77 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_3044 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008048  Sala_3044  2-keto-4-pentenoate hydratase, putative  100 
 
 		 260 aa  522  1e-147  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.111412 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3511  2-keto-4-pentenoate hydratase-like protein  51.56 
 
 		 269 aa  245  4e-64  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0237  2-keto-4-pentenoate hydratase-like protein  40.84 
 
 		 311 aa  197  2.0000000000000003e-49  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1767  2-keto-4-pentenoate hydratase, putative  36.86 
 
 		 271 aa  152  4e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.306467 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0742  2-keto-4-pentenoate hydratase-like protein  34.78 
 
 		 281 aa  143  3e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.273498 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01499  2-keto-4-pentenoate hydratase, putative  34.17 
 
 		 482 aa  107  2e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1911  putative 2-keto-4-pentenoate hydratase-like protein  28.73 
 
 		 256 aa  73.2  0.000000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.123637 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6468  2-keto-4-pentenoate hydratase-like protein  26.32 
 
 		 253 aa  65.9  0.0000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.391434 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0105  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  27.04 
 
 		 265 aa  65.5  0.0000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6932  2-keto-4-pentenoate hydratase-like  27.04 
 
 		 253 aa  64.7  0.000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.228017  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1441  2-keto-4-pentenoate hydratase-like  26.69 
 
 		 253 aa  63.9  0.000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6387  2-keto-4-pentenoate hydratase-like protein  26.69 
 
 		 253 aa  63.9  0.000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.956579  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5715  2-keto-4-pentenoate hydratase-like protein  25.94 
 
 		 253 aa  63.2  0.000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.480508 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7051  2-keto-4-pentenoate hydratase-like protein  26.69 
 
 		 253 aa  62.8  0.000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1322  hydratase/decarboxylase family protein  29.63 
 
 		 254 aa  62  0.000000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.831556  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2003  putative hydratase/decarboxylase  27.2 
 
 		 253 aa  62  0.00000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.378768  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6957  Hydratase/decarboxylase  27.2 
 
 		 249 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0262  2-keto-4-pentenoate hydratase, putative  32.53 
 
 		 110 aa  58.9  0.00000008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1982  2-keto-4-pentenoate hydratase  28.46 
 
 		 264 aa  58.9  0.00000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.572392 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5380  2-keto-4-pentenoate hydratase-like protein  26.64 
 
 		 254 aa  58.9  0.00000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.506501  normal  0.128473 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1231  putative hydratase/decarboxylase  28.15 
 
 		 253 aa  55.8  0.0000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.2162  normal  0.357566 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2148  putative hydratase/decarboxylase  25.98 
 
 		 266 aa  54.7  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.691188 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4255  2-keto-4-pentenoate hydratase-like protein  25.2 
 
 		 257 aa  54.3  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0828  hydratase/decarboxylase  27.31 
 
 		 279 aa  53.9  0.000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.302369  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0042  hydratase/decarboxylase family protein  27.35 
 
 		 366 aa  53.9  0.000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2075  hydratase/decarboxylase family protein  24.69 
 
 		 258 aa  53.5  0.000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.488863  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1455  hydratase/decarboxylase family protein  26.97 
 
 		 254 aa  53.1  0.000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.44965  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1639  4-oxalocrotonate decarboxylase  27.82 
 
 		 259 aa  52.8  0.000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.193054 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2038  putative hydratase  28.67 
 
 		 268 aa  52.4  0.000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.450204  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0200  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  31.91 
 
 		 260 aa  51.6  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.428998  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5798  hydratase/decarboxylase family protein  25.85 
 
 		 269 aa  51.2  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000000214426  normal  0.683371 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2077  2-oxopent-4-enoate hydratase  25.79 
 
 		 261 aa  50.8  0.00002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.849096  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0259  hydratase/decarboxylase  24.9 
 
 		 263 aa  51.2  0.00002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000347099  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2111  4-oxalocrotonate decarboxylase  28.15 
 
 		 280 aa  51.2  0.00002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2133  putative 2-keto-4-pentenoate hydratase  26.62 
 
 		 261 aa  50.8  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1543  hydratase/decarboxylase family protein  26.45 
 
 		 254 aa  50.4  0.00003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.112303  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0595  4-oxalocrotonate decarboxylase  27.47 
 
 		 262 aa  50.1  0.00004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2055  4-oxalocrotonate decarboxylase  28.3 
 
 		 259 aa  48.9  0.00007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0304181  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1513  hydratase/decarboxylase  24.8 
 
 		 280 aa  48.5  0.0001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0110  2-oxopent-4-enoate hydratase  30.09 
 
