  170  2e-41  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.930854  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4749  4-oxalocrotonate decarboxylase  42.15 
 
 		 261 aa  170  2e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0856703  normal  0.088822 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5044  4-oxalocrotonate decarboxylase  42.15 
 
 		 261 aa  168  9e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0909  2-oxopent-4-enoate hydratase  40.54 
 
 		 262 aa  167  1e-40  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2158  4-oxalocrotonate decarboxylase  38.07 
 
 		 262 aa  166  2.9999999999999998e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3689  hydratase/decarboxylase  43.17 
 
 		 266 aa  166  4e-40  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2155  2-hydroxypenta-2,4-dienoate hydratase, putative  39.92 
 
 		 255 aa  166  5e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3472  2-oxopent-4-enoate hydratase  39 
 
 		 260 aa  166  5e-40  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.102578  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1520  4-oxalocrotonate decarboxylase  42.6 
 
 		 261 aa  165  6.9999999999999995e-40  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2299  4-oxalocrotonate decarboxylase  40.64 
 
 		 261 aa  162  4.0000000000000004e-39  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2039  4-oxalocrotonate decarboxylase  42.74 
 
 		 273 aa  162  6e-39  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13569  hydratase  40.81 
 
 		 261 aa  162  7e-39  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000748615 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5236  4-oxalocrotonate decarboxylase  41.26 
 
 		 261 aa  162  7e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.270652 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2405  4-oxalocrotonate decarboxylase  41.54 
 
 		 267 aa  161  8.000000000000001e-39  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3612  2-oxo-hepta-3-ene-1,7-dioic acid hydratase  37.83 
 
 		 261 aa  159  3e-38  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3781  hydratase/decarboxylase  42.34 
 
 		 262 aa  159  6e-38  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0303669  decreased coverage  0.000202677 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0225  4-oxalocrotonate decarboxylase  40.99 
 
 		 262 aa  158  9e-38  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>