 		 254 aa  48.1  0.0001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  decreased coverage  0.00322536  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4066  2-oxo-hepta-3-ene-1,7-dioic acid hydratase  26.69 
 
 		 274 aa  47.4  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.597772 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0175  putative hydratase/decarboxylase  25.34 
 
 		 261 aa  47.8  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.293299  normal  0.703391 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2258  putative hydratase/decarboxylase  27.2 
 
 		 253 aa  47.8  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0643634  normal  0.693124 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3399  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  28 
 
 		 260 aa  48.1  0.0002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3024  2-keto-4-pentenoate hydratase-like  29.27 
 
 		 254 aa  48.1  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.332921 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2299  4-oxalocrotonate decarboxylase  25.79 
 
 		 261 aa  47  0.0003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15110  2-keto-4-pentenoate hydratase  25.98 
 
 		 264 aa  47.4  0.0003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.473426  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3499  2-oxo-hepta-3-ene-1,7-dioic acid hydratase  27.31 
 
 		 266 aa  47  0.0003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00827858 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1904  hydratase/decarboxylase  23.33 
 
 		 270 aa  46.6  0.0004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2125  4-oxalocrotonate decarboxylase  24.37 
 
 		 264 aa  46.6  0.0004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.740862  normal  0.868744 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4393  hydratase/decarboxylase  26.02 
 
 		 283 aa  46.6  0.0004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0623  putative 2-keto-4-pentenoate hydratase-like protein  22.97 
 
 		 253 aa  46.2  0.0005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.602198  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0880  hydratase/decarboxylase  26.84 
 
 		 282 aa  45.8  0.0007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.777831 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5829  2-oxo-hepta-3-ene-1,7-dioic acid hydratase  24.02 
 
 		 267 aa  45.4  0.0009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.193631  normal  0.310568 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9115  2-oxopent-4-enoate hydratase  26.91 
 
 		 265 aa  45.4  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1186  4-oxalocrotonate decarboxylase  26.67 
 
 		 264 aa  45.1  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0763202  normal  0.362959 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1651  4-oxalocrotonate decarboxylase  26.07 
 
 		 275 aa  45.1  0.001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.452701  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3464  2-oxo-hepta-3-ene-1,7-dioic acid hydratase  25.53 
 
 		 266 aa  44.3  0.002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2941  2-oxo-hepta-3-ene-1,7-dioate hydratase  23.72 
 
 		 268 aa  44.3  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5826  2-keto-4-pentenoate hydratase-like protein  25.11 
 
 		 256 aa  43.9  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.242898  normal  0.506038 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4269  2-oxo-hepta-3-ene-1,7-dioic acid hydratase  26.81 
 
 		 282 aa  43.5  0.003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.238552  normal  0.686193 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4279  2-oxo-hepta-3-ene-1,7-dioic acid hydratase  25.42 
 
 		 268 aa  43.1  0.004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  decreased coverage  0.00917502  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00304  2-keto-4-pentenoate hydratase  26.32 
 
 		 269 aa  42.7  0.005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.503312  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00308  hypothetical protein  26.32 
 
 		 269 aa  42.7  0.005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.527408  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4209  4-oxalocrotonate decarboxylase  24.71 
 
 		 264 aa  43.1  0.005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0381  2-keto-4-pentenoate hydratase  26.32 
 
 		 269 aa  42.7  0.005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.795138  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1469  4-oxalocrotonate decarboxylase  24.26 
 
 		 257 aa  42.7  0.006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0414  2-keto-4-pentenoate hydratase  26.32 
 
 		 269 aa  42.7  0.006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0374  2-keto-4-pentenoate hydratase  26.32 
 
 		 269 aa  42.7  0.006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.832182  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2033  putative 2-oxo-hept-3-ene-1,7-dioate hydratase(HpaH)  25.24 
 
 		 267 aa  42.7  0.006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.25595  normal  0.0822961 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1149  2-oxopent-4-enoate hydratase  25.29 
 
 		 269 aa  42.7  0.006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.363401  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3589  2-oxo-hepta-3-ene-1,7-dioic acid hydratase  25 
 
 		 268 aa  42.7  0.007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.82541  normal  0.773607 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3592  hydratase/decarboxylase  23.61 
 
 		 260 aa  42.4  0.007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.148442  normal  0.0625876 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5795  2-keto-4-pentenoate hydratase-like protein  24.4 
 
 		 267 aa  42.4  0.007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2578  4-oxalocrotonate decarboxylase  25.86 
 
 		 276 aa  42.4  0.009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3275  2-keto-4-pentenoate hydratase  26.32 
 
 		 269 aa  42  0.009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.235013  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3256  4-oxalocrotonate decarboxylase  26.32 
 
 		 269 aa  42  0.009  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